FuNGI

G0RTQ6

Protein Details

Accession

G0RTQ6

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
28-49	TDPRFRLPSRKHTKTTVDKRFA	Hydrophilic
64-84	DKYGRKIKSDSKKKALQRLEE	Basic
466-496	ETTIEKYARKERERKEKKRQAAKAKREALNG	Basic
537-561	APATKSSIRKEERRKKREAREAAAA	Hydrophilic
594-623	EILRAEKQKGKKAKYQKKKKGKGAGDAPAG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
3-10	KRKGKKKT
419-420	RR
471-492	KYARKERERKEKKRQAAKAKRE
544-556	IRKEERRKKREAR
599-617	EKQKGKKAKYQKKKKGKGA
667-694	EGRKKRKMAVGGDEEDQPRDKKSKKGRR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039754 Esf1 IPR012580 NUC153
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0003723 F:RNA binding GO:0006364 P:rRNA processing
KEGG	tre:TRIREDRAFT_68184 -
Pfam	View protein in Pfam PF08159 NUC153

Amino Acid Sequences

MDKRKGKKKTGGAAPAPISDERFASFQTDPRFRLPSRKHTKTTVDKRFAGILKDDDFTATAKVDKYGRKIKSDSKKKALQRLEEDEEEEEDIEVEDDKVVERELRAASRSRKYDPAREGGFSSSEDSDSDSDSEESVLDLATGGDMQRLEQEEIKTGEVTTRIAVVNLDWDHVKSTDLMALFSSFIPANDGGKVLNVAIYPSEFGKERMQQEELEGPPRQLFKRGKKDEESDDDESVSDSEAEEAAIKKKLIQEGDDQDFDSDALRAYQLDRLRYYYAVMTCSSKSTAQAIYEATDGTEYQASSNFIDLRFVPDDVTFDDEPRDQCDKVPESYKPIEFVTNALQSSKVKLTWDMHPEEINRKESIKRAFKGSRAEIDEQDLKAYLAGDSESDEDEEDDADAGDAAADGEPKLSKKELARRKMREALGLAAEPEATKKSKDAPVGEMEVTFTPALSGEKAKKEDREETTIEKYARKERERKEKKRQAAKAKREALNGGKDDSDDDDDDVHVVHGGGGDDEDGEDLGFNDPFFTTADPAPATKSSIRKEERRKKREAREAAAALDAQEKAHLAKVMAEDKNDSNQAEHLDHFDMNEILRAEKQKGKKAKYQKKKKGKGAGDAPAGLQEDFEIDVKDERFKAVFDSHEFAIDPSNPKFKATEGMKKLLDEGRKKRKMAVGGDEEDQPRDKKSKKGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.63
3	0.56
4	0.47
5	0.4
6	0.31
7	0.27
8	0.21
9	0.2
10	0.18
11	0.2
12	0.2
13	0.23
14	0.31
15	0.37
16	0.38
17	0.42
18	0.47
19	0.45
20	0.54
21	0.57
22	0.59
23	0.63
24	0.69
25	0.7
26	0.71
27	0.8
28	0.8
29	0.83
30	0.82
31	0.8
32	0.73
33	0.7
34	0.69
35	0.62
36	0.54
37	0.48
38	0.41
39	0.36
40	0.34
41	0.32
42	0.25
43	0.23
44	0.21
45	0.18
46	0.14
47	0.14
48	0.14
49	0.17
50	0.22
51	0.26
52	0.34
53	0.42
54	0.45
55	0.5
56	0.55
57	0.62
58	0.67
59	0.73
60	0.75
61	0.75
62	0.79
63	0.8
64	0.84
65	0.82
66	0.8
67	0.77
68	0.76
69	0.73
70	0.66
71	0.6
72	0.51
73	0.44
74	0.36
75	0.27
76	0.19
77	0.12
78	0.11
79	0.09
80	0.08
81	0.07
82	0.06
83	0.06
84	0.07
85	0.07
86	0.08
87	0.09
88	0.09
89	0.13
90	0.16
91	0.18
92	0.2
93	0.27
94	0.34
95	0.41
96	0.45
97	0.45
98	0.52
99	0.56
100	0.62
101	0.61
102	0.62
103	0.57
104	0.54
105	0.51
106	0.44
107	0.39
108	0.31
109	0.28
110	0.2
111	0.18
112	0.16
113	0.16
114	0.15
115	0.15
116	0.14
117	0.13
118	0.12
119	0.12
120	0.12
121	0.1
122	0.09
123	0.08
124	0.07
125	0.05
126	0.05
127	0.04
128	0.04
129	0.04
130	0.04
131	0.06
132	0.06
133	0.06
134	0.09
135	0.12
136	0.14
137	0.17
138	0.18
139	0.21
140	0.23
141	0.23
142	0.21
143	0.18
144	0.18
145	0.15
146	0.15
147	0.12
148	0.12
149	0.11
150	0.11
151	0.11
152	0.09
153	0.14
154	0.14
155	0.14
156	0.12
157	0.13
158	0.14
159	0.14
160	0.15
161	0.09
162	0.1
163	0.12
164	0.11
165	0.11
166	0.1
167	0.1
168	0.11
169	0.1
170	0.11
171	0.08
172	0.08
173	0.1
174	0.1
175	0.11
176	0.1
177	0.11
178	0.09
179	0.09
180	0.1
181	0.07
182	0.08
183	0.07
184	0.06
185	0.06
186	0.07
187	0.07
188	0.07
189	0.09
190	0.08
191	0.11
192	0.16
193	0.21
194	0.24
195	0.27
196	0.28
197	0.27
198	0.29
199	0.32
200	0.28
201	0.27
202	0.25
203	0.22
204	0.23
205	0.26
206	0.24
207	0.27
208	0.34
209	0.4
210	0.51
211	0.57
212	0.61
213	0.63
214	0.68
215	0.66
216	0.64
217	0.61
218	0.53
219	0.46
220	0.4
221	0.34
222	0.3
223	0.23
224	0.16
225	0.09
226	0.06
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.06
231	0.07
232	0.09
233	0.11
234	0.11
235	0.12
236	0.16
237	0.19
238	0.19
239	0.2
240	0.25
241	0.29
242	0.33
243	0.31
244	0.28
245	0.25
246	0.23
247	0.21
248	0.15
249	0.09
250	0.06
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.06
255	0.11
256	0.13
257	0.15
258	0.16
259	0.19
260	0.2
261	0.2
262	0.2
263	0.19
264	0.17
265	0.16
266	0.16
267	0.16
268	0.15
269	0.16
270	0.16
271	0.13
272	0.13
273	0.14
274	0.15
275	0.13
276	0.14
277	0.13
278	0.12
279	0.12
280	0.11
281	0.09
282	0.07
283	0.07
284	0.06
285	0.07
286	0.06
287	0.06
288	0.08
289	0.09
290	0.09
291	0.1
292	0.1
293	0.09
294	0.1
295	0.1
296	0.13
297	0.13
298	0.13
299	0.12
300	0.11
301	0.12
302	0.12
303	0.16
304	0.12
305	0.11
306	0.13
307	0.13
308	0.14
309	0.17
310	0.2
311	0.15
312	0.16
313	0.21
314	0.22
315	0.23
316	0.26
317	0.22
318	0.26
319	0.29
320	0.28
321	0.24
322	0.22
323	0.21
324	0.18
325	0.18
326	0.16
327	0.15
328	0.15
329	0.13
330	0.14
331	0.13
332	0.15
333	0.15
334	0.12
335	0.1
336	0.13
337	0.16
338	0.19
339	0.24
340	0.24
341	0.23
342	0.25
343	0.25
344	0.29
345	0.3
346	0.27
347	0.23
348	0.22
349	0.24
350	0.27
351	0.35
352	0.36
353	0.34
354	0.4
355	0.42
356	0.44
357	0.49
358	0.46
359	0.43
360	0.4
361	0.41
362	0.33
363	0.34
364	0.33
365	0.26
366	0.24
367	0.18
368	0.14
369	0.12
370	0.11
371	0.07
372	0.05
373	0.05
374	0.04
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.05
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.04
396	0.05
397	0.05
398	0.07
399	0.08
400	0.11
401	0.16
402	0.26
403	0.35
404	0.44
405	0.54
406	0.58
407	0.64
408	0.69
409	0.64
410	0.59
411	0.51
412	0.44
413	0.36
414	0.3
415	0.23
416	0.15
417	0.14
418	0.1
419	0.09
420	0.09
421	0.08
422	0.08
423	0.09
424	0.15
425	0.19
426	0.24
427	0.25
428	0.26
429	0.29
430	0.31
431	0.31
432	0.25
433	0.22
434	0.17
435	0.17
436	0.13
437	0.09
438	0.06
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.11
443	0.13
444	0.18
445	0.23
446	0.26
447	0.29
448	0.34
449	0.4
450	0.41
451	0.43
452	0.41
453	0.42
454	0.43
455	0.44
456	0.4
457	0.36
458	0.35
459	0.38
460	0.44
461	0.47
462	0.52
463	0.56
464	0.66
465	0.74
466	0.81
467	0.84
468	0.85
469	0.88
470	0.89
471	0.89
472	0.89
473	0.89
474	0.89
475	0.88
476	0.87
477	0.81
478	0.72
479	0.68
480	0.62
481	0.58
482	0.49
483	0.4
484	0.32
485	0.28
486	0.26
487	0.24
488	0.21
489	0.14
490	0.13
491	0.12
492	0.12
493	0.12
494	0.11
495	0.09
496	0.06
497	0.05
498	0.05
499	0.05
500	0.05
501	0.05
502	0.05
503	0.05
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.06
516	0.07
517	0.08
518	0.08
519	0.09
520	0.1
521	0.13
522	0.13
523	0.13
524	0.15
525	0.15
526	0.18
527	0.2
528	0.26
529	0.28
530	0.37
531	0.43
532	0.5
533	0.61
534	0.68
535	0.75
536	0.76
537	0.83
538	0.84
539	0.88
540	0.89
541	0.87
542	0.82
543	0.8
544	0.74
545	0.64
546	0.55
547	0.44
548	0.34
549	0.28
550	0.22
551	0.13
552	0.11
553	0.1
554	0.1
555	0.12
556	0.13
557	0.1
558	0.13
559	0.18
560	0.25
561	0.26
562	0.27
563	0.27
564	0.28
565	0.32
566	0.31
567	0.27
568	0.21
569	0.21
570	0.24
571	0.23
572	0.21
573	0.2
574	0.2
575	0.2
576	0.19
577	0.18
578	0.15
579	0.13
580	0.16
581	0.13
582	0.12
583	0.16
584	0.19
585	0.22
586	0.29
587	0.35
588	0.41
589	0.5
590	0.56
591	0.62
592	0.7
593	0.76
594	0.8
595	0.85
596	0.87
597	0.89
598	0.93
599	0.94
600	0.93
601	0.89
602	0.88
603	0.86
604	0.83
605	0.76
606	0.67
607	0.57
608	0.49
609	0.43
610	0.32
611	0.23
612	0.14
613	0.11
614	0.11
615	0.12
616	0.09
617	0.09
618	0.13
619	0.15
620	0.19
621	0.19
622	0.2
623	0.2
624	0.2
625	0.23
626	0.23
627	0.26
628	0.27
629	0.3
630	0.28
631	0.29
632	0.29
633	0.25
634	0.25
635	0.25
636	0.25
637	0.25
638	0.32
639	0.31
640	0.32
641	0.32
642	0.29
643	0.35
644	0.38
645	0.44
646	0.44
647	0.51
648	0.51
649	0.5
650	0.54
651	0.5
652	0.51
653	0.51
654	0.55
655	0.59
656	0.65
657	0.66
658	0.69
659	0.7
660	0.69
661	0.67
662	0.66
663	0.64
664	0.59
665	0.6
666	0.59
667	0.53
668	0.47
669	0.43
670	0.35
671	0.31
672	0.36
673	0.39
674	0.43

G0RTQ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer