FuNGI

G0RRY1

Protein Details

Accession

G0RRY1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-26	MSDLSNKKRKRDGEKNPSSKKKVAID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-22	KKRKRDGEKNPSSKKK

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	tre:TRIREDRAFT_5164 -
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MSDLSNKKRKRDGEKNPSSKKKVAIDAPASTATVSSVLRPKYCPPVVVNTPGMEMPSDLVFNSYLPKNASSKSKKTADKRLLLHSTSHRSLDYTAREEEEARDSKPLLNHFIGIYDPKTGKMEVVEAKKMVVRGTVRSKQVPTSTSQQQEKKTMLDQRTDLGQTFGTKKAKKAIQDKVLNAITPQRKTADGRPVQLDDASKATLSSIGAVTSTMASREELQAVIDEAKPVPKANLDADEIYDVYRPEELIGADILNLVPIREWQEKAKHGESIQFRSRYVVSRVQAIASNESAEMRLRVLRYLSIVLLFYLYSKPGRQRGTRQVPPRDKLRELLAPAPEAVIENIRRKFSDAGQLRKFHIDLLIAHCCALACIVDNFEVDTQALRDDLRIDQRMMNQYFHEIGARVKPVKDKAEDRILHVAKLALPLDFPKQRQIRARR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.87
2	0.91
3	0.92
4	0.94
5	0.9
6	0.84
7	0.81
8	0.77
9	0.74
10	0.7
11	0.69
12	0.64
13	0.6
14	0.58
15	0.51
16	0.44
17	0.35
18	0.28
19	0.19
20	0.16
21	0.13
22	0.14
23	0.19
24	0.23
25	0.25
26	0.28
27	0.32
28	0.4
29	0.42
30	0.41
31	0.38
32	0.44
33	0.47
34	0.5
35	0.48
36	0.39
37	0.38
38	0.34
39	0.31
40	0.22
41	0.17
42	0.12
43	0.11
44	0.1
45	0.08
46	0.09
47	0.09
48	0.09
49	0.14
50	0.14
51	0.15
52	0.17
53	0.2
54	0.22
55	0.25
56	0.36
57	0.39
58	0.45
59	0.51
60	0.58
61	0.64
62	0.69
63	0.76
64	0.75
65	0.75
66	0.72
67	0.73
68	0.7
69	0.63
70	0.61
71	0.58
72	0.56
73	0.5
74	0.48
75	0.39
76	0.34
77	0.35
78	0.35
79	0.33
80	0.29
81	0.28
82	0.28
83	0.28
84	0.28
85	0.28
86	0.28
87	0.25
88	0.22
89	0.23
90	0.22
91	0.24
92	0.27
93	0.28
94	0.26
95	0.25
96	0.25
97	0.23
98	0.23
99	0.21
100	0.19
101	0.17
102	0.16
103	0.15
104	0.15
105	0.17
106	0.16
107	0.16
108	0.14
109	0.19
110	0.21
111	0.25
112	0.26
113	0.24
114	0.25
115	0.26
116	0.26
117	0.21
118	0.19
119	0.17
120	0.2
121	0.29
122	0.35
123	0.37
124	0.4
125	0.41
126	0.41
127	0.43
128	0.38
129	0.33
130	0.34
131	0.37
132	0.4
133	0.45
134	0.47
135	0.47
136	0.5
137	0.48
138	0.43
139	0.42
140	0.42
141	0.39
142	0.37
143	0.34
144	0.3
145	0.32
146	0.31
147	0.25
148	0.19
149	0.16
150	0.15
151	0.17
152	0.21
153	0.25
154	0.25
155	0.27
156	0.34
157	0.36
158	0.41
159	0.47
160	0.5
161	0.53
162	0.57
163	0.56
164	0.55
165	0.52
166	0.45
167	0.37
168	0.36
169	0.31
170	0.26
171	0.27
172	0.21
173	0.23
174	0.26
175	0.31
176	0.34
177	0.32
178	0.34
179	0.36
180	0.35
181	0.34
182	0.32
183	0.27
184	0.17
185	0.15
186	0.13
187	0.1
188	0.09
189	0.08
190	0.08
191	0.07
192	0.07
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.05
200	0.04
201	0.05
202	0.05
203	0.06
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.08
211	0.07
212	0.07
213	0.06
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.09
220	0.1
221	0.13
222	0.13
223	0.13
224	0.13
225	0.13
226	0.12
227	0.11
228	0.11
229	0.08
230	0.07
231	0.07
232	0.06
233	0.06
234	0.07
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.05
240	0.06
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.04
245	0.04
246	0.05
247	0.1
248	0.13
249	0.14
250	0.18
251	0.24
252	0.29
253	0.34
254	0.35
255	0.32
256	0.3
257	0.36
258	0.36
259	0.38
260	0.4
261	0.36
262	0.35
263	0.34
264	0.35
265	0.32
266	0.33
267	0.32
268	0.26
269	0.29
270	0.3
271	0.28
272	0.3
273	0.27
274	0.24
275	0.18
276	0.18
277	0.13
278	0.13
279	0.12
280	0.1
281	0.09
282	0.08
283	0.1
284	0.1
285	0.11
286	0.12
287	0.12
288	0.13
289	0.14
290	0.13
291	0.11
292	0.11
293	0.1
294	0.09
295	0.09
296	0.08
297	0.07
298	0.08
299	0.09
300	0.12
301	0.17
302	0.24
303	0.3
304	0.35
305	0.43
306	0.53
307	0.62
308	0.67
309	0.71
310	0.75
311	0.78
312	0.77
313	0.77
314	0.72
315	0.64
316	0.59
317	0.55
318	0.49
319	0.44
320	0.44
321	0.38
322	0.32
323	0.3
324	0.27
325	0.22
326	0.17
327	0.14
328	0.14
329	0.16
330	0.22
331	0.25
332	0.27
333	0.27
334	0.3
335	0.32
336	0.3
337	0.36
338	0.37
339	0.44
340	0.49
341	0.52
342	0.51
343	0.52
344	0.49
345	0.39
346	0.34
347	0.26
348	0.22
349	0.25
350	0.28
351	0.24
352	0.24
353	0.23
354	0.21
355	0.18
356	0.16
357	0.1
358	0.07
359	0.08
360	0.09
361	0.1
362	0.1
363	0.12
364	0.11
365	0.12
366	0.1
367	0.1
368	0.09
369	0.09
370	0.09
371	0.08
372	0.09
373	0.1
374	0.15
375	0.22
376	0.24
377	0.26
378	0.29
379	0.36
380	0.44
381	0.45
382	0.42
383	0.35
384	0.36
385	0.35
386	0.32
387	0.27
388	0.19
389	0.2
390	0.24
391	0.29
392	0.28
393	0.29
394	0.36
395	0.41
396	0.47
397	0.51
398	0.51
399	0.52
400	0.6
401	0.59
402	0.57
403	0.61
404	0.55
405	0.48
406	0.44
407	0.38
408	0.29
409	0.32
410	0.27
411	0.17
412	0.17
413	0.19
414	0.26
415	0.31
416	0.31
417	0.36
418	0.41
419	0.48

G0RRY1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer