Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RS16

Protein Details
Accession G0RS16    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-54KPPVQALKVANKQKRKQLFVAHKKASNKERHEERHRRRREENKNPELKAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-58KQKRKQLFVAHKKASNKERHEERHRRRREENKNPELKAARLAK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
KEGG tre:TRIREDRAFT_80748  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MGFTKPPVQALKVANKQKRKQLFVAHKKASNKERHEERHRRRREENKNPELKAARLAKNVPRTLEHKRVWDDVDDDSLGAVVDLEQLKRRRIEQAEAEERAAVEAAEKMDQDDDDDDDDNDSMLDSDEEDEEAKEARLERQREKRAQRVPSIAPSTTSTNLDLTPTSLALKFPSLFTDEPPPEPKILVTTSLNSTIHDEAQLICTLFPNANYIPRSSHRYGYKYSLRDICKFSASRDYTAVVLVKEDQKKPTGLSIVHLPKGPTFHFSISNWIEGKKLPGHGNPTNHYPELLLNNFKTPLGLLTAKLFQTMFPPRPEFEGRQVVALHNQRDYIFVRRFRYAFRDKRPTEKSVVDAEGKALQGVENIRAGLQELGPRFTLKLRRVDKGVGRAGSEGEDAIQWEWKSKMEKDRKRFNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.71
3 0.75
4 0.79
5 0.81
6 0.78
7 0.76
8 0.76
9 0.79
10 0.8
11 0.84
12 0.81
13 0.78
14 0.77
15 0.79
16 0.78
17 0.76
18 0.73
19 0.72
20 0.75
21 0.79
22 0.84
23 0.86
24 0.87
25 0.88
26 0.91
27 0.89
28 0.89
29 0.9
30 0.9
31 0.9
32 0.9
33 0.9
34 0.89
35 0.82
36 0.8
37 0.72
38 0.62
39 0.6
40 0.58
41 0.52
42 0.49
43 0.53
44 0.52
45 0.58
46 0.6
47 0.54
48 0.49
49 0.5
50 0.53
51 0.57
52 0.53
53 0.52
54 0.53
55 0.54
56 0.52
57 0.48
58 0.42
59 0.33
60 0.33
61 0.25
62 0.21
63 0.16
64 0.14
65 0.11
66 0.09
67 0.07
68 0.04
69 0.07
70 0.08
71 0.1
72 0.16
73 0.2
74 0.24
75 0.26
76 0.28
77 0.33
78 0.36
79 0.42
80 0.43
81 0.5
82 0.54
83 0.53
84 0.52
85 0.44
86 0.4
87 0.33
88 0.25
89 0.14
90 0.08
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.08
122 0.08
123 0.14
124 0.21
125 0.26
126 0.34
127 0.43
128 0.52
129 0.6
130 0.66
131 0.69
132 0.71
133 0.72
134 0.69
135 0.66
136 0.59
137 0.58
138 0.54
139 0.45
140 0.39
141 0.35
142 0.32
143 0.27
144 0.26
145 0.19
146 0.16
147 0.16
148 0.15
149 0.13
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.09
156 0.08
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.1
161 0.12
162 0.12
163 0.14
164 0.21
165 0.2
166 0.22
167 0.25
168 0.25
169 0.22
170 0.22
171 0.2
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.13
176 0.13
177 0.14
178 0.17
179 0.17
180 0.15
181 0.17
182 0.15
183 0.14
184 0.12
185 0.11
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.12
198 0.13
199 0.13
200 0.16
201 0.18
202 0.26
203 0.25
204 0.3
205 0.31
206 0.33
207 0.35
208 0.39
209 0.44
210 0.38
211 0.4
212 0.42
213 0.41
214 0.41
215 0.42
216 0.37
217 0.35
218 0.33
219 0.31
220 0.33
221 0.32
222 0.29
223 0.27
224 0.26
225 0.22
226 0.22
227 0.22
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.16
232 0.2
233 0.22
234 0.22
235 0.23
236 0.24
237 0.24
238 0.25
239 0.23
240 0.19
241 0.18
242 0.25
243 0.27
244 0.28
245 0.29
246 0.26
247 0.23
248 0.26
249 0.25
250 0.19
251 0.17
252 0.18
253 0.19
254 0.19
255 0.26
256 0.25
257 0.27
258 0.25
259 0.23
260 0.22
261 0.2
262 0.23
263 0.18
264 0.21
265 0.21
266 0.23
267 0.31
268 0.35
269 0.4
270 0.39
271 0.42
272 0.42
273 0.38
274 0.35
275 0.29
276 0.26
277 0.26
278 0.26
279 0.25
280 0.21
281 0.23
282 0.23
283 0.22
284 0.2
285 0.14
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.12
290 0.14
291 0.17
292 0.17
293 0.18
294 0.17
295 0.13
296 0.18
297 0.25
298 0.26
299 0.28
300 0.31
301 0.31
302 0.36
303 0.41
304 0.39
305 0.38
306 0.43
307 0.39
308 0.39
309 0.39
310 0.34
311 0.37
312 0.39
313 0.34
314 0.26
315 0.27
316 0.25
317 0.27
318 0.29
319 0.29
320 0.31
321 0.35
322 0.38
323 0.42
324 0.43
325 0.43
326 0.5
327 0.52
328 0.54
329 0.58
330 0.65
331 0.63
332 0.72
333 0.74
334 0.7
335 0.66
336 0.6
337 0.54
338 0.49
339 0.5
340 0.43
341 0.37
342 0.34
343 0.3
344 0.27
345 0.23
346 0.17
347 0.13
348 0.13
349 0.14
350 0.15
351 0.13
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.14
356 0.13
357 0.13
358 0.16
359 0.16
360 0.18
361 0.19
362 0.2
363 0.2
364 0.25
365 0.32
366 0.32
367 0.41
368 0.44
369 0.49
370 0.52
371 0.59
372 0.6
373 0.6
374 0.62
375 0.54
376 0.5
377 0.46
378 0.42
379 0.36
380 0.29
381 0.2
382 0.14
383 0.12
384 0.12
385 0.12
386 0.16
387 0.14
388 0.17
389 0.18
390 0.22
391 0.27
392 0.33
393 0.43
394 0.49
395 0.6
396 0.66