FuNGI

G0R993

Protein Details

Accession

G0R993

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
459-485	EEERMGRGERSKKKRRFRSLSPLARGG	Basic
542-565	CGYFYERDRRLPRQTKNLHLQDIR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
464-477	GRGERSKKKRRFRS

Subcellular Location(s)

mito 18, cyto 4.5, cyto_nucl 4.5, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006939 SNF5 IPR013088 Znf_NHR/GATA
Gene Ontology	GO:0000228 C:nuclear chromosome GO:0070603 C:SWI/SNF superfamily-type complex GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006338 P:chromatin remodeling GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
KEGG	tre:TRIREDRAFT_54598 -
Pfam	View protein in Pfam PF04855 SNF5

Amino Acid Sequences

MERSKPQAFLSSYAPRLRTYNNSLLTPVLPSAPTGPVSRTTKRGTTIINYAEDGYDDLDDDSDDTRRRPTGLRSLRKEDSVSRQDLADKVGKEIKEPVEVQGIWRDWMGKSRSVRSDQQNAAQAHLPLTLIPIRIDLDIPSFIPPAPFPAPNPNSVDISLPQYRPQEMTVPYKLRDIFCWNLHETLITTDQFAQTLAQDLDLPNRPAVIAEISKQIRTQLEEYAGVALHPLFHTEPIFKSRDDSPASFARGVSRPETPIQTGGQATPTPQPQTSQAPDVTAEATPILPDSDDYNPDDTYRCIINLSLNLSSMLYTDKFEWSLLHPPGTAEAFAKATCADLGLAGEWVPAMTHAIYEAVLRLKKEACEAGGLVGGWGGAQQELPNDAAHGQEAGWRYDPDHLADEWEPKVEFLSKEEMEKREGDRERQIRRLRRETARFSSTTGMMGGTPFGAGTAVEAEEERMGRGERSKKKRRFRSLSPLARGGTPLGRLTPDVGGYGGGVGALTDMERMTWRCSHCRTWGTSVWAVRDGPAGPKSLCANCGYFYERDRRLPRQTKNLHLQDIRAV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.41
3	0.42
4	0.44
5	0.45
6	0.45
7	0.48
8	0.47
9	0.47
10	0.46
11	0.45
12	0.4
13	0.34
14	0.26
15	0.19
16	0.15
17	0.15
18	0.16
19	0.17
20	0.18
21	0.18
22	0.19
23	0.26
24	0.32
25	0.36
26	0.4
27	0.43
28	0.45
29	0.47
30	0.5
31	0.46
32	0.45
33	0.48
34	0.46
35	0.43
36	0.39
37	0.36
38	0.31
39	0.27
40	0.22
41	0.16
42	0.11
43	0.09
44	0.09
45	0.08
46	0.08
47	0.08
48	0.09
49	0.12
50	0.14
51	0.15
52	0.19
53	0.2
54	0.23
55	0.26
56	0.32
57	0.39
58	0.48
59	0.57
60	0.61
61	0.68
62	0.68
63	0.67
64	0.63
65	0.59
66	0.58
67	0.55
68	0.51
69	0.43
70	0.41
71	0.41
72	0.38
73	0.36
74	0.32
75	0.25
76	0.26
77	0.3
78	0.29
79	0.28
80	0.33
81	0.31
82	0.31
83	0.31
84	0.29
85	0.3
86	0.3
87	0.3
88	0.31
89	0.29
90	0.24
91	0.24
92	0.23
93	0.17
94	0.25
95	0.27
96	0.26
97	0.3
98	0.37
99	0.43
100	0.47
101	0.54
102	0.54
103	0.6
104	0.57
105	0.58
106	0.59
107	0.53
108	0.5
109	0.44
110	0.37
111	0.28
112	0.26
113	0.2
114	0.12
115	0.14
116	0.14
117	0.12
118	0.11
119	0.12
120	0.12
121	0.13
122	0.13
123	0.11
124	0.11
125	0.11
126	0.12
127	0.12
128	0.12
129	0.11
130	0.12
131	0.11
132	0.14
133	0.17
134	0.17
135	0.17
136	0.27
137	0.29
138	0.32
139	0.36
140	0.33
141	0.31
142	0.31
143	0.31
144	0.22
145	0.26
146	0.27
147	0.23
148	0.25
149	0.26
150	0.26
151	0.26
152	0.26
153	0.26
154	0.25
155	0.31
156	0.34
157	0.35
158	0.35
159	0.38
160	0.39
161	0.34
162	0.33
163	0.33
164	0.31
165	0.3
166	0.34
167	0.31
168	0.29
169	0.28
170	0.26
171	0.2
172	0.18
173	0.18
174	0.13
175	0.13
176	0.13
177	0.13
178	0.13
179	0.12
180	0.1
181	0.07
182	0.1
183	0.09
184	0.08
185	0.09
186	0.09
187	0.13
188	0.16
189	0.17
190	0.14
191	0.14
192	0.14
193	0.13
194	0.14
195	0.12
196	0.09
197	0.1
198	0.17
199	0.17
200	0.18
201	0.18
202	0.2
203	0.18
204	0.2
205	0.2
206	0.16
207	0.17
208	0.17
209	0.17
210	0.15
211	0.14
212	0.11
213	0.09
214	0.07
215	0.05
216	0.05
217	0.06
218	0.06
219	0.07
220	0.08
221	0.09
222	0.11
223	0.14
224	0.16
225	0.15
226	0.17
227	0.18
228	0.23
229	0.26
230	0.25
231	0.25
232	0.27
233	0.29
234	0.27
235	0.25
236	0.23
237	0.22
238	0.23
239	0.21
240	0.19
241	0.19
242	0.2
243	0.22
244	0.19
245	0.18
246	0.16
247	0.16
248	0.15
249	0.13
250	0.13
251	0.11
252	0.12
253	0.13
254	0.14
255	0.14
256	0.14
257	0.15
258	0.16
259	0.21
260	0.21
261	0.21
262	0.19
263	0.18
264	0.18
265	0.18
266	0.16
267	0.11
268	0.09
269	0.07
270	0.06
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.03
275	0.04
276	0.06
277	0.07
278	0.09
279	0.1
280	0.11
281	0.12
282	0.12
283	0.13
284	0.11
285	0.11
286	0.1
287	0.09
288	0.08
289	0.08
290	0.09
291	0.1
292	0.12
293	0.11
294	0.11
295	0.11
296	0.1
297	0.1
298	0.09
299	0.08
300	0.07
301	0.07
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.09
306	0.1
307	0.11
308	0.17
309	0.18
310	0.17
311	0.16
312	0.16
313	0.17
314	0.17
315	0.15
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.07
322	0.07
323	0.06
324	0.06
325	0.05
326	0.04
327	0.05
328	0.04
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.03
334	0.03
335	0.03
336	0.04
337	0.03
338	0.03
339	0.04
340	0.04
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.09
345	0.1
346	0.11
347	0.13
348	0.14
349	0.14
350	0.16
351	0.16
352	0.13
353	0.14
354	0.14
355	0.12
356	0.12
357	0.11
358	0.08
359	0.07
360	0.06
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.04
367	0.05
368	0.06
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.07
373	0.07
374	0.07
375	0.07
376	0.06
377	0.08
378	0.1
379	0.11
380	0.13
381	0.13
382	0.14
383	0.18
384	0.19
385	0.18
386	0.19
387	0.17
388	0.19
389	0.2
390	0.23
391	0.18
392	0.19
393	0.17
394	0.14
395	0.16
396	0.15
397	0.14
398	0.13
399	0.2
400	0.19
401	0.24
402	0.29
403	0.29
404	0.29
405	0.31
406	0.31
407	0.34
408	0.37
409	0.36
410	0.41
411	0.48
412	0.52
413	0.58
414	0.65
415	0.65
416	0.71
417	0.75
418	0.74
419	0.76
420	0.78
421	0.77
422	0.76
423	0.72
424	0.63
425	0.57
426	0.52
427	0.42
428	0.34
429	0.26
430	0.19
431	0.13
432	0.13
433	0.1
434	0.07
435	0.06
436	0.05
437	0.05
438	0.04
439	0.04
440	0.04
441	0.05
442	0.05
443	0.06
444	0.06
445	0.07
446	0.08
447	0.09
448	0.08
449	0.09
450	0.1
451	0.11
452	0.19
453	0.28
454	0.37
455	0.48
456	0.58
457	0.67
458	0.77
459	0.86
460	0.9
461	0.89
462	0.89
463	0.89
464	0.9
465	0.9
466	0.85
467	0.8
468	0.7
469	0.61
470	0.53
471	0.44
472	0.36
473	0.28
474	0.23
475	0.19
476	0.19
477	0.18
478	0.19
479	0.18
480	0.16
481	0.14
482	0.13
483	0.11
484	0.1
485	0.1
486	0.07
487	0.05
488	0.04
489	0.04
490	0.03
491	0.03
492	0.03
493	0.04
494	0.04
495	0.05
496	0.08
497	0.1
498	0.14
499	0.2
500	0.25
501	0.32
502	0.38
503	0.43
504	0.49
505	0.54
506	0.56
507	0.58
508	0.59
509	0.58
510	0.58
511	0.56
512	0.5
513	0.47
514	0.41
515	0.35
516	0.32
517	0.26
518	0.26
519	0.25
520	0.25
521	0.22
522	0.25
523	0.29
524	0.29
525	0.31
526	0.28
527	0.28
528	0.25
529	0.29
530	0.3
531	0.28
532	0.3
533	0.37
534	0.39
535	0.47
536	0.53
537	0.57
538	0.64
539	0.71
540	0.75
541	0.77
542	0.8
543	0.81
544	0.84
545	0.84
546	0.82
547	0.74

G0R993

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer