Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RTF9

Protein Details
Accession G0RTF9    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MSSLRNSIQRRPHRERAQPLERRRLGHydrophilic
162-183EGLSSRRRRRRSGAKGPRKIVFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-180RRRRRRSGAKGPRK
260-272RRGKKIMVRKRKR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG tre:TRIREDRAFT_67840  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSLRNSIQRRPHRERAQPLERRRLGLLEKHKDYSQRAKDYNQKKATLKALREKAADRNEDEFYFGMMSRKGPGAKITSGKSWNGRVEGDRGNNKGMDMDTVRLLKTQDLGYVRTMKQVAVKELARLEEQAVLVKGLEELAAAEEDDDDNDDEGFDDDSEEEGLSSRRRRRRSGAKGPRKIVFMDNEDERDEALQAAEESQGPKREDQQAAFERSENLAELKRKLEHARKKVKSLMAAESQLEVQQAKMAKTATSGGTTRRGKKIMVRKRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.87
3 0.86
4 0.87
5 0.87
6 0.86
7 0.86
8 0.8
9 0.73
10 0.64
11 0.6
12 0.54
13 0.53
14 0.55
15 0.53
16 0.55
17 0.55
18 0.56
19 0.56
20 0.57
21 0.59
22 0.58
23 0.57
24 0.56
25 0.6
26 0.67
27 0.71
28 0.75
29 0.71
30 0.68
31 0.62
32 0.64
33 0.67
34 0.65
35 0.63
36 0.63
37 0.63
38 0.61
39 0.61
40 0.58
41 0.56
42 0.56
43 0.53
44 0.46
45 0.42
46 0.4
47 0.37
48 0.36
49 0.28
50 0.21
51 0.18
52 0.15
53 0.14
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.15
58 0.15
59 0.15
60 0.18
61 0.2
62 0.23
63 0.27
64 0.28
65 0.3
66 0.32
67 0.34
68 0.35
69 0.35
70 0.34
71 0.32
72 0.31
73 0.27
74 0.29
75 0.31
76 0.33
77 0.33
78 0.32
79 0.32
80 0.3
81 0.28
82 0.25
83 0.2
84 0.16
85 0.13
86 0.12
87 0.13
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.14
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.21
100 0.21
101 0.22
102 0.22
103 0.19
104 0.22
105 0.22
106 0.22
107 0.21
108 0.21
109 0.19
110 0.2
111 0.21
112 0.16
113 0.15
114 0.13
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.09
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.04
124 0.04
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.05
150 0.06
151 0.1
152 0.16
153 0.24
154 0.31
155 0.36
156 0.42
157 0.51
158 0.6
159 0.68
160 0.73
161 0.76
162 0.8
163 0.84
164 0.83
165 0.77
166 0.67
167 0.59
168 0.51
169 0.44
170 0.36
171 0.32
172 0.29
173 0.28
174 0.27
175 0.25
176 0.21
177 0.17
178 0.14
179 0.1
180 0.08
181 0.06
182 0.05
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.11
188 0.17
189 0.18
190 0.19
191 0.24
192 0.31
193 0.34
194 0.34
195 0.4
196 0.41
197 0.45
198 0.44
199 0.4
200 0.34
201 0.31
202 0.3
203 0.22
204 0.18
205 0.18
206 0.21
207 0.22
208 0.24
209 0.25
210 0.29
211 0.37
212 0.45
213 0.5
214 0.57
215 0.66
216 0.68
217 0.73
218 0.76
219 0.72
220 0.69
221 0.63
222 0.58
223 0.53
224 0.5
225 0.44
226 0.37
227 0.33
228 0.27
229 0.23
230 0.17
231 0.11
232 0.13
233 0.15
234 0.14
235 0.17
236 0.17
237 0.16
238 0.18
239 0.21
240 0.19
241 0.2
242 0.22
243 0.22
244 0.31
245 0.39
246 0.44
247 0.48
248 0.49
249 0.48
250 0.56
251 0.63
252 0.65