Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RH31

Protein Details
Accession G0RH31    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
375-402DSEVRARERARREKRKEEERKLRQTRMGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
223-240PPKFKHKKIPRGPPSPPP
379-400RARERARREKRKEEERKLRQTR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0060090  F:molecular adaptor activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG tre:TRIREDRAFT_76960  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MTSMAASLQASLPKPKYTGEDEEAPSRAQQRGPRIVGPGQLDETQIVLKRSGPPPYGQRAGWRPRSQEDFGDGGAFPEIPIAQYPLDMGKKGAKTSNALALQVDAEGKVKYDAIARQGHGEGRIIHTSFKDLIPLRQRADAGEIDLSRPDKESVEATTERTKNALAALVSGAVAAQKPKNLNIGQRKDPTFVRYTPANQMGDNSKKQDRIMKIVERQRDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEMWRIPPPVSNWKNPKGFTVPLDKRLAADGRGLQDITINDKHAQFAEAIKMAERHAREEVQQRALMQQRLAEKEKMQKEENLRALAQKAREDRAAAGRRSRSPSRSSYSGSESRGSDSEDSEVRARERARREKRKEEERKLRQTRMGAERRIQVMAREQNRDISEKIALGIAKPSQSKETMYDSRLFNQSSGFDSGFNEDNPYDKPLFAAQDAINSIYRPRANLDDEDAEAGDREMAKIQKSSRFGEALGKGTFKGASEAEAREGPVQFEKDAADPFNVDKFLSEVDQNSSSKRGYGLQDEERRAKKARVEEDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.34
4 0.37
5 0.42
6 0.4
7 0.45
8 0.46
9 0.49
10 0.48
11 0.44
12 0.4
13 0.36
14 0.34
15 0.31
16 0.34
17 0.39
18 0.47
19 0.5
20 0.5
21 0.52
22 0.51
23 0.52
24 0.49
25 0.43
26 0.36
27 0.33
28 0.31
29 0.26
30 0.24
31 0.21
32 0.21
33 0.19
34 0.16
35 0.18
36 0.25
37 0.29
38 0.35
39 0.34
40 0.37
41 0.43
42 0.51
43 0.53
44 0.46
45 0.5
46 0.53
47 0.6
48 0.65
49 0.63
50 0.6
51 0.63
52 0.69
53 0.63
54 0.57
55 0.52
56 0.44
57 0.38
58 0.35
59 0.28
60 0.21
61 0.19
62 0.15
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.14
73 0.16
74 0.16
75 0.17
76 0.22
77 0.24
78 0.27
79 0.31
80 0.28
81 0.3
82 0.32
83 0.39
84 0.34
85 0.32
86 0.29
87 0.26
88 0.23
89 0.2
90 0.17
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.13
99 0.15
100 0.19
101 0.24
102 0.24
103 0.26
104 0.28
105 0.29
106 0.26
107 0.26
108 0.21
109 0.21
110 0.24
111 0.22
112 0.21
113 0.2
114 0.22
115 0.22
116 0.2
117 0.22
118 0.2
119 0.26
120 0.33
121 0.38
122 0.36
123 0.38
124 0.38
125 0.33
126 0.35
127 0.29
128 0.22
129 0.21
130 0.19
131 0.17
132 0.19
133 0.19
134 0.16
135 0.17
136 0.16
137 0.13
138 0.14
139 0.15
140 0.14
141 0.19
142 0.19
143 0.21
144 0.28
145 0.29
146 0.27
147 0.27
148 0.25
149 0.2
150 0.2
151 0.19
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.05
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.11
164 0.12
165 0.14
166 0.21
167 0.23
168 0.31
169 0.39
170 0.45
171 0.49
172 0.55
173 0.55
174 0.52
175 0.51
176 0.47
177 0.41
178 0.35
179 0.32
180 0.28
181 0.29
182 0.33
183 0.37
184 0.33
185 0.28
186 0.3
187 0.32
188 0.35
189 0.35
190 0.33
191 0.31
192 0.32
193 0.33
194 0.38
195 0.35
196 0.36
197 0.4
198 0.42
199 0.46
200 0.51
201 0.56
202 0.51
203 0.51
204 0.46
205 0.43
206 0.4
207 0.42
208 0.45
209 0.43
210 0.43
211 0.51
212 0.55
213 0.54
214 0.61
215 0.61
216 0.63
217 0.67
218 0.76
219 0.75
220 0.77
221 0.79
222 0.78
223 0.75
224 0.71
225 0.65
226 0.55
227 0.52
228 0.48
229 0.49
230 0.49
231 0.49
232 0.47
233 0.48
234 0.5
235 0.45
236 0.42
237 0.42
238 0.41
239 0.39
240 0.36
241 0.34
242 0.33
243 0.32
244 0.31
245 0.28
246 0.21
247 0.15
248 0.16
249 0.18
250 0.25
251 0.28
252 0.35
253 0.41
254 0.46
255 0.51
256 0.48
257 0.48
258 0.41
259 0.39
260 0.34
261 0.38
262 0.33
263 0.35
264 0.37
265 0.33
266 0.3
267 0.3
268 0.28
269 0.18
270 0.18
271 0.14
272 0.13
273 0.14
274 0.13
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.14
279 0.13
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.15
284 0.13
285 0.14
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.14
295 0.13
296 0.13
297 0.14
298 0.15
299 0.18
300 0.24
301 0.28
302 0.27
303 0.27
304 0.25
305 0.28
306 0.31
307 0.29
308 0.23
309 0.22
310 0.22
311 0.26
312 0.29
313 0.26
314 0.25
315 0.32
316 0.37
317 0.38
318 0.36
319 0.36
320 0.39
321 0.45
322 0.46
323 0.4
324 0.35
325 0.32
326 0.33
327 0.31
328 0.27
329 0.24
330 0.23
331 0.23
332 0.24
333 0.24
334 0.23
335 0.3
336 0.34
337 0.31
338 0.34
339 0.36
340 0.4
341 0.46
342 0.48
343 0.43
344 0.42
345 0.46
346 0.46
347 0.46
348 0.44
349 0.41
350 0.43
351 0.43
352 0.4
353 0.37
354 0.32
355 0.3
356 0.27
357 0.26
358 0.21
359 0.17
360 0.17
361 0.15
362 0.16
363 0.16
364 0.16
365 0.15
366 0.19
367 0.2
368 0.25
369 0.34
370 0.43
371 0.52
372 0.62
373 0.7
374 0.76
375 0.83
376 0.88
377 0.89
378 0.89
379 0.89
380 0.88
381 0.91
382 0.88
383 0.84
384 0.78
385 0.71
386 0.69
387 0.68
388 0.66
389 0.59
390 0.55
391 0.54
392 0.51
393 0.49
394 0.41
395 0.32
396 0.33
397 0.37
398 0.37
399 0.37
400 0.35
401 0.39
402 0.4
403 0.41
404 0.34
405 0.27
406 0.24
407 0.19
408 0.19
409 0.16
410 0.14
411 0.12
412 0.14
413 0.13
414 0.15
415 0.16
416 0.18
417 0.18
418 0.2
419 0.21
420 0.22
421 0.29
422 0.3
423 0.32
424 0.35
425 0.34
426 0.37
427 0.4
428 0.37
429 0.29
430 0.26
431 0.25
432 0.23
433 0.24
434 0.2
435 0.17
436 0.17
437 0.19
438 0.19
439 0.18
440 0.17
441 0.14
442 0.15
443 0.17
444 0.2
445 0.18
446 0.16
447 0.17
448 0.17
449 0.2
450 0.18
451 0.21
452 0.17
453 0.19
454 0.21
455 0.21
456 0.19
457 0.17
458 0.18
459 0.19
460 0.2
461 0.18
462 0.2
463 0.23
464 0.26
465 0.28
466 0.32
467 0.29
468 0.29
469 0.29
470 0.25
471 0.2
472 0.17
473 0.15
474 0.11
475 0.09
476 0.09
477 0.12
478 0.14
479 0.16
480 0.2
481 0.25
482 0.3
483 0.35
484 0.37
485 0.38
486 0.37
487 0.36
488 0.4
489 0.39
490 0.37
491 0.34
492 0.32
493 0.27
494 0.27
495 0.27
496 0.19
497 0.18
498 0.13
499 0.15
500 0.18
501 0.19
502 0.21
503 0.21
504 0.22
505 0.22
506 0.23
507 0.22
508 0.23
509 0.24
510 0.21
511 0.21
512 0.21
513 0.2
514 0.22
515 0.22
516 0.18
517 0.17
518 0.19
519 0.22
520 0.21
521 0.18
522 0.16
523 0.16
524 0.17
525 0.17
526 0.17
527 0.15
528 0.2
529 0.25
530 0.25
531 0.26
532 0.28
533 0.26
534 0.25
535 0.25
536 0.26
537 0.26
538 0.33
539 0.38
540 0.45
541 0.53
542 0.59
543 0.66
544 0.64
545 0.64
546 0.61
547 0.58
548 0.55
549 0.56
550 0.59