Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RJ00

Protein Details
Accession G0RJ00    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-36RGRGEWSRTKVDKRKRHDEYREYKRRKVSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
2-33GKKGDRGRGEWSRTKVDKRKRHDEYREYKRRK
55-59RRPKR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR041708  PUS1/PUS2-like  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:1990481  P:mRNA pseudouridine synthesis  
GO:0031120  P:snRNA pseudouridine synthesis  
GO:0031119  P:tRNA pseudouridine synthesis  
KEGG tre:TRIREDRAFT_27492  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
CDD cd02568  PseudoU_synth_PUS1_PUS2  
Amino Acid Sequences KGKKGDRGRGEWSRTKVDKRKRHDEYREYKRRKVSDIDNPKANPFSKEEIEAEGRRPKRKVAVMIGYAGTGYKGMQLNGDEETIERDLFQAFIKAGAISKANADDPRKSSLARCARTDKGVHAAGNVISLKLIIEDEDIVDKINEALPAQIRVWGIQRTNNSFNCYQYCDSRWYEYLMPSYCLLPPHPQSFLGKKLVEINKEYGAEEETNARLADVKDFWAEVEEKEIQPILARLDPETRAAVMERLHSEDAFEEKADNSAQAAEPAATATAAAAEPEETAKEDEQDYTVQPKRRELGPVDFALRDIKAAYIGAKRAYRVSPERIQRLQEALNKYEGTNNFHNYTVQKSHGDPSSKRHIRSFVVNPKPIIIGDTEWLSLKVHGQSFMMHQIRKMVGLVTLLVRCGTTLDRITESYGPKKMAIPKMPGLGLLLERPVFENYNKRAKETLGREEIDFDKYNDKIEAFKQEQIYSRIFSVEEKDNSFHTFFSQIDQFRSNHFLWLTAGGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.74
3 0.75
4 0.76
5 0.78
6 0.79
7 0.84
8 0.84
9 0.88
10 0.88
11 0.89
12 0.89
13 0.91
14 0.93
15 0.89
16 0.87
17 0.85
18 0.8
19 0.75
20 0.72
21 0.7
22 0.7
23 0.74
24 0.74
25 0.72
26 0.68
27 0.66
28 0.64
29 0.56
30 0.48
31 0.42
32 0.41
33 0.36
34 0.38
35 0.36
36 0.35
37 0.4
38 0.39
39 0.39
40 0.42
41 0.46
42 0.49
43 0.49
44 0.49
45 0.51
46 0.56
47 0.59
48 0.59
49 0.61
50 0.57
51 0.58
52 0.53
53 0.44
54 0.36
55 0.28
56 0.19
57 0.11
58 0.08
59 0.1
60 0.11
61 0.12
62 0.14
63 0.15
64 0.16
65 0.17
66 0.18
67 0.13
68 0.11
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.11
73 0.1
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.1
78 0.08
79 0.09
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.1
86 0.11
87 0.13
88 0.15
89 0.2
90 0.23
91 0.26
92 0.28
93 0.33
94 0.33
95 0.32
96 0.32
97 0.37
98 0.43
99 0.42
100 0.44
101 0.45
102 0.47
103 0.51
104 0.5
105 0.43
106 0.4
107 0.39
108 0.34
109 0.28
110 0.27
111 0.22
112 0.23
113 0.2
114 0.14
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.09
134 0.1
135 0.12
136 0.12
137 0.15
138 0.14
139 0.14
140 0.18
141 0.19
142 0.2
143 0.22
144 0.27
145 0.3
146 0.36
147 0.37
148 0.39
149 0.36
150 0.37
151 0.35
152 0.35
153 0.31
154 0.28
155 0.28
156 0.29
157 0.3
158 0.3
159 0.29
160 0.27
161 0.28
162 0.26
163 0.29
164 0.25
165 0.24
166 0.22
167 0.22
168 0.2
169 0.18
170 0.18
171 0.18
172 0.21
173 0.22
174 0.23
175 0.23
176 0.25
177 0.28
178 0.31
179 0.31
180 0.27
181 0.25
182 0.33
183 0.35
184 0.34
185 0.33
186 0.31
187 0.28
188 0.28
189 0.28
190 0.2
191 0.18
192 0.15
193 0.13
194 0.13
195 0.1
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.08
210 0.11
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.09
231 0.11
232 0.1
233 0.12
234 0.13
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.12
239 0.1
240 0.09
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.15
276 0.2
277 0.24
278 0.25
279 0.27
280 0.29
281 0.3
282 0.34
283 0.31
284 0.33
285 0.32
286 0.32
287 0.32
288 0.29
289 0.27
290 0.24
291 0.2
292 0.13
293 0.1
294 0.08
295 0.06
296 0.07
297 0.09
298 0.1
299 0.11
300 0.15
301 0.15
302 0.16
303 0.19
304 0.19
305 0.23
306 0.25
307 0.31
308 0.34
309 0.4
310 0.46
311 0.46
312 0.47
313 0.43
314 0.42
315 0.4
316 0.39
317 0.37
318 0.32
319 0.32
320 0.3
321 0.29
322 0.31
323 0.28
324 0.27
325 0.28
326 0.29
327 0.28
328 0.28
329 0.3
330 0.25
331 0.28
332 0.26
333 0.24
334 0.23
335 0.23
336 0.27
337 0.3
338 0.35
339 0.31
340 0.35
341 0.43
342 0.46
343 0.47
344 0.46
345 0.45
346 0.42
347 0.49
348 0.52
349 0.52
350 0.55
351 0.57
352 0.53
353 0.5
354 0.48
355 0.39
356 0.31
357 0.21
358 0.14
359 0.12
360 0.13
361 0.12
362 0.11
363 0.12
364 0.12
365 0.11
366 0.12
367 0.15
368 0.15
369 0.15
370 0.15
371 0.16
372 0.18
373 0.27
374 0.29
375 0.25
376 0.24
377 0.28
378 0.28
379 0.28
380 0.26
381 0.17
382 0.14
383 0.14
384 0.15
385 0.13
386 0.12
387 0.12
388 0.11
389 0.11
390 0.09
391 0.1
392 0.1
393 0.11
394 0.13
395 0.16
396 0.18
397 0.19
398 0.22
399 0.25
400 0.29
401 0.31
402 0.32
403 0.31
404 0.3
405 0.35
406 0.4
407 0.44
408 0.46
409 0.47
410 0.47
411 0.49
412 0.48
413 0.43
414 0.35
415 0.28
416 0.23
417 0.18
418 0.16
419 0.13
420 0.13
421 0.15
422 0.16
423 0.17
424 0.19
425 0.27
426 0.31
427 0.41
428 0.41
429 0.42
430 0.42
431 0.43
432 0.5
433 0.48
434 0.51
435 0.49
436 0.5
437 0.47
438 0.49
439 0.47
440 0.43
441 0.38
442 0.3
443 0.28
444 0.27
445 0.29
446 0.26
447 0.25
448 0.23
449 0.25
450 0.33
451 0.31
452 0.36
453 0.38
454 0.4
455 0.44
456 0.45
457 0.44
458 0.37
459 0.34
460 0.3
461 0.26
462 0.24
463 0.25
464 0.29
465 0.3
466 0.31
467 0.32
468 0.33
469 0.37
470 0.36
471 0.3
472 0.24
473 0.23
474 0.2
475 0.24
476 0.29
477 0.27
478 0.31
479 0.35
480 0.33
481 0.34
482 0.4
483 0.36
484 0.34
485 0.31
486 0.28
487 0.26