Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RWJ4

Protein Details
Accession G0RWJ4    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-50IDSPPQNKHGRSRSRSPNLFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
322-330RPRSPIRRS
365-384TAAKAAEKERKRLEKEQLKE
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 5.5, cyto_mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042530  EME1/EME2_C  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
IPR047521  XPF_nuclease_EME1_ascomycetes  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
KEGG tre:TRIREDRAFT_112233  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20085  XPF_nuclease_Mms4  
Amino Acid Sequences MAPQVIDLISSSPSLPAREASPLASSPIAIDSPPQNKHGRSRSRSPNLFVTSDLDITDDEFGRRDARTAKRLRISETESLPASVSRAPQPPFLSATSNRPSRVEFDPIEFTSSLELDTPKIQHHAGAASNALRLDQTHQAPPNTGLSSDPFASSPPPPPPPLAAAEPKSRPSQRSTTDVTDPFASSPLPPHNPLAATPPVVRVARAARERPESAHPLPSDVGSPDPFASSPDANVPQPAKVSTSRRAVSVEVADQPWGRRHWDPISSSAPEQTPRISPAKRSLAEPRDAGPVVISIDSDSAGTSDDEFPDIANLGASSFRPRPRSPIRRSRSDVISSRSSRPRAATSAATAKTAEQRARDKEAQTAAKAAEKERKRLEKEQLKEAKALEKERATALAEVNKVRTDKKVSTPEMILNMPSGIAEGLKVQLETLLDGLTVEHTTWNSPVANAFKWQRKVRSRFDEEMGHWEPVPLRVMPEKHVLILMTADEFVGMAVDDTVDSTVSQAKRHFPGHELIYLLEGMNLWVRKNRNIRNRRFTSGVRAQDQPPPEAMAASSSSTTTTTATTAPAVPRRRRRNAAAEEYIAEDIVEDAMLHLQIEHDVLIHHTAVPLESAQWIVAFTQHISTIPYKKMRDKMTSAAGFCMESGQVRTGDDARDTYVRMLQEIARVTAPIAYGIVSEFDSVSKLVTGLEQGGPLALESVRKSLNKDGVASERTVGQADKCRDRIDVTSEVRDSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.17
4 0.18
5 0.22
6 0.23
7 0.22
8 0.23
9 0.23
10 0.24
11 0.23
12 0.2
13 0.16
14 0.17
15 0.16
16 0.12
17 0.15
18 0.2
19 0.27
20 0.3
21 0.34
22 0.38
23 0.42
24 0.52
25 0.59
26 0.63
27 0.63
28 0.7
29 0.76
30 0.81
31 0.83
32 0.78
33 0.77
34 0.71
35 0.65
36 0.56
37 0.48
38 0.4
39 0.34
40 0.29
41 0.21
42 0.15
43 0.15
44 0.17
45 0.14
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.15
50 0.15
51 0.18
52 0.24
53 0.31
54 0.4
55 0.47
56 0.55
57 0.61
58 0.63
59 0.65
60 0.64
61 0.63
62 0.6
63 0.56
64 0.51
65 0.43
66 0.41
67 0.36
68 0.28
69 0.24
70 0.19
71 0.19
72 0.21
73 0.26
74 0.28
75 0.33
76 0.35
77 0.35
78 0.36
79 0.35
80 0.35
81 0.32
82 0.38
83 0.41
84 0.43
85 0.42
86 0.4
87 0.4
88 0.38
89 0.39
90 0.38
91 0.32
92 0.32
93 0.36
94 0.35
95 0.37
96 0.33
97 0.29
98 0.23
99 0.22
100 0.17
101 0.13
102 0.13
103 0.11
104 0.14
105 0.15
106 0.15
107 0.18
108 0.18
109 0.17
110 0.18
111 0.2
112 0.18
113 0.18
114 0.19
115 0.17
116 0.18
117 0.17
118 0.15
119 0.12
120 0.11
121 0.14
122 0.18
123 0.2
124 0.26
125 0.3
126 0.31
127 0.33
128 0.34
129 0.35
130 0.29
131 0.26
132 0.21
133 0.19
134 0.21
135 0.2
136 0.19
137 0.14
138 0.14
139 0.17
140 0.18
141 0.2
142 0.23
143 0.26
144 0.27
145 0.29
146 0.3
147 0.3
148 0.32
149 0.32
150 0.33
151 0.33
152 0.38
153 0.39
154 0.4
155 0.45
156 0.45
157 0.43
158 0.42
159 0.46
160 0.44
161 0.47
162 0.49
163 0.47
164 0.5
165 0.48
166 0.44
167 0.37
168 0.34
169 0.28
170 0.23
171 0.19
172 0.12
173 0.15
174 0.2
175 0.22
176 0.23
177 0.24
178 0.26
179 0.26
180 0.26
181 0.28
182 0.23
183 0.22
184 0.21
185 0.21
186 0.23
187 0.22
188 0.22
189 0.19
190 0.21
191 0.26
192 0.31
193 0.33
194 0.33
195 0.38
196 0.39
197 0.4
198 0.42
199 0.41
200 0.38
201 0.41
202 0.36
203 0.33
204 0.32
205 0.29
206 0.25
207 0.18
208 0.18
209 0.13
210 0.14
211 0.11
212 0.12
213 0.11
214 0.11
215 0.14
216 0.12
217 0.12
218 0.15
219 0.17
220 0.16
221 0.19
222 0.19
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.17
227 0.2
228 0.25
229 0.28
230 0.35
231 0.34
232 0.35
233 0.36
234 0.33
235 0.3
236 0.27
237 0.23
238 0.18
239 0.18
240 0.18
241 0.17
242 0.17
243 0.19
244 0.18
245 0.19
246 0.18
247 0.23
248 0.26
249 0.31
250 0.31
251 0.33
252 0.36
253 0.34
254 0.33
255 0.31
256 0.28
257 0.24
258 0.23
259 0.19
260 0.16
261 0.18
262 0.24
263 0.22
264 0.24
265 0.31
266 0.38
267 0.37
268 0.39
269 0.44
270 0.43
271 0.45
272 0.43
273 0.36
274 0.33
275 0.32
276 0.28
277 0.19
278 0.15
279 0.12
280 0.11
281 0.09
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.05
304 0.09
305 0.13
306 0.16
307 0.22
308 0.22
309 0.31
310 0.41
311 0.51
312 0.56
313 0.63
314 0.65
315 0.69
316 0.74
317 0.71
318 0.65
319 0.61
320 0.56
321 0.5
322 0.52
323 0.46
324 0.47
325 0.47
326 0.44
327 0.39
328 0.37
329 0.35
330 0.3
331 0.3
332 0.25
333 0.22
334 0.27
335 0.25
336 0.23
337 0.21
338 0.19
339 0.21
340 0.23
341 0.22
342 0.19
343 0.24
344 0.27
345 0.33
346 0.36
347 0.32
348 0.33
349 0.36
350 0.34
351 0.29
352 0.27
353 0.21
354 0.21
355 0.21
356 0.19
357 0.22
358 0.22
359 0.27
360 0.32
361 0.39
362 0.41
363 0.47
364 0.56
365 0.56
366 0.57
367 0.62
368 0.63
369 0.57
370 0.53
371 0.48
372 0.43
373 0.38
374 0.36
375 0.3
376 0.23
377 0.23
378 0.21
379 0.21
380 0.17
381 0.15
382 0.14
383 0.15
384 0.16
385 0.15
386 0.16
387 0.17
388 0.16
389 0.16
390 0.18
391 0.2
392 0.21
393 0.28
394 0.36
395 0.36
396 0.38
397 0.38
398 0.37
399 0.34
400 0.31
401 0.23
402 0.15
403 0.13
404 0.1
405 0.08
406 0.07
407 0.04
408 0.04
409 0.03
410 0.04
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.05
420 0.04
421 0.04
422 0.05
423 0.04
424 0.05
425 0.04
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.06
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.1
434 0.12
435 0.13
436 0.16
437 0.21
438 0.26
439 0.33
440 0.38
441 0.44
442 0.52
443 0.59
444 0.64
445 0.68
446 0.69
447 0.66
448 0.65
449 0.61
450 0.52
451 0.52
452 0.45
453 0.36
454 0.28
455 0.26
456 0.23
457 0.19
458 0.2
459 0.12
460 0.12
461 0.15
462 0.17
463 0.19
464 0.24
465 0.22
466 0.21
467 0.21
468 0.19
469 0.15
470 0.14
471 0.12
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.05
476 0.04
477 0.04
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.02
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.1
490 0.11
491 0.14
492 0.16
493 0.2
494 0.25
495 0.28
496 0.29
497 0.26
498 0.31
499 0.31
500 0.3
501 0.26
502 0.22
503 0.2
504 0.19
505 0.16
506 0.11
507 0.08
508 0.06
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.14
513 0.16
514 0.24
515 0.33
516 0.42
517 0.49
518 0.59
519 0.69
520 0.75
521 0.79
522 0.76
523 0.72
524 0.65
525 0.64
526 0.63
527 0.59
528 0.51
529 0.49
530 0.46
531 0.46
532 0.46
533 0.38
534 0.3
535 0.26
536 0.22
537 0.19
538 0.17
539 0.13
540 0.12
541 0.12
542 0.11
543 0.09
544 0.1
545 0.1
546 0.11
547 0.1
548 0.09
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.11
553 0.13
554 0.17
555 0.24
556 0.32
557 0.4
558 0.5
559 0.59
560 0.67
561 0.71
562 0.74
563 0.77
564 0.77
565 0.78
566 0.72
567 0.64
568 0.56
569 0.51
570 0.44
571 0.33
572 0.23
573 0.14
574 0.09
575 0.07
576 0.06
577 0.03
578 0.04
579 0.05
580 0.05
581 0.05
582 0.04
583 0.05
584 0.05
585 0.06
586 0.05
587 0.05
588 0.05
589 0.07
590 0.08
591 0.08
592 0.08
593 0.08
594 0.09
595 0.09
596 0.09
597 0.08
598 0.07
599 0.08
600 0.08
601 0.07
602 0.07
603 0.07
604 0.07
605 0.08
606 0.09
607 0.09
608 0.1
609 0.1
610 0.1
611 0.14
612 0.18
613 0.22
614 0.28
615 0.35
616 0.39
617 0.46
618 0.53
619 0.57
620 0.6
621 0.6
622 0.59
623 0.62
624 0.62
625 0.55
626 0.49
627 0.42
628 0.35
629 0.3
630 0.25
631 0.15
632 0.12
633 0.13
634 0.13
635 0.13
636 0.13
637 0.16
638 0.17
639 0.18
640 0.19
641 0.18
642 0.19
643 0.2
644 0.21
645 0.2
646 0.22
647 0.2
648 0.19
649 0.2
650 0.18
651 0.22
652 0.22
653 0.22
654 0.19
655 0.19
656 0.18
657 0.18
658 0.16
659 0.12
660 0.1
661 0.08
662 0.08
663 0.08
664 0.09
665 0.08
666 0.08
667 0.08
668 0.08
669 0.09
670 0.09
671 0.09
672 0.08
673 0.08
674 0.08
675 0.08
676 0.09
677 0.11
678 0.12
679 0.12
680 0.11
681 0.11
682 0.11
683 0.1
684 0.1
685 0.08
686 0.1
687 0.11
688 0.15
689 0.2
690 0.21
691 0.26
692 0.32
693 0.39
694 0.39
695 0.4
696 0.41
697 0.44
698 0.45
699 0.42
700 0.35
701 0.29
702 0.28
703 0.27
704 0.23
705 0.21
706 0.28
707 0.34
708 0.42
709 0.43
710 0.44
711 0.44
712 0.46
713 0.46
714 0.43
715 0.45
716 0.41
717 0.45