Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RFD1

Protein Details
Accession G0RFD1    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-41ADKRSNGSRNRRGGDRRRDRQDYPRDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-34SRNRRGGDRRRDR
75-77RRR
219-272GGSRSRSPMPPRRGGRRPGARREGGGRDQDGARGGRSGGGDGRAARTNAPRPKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG tre:TRIREDRAFT_59105  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MASDKMDRGLDEIIADKRSNGSRNRRGGDRRRDRQDYPRDGVKKSLRNEPRNLDSEWVHDRYEENTYRQRGPAPRRRRESPSGGDVRGTRLRVENIHYDLTEEDLDELFRRIGPITKLQLRYDRSGRSEGVAFVTYESSSDAAEAVRQFDGANANGQPIRLTILSGGPSRNPFDTAVMPGKPLSERISAPGGRSRSLSPHRRYDEEDAARRGIDRYVPGGSRSRSPMPPRRGGRRPGARREGGGRDQDGARGGRSGGGDGRAARTNAPRPKKTQEELDAEMEDYFNANGGAAEPAAEAAAQPAAAPNGEAAAPANADDIDMIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.19
4 0.22
5 0.27
6 0.33
7 0.38
8 0.46
9 0.53
10 0.62
11 0.66
12 0.71
13 0.76
14 0.8
15 0.82
16 0.82
17 0.83
18 0.83
19 0.85
20 0.82
21 0.82
22 0.82
23 0.8
24 0.75
25 0.74
26 0.69
27 0.63
28 0.66
29 0.65
30 0.62
31 0.57
32 0.61
33 0.62
34 0.65
35 0.71
36 0.69
37 0.67
38 0.63
39 0.6
40 0.53
41 0.44
42 0.42
43 0.41
44 0.36
45 0.29
46 0.26
47 0.25
48 0.24
49 0.31
50 0.29
51 0.28
52 0.34
53 0.38
54 0.4
55 0.41
56 0.45
57 0.46
58 0.53
59 0.58
60 0.61
61 0.67
62 0.72
63 0.76
64 0.77
65 0.76
66 0.74
67 0.7
68 0.69
69 0.65
70 0.58
71 0.54
72 0.47
73 0.45
74 0.41
75 0.35
76 0.27
77 0.24
78 0.26
79 0.26
80 0.29
81 0.28
82 0.27
83 0.28
84 0.26
85 0.24
86 0.21
87 0.21
88 0.17
89 0.12
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.09
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.11
100 0.13
101 0.18
102 0.22
103 0.29
104 0.32
105 0.34
106 0.4
107 0.4
108 0.43
109 0.42
110 0.41
111 0.37
112 0.37
113 0.35
114 0.3
115 0.27
116 0.23
117 0.2
118 0.16
119 0.13
120 0.11
121 0.11
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.09
138 0.08
139 0.09
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.07
146 0.09
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.07
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.12
156 0.13
157 0.13
158 0.14
159 0.12
160 0.13
161 0.13
162 0.15
163 0.17
164 0.16
165 0.16
166 0.14
167 0.15
168 0.13
169 0.14
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.15
174 0.2
175 0.2
176 0.21
177 0.25
178 0.23
179 0.21
180 0.23
181 0.21
182 0.24
183 0.32
184 0.4
185 0.4
186 0.48
187 0.51
188 0.52
189 0.56
190 0.54
191 0.55
192 0.53
193 0.53
194 0.46
195 0.43
196 0.4
197 0.36
198 0.3
199 0.22
200 0.17
201 0.13
202 0.13
203 0.15
204 0.16
205 0.18
206 0.22
207 0.23
208 0.24
209 0.28
210 0.3
211 0.34
212 0.42
213 0.49
214 0.52
215 0.6
216 0.63
217 0.68
218 0.71
219 0.71
220 0.72
221 0.73
222 0.75
223 0.75
224 0.77
225 0.7
226 0.65
227 0.64
228 0.61
229 0.56
230 0.51
231 0.42
232 0.37
233 0.35
234 0.33
235 0.31
236 0.25
237 0.19
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.14
242 0.15
243 0.13
244 0.14
245 0.15
246 0.15
247 0.19
248 0.19
249 0.2
250 0.21
251 0.26
252 0.33
253 0.41
254 0.49
255 0.51
256 0.54
257 0.63
258 0.68
259 0.66
260 0.66
261 0.65
262 0.62
263 0.61
264 0.58
265 0.51
266 0.43
267 0.38
268 0.29
269 0.21
270 0.15
271 0.1
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.06
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.08
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.08
303 0.08