FuNGI

G0RPR3

Protein Details

Accession

G0RPR3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-37	EPQTKRAKMSSSKTRQHQHSGI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
KEGG	tre:TRIREDRAFT_80052 -
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MPSKREAEDTGGDTPEPQTKRAKMSSSKTRQHQHSGIDPTWGQKYVFSGTETATTIPEGEESEFEDDTDAMAYLLSVRQQAYSIPHLLVAPPVQIGPQLPPGFDREEDESEEEGEMKESYHAPDTSNAPESNGFYEDGAYIGITEGWRGNGSDQDDVPDEENPEAIQRAVDEAYFASILHQYHHLRKILHTEPPANAARRLSRSQATEALSFGRSTITLWSRLLKTTDPHPVQVALMSKDTVLKILRVMMSGKFLRSGYSIPPRTSQWLWALLARLPAMGELNHAEISWIRDLGRRAVLLGRSLAEMAALREELADSGFGVNDNVDASSSDEEVVAETIEEGDEEGDDDGDALPAVKATATKPPASAHRRRNSSSPIPDDVTEAKEGSEDEDVAMDTASDSSADEGEIPDQPDEATALEEAKHRLLARLAESENERRKEEERRDARMNMRATLTMILTVAGEFYGQRDLLEFREPFVGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.3
3	0.27
4	0.26
5	0.31
6	0.35
7	0.43
8	0.48
9	0.54
10	0.55
11	0.63
12	0.71
13	0.73
14	0.77
15	0.78
16	0.82
17	0.81
18	0.81
19	0.77
20	0.72
21	0.7
22	0.69
23	0.6
24	0.56
25	0.5
26	0.44
27	0.42
28	0.38
29	0.29
30	0.23
31	0.25
32	0.23
33	0.25
34	0.23
35	0.21
36	0.2
37	0.22
38	0.22
39	0.2
40	0.16
41	0.15
42	0.14
43	0.12
44	0.12
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.12
49	0.14
50	0.14
51	0.13
52	0.14
53	0.12
54	0.11
55	0.11
56	0.09
57	0.06
58	0.06
59	0.05
60	0.05
61	0.06
62	0.07
63	0.09
64	0.09
65	0.1
66	0.1
67	0.13
68	0.16
69	0.2
70	0.21
71	0.19
72	0.19
73	0.19
74	0.19
75	0.19
76	0.16
77	0.12
78	0.1
79	0.1
80	0.09
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.18
85	0.18
86	0.18
87	0.19
88	0.22
89	0.24
90	0.23
91	0.24
92	0.21
93	0.23
94	0.25
95	0.27
96	0.24
97	0.22
98	0.22
99	0.19
100	0.14
101	0.13
102	0.1
103	0.08
104	0.09
105	0.09
106	0.11
107	0.14
108	0.15
109	0.15
110	0.18
111	0.21
112	0.23
113	0.26
114	0.24
115	0.22
116	0.23
117	0.23
118	0.22
119	0.2
120	0.17
121	0.12
122	0.13
123	0.11
124	0.1
125	0.09
126	0.06
127	0.05
128	0.05
129	0.05
130	0.05
131	0.05
132	0.06
133	0.06
134	0.07
135	0.07
136	0.08
137	0.11
138	0.13
139	0.14
140	0.14
141	0.15
142	0.16
143	0.17
144	0.17
145	0.15
146	0.14
147	0.12
148	0.12
149	0.1
150	0.09
151	0.09
152	0.08
153	0.06
154	0.05
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.06
159	0.06
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.06
164	0.08
165	0.08
166	0.09
167	0.15
168	0.16
169	0.22
170	0.27
171	0.29
172	0.28
173	0.29
174	0.36
175	0.33
176	0.36
177	0.34
178	0.32
179	0.29
180	0.34
181	0.36
182	0.3
183	0.29
184	0.25
185	0.26
186	0.28
187	0.29
188	0.27
189	0.27
190	0.28
191	0.29
192	0.32
193	0.3
194	0.26
195	0.24
196	0.22
197	0.19
198	0.17
199	0.14
200	0.1
201	0.07
202	0.07
203	0.11
204	0.11
205	0.12
206	0.13
207	0.16
208	0.16
209	0.18
210	0.19
211	0.16
212	0.16
213	0.19
214	0.27
215	0.25
216	0.25
217	0.24
218	0.23
219	0.22
220	0.22
221	0.2
222	0.12
223	0.11
224	0.11
225	0.1
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.09
230	0.08
231	0.08
232	0.1
233	0.1
234	0.1
235	0.11
236	0.1
237	0.14
238	0.14
239	0.14
240	0.13
241	0.13
242	0.13
243	0.13
244	0.14
245	0.15
246	0.24
247	0.27
248	0.26
249	0.28
250	0.28
251	0.32
252	0.31
253	0.29
254	0.22
255	0.22
256	0.22
257	0.21
258	0.21
259	0.18
260	0.18
261	0.15
262	0.12
263	0.09
264	0.09
265	0.08
266	0.07
267	0.06
268	0.06
269	0.07
270	0.07
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.1
275	0.1
276	0.09
277	0.09
278	0.12
279	0.13
280	0.16
281	0.17
282	0.15
283	0.15
284	0.17
285	0.18
286	0.16
287	0.15
288	0.13
289	0.12
290	0.12
291	0.1
292	0.08
293	0.07
294	0.06
295	0.06
296	0.06
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.04
304	0.04
305	0.04
306	0.05
307	0.05
308	0.04
309	0.04
310	0.05
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.06
315	0.07
316	0.08
317	0.08
318	0.07
319	0.07
320	0.08
321	0.07
322	0.06
323	0.05
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.03
329	0.03
330	0.03
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.05
345	0.07
346	0.15
347	0.17
348	0.19
349	0.2
350	0.23
351	0.33
352	0.4
353	0.48
354	0.51
355	0.57
356	0.63
357	0.65
358	0.69
359	0.68
360	0.69
361	0.68
362	0.63
363	0.58
364	0.53
365	0.51
366	0.47
367	0.41
368	0.34
369	0.27
370	0.22
371	0.17
372	0.15
373	0.15
374	0.14
375	0.13
376	0.1
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.09
381	0.09
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.08
394	0.11
395	0.12
396	0.11
397	0.11
398	0.11
399	0.11
400	0.11
401	0.1
402	0.08
403	0.07
404	0.08
405	0.09
406	0.12
407	0.14
408	0.15
409	0.18
410	0.17
411	0.19
412	0.22
413	0.24
414	0.25
415	0.29
416	0.28
417	0.29
418	0.34
419	0.41
420	0.47
421	0.46
422	0.45
423	0.42
424	0.46
425	0.52
426	0.56
427	0.58
428	0.57
429	0.62
430	0.66
431	0.7
432	0.72
433	0.69
434	0.63
435	0.56
436	0.5
437	0.43
438	0.38
439	0.33
440	0.27
441	0.2
442	0.17
443	0.14
444	0.11
445	0.1
446	0.09
447	0.06
448	0.06
449	0.05
450	0.07
451	0.1
452	0.1
453	0.1
454	0.12
455	0.14
456	0.16
457	0.24
458	0.23
459	0.21

G0RPR3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer