Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RIB4

Protein Details
Accession G0RIB4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-75SVLQTLKRQNEPPKSPKKNASRGPLSRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-70KSPKKNASR
Subcellular Location(s) mito 11.5, cyto_mito 9.5, extr 8, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045116  Clp1/Grc3  
IPR032319  CLP1_P  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0051731  F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG tre:TRIREDRAFT_61183  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16575  CLP1_P  
Amino Acid Sequences MALDQSVAAVSAISALAARRRLAANTPVREPSSSPEPEESSSARTNSFSVLQTLKRQNEPPKSPKKNASRGPLSRGESRAASLGNRMSGRGLTWGIPDTSSDPSTPDAASSATRVQYSSFLLNKNNCRVTTKGTVALKLRDSERFIVIGSFGIKVSAGEVTIFGATLKPSDAIHWVHAPHCHAIPVIRTSEKVALELHSDSNADGLRRLSRLSPLFRGIWGESKDDSTEATLGKGRTFQIVCSSDDAPKKCVIQELSSPPAWNKKLADLVTVAKNGPLTTLVCGPKSAGKSTFSKMLANRLLTSETAATARAGTHGVAVLDLDPGQPEYAPCGTLSLVHVTRPNLSAAFTHPNLDNDTYKVIRCHALASLTPASAPEHYLECVLDLLDSYRRLLRNCHLLINTPGWILGTGQDLLVDIISRVNPPEVIYMSEDGPADVVEVLRAATKRSFTTLPSQPSEFASRTAAHLRAMQAMSYFHLQNEGKASGGMRSSWNSSPLSSMPPLQVRYSGSGQGIQGILPYDYQTPPELLSQAVNGMILAAVDVEDSKAFRNLASTAASPDENGASAVEGMISRTAEGLPYIPNPNDIALDPRFSRTIGLVLIRGIDTATQTLQVLTPIPLQTIEQIRSQGRQIVLVHGRFDAPTWAYTEDLYHRSQQGDAGAERALQMAGVDPNDEEEEDDEDEVVVASNEEEAAAETDAPPLDPSAGSSTALPWVEVLRGSQKRPVGSRVWRVRRDLGRNVGGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.12
4 0.15
5 0.16
6 0.18
7 0.2
8 0.23
9 0.28
10 0.36
11 0.41
12 0.43
13 0.48
14 0.49
15 0.5
16 0.49
17 0.45
18 0.41
19 0.41
20 0.38
21 0.37
22 0.37
23 0.38
24 0.38
25 0.4
26 0.36
27 0.33
28 0.35
29 0.33
30 0.29
31 0.27
32 0.26
33 0.25
34 0.27
35 0.23
36 0.23
37 0.26
38 0.29
39 0.37
40 0.45
41 0.47
42 0.49
43 0.56
44 0.61
45 0.67
46 0.73
47 0.74
48 0.76
49 0.8
50 0.83
51 0.85
52 0.85
53 0.85
54 0.84
55 0.84
56 0.83
57 0.79
58 0.78
59 0.77
60 0.71
61 0.67
62 0.61
63 0.54
64 0.45
65 0.41
66 0.36
67 0.29
68 0.25
69 0.23
70 0.23
71 0.25
72 0.24
73 0.23
74 0.22
75 0.21
76 0.2
77 0.19
78 0.18
79 0.14
80 0.16
81 0.18
82 0.17
83 0.17
84 0.17
85 0.17
86 0.19
87 0.19
88 0.17
89 0.16
90 0.18
91 0.19
92 0.18
93 0.16
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.14
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.17
102 0.17
103 0.18
104 0.2
105 0.24
106 0.24
107 0.25
108 0.32
109 0.39
110 0.44
111 0.5
112 0.52
113 0.47
114 0.48
115 0.47
116 0.47
117 0.48
118 0.44
119 0.44
120 0.41
121 0.44
122 0.44
123 0.46
124 0.42
125 0.37
126 0.37
127 0.34
128 0.35
129 0.33
130 0.31
131 0.27
132 0.24
133 0.21
134 0.19
135 0.16
136 0.13
137 0.11
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.09
158 0.13
159 0.14
160 0.16
161 0.19
162 0.2
163 0.21
164 0.24
165 0.25
166 0.23
167 0.22
168 0.2
169 0.17
170 0.18
171 0.19
172 0.2
173 0.21
174 0.2
175 0.2
176 0.22
177 0.26
178 0.24
179 0.22
180 0.2
181 0.17
182 0.19
183 0.2
184 0.17
185 0.13
186 0.13
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.11
191 0.1
192 0.11
193 0.13
194 0.13
195 0.15
196 0.14
197 0.2
198 0.25
199 0.28
200 0.3
201 0.31
202 0.31
203 0.31
204 0.33
205 0.27
206 0.28
207 0.26
208 0.25
209 0.22
210 0.23
211 0.23
212 0.19
213 0.18
214 0.13
215 0.13
216 0.1
217 0.11
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.15
222 0.15
223 0.18
224 0.19
225 0.18
226 0.22
227 0.24
228 0.25
229 0.26
230 0.27
231 0.26
232 0.32
233 0.33
234 0.27
235 0.27
236 0.27
237 0.24
238 0.27
239 0.24
240 0.22
241 0.27
242 0.3
243 0.32
244 0.31
245 0.31
246 0.28
247 0.34
248 0.32
249 0.28
250 0.24
251 0.23
252 0.28
253 0.27
254 0.28
255 0.22
256 0.24
257 0.24
258 0.24
259 0.21
260 0.16
261 0.16
262 0.14
263 0.12
264 0.11
265 0.08
266 0.09
267 0.15
268 0.15
269 0.15
270 0.15
271 0.16
272 0.18
273 0.2
274 0.21
275 0.17
276 0.19
277 0.22
278 0.24
279 0.29
280 0.26
281 0.28
282 0.27
283 0.32
284 0.33
285 0.31
286 0.29
287 0.24
288 0.24
289 0.2
290 0.2
291 0.13
292 0.1
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.06
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.14
327 0.14
328 0.15
329 0.15
330 0.15
331 0.11
332 0.11
333 0.11
334 0.12
335 0.16
336 0.15
337 0.16
338 0.16
339 0.17
340 0.18
341 0.19
342 0.17
343 0.13
344 0.15
345 0.15
346 0.15
347 0.14
348 0.14
349 0.13
350 0.13
351 0.13
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.15
356 0.14
357 0.13
358 0.12
359 0.12
360 0.11
361 0.1
362 0.11
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.06
371 0.05
372 0.04
373 0.05
374 0.06
375 0.07
376 0.07
377 0.1
378 0.12
379 0.13
380 0.16
381 0.18
382 0.25
383 0.26
384 0.29
385 0.26
386 0.27
387 0.28
388 0.27
389 0.24
390 0.15
391 0.14
392 0.1
393 0.1
394 0.08
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.03
405 0.04
406 0.04
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.08
413 0.08
414 0.09
415 0.1
416 0.11
417 0.11
418 0.12
419 0.12
420 0.1
421 0.09
422 0.08
423 0.07
424 0.05
425 0.05
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.06
430 0.06
431 0.07
432 0.09
433 0.1
434 0.11
435 0.14
436 0.15
437 0.15
438 0.23
439 0.28
440 0.31
441 0.32
442 0.32
443 0.3
444 0.31
445 0.33
446 0.26
447 0.21
448 0.19
449 0.17
450 0.19
451 0.21
452 0.2
453 0.17
454 0.19
455 0.18
456 0.2
457 0.2
458 0.17
459 0.14
460 0.14
461 0.15
462 0.15
463 0.14
464 0.09
465 0.15
466 0.15
467 0.15
468 0.19
469 0.17
470 0.15
471 0.15
472 0.16
473 0.12
474 0.12
475 0.12
476 0.1
477 0.12
478 0.16
479 0.16
480 0.19
481 0.18
482 0.18
483 0.19
484 0.18
485 0.2
486 0.18
487 0.18
488 0.18
489 0.22
490 0.23
491 0.21
492 0.22
493 0.2
494 0.23
495 0.24
496 0.23
497 0.2
498 0.2
499 0.19
500 0.19
501 0.17
502 0.13
503 0.11
504 0.1
505 0.09
506 0.07
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.11
511 0.11
512 0.11
513 0.12
514 0.13
515 0.12
516 0.11
517 0.11
518 0.1
519 0.09
520 0.09
521 0.07
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.04
526 0.03
527 0.03
528 0.02
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.04
533 0.05
534 0.06
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.1
539 0.1
540 0.12
541 0.14
542 0.14
543 0.14
544 0.16
545 0.16
546 0.14
547 0.14
548 0.12
549 0.1
550 0.09
551 0.08
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.07
563 0.06
564 0.07
565 0.08
566 0.08
567 0.12
568 0.15
569 0.15
570 0.16
571 0.17
572 0.17
573 0.17
574 0.16
575 0.18
576 0.16
577 0.19
578 0.19
579 0.2
580 0.2
581 0.19
582 0.2
583 0.16
584 0.16
585 0.15
586 0.15
587 0.14
588 0.13
589 0.14
590 0.13
591 0.12
592 0.1
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.08
598 0.08
599 0.09
600 0.09
601 0.09
602 0.1
603 0.1
604 0.13
605 0.13
606 0.13
607 0.13
608 0.13
609 0.18
610 0.22
611 0.22
612 0.21
613 0.25
614 0.26
615 0.28
616 0.29
617 0.3
618 0.25
619 0.28
620 0.26
621 0.3
622 0.35
623 0.35
624 0.34
625 0.3
626 0.3
627 0.25
628 0.25
629 0.21
630 0.16
631 0.15
632 0.16
633 0.17
634 0.16
635 0.17
636 0.19
637 0.19
638 0.21
639 0.23
640 0.24
641 0.25
642 0.26
643 0.26
644 0.26
645 0.24
646 0.25
647 0.23
648 0.2
649 0.18
650 0.17
651 0.17
652 0.16
653 0.12
654 0.08
655 0.07
656 0.08
657 0.1
658 0.1
659 0.1
660 0.09
661 0.12
662 0.13
663 0.13
664 0.11
665 0.11
666 0.13
667 0.14
668 0.14
669 0.12
670 0.11
671 0.11
672 0.1
673 0.09
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.06
682 0.07
683 0.08
684 0.08
685 0.08
686 0.11
687 0.11
688 0.11
689 0.1
690 0.09
691 0.1
692 0.1
693 0.12
694 0.15
695 0.16
696 0.16
697 0.16
698 0.16
699 0.2
700 0.2
701 0.18
702 0.14
703 0.14
704 0.15
705 0.15
706 0.16
707 0.21
708 0.26
709 0.29
710 0.34
711 0.38
712 0.42
713 0.46
714 0.5
715 0.49
716 0.53
717 0.62
718 0.67
719 0.73
720 0.73
721 0.75
722 0.78
723 0.79
724 0.78
725 0.76
726 0.74