FuNGI

G0RDB0

Protein Details

Accession

G0RDB0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
195-219	SSQIKVAPKRQQQQQQQQQQQQQQQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 12.333, cyto 5.5, cyto_mito 5.166, mito 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045117 ATXN2-like IPR009604 LsmAD_domain
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	tre:TRIREDRAFT_105054 -
Pfam	View protein in Pfam PF06741 LsmAD

Amino Acid Sequences

MPTQPRRDAQQGGSSSSKTDGKMNGNRSGFRTDTAISNGRFGGQRVLQPWVPDKNDNFDGSLEKTSSSGAPWDQFAENERLFGLKTDYDENIYTTAINKDHPQYRERIAAAEKKAREIERSAAMTAHVAEERVMDYSGGKDRTDDNEEDKYSGVRRQDFPPLASGRENRYMPPAKRAPAGQTTVRGAPVDPAIISSQIKVAPKRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQPQAGEAPKVTEPSKASEPSKASASDALKNGNQGKRETQKPADAQQPSNSSASKPAGKDNSTAPAPAPAASAPAPAPTKENARPAEPSVAEKQGINGRATALGSTSRPVAQLPPNAPSATLTVERDVLVSFKNFATQQRHYAEKARSNKAKADKEVKLTELKKFANDFKLSTPVPSDLVSIIAKDPAKQREIQAKAMKDAEEMAAKAKDVAAQAKKEVVAPKDVAQAKRASPSTTASAAAEARPARGALGLQATPPNGGPGRHAGSRQQFPQQQYHAQGYRNGRVGPQHAPQPHANPNTLAQRIRSSEQRYSQPPPAHQHAVGPEIRAPPTGPANGADYSRRHSGHPGAKLNPNSNEFRPSPFAPTFNPNGHPSATSSPRSAVNHVSDVAAPAPAASTQPQGQLIRRKTKAVDPSKCCILAHIKTIAPPQGRNWDDNGGLRPAYDTLPTWRQLQDDEKPDSTMHLTYKELFERQPFAATPSMPTPNPAHVVPQLAHQHQLPFHLQPGAHNMMPRQSPHMPPMQMHTPQHGPLPHQPYGNDDHRMMHSNSAQSFASPRMGQLPVAYQQVNPGAQVPYGQPVYIGAGNPQLGQFRSYSNNPHYVPPQGQMGAPMMMQPQFMAGPQGMMAPPMMYGTHHPQFMPPAGPPQQVPVANGYPSPGRPAAPMMVHQGSQQSHNMYAMSPNIQYNQPAYGPAQGGAPMANTRSYTGHGPQHFSPNPQQVPHHYSPQPPNSSGGNYNAHANHGAGKQQQQAHAHSGPQANRTASTSPPNQEAERPDEAK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.4
3	0.38
4	0.36
5	0.29
6	0.31
7	0.32
8	0.38
9	0.46
10	0.5
11	0.55
12	0.55
13	0.57
14	0.55
15	0.55
16	0.47
17	0.4
18	0.38
19	0.31
20	0.3
21	0.34
22	0.37
23	0.31
24	0.32
25	0.31
26	0.3
27	0.3
28	0.27
29	0.28
30	0.25
31	0.29
32	0.29
33	0.34
34	0.33
35	0.35
36	0.41
37	0.41
38	0.42
39	0.44
40	0.44
41	0.46
42	0.49
43	0.47
44	0.42
45	0.35
46	0.34
47	0.31
48	0.32
49	0.25
50	0.2
51	0.19
52	0.2
53	0.19
54	0.16
55	0.17
56	0.17
57	0.18
58	0.19
59	0.22
60	0.21
61	0.21
62	0.24
63	0.28
64	0.25
65	0.24
66	0.23
67	0.2
68	0.19
69	0.2
70	0.19
71	0.14
72	0.16
73	0.19
74	0.2
75	0.23
76	0.23
77	0.23
78	0.21
79	0.19
80	0.17
81	0.15
82	0.18
83	0.16
84	0.17
85	0.2
86	0.27
87	0.34
88	0.37
89	0.38
90	0.39
91	0.43
92	0.48
93	0.45
94	0.42
95	0.41
96	0.46
97	0.49
98	0.52
99	0.48
100	0.46
101	0.52
102	0.49
103	0.46
104	0.42
105	0.39
106	0.38
107	0.4
108	0.35
109	0.3
110	0.28
111	0.25
112	0.22
113	0.2
114	0.13
115	0.11
116	0.1
117	0.11
118	0.11
119	0.11
120	0.11
121	0.09
122	0.09
123	0.12
124	0.19
125	0.2
126	0.19
127	0.19
128	0.22
129	0.28
130	0.33
131	0.32
132	0.3
133	0.35
134	0.37
135	0.36
136	0.33
137	0.3
138	0.27
139	0.28
140	0.3
141	0.29
142	0.31
143	0.34
144	0.43
145	0.44
146	0.43
147	0.46
148	0.42
149	0.39
150	0.41
151	0.41
152	0.37
153	0.42
154	0.41
155	0.35
156	0.42
157	0.48
158	0.44
159	0.5
160	0.5
161	0.46
162	0.48
163	0.49
164	0.46
165	0.44
166	0.47
167	0.4
168	0.38
169	0.39
170	0.37
171	0.36
172	0.31
173	0.24
174	0.21
175	0.19
176	0.16
177	0.12
178	0.12
179	0.11
180	0.13
181	0.14
182	0.12
183	0.13
184	0.15
185	0.2
186	0.21
187	0.28
188	0.35
189	0.44
190	0.51
191	0.58
192	0.65
193	0.71
194	0.79
195	0.83
196	0.84
197	0.84
198	0.84
199	0.83
200	0.82
201	0.79
202	0.76
203	0.74
204	0.71
205	0.7
206	0.7
207	0.7
208	0.71
209	0.7
210	0.69
211	0.65
212	0.61
213	0.53
214	0.47
215	0.44
216	0.37
217	0.32
218	0.25
219	0.23
220	0.2
221	0.23
222	0.22
223	0.2
224	0.2
225	0.24
226	0.29
227	0.3
228	0.31
229	0.34
230	0.36
231	0.34
232	0.36
233	0.31
234	0.27
235	0.28
236	0.3
237	0.28
238	0.27
239	0.28
240	0.26
241	0.3
242	0.36
243	0.33
244	0.33
245	0.31
246	0.37
247	0.41
248	0.46
249	0.49
250	0.46
251	0.5
252	0.51
253	0.53
254	0.54
255	0.51
256	0.48
257	0.46
258	0.46
259	0.41
260	0.39
261	0.34
262	0.27
263	0.27
264	0.28
265	0.28
266	0.25
267	0.29
268	0.33
269	0.34
270	0.35
271	0.32
272	0.34
273	0.3
274	0.29
275	0.23
276	0.21
277	0.2
278	0.18
279	0.17
280	0.11
281	0.13
282	0.12
283	0.13
284	0.1
285	0.13
286	0.14
287	0.13
288	0.16
289	0.16
290	0.22
291	0.25
292	0.32
293	0.3
294	0.31
295	0.34
296	0.34
297	0.38
298	0.32
299	0.32
300	0.28
301	0.28
302	0.26
303	0.23
304	0.24
305	0.23
306	0.25
307	0.22
308	0.18
309	0.17
310	0.17
311	0.17
312	0.14
313	0.1
314	0.09
315	0.09
316	0.1
317	0.1
318	0.1
319	0.1
320	0.1
321	0.14
322	0.17
323	0.22
324	0.23
325	0.25
326	0.26
327	0.26
328	0.25
329	0.22
330	0.18
331	0.15
332	0.16
333	0.14
334	0.13
335	0.14
336	0.14
337	0.13
338	0.12
339	0.1
340	0.09
341	0.08
342	0.09
343	0.08
344	0.11
345	0.12
346	0.17
347	0.23
348	0.25
349	0.31
350	0.33
351	0.36
352	0.35
353	0.41
354	0.42
355	0.43
356	0.49
357	0.5
358	0.53
359	0.52
360	0.57
361	0.59
362	0.59
363	0.57
364	0.57
365	0.53
366	0.53
367	0.52
368	0.48
369	0.47
370	0.42
371	0.4
372	0.38
373	0.35
374	0.32
375	0.33
376	0.34
377	0.34
378	0.33
379	0.31
380	0.26
381	0.31
382	0.28
383	0.26
384	0.24
385	0.18
386	0.17
387	0.16
388	0.15
389	0.1
390	0.11
391	0.11
392	0.1
393	0.09
394	0.11
395	0.11
396	0.13
397	0.18
398	0.19
399	0.21
400	0.22
401	0.26
402	0.32
403	0.35
404	0.41
405	0.41
406	0.38
407	0.39
408	0.39
409	0.35
410	0.26
411	0.24
412	0.17
413	0.12
414	0.11
415	0.11
416	0.1
417	0.09
418	0.09
419	0.08
420	0.09
421	0.09
422	0.15
423	0.17
424	0.17
425	0.18
426	0.19
427	0.19
428	0.2
429	0.23
430	0.18
431	0.17
432	0.18
433	0.19
434	0.25
435	0.28
436	0.26
437	0.25
438	0.26
439	0.24
440	0.28
441	0.27
442	0.21
443	0.19
444	0.2
445	0.21
446	0.19
447	0.19
448	0.14
449	0.14
450	0.14
451	0.12
452	0.13
453	0.11
454	0.1
455	0.09
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.08
460	0.06
461	0.08
462	0.08
463	0.08
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.09
468	0.1
469	0.08
470	0.08
471	0.09
472	0.12
473	0.15
474	0.16
475	0.16
476	0.2
477	0.25
478	0.28
479	0.29
480	0.32
481	0.33
482	0.34
483	0.39
484	0.36
485	0.34
486	0.34
487	0.36
488	0.32
489	0.29
490	0.32
491	0.31
492	0.31
493	0.3
494	0.28
495	0.24
496	0.23
497	0.25
498	0.23
499	0.22
500	0.24
501	0.23
502	0.26
503	0.27
504	0.3
505	0.34
506	0.32
507	0.3
508	0.26
509	0.28
510	0.29
511	0.3
512	0.26
513	0.2
514	0.21
515	0.23
516	0.24
517	0.27
518	0.26
519	0.29
520	0.33
521	0.37
522	0.38
523	0.4
524	0.45
525	0.42
526	0.42
527	0.42
528	0.43
529	0.4
530	0.36
531	0.33
532	0.28
533	0.29
534	0.26
535	0.21
536	0.18
537	0.18
538	0.18
539	0.16
540	0.15
541	0.12
542	0.14
543	0.14
544	0.11
545	0.1
546	0.13
547	0.13
548	0.14
549	0.15
550	0.14
551	0.17
552	0.21
553	0.21
554	0.19
555	0.21
556	0.28
557	0.32
558	0.38
559	0.39
560	0.39
561	0.44
562	0.46
563	0.46
564	0.43
565	0.4
566	0.36
567	0.32
568	0.34
569	0.29
570	0.29
571	0.3
572	0.27
573	0.29
574	0.27
575	0.28
576	0.25
577	0.28
578	0.29
579	0.27
580	0.29
581	0.25
582	0.26
583	0.24
584	0.23
585	0.21
586	0.22
587	0.24
588	0.23
589	0.22
590	0.22
591	0.26
592	0.27
593	0.26
594	0.25
595	0.23
596	0.23
597	0.22
598	0.21
599	0.17
600	0.16
601	0.14
602	0.1
603	0.07
604	0.06
605	0.05
606	0.05
607	0.06
608	0.06
609	0.07
610	0.08
611	0.1
612	0.14
613	0.15
614	0.2
615	0.28
616	0.33
617	0.41
618	0.41
619	0.42
620	0.41
621	0.46
622	0.52
623	0.53
624	0.56
625	0.52
626	0.55
627	0.56
628	0.55
629	0.48
630	0.4
631	0.37
632	0.3
633	0.28
634	0.27
635	0.24
636	0.25
637	0.28
638	0.31
639	0.25
640	0.24
641	0.24
642	0.3
643	0.31
644	0.31
645	0.31
646	0.29
647	0.28
648	0.3
649	0.29
650	0.21
651	0.19
652	0.17
653	0.15
654	0.14
655	0.13
656	0.12
657	0.1
658	0.14
659	0.18
660	0.2
661	0.21
662	0.21
663	0.21
664	0.23
665	0.28
666	0.3
667	0.32
668	0.35
669	0.33
670	0.33
671	0.33
672	0.31
673	0.27
674	0.23
675	0.18
676	0.16
677	0.16
678	0.16
679	0.19
680	0.2
681	0.2
682	0.19
683	0.2
684	0.22
685	0.22
686	0.23
687	0.2
688	0.2
689	0.21
690	0.2
691	0.2
692	0.2
693	0.23
694	0.2
695	0.23
696	0.22
697	0.22
698	0.24
699	0.22
700	0.21
701	0.19
702	0.22
703	0.2
704	0.24
705	0.27
706	0.26
707	0.27
708	0.25
709	0.26
710	0.24
711	0.28
712	0.23
713	0.19
714	0.19
715	0.21
716	0.2
717	0.18
718	0.24
719	0.25
720	0.23
721	0.23
722	0.22
723	0.24
724	0.26
725	0.26
726	0.25
727	0.26
728	0.27
729	0.3
730	0.36
731	0.33
732	0.31
733	0.36
734	0.36
735	0.38
736	0.36
737	0.37
738	0.33
739	0.33
740	0.36
741	0.32
742	0.3
743	0.33
744	0.39
745	0.37
746	0.36
747	0.35
748	0.35
749	0.4
750	0.4
751	0.36
752	0.29
753	0.29
754	0.3
755	0.35
756	0.32
757	0.29
758	0.28
759	0.29
760	0.28
761	0.28
762	0.26
763	0.21
764	0.22
765	0.2
766	0.21
767	0.16
768	0.16
769	0.18
770	0.19
771	0.19
772	0.18
773	0.19
774	0.18
775	0.22
776	0.21
777	0.17
778	0.19
779	0.22
780	0.21
781	0.18
782	0.17
783	0.15
784	0.14
785	0.16
786	0.14
787	0.15
788	0.15
789	0.15
790	0.12
791	0.12
792	0.15
793	0.15
794	0.14
795	0.11
796	0.13
797	0.14
798	0.15
799	0.15
800	0.15
801	0.14
802	0.15
803	0.15
804	0.15
805	0.2
806	0.22
807	0.29
808	0.31
809	0.38
810	0.38
811	0.42
812	0.41
813	0.41
814	0.4
815	0.35
816	0.34
817	0.28
818	0.26
819	0.24
820	0.23
821	0.19
822	0.16
823	0.15
824	0.13
825	0.12
826	0.12
827	0.1
828	0.1
829	0.09
830	0.09
831	0.1
832	0.08
833	0.08
834	0.08
835	0.1
836	0.09
837	0.09
838	0.09
839	0.07
840	0.07
841	0.07
842	0.07
843	0.07
844	0.11
845	0.19
846	0.22
847	0.23
848	0.23
849	0.24
850	0.28
851	0.3
852	0.28
853	0.22
854	0.26
855	0.3
856	0.31
857	0.3
858	0.3
859	0.33
860	0.32
861	0.32
862	0.3
863	0.28
864	0.27
865	0.27
866	0.25
867	0.22
868	0.21
869	0.25
870	0.21
871	0.19
872	0.19
873	0.23
874	0.24
875	0.23
876	0.25
877	0.27
878	0.27
879	0.27
880	0.26
881	0.28
882	0.26
883	0.27
884	0.28
885	0.24
886	0.23
887	0.24
888	0.24
889	0.19
890	0.2
891	0.2
892	0.19
893	0.18
894	0.18
895	0.2
896	0.21
897	0.22
898	0.21
899	0.22
900	0.2
901	0.2
902	0.2
903	0.21
904	0.21
905	0.2
906	0.19
907	0.16
908	0.16
909	0.14
910	0.15
911	0.12
912	0.12
913	0.14
914	0.13
915	0.15
916	0.16
917	0.18
918	0.22
919	0.26
920	0.33
921	0.34
922	0.39
923	0.4
924	0.49
925	0.48
926	0.49
927	0.52
928	0.54
929	0.54
930	0.53
931	0.54
932	0.52
933	0.59
934	0.57
935	0.57
936	0.51
937	0.56
938	0.62
939	0.67
940	0.65
941	0.57
942	0.56
943	0.51
944	0.52
945	0.46
946	0.43
947	0.38
948	0.33
949	0.38
950	0.35
951	0.34
952	0.3
953	0.28
954	0.28
955	0.25
956	0.29
957	0.28
958	0.32
959	0.37
960	0.4
961	0.46
962	0.45
963	0.47
964	0.49
965	0.47
966	0.44
967	0.43
968	0.45
969	0.43
970	0.42
971	0.43
972	0.37
973	0.37
974	0.38
975	0.35
976	0.32
977	0.36
978	0.39
979	0.38
980	0.42
981	0.44
982	0.43
983	0.46
984	0.47
985	0.46

G0RDB0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer