Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0R878

Protein Details
Accession G0R878    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
224-247PSHAPAPSRPRKRKVESPRRDAEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-239PSRPRKRKVE
303-311PSKAPPPTK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG tre:TRIREDRAFT_53468  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MTASRVIKLPRDDDESAYVLIQVVQKGSKPLDVKLVGTEGAAPYATTLKHDRVSSLRVANCPVSESEWQTILQSLFDLQPAGDIQATASIKGEASLSITVRKRVQGITQRLGSIDLKYNENEGIELFEWCADSIDALAQSKQALAEATTHATELESTVKELKTQLDELVTSKQEDETALLMKFRDLLNEKKVKIREQQKILTTGSFQNSQPASQRAPQQVESGPSHAPAPSRPRKRKVESPRRDAEEAEEDDEMELDNIKVEPQSSDPEDTPEDTASTASEDEDEGDDRGNNAATPKATPKAPSKAPPPTKKADEQPPAPRHLPFTRNAKATPAKAPEADIETESDDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.38
3 0.34
4 0.3
5 0.25
6 0.17
7 0.18
8 0.17
9 0.14
10 0.14
11 0.15
12 0.16
13 0.2
14 0.21
15 0.24
16 0.24
17 0.25
18 0.31
19 0.32
20 0.31
21 0.3
22 0.3
23 0.24
24 0.22
25 0.22
26 0.14
27 0.13
28 0.12
29 0.09
30 0.08
31 0.11
32 0.11
33 0.13
34 0.16
35 0.2
36 0.24
37 0.25
38 0.27
39 0.29
40 0.33
41 0.35
42 0.38
43 0.38
44 0.35
45 0.38
46 0.37
47 0.33
48 0.31
49 0.26
50 0.23
51 0.23
52 0.24
53 0.23
54 0.22
55 0.22
56 0.2
57 0.22
58 0.18
59 0.15
60 0.12
61 0.11
62 0.1
63 0.11
64 0.1
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.09
69 0.08
70 0.07
71 0.06
72 0.12
73 0.13
74 0.11
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.06
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.16
85 0.18
86 0.21
87 0.23
88 0.24
89 0.25
90 0.24
91 0.32
92 0.34
93 0.41
94 0.43
95 0.43
96 0.41
97 0.39
98 0.4
99 0.33
100 0.26
101 0.24
102 0.21
103 0.2
104 0.21
105 0.21
106 0.19
107 0.18
108 0.16
109 0.1
110 0.11
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.08
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.07
133 0.07
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.12
148 0.13
149 0.12
150 0.13
151 0.13
152 0.11
153 0.11
154 0.12
155 0.14
156 0.13
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.1
170 0.09
171 0.12
172 0.13
173 0.17
174 0.24
175 0.3
176 0.31
177 0.35
178 0.37
179 0.38
180 0.43
181 0.48
182 0.49
183 0.49
184 0.54
185 0.51
186 0.52
187 0.49
188 0.41
189 0.34
190 0.29
191 0.25
192 0.22
193 0.19
194 0.21
195 0.21
196 0.21
197 0.22
198 0.22
199 0.22
200 0.23
201 0.3
202 0.29
203 0.32
204 0.32
205 0.32
206 0.31
207 0.33
208 0.31
209 0.27
210 0.22
211 0.19
212 0.18
213 0.17
214 0.16
215 0.16
216 0.24
217 0.32
218 0.42
219 0.51
220 0.59
221 0.67
222 0.74
223 0.8
224 0.81
225 0.83
226 0.82
227 0.82
228 0.82
229 0.78
230 0.72
231 0.62
232 0.55
233 0.5
234 0.42
235 0.35
236 0.27
237 0.21
238 0.2
239 0.19
240 0.15
241 0.08
242 0.06
243 0.04
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.08
250 0.09
251 0.14
252 0.16
253 0.19
254 0.19
255 0.22
256 0.24
257 0.24
258 0.23
259 0.19
260 0.17
261 0.14
262 0.14
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.1
280 0.12
281 0.12
282 0.15
283 0.19
284 0.22
285 0.23
286 0.28
287 0.34
288 0.4
289 0.45
290 0.49
291 0.53
292 0.6
293 0.69
294 0.73
295 0.72
296 0.73
297 0.73
298 0.73
299 0.73
300 0.73
301 0.71
302 0.7
303 0.74
304 0.71
305 0.72
306 0.67
307 0.6
308 0.56
309 0.55
310 0.52
311 0.48
312 0.52
313 0.53
314 0.55
315 0.54
316 0.56
317 0.55
318 0.55
319 0.56
320 0.53
321 0.49
322 0.46
323 0.47
324 0.42
325 0.39
326 0.37
327 0.3
328 0.26
329 0.23