FuNGI

G0RQ42

Protein Details

Accession

G0RQ42

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1251-1275	QVVGEKPAPSQKKKKTPLPVWLPLT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
414-438	RRARRERKLRFVGGKDKASKKASSK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12.5, cyto 11.5, nucl 10.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005739 C:mitochondrion GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	tre:TRIREDRAFT_79947 -
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MPYNNLSSSSIPPFEIHAFNPASPLTIPEPGAPKPQTKTNTYGIPGEPEDMLMVFDACIRVGKLERAALVLKRLSSVGTTSDEERIILNNKYLRASLNQMRTTPDRKQAEQLHKWYELQIRSKNLPHTAETIACMLKASLLSERGARLERLVKRYMGMAPDEAGLRVLSMDEILSDQDLAVITRICPTYNFAPDEGDLEDLALAQENSQEAEASSSLDTEAGQSSASGSVPELIPTPQRGEGLNTLKKGLGLLLGLQNVDISKLPYSDRVDIQLQLERDTISSAIEKWRLDNKTLQKRGVTTALAPSHKEGSMSQNLASWMSAMETRIYQELRLIEQSEAKKSKSDKDLTRCIYGPFIQQGDPARLAAVTILSVINLGTVLGVEKGLPISRLITHIAKAVQEDIEMYQKELAERRARRERKLRFVGGKDKASKKASSKDAGKEEEPPVLVDTTEQQSAMEENSRSPWSLQIKAQVGSILLQMLMESAKINVVVERSESKELISQYQPAFNHQSVLRKGKKVGALFFNTRLVEQLKREPVGDFIAKHIPMVVEPKPWQSFTEGGFLDSTTSFVRVKPGDVEQKLYSNAAIKRGDMTQVFKGLDVLGKTPWIINKDTLNVMMEAWNSGEEIANIPPLNPNLTIPPEPDSSADPLVRKNWIRAVKAIENERSGLHSQRCFMNLQLEIARAFRNQTIYFPHNVDYRGRAYPMPTYLNHMGADHARAILKFARGKELGVRGLRWLKIHLANVYGLDKASFDEREAFADENVANIIDSATNPLNGSRWWLKGEDPWQCLSACFELKAALELPDPTKFVSHLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDTWGAKQVNLEPGDRPADVYSAVADLVKQAIAKDKENGNAFAEALDGKITRKVVKQTVMTNVYGVTFSGAKKQICKQIDALYPDLGEKVGISNMLLSTYIAKQVFQALATMFKGAHDIQYWLGEIGGRVCRALTPAQLQQIARKSATTARKKVEFDDLVQQFRSSVVWTTPLRMPVVQPYRKTTAREIKTCLQAVIYPMSDQTDPVNRRKQLQGFPPNFIHSLDASHMLLSALECHARGLDFAAVHDSFWTHAGDLDVMNEVLREAFIRIHEEDVVGRLGAEFAARHQGSIYLAKIDPDTPVAKKIKELRKASKLSPKEELLLEHKRNQLKLSGNPWDLEAAKKIVTPASVYEEMMAAEVDMDIHEDVKDIGLGAIPEEAELVDQEDLEAQTDNSAVSAEFTERLMKDMHSSFFETQVVGEKPAPSQKKKKTPLPVWLPLTIPEVPKKGDFDVKRLRESKYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.29
3	0.25
4	0.27
5	0.28
6	0.27
7	0.29
8	0.24
9	0.22
10	0.2
11	0.23
12	0.19
13	0.21
14	0.22
15	0.24
16	0.28
17	0.28
18	0.37
19	0.36
20	0.39
21	0.39
22	0.47
23	0.48
24	0.49
25	0.53
26	0.5
27	0.54
28	0.51
29	0.52
30	0.45
31	0.44
32	0.4
33	0.36
34	0.3
35	0.23
36	0.21
37	0.16
38	0.15
39	0.1
40	0.09
41	0.07
42	0.08
43	0.08
44	0.08
45	0.09
46	0.09
47	0.12
48	0.14
49	0.18
50	0.21
51	0.23
52	0.24
53	0.25
54	0.29
55	0.28
56	0.31
57	0.3
58	0.26
59	0.25
60	0.24
61	0.22
62	0.19
63	0.19
64	0.16
65	0.18
66	0.2
67	0.21
68	0.24
69	0.23
70	0.22
71	0.21
72	0.22
73	0.22
74	0.22
75	0.25
76	0.26
77	0.28
78	0.29
79	0.3
80	0.28
81	0.28
82	0.34
83	0.37
84	0.42
85	0.44
86	0.43
87	0.48
88	0.52
89	0.54
90	0.52
91	0.54
92	0.51
93	0.5
94	0.58
95	0.63
96	0.67
97	0.7
98	0.7
99	0.67
100	0.64
101	0.62
102	0.58
103	0.56
104	0.52
105	0.51
106	0.5
107	0.51
108	0.53
109	0.58
110	0.58
111	0.57
112	0.53
113	0.48
114	0.46
115	0.42
116	0.38
117	0.34
118	0.31
119	0.25
120	0.21
121	0.19
122	0.15
123	0.13
124	0.12
125	0.12
126	0.12
127	0.14
128	0.15
129	0.17
130	0.18
131	0.2
132	0.22
133	0.21
134	0.22
135	0.29
136	0.34
137	0.38
138	0.4
139	0.38
140	0.36
141	0.38
142	0.38
143	0.32
144	0.28
145	0.23
146	0.21
147	0.21
148	0.21
149	0.18
150	0.15
151	0.12
152	0.09
153	0.08
154	0.07
155	0.06
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.05
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.08
169	0.08
170	0.12
171	0.13
172	0.12
173	0.13
174	0.18
175	0.22
176	0.28
177	0.3
178	0.26
179	0.28
180	0.28
181	0.29
182	0.25
183	0.2
184	0.13
185	0.11
186	0.11
187	0.08
188	0.08
189	0.07
190	0.06
191	0.05
192	0.07
193	0.07
194	0.08
195	0.08
196	0.08
197	0.07
198	0.09
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.08
213	0.08
214	0.07
215	0.07
216	0.08
217	0.09
218	0.09
219	0.1
220	0.1
221	0.13
222	0.15
223	0.18
224	0.18
225	0.19
226	0.19
227	0.22
228	0.28
229	0.34
230	0.37
231	0.35
232	0.34
233	0.34
234	0.33
235	0.29
236	0.22
237	0.14
238	0.09
239	0.11
240	0.12
241	0.13
242	0.12
243	0.12
244	0.12
245	0.1
246	0.11
247	0.09
248	0.08
249	0.08
250	0.1
251	0.11
252	0.17
253	0.21
254	0.24
255	0.24
256	0.27
257	0.28
258	0.29
259	0.3
260	0.28
261	0.25
262	0.23
263	0.22
264	0.18
265	0.17
266	0.16
267	0.13
268	0.1
269	0.11
270	0.1
271	0.15
272	0.18
273	0.18
274	0.21
275	0.29
276	0.3
277	0.32
278	0.39
279	0.44
280	0.51
281	0.57
282	0.57
283	0.51
284	0.51
285	0.53
286	0.48
287	0.39
288	0.3
289	0.31
290	0.33
291	0.32
292	0.31
293	0.29
294	0.28
295	0.26
296	0.26
297	0.2
298	0.21
299	0.26
300	0.27
301	0.25
302	0.24
303	0.24
304	0.24
305	0.22
306	0.15
307	0.09
308	0.09
309	0.1
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.1
314	0.13
315	0.13
316	0.12
317	0.14
318	0.15
319	0.16
320	0.18
321	0.18
322	0.16
323	0.22
324	0.24
325	0.29
326	0.31
327	0.29
328	0.32
329	0.33
330	0.4
331	0.43
332	0.49
333	0.49
334	0.54
335	0.63
336	0.62
337	0.63
338	0.56
339	0.49
340	0.44
341	0.37
342	0.32
343	0.26
344	0.24
345	0.2
346	0.22
347	0.23
348	0.23
349	0.22
350	0.19
351	0.16
352	0.14
353	0.13
354	0.11
355	0.08
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.05
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.05
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.08
377	0.09
378	0.11
379	0.14
380	0.14
381	0.14
382	0.17
383	0.17
384	0.16
385	0.16
386	0.16
387	0.12
388	0.11
389	0.11
390	0.1
391	0.14
392	0.13
393	0.13
394	0.13
395	0.13
396	0.15
397	0.17
398	0.22
399	0.26
400	0.29
401	0.37
402	0.47
403	0.51
404	0.59
405	0.66
406	0.69
407	0.7
408	0.75
409	0.74
410	0.71
411	0.72
412	0.73
413	0.7
414	0.68
415	0.65
416	0.61
417	0.6
418	0.57
419	0.54
420	0.5
421	0.52
422	0.51
423	0.51
424	0.52
425	0.52
426	0.54
427	0.53
428	0.49
429	0.46
430	0.42
431	0.36
432	0.31
433	0.24
434	0.2
435	0.16
436	0.15
437	0.1
438	0.11
439	0.11
440	0.11
441	0.11
442	0.09
443	0.09
444	0.1
445	0.11
446	0.12
447	0.1
448	0.1
449	0.13
450	0.14
451	0.14
452	0.14
453	0.19
454	0.2
455	0.23
456	0.24
457	0.28
458	0.3
459	0.29
460	0.29
461	0.24
462	0.2
463	0.17
464	0.16
465	0.09
466	0.06
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.04
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.05
477	0.05
478	0.06
479	0.06
480	0.07
481	0.1
482	0.12
483	0.14
484	0.14
485	0.14
486	0.17
487	0.17
488	0.2
489	0.19
490	0.2
491	0.19
492	0.24
493	0.23
494	0.23
495	0.27
496	0.23
497	0.25
498	0.22
499	0.29
500	0.29
501	0.37
502	0.38
503	0.36
504	0.38
505	0.39
506	0.43
507	0.38
508	0.38
509	0.35
510	0.35
511	0.35
512	0.35
513	0.34
514	0.29
515	0.26
516	0.24
517	0.2
518	0.18
519	0.18
520	0.23
521	0.23
522	0.23
523	0.24
524	0.23
525	0.22
526	0.23
527	0.22
528	0.16
529	0.15
530	0.19
531	0.18
532	0.17
533	0.17
534	0.13
535	0.12
536	0.16
537	0.14
538	0.14
539	0.15
540	0.2
541	0.2
542	0.21
543	0.21
544	0.19
545	0.21
546	0.19
547	0.23
548	0.19
549	0.18
550	0.17
551	0.16
552	0.15
553	0.12
554	0.12
555	0.07
556	0.09
557	0.08
558	0.08
559	0.12
560	0.12
561	0.13
562	0.14
563	0.18
564	0.24
565	0.24
566	0.28
567	0.25
568	0.26
569	0.26
570	0.24
571	0.2
572	0.18
573	0.18
574	0.19
575	0.19
576	0.17
577	0.18
578	0.19
579	0.2
580	0.16
581	0.18
582	0.14
583	0.17
584	0.17
585	0.15
586	0.15
587	0.13
588	0.13
589	0.11
590	0.1
591	0.07
592	0.07
593	0.08
594	0.08
595	0.1
596	0.11
597	0.12
598	0.13
599	0.14
600	0.16
601	0.16
602	0.16
603	0.15
604	0.12
605	0.11
606	0.1
607	0.09
608	0.07
609	0.07
610	0.06
611	0.05
612	0.05
613	0.05
614	0.04
615	0.05
616	0.05
617	0.07
618	0.06
619	0.07
620	0.08
621	0.08
622	0.09
623	0.08
624	0.09
625	0.09
626	0.12
627	0.13
628	0.12
629	0.15
630	0.14
631	0.15
632	0.15
633	0.15
634	0.14
635	0.15
636	0.15
637	0.13
638	0.13
639	0.14
640	0.18
641	0.17
642	0.16
643	0.21
644	0.25
645	0.26
646	0.27
647	0.32
648	0.31
649	0.34
650	0.37
651	0.32
652	0.27
653	0.27
654	0.25
655	0.21
656	0.19
657	0.19
658	0.19
659	0.18
660	0.19
661	0.19
662	0.21
663	0.19
664	0.18
665	0.18
666	0.15
667	0.15
668	0.15
669	0.14
670	0.13
671	0.13
672	0.13
673	0.09
674	0.1
675	0.1
676	0.12
677	0.12
678	0.13
679	0.18
680	0.19
681	0.21
682	0.21
683	0.22
684	0.21
685	0.22
686	0.21
687	0.19
688	0.2
689	0.18
690	0.19
691	0.17
692	0.16
693	0.17
694	0.19
695	0.19
696	0.16
697	0.21
698	0.22
699	0.23
700	0.21
701	0.19
702	0.17
703	0.15
704	0.16
705	0.1
706	0.09
707	0.08
708	0.08
709	0.1
710	0.11
711	0.14
712	0.15
713	0.16
714	0.2
715	0.2
716	0.21
717	0.23
718	0.24
719	0.25
720	0.23
721	0.23
722	0.22
723	0.25
724	0.26
725	0.23
726	0.21
727	0.2
728	0.22
729	0.24
730	0.21
731	0.18
732	0.17
733	0.18
734	0.17
735	0.14
736	0.1
737	0.08
738	0.08
739	0.07
740	0.08
741	0.07
742	0.07
743	0.1
744	0.1
745	0.12
746	0.13
747	0.13
748	0.11
749	0.13
750	0.12
751	0.09
752	0.09
753	0.07
754	0.05
755	0.05
756	0.05
757	0.04
758	0.04
759	0.07
760	0.07
761	0.07
762	0.08
763	0.08
764	0.09
765	0.08
766	0.13
767	0.14
768	0.15
769	0.16
770	0.17
771	0.18
772	0.22
773	0.29
774	0.31
775	0.3
776	0.3
777	0.29
778	0.29
779	0.28
780	0.25
781	0.21
782	0.15
783	0.13
784	0.12
785	0.11
786	0.11
787	0.12
788	0.11
789	0.09
790	0.09
791	0.1
792	0.11
793	0.11
794	0.12
795	0.11
796	0.11
797	0.1
798	0.11
799	0.16
800	0.17
801	0.19
802	0.24
803	0.27
804	0.28
805	0.28
806	0.28
807	0.22
808	0.25
809	0.22
810	0.17
811	0.14
812	0.14
813	0.13
814	0.12
815	0.12
816	0.07
817	0.06
818	0.06
819	0.06
820	0.05
821	0.06
822	0.06
823	0.05
824	0.08
825	0.08
826	0.08
827	0.09
828	0.11
829	0.17
830	0.19
831	0.2
832	0.17
833	0.2
834	0.22
835	0.21
836	0.19
837	0.13
838	0.12
839	0.12
840	0.11
841	0.09
842	0.07
843	0.07
844	0.06
845	0.05
846	0.05
847	0.05
848	0.05
849	0.05
850	0.05
851	0.13
852	0.15
853	0.17
854	0.21
855	0.23
856	0.28
857	0.3
858	0.31
859	0.25
860	0.24
861	0.22
862	0.18
863	0.15
864	0.1
865	0.08
866	0.08
867	0.06
868	0.06
869	0.09
870	0.1
871	0.13
872	0.17
873	0.22
874	0.26
875	0.31
876	0.34
877	0.36
878	0.42
879	0.43
880	0.39
881	0.34
882	0.29
883	0.24
884	0.2
885	0.16
886	0.1
887	0.08
888	0.08
889	0.14
890	0.19
891	0.19
892	0.23
893	0.28
894	0.36
895	0.36
896	0.38
897	0.35
898	0.38
899	0.42
900	0.42
901	0.39
902	0.31
903	0.29
904	0.27
905	0.24
906	0.16
907	0.11
908	0.07
909	0.06
910	0.06
911	0.06
912	0.05
913	0.06
914	0.06
915	0.06
916	0.07
917	0.06
918	0.08
919	0.08
920	0.13
921	0.12
922	0.12
923	0.12
924	0.15
925	0.16
926	0.13
927	0.14
928	0.1
929	0.12
930	0.12
931	0.13
932	0.09
933	0.09
934	0.11
935	0.1
936	0.12
937	0.1
938	0.11
939	0.12
940	0.13
941	0.13
942	0.11
943	0.1
944	0.09
945	0.08
946	0.1
947	0.12
948	0.11
949	0.11
950	0.11
951	0.11
952	0.13
953	0.15
954	0.14
955	0.16
956	0.2
957	0.24
958	0.27
959	0.27
960	0.31
961	0.35
962	0.35
963	0.31
964	0.28
965	0.26
966	0.3
967	0.4
968	0.43
969	0.44
970	0.47
971	0.53
972	0.54
973	0.55
974	0.56
975	0.48
976	0.42
977	0.45
978	0.42
979	0.38
980	0.37
981	0.35
982	0.26
983	0.24
984	0.21
985	0.13
986	0.11
987	0.1
988	0.16
989	0.16
990	0.2
991	0.22
992	0.24
993	0.25
994	0.24
995	0.24
996	0.28
997	0.37
998	0.39
999	0.39
1000	0.42
1001	0.47
1002	0.5
1003	0.53
1004	0.53
1005	0.53
1006	0.55
1007	0.57
1008	0.58
1009	0.58
1010	0.61
1011	0.58
1012	0.49
1013	0.39
1014	0.33
1015	0.3
1016	0.28
1017	0.22
1018	0.15
1019	0.14
1020	0.16
1021	0.16
1022	0.15
1023	0.15
1024	0.21
1025	0.25
1026	0.32
1027	0.41
1028	0.4
1029	0.45
1030	0.52
1031	0.56
1032	0.55
1033	0.61
1034	0.64
1035	0.59
1036	0.62
1037	0.61
1038	0.56
1039	0.5
1040	0.42
1041	0.34
1042	0.23
1043	0.22
1044	0.18
1045	0.18
1046	0.15
1047	0.14
1048	0.14
1049	0.11
1050	0.11
1051	0.09
1052	0.09
1053	0.08
1054	0.08
1055	0.08
1056	0.08
1057	0.09
1058	0.09
1059	0.09
1060	0.09
1061	0.11
1062	0.1
1063	0.1
1064	0.15
1065	0.14
1066	0.14
1067	0.14
1068	0.13
1069	0.11
1070	0.12
1071	0.12
1072	0.08
1073	0.09
1074	0.1
1075	0.1
1076	0.1
1077	0.1
1078	0.1
1079	0.09
1080	0.09
1081	0.08
1082	0.07
1083	0.06
1084	0.06
1085	0.06
1086	0.06
1087	0.08
1088	0.09
1089	0.14
1090	0.14
1091	0.16
1092	0.17
1093	0.17
1094	0.16
1095	0.16
1096	0.16
1097	0.11
1098	0.1
1099	0.08
1100	0.08
1101	0.08
1102	0.08
1103	0.06
1104	0.07
1105	0.16
1106	0.16
1107	0.16
1108	0.16
1109	0.18
1110	0.2
1111	0.23
1112	0.23
1113	0.17
1114	0.18
1115	0.19
1116	0.2
1117	0.19
1118	0.17
1119	0.18
1120	0.2
1121	0.18
1122	0.26
1123	0.29
1124	0.28
1125	0.34
1126	0.43
1127	0.49
1128	0.55
1129	0.62
1130	0.64
1131	0.7
1132	0.75
1133	0.76
1134	0.77
1135	0.74
1136	0.7
1137	0.67
1138	0.6
1139	0.53
1140	0.49
1141	0.46
1142	0.43
1143	0.47
1144	0.46
1145	0.46
1146	0.51
1147	0.52
1148	0.52
1149	0.5
1150	0.49
1151	0.46
1152	0.48
1153	0.5
1154	0.52
1155	0.49
1156	0.47
1157	0.46
1158	0.43
1159	0.37
1160	0.32
1161	0.27
1162	0.21
1163	0.19
1164	0.2
1165	0.21
1166	0.19
1167	0.19
1168	0.18
1169	0.17
1170	0.22
1171	0.23
1172	0.22
1173	0.21
1174	0.2
1175	0.19
1176	0.17
1177	0.15
1178	0.07
1179	0.06
1180	0.05
1181	0.05
1182	0.04
1183	0.06
1184	0.06
1185	0.06
1186	0.06
1187	0.07
1188	0.07
1189	0.08
1190	0.08
1191	0.06
1192	0.06
1193	0.07
1194	0.07
1195	0.07
1196	0.08
1197	0.07
1198	0.07
1199	0.07
1200	0.07
1201	0.06
1202	0.06
1203	0.07
1204	0.07
1205	0.07
1206	0.07
1207	0.09
1208	0.09
1209	0.1
1210	0.1
1211	0.08
1212	0.09
1213	0.09
1214	0.09
1215	0.07
1216	0.07
1217	0.06
1218	0.07
1219	0.08
1220	0.09
1221	0.1
1222	0.11
1223	0.17
1224	0.16
1225	0.18
1226	0.18
1227	0.18
1228	0.23
1229	0.26
1230	0.28
1231	0.25
1232	0.31
1233	0.3
1234	0.31
1235	0.31
1236	0.25
1237	0.22
1238	0.27
1239	0.25
1240	0.22
1241	0.24
1242	0.22
1243	0.25
1244	0.35
1245	0.43
1246	0.45
1247	0.54
1248	0.61
1249	0.7
1250	0.78
1251	0.83
1252	0.85
1253	0.85
1254	0.87
1255	0.86
1256	0.85
1257	0.79
1258	0.72
1259	0.64
1260	0.56
1261	0.51
1262	0.44
1263	0.39
1264	0.35
1265	0.34
1266	0.33
1267	0.35
1268	0.36
1269	0.36
1270	0.42
1271	0.41
1272	0.44
1273	0.52
1274	0.55
1275	0.61
1276	0.62
1277	0.62
1278	0.61

G0RQ42

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer