Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RBU8

Protein Details
Accession G0RBU8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-85SSSNRISKSSKTRRRSSKSTTKNQLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-128LRSKRGALKRKER
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 11.5, cyto_nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG tre:TRIREDRAFT_104239  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MAPQKPSATALRHARITNAIHPLAPPKTFRPNASTTDSFLSTKRDKRTIKHSAFISRVASSSNRISKSSKTRRRSSKSTTKNQLSSLDSLADALPELADGEGAAEVLDGKIKHQSLRSKRGALKRKERLLRGEMARFGVSMAQLSTVSAAAQTQQQQGAAAGSFNNNNKPVAETKKAAEETKQPAPAPAVSNRWAALRGYISATMEQNPAFVNKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.46
3 0.46
4 0.43
5 0.41
6 0.36
7 0.32
8 0.32
9 0.36
10 0.34
11 0.32
12 0.3
13 0.28
14 0.38
15 0.41
16 0.43
17 0.43
18 0.44
19 0.47
20 0.51
21 0.47
22 0.4
23 0.4
24 0.39
25 0.34
26 0.3
27 0.32
28 0.31
29 0.37
30 0.4
31 0.46
32 0.48
33 0.53
34 0.61
35 0.65
36 0.63
37 0.63
38 0.6
39 0.59
40 0.56
41 0.54
42 0.46
43 0.36
44 0.32
45 0.27
46 0.24
47 0.2
48 0.24
49 0.27
50 0.27
51 0.28
52 0.3
53 0.35
54 0.45
55 0.53
56 0.56
57 0.58
58 0.66
59 0.74
60 0.8
61 0.81
62 0.8
63 0.79
64 0.79
65 0.81
66 0.82
67 0.78
68 0.72
69 0.66
70 0.61
71 0.53
72 0.45
73 0.35
74 0.26
75 0.19
76 0.17
77 0.14
78 0.1
79 0.07
80 0.05
81 0.04
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.02
86 0.02
87 0.03
88 0.02
89 0.03
90 0.02
91 0.02
92 0.02
93 0.02
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.15
101 0.24
102 0.3
103 0.4
104 0.44
105 0.47
106 0.53
107 0.6
108 0.65
109 0.65
110 0.68
111 0.68
112 0.72
113 0.72
114 0.7
115 0.66
116 0.6
117 0.59
118 0.52
119 0.47
120 0.39
121 0.35
122 0.31
123 0.25
124 0.21
125 0.15
126 0.11
127 0.08
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.08
139 0.1
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.1
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.12
151 0.13
152 0.17
153 0.18
154 0.18
155 0.18
156 0.21
157 0.25
158 0.29
159 0.32
160 0.31
161 0.31
162 0.39
163 0.41
164 0.4
165 0.37
166 0.38
167 0.39
168 0.44
169 0.47
170 0.39
171 0.38
172 0.39
173 0.39
174 0.35
175 0.34
176 0.32
177 0.3
178 0.32
179 0.31
180 0.29
181 0.27
182 0.24
183 0.22
184 0.19
185 0.18
186 0.19
187 0.2
188 0.21
189 0.22
190 0.23
191 0.22
192 0.22
193 0.2
194 0.18
195 0.17