Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0R7E6

Protein Details
Accession G0R7E6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
133-152ESEKWDKRMKKKGAHRDNNABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-144KKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG tre:TRIREDRAFT_54852  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MEESKPVEALEEPQPVEAAEESQPVKDAEAPQPVQPAPEATAEESKKSEEDAAAKAKDRMARFKALQARAKKSSETNFKEATLESQRLSTNPSELTALHRRHAIASHKLLKADTEEAGEDFERKRAWDWTVDESEKWDKRMKKKGAHRDNNAFQDYHQEANKSYKRQLRNVNVDLEKYEKQKMAAIEKAAASGGLDIVETEDGELIAVDKDGTFYSTADTTSFAQNKPDKEAVDRLVKDLQRAEEVRLKKRKERMAQNGEDGDVTYINEKNKQFNQKLSRFYNKYTAEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.22
3 0.23
4 0.19
5 0.15
6 0.12
7 0.16
8 0.16
9 0.16
10 0.18
11 0.16
12 0.17
13 0.19
14 0.22
15 0.23
16 0.31
17 0.32
18 0.32
19 0.37
20 0.36
21 0.33
22 0.29
23 0.25
24 0.19
25 0.2
26 0.2
27 0.18
28 0.26
29 0.26
30 0.27
31 0.26
32 0.25
33 0.23
34 0.23
35 0.22
36 0.17
37 0.19
38 0.22
39 0.27
40 0.28
41 0.29
42 0.29
43 0.31
44 0.34
45 0.34
46 0.38
47 0.36
48 0.41
49 0.4
50 0.46
51 0.52
52 0.54
53 0.59
54 0.58
55 0.61
56 0.6
57 0.6
58 0.55
59 0.52
60 0.53
61 0.56
62 0.55
63 0.53
64 0.49
65 0.47
66 0.46
67 0.4
68 0.37
69 0.32
70 0.27
71 0.22
72 0.23
73 0.23
74 0.21
75 0.25
76 0.2
77 0.16
78 0.15
79 0.15
80 0.14
81 0.14
82 0.2
83 0.25
84 0.26
85 0.25
86 0.26
87 0.26
88 0.26
89 0.31
90 0.3
91 0.28
92 0.34
93 0.4
94 0.39
95 0.4
96 0.38
97 0.34
98 0.31
99 0.26
100 0.19
101 0.13
102 0.12
103 0.11
104 0.12
105 0.11
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.13
113 0.14
114 0.18
115 0.2
116 0.24
117 0.28
118 0.28
119 0.27
120 0.27
121 0.33
122 0.29
123 0.29
124 0.3
125 0.31
126 0.39
127 0.49
128 0.54
129 0.55
130 0.64
131 0.72
132 0.77
133 0.8
134 0.79
135 0.77
136 0.75
137 0.71
138 0.63
139 0.52
140 0.41
141 0.38
142 0.33
143 0.27
144 0.22
145 0.17
146 0.17
147 0.26
148 0.3
149 0.26
150 0.31
151 0.35
152 0.39
153 0.45
154 0.54
155 0.54
156 0.58
157 0.58
158 0.59
159 0.54
160 0.5
161 0.43
162 0.38
163 0.32
164 0.25
165 0.26
166 0.2
167 0.19
168 0.22
169 0.24
170 0.25
171 0.25
172 0.23
173 0.22
174 0.21
175 0.21
176 0.18
177 0.15
178 0.1
179 0.07
180 0.06
181 0.04
182 0.04
183 0.03
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.17
209 0.2
210 0.19
211 0.26
212 0.3
213 0.31
214 0.36
215 0.38
216 0.32
217 0.33
218 0.38
219 0.36
220 0.41
221 0.39
222 0.36
223 0.4
224 0.39
225 0.38
226 0.36
227 0.33
228 0.3
229 0.31
230 0.33
231 0.33
232 0.38
233 0.45
234 0.51
235 0.54
236 0.56
237 0.63
238 0.69
239 0.71
240 0.76
241 0.78
242 0.79
243 0.79
244 0.77
245 0.7
246 0.61
247 0.51
248 0.41
249 0.3
250 0.21
251 0.16
252 0.12
253 0.14
254 0.16
255 0.22
256 0.23
257 0.3
258 0.38
259 0.48
260 0.5
261 0.57
262 0.65
263 0.66
264 0.73
265 0.73
266 0.76
267 0.7
268 0.7
269 0.7
270 0.62
271 0.61
272 0.57
273 0.54
274 0.5
275 0.48
276 0.47
277 0.44
278 0.43
279 0.38