Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RJ94

Protein Details
Accession G0RJ94    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
294-315AGSGGKKQRERERKVKQTVDFDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-142R
153-182APRDGPRGGQAARVRGGRGGRFPRERDDRH
299-307KKQRERERK
323-353RTRGGGRGGRGGPRGGRGGERGRGGNFRGGR
Subcellular Location(s) cyto 9.5, mito 9, cyto_nucl 6.5, extr 4, nucl 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG tre:TRIREDRAFT_121766  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MPDARRPLLQFAAWPMPVMRPGFEPRATCTAPTASLPLPLPLPRIRHGTKTRRRGDGGMFVVVVVVVVVIVVGANRFAYLGNDSDGEEKPVVPVKTVDKVTPRTTKRNVEPQAPQAPVRTGGNRRGGPGGNEGAFRDRGAGRERNQTRPTDEAPRDGPRGGQAARVRGGRGGRFPRERDDRHPHKSGVVSGSEKQAALSWGATEGNAELKDEQAGEAIAESEKKEDQPEDAAAEEPAEPEDKSISYSDYLAQQAEKKAALEADLHIRAPNEGSKLDKKWANAKPLEKEEDVYFAGSGGKKQRERERKVKQTVDFDPRFVEPERTRGGGRGGRGGPRGGRGGERGRGGNFRGGRGGQQASASINTNDQSAFPSLGGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.28
3 0.26
4 0.3
5 0.29
6 0.23
7 0.21
8 0.27
9 0.32
10 0.35
11 0.35
12 0.35
13 0.42
14 0.42
15 0.38
16 0.35
17 0.32
18 0.29
19 0.28
20 0.27
21 0.2
22 0.23
23 0.23
24 0.21
25 0.21
26 0.21
27 0.25
28 0.25
29 0.29
30 0.29
31 0.37
32 0.38
33 0.45
34 0.54
35 0.61
36 0.66
37 0.72
38 0.76
39 0.75
40 0.76
41 0.71
42 0.67
43 0.65
44 0.57
45 0.49
46 0.41
47 0.33
48 0.29
49 0.23
50 0.17
51 0.08
52 0.04
53 0.02
54 0.02
55 0.02
56 0.02
57 0.02
58 0.02
59 0.02
60 0.03
61 0.03
62 0.03
63 0.04
64 0.04
65 0.06
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.14
72 0.15
73 0.16
74 0.15
75 0.13
76 0.14
77 0.19
78 0.19
79 0.17
80 0.19
81 0.2
82 0.26
83 0.28
84 0.29
85 0.29
86 0.35
87 0.4
88 0.47
89 0.49
90 0.51
91 0.57
92 0.62
93 0.63
94 0.68
95 0.65
96 0.63
97 0.62
98 0.61
99 0.61
100 0.55
101 0.49
102 0.4
103 0.37
104 0.32
105 0.3
106 0.28
107 0.26
108 0.31
109 0.38
110 0.37
111 0.37
112 0.38
113 0.37
114 0.33
115 0.32
116 0.28
117 0.21
118 0.21
119 0.2
120 0.19
121 0.18
122 0.16
123 0.15
124 0.13
125 0.14
126 0.2
127 0.25
128 0.25
129 0.35
130 0.39
131 0.45
132 0.48
133 0.47
134 0.45
135 0.44
136 0.44
137 0.43
138 0.4
139 0.35
140 0.36
141 0.37
142 0.36
143 0.31
144 0.28
145 0.21
146 0.23
147 0.2
148 0.22
149 0.2
150 0.22
151 0.25
152 0.25
153 0.23
154 0.22
155 0.25
156 0.2
157 0.25
158 0.27
159 0.31
160 0.35
161 0.37
162 0.41
163 0.47
164 0.49
165 0.51
166 0.55
167 0.57
168 0.59
169 0.61
170 0.54
171 0.48
172 0.46
173 0.4
174 0.32
175 0.26
176 0.22
177 0.19
178 0.2
179 0.18
180 0.17
181 0.14
182 0.13
183 0.11
184 0.09
185 0.08
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.12
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.1
220 0.11
221 0.09
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.08
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.1
234 0.11
235 0.13
236 0.13
237 0.12
238 0.13
239 0.15
240 0.16
241 0.17
242 0.16
243 0.14
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.11
248 0.11
249 0.15
250 0.16
251 0.16
252 0.16
253 0.16
254 0.15
255 0.16
256 0.17
257 0.13
258 0.13
259 0.18
260 0.23
261 0.25
262 0.31
263 0.32
264 0.32
265 0.4
266 0.45
267 0.49
268 0.5
269 0.53
270 0.55
271 0.58
272 0.61
273 0.52
274 0.48
275 0.4
276 0.37
277 0.31
278 0.25
279 0.18
280 0.13
281 0.16
282 0.14
283 0.17
284 0.21
285 0.28
286 0.32
287 0.39
288 0.5
289 0.57
290 0.66
291 0.73
292 0.77
293 0.79
294 0.85
295 0.86
296 0.81
297 0.79
298 0.78
299 0.78
300 0.68
301 0.59
302 0.52
303 0.44
304 0.42
305 0.36
306 0.36
307 0.27
308 0.32
309 0.35
310 0.35
311 0.35
312 0.34
313 0.39
314 0.34
315 0.34
316 0.36
317 0.35
318 0.38
319 0.4
320 0.41
321 0.36
322 0.36
323 0.38
324 0.31
325 0.31
326 0.32
327 0.36
328 0.37
329 0.39
330 0.38
331 0.38
332 0.4
333 0.4
334 0.42
335 0.38
336 0.35
337 0.36
338 0.34
339 0.34
340 0.35
341 0.35
342 0.28
343 0.27
344 0.27
345 0.24
346 0.25
347 0.25
348 0.2
349 0.2
350 0.19
351 0.19
352 0.18
353 0.16
354 0.17
355 0.17
356 0.17