Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

G0RHZ0

Protein Details
Accession G0RHZ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
30-54ATGFPQHKRRWKSSAFKQQRNGGAAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013929  RNA_pol_II_AP1_C  
IPR013930  RNA_pol_II_AP1_N  
IPR039913  RPAP1/Rba50  
Gene Ontology GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG tre:TRIREDRAFT_47621  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08620  RPAP1_C  
PF08621  RPAP1_N  
Amino Acid Sequences MDPTLLIGDIVERDDKATKPVEFPSGPIPATGFPQHKRRWKSSAFKQQRNGGAAPQSNQAQSTEPAQSQTFEEAERERIDRENRQKISDMTPQEISRAQEDLLNGLNPALIQRLLQRANIDEPDPTSPFNLPESREPQPTSASSRAPPEIRVGDVPKAATVEDETADVARPEQNTKSTPAPSPPPPPAAQTKSTKKIPDNYDEDQAPAQIPPDLFPITDLPKSTHFPVPPSLPDLDPSDPNFLATLHDKYFPNLPADPSKLAWMAPVPTQDSPADKDSPYYPHPEISVSALRFDFRGRFLSPRVSRSIPASKGLHHHGEAPEAAGYTIAELARLARSAVPAQRCIAFQTLGRILYRLGRGEWGTTPEHPIAMGVWSAVKEGRVLESLTEASMAEGGHRGSRAYAVEALWLFEKGGWREKLQVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.2
4 0.25
5 0.25
6 0.28
7 0.31
8 0.36
9 0.33
10 0.35
11 0.36
12 0.35
13 0.33
14 0.3
15 0.28
16 0.22
17 0.26
18 0.3
19 0.31
20 0.32
21 0.41
22 0.5
23 0.57
24 0.65
25 0.67
26 0.7
27 0.73
28 0.78
29 0.8
30 0.82
31 0.84
32 0.85
33 0.85
34 0.84
35 0.81
36 0.76
37 0.66
38 0.59
39 0.56
40 0.51
41 0.45
42 0.42
43 0.37
44 0.33
45 0.32
46 0.28
47 0.23
48 0.21
49 0.23
50 0.22
51 0.2
52 0.22
53 0.22
54 0.22
55 0.21
56 0.23
57 0.2
58 0.16
59 0.18
60 0.17
61 0.2
62 0.21
63 0.21
64 0.2
65 0.25
66 0.3
67 0.38
68 0.46
69 0.52
70 0.53
71 0.55
72 0.56
73 0.53
74 0.54
75 0.52
76 0.45
77 0.38
78 0.4
79 0.37
80 0.36
81 0.35
82 0.3
83 0.24
84 0.22
85 0.18
86 0.17
87 0.17
88 0.16
89 0.15
90 0.13
91 0.12
92 0.1
93 0.1
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.06
98 0.06
99 0.1
100 0.16
101 0.18
102 0.19
103 0.2
104 0.21
105 0.25
106 0.26
107 0.23
108 0.17
109 0.18
110 0.2
111 0.2
112 0.18
113 0.16
114 0.15
115 0.16
116 0.19
117 0.2
118 0.19
119 0.24
120 0.29
121 0.31
122 0.34
123 0.34
124 0.32
125 0.32
126 0.32
127 0.32
128 0.3
129 0.29
130 0.27
131 0.29
132 0.31
133 0.29
134 0.28
135 0.26
136 0.24
137 0.23
138 0.24
139 0.23
140 0.21
141 0.21
142 0.2
143 0.16
144 0.15
145 0.14
146 0.11
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.09
158 0.11
159 0.12
160 0.15
161 0.16
162 0.2
163 0.23
164 0.23
165 0.24
166 0.25
167 0.29
168 0.3
169 0.33
170 0.33
171 0.33
172 0.31
173 0.32
174 0.36
175 0.35
176 0.36
177 0.39
178 0.43
179 0.46
180 0.49
181 0.5
182 0.47
183 0.51
184 0.5
185 0.49
186 0.48
187 0.44
188 0.43
189 0.39
190 0.37
191 0.29
192 0.24
193 0.18
194 0.12
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.09
203 0.11
204 0.12
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.15
209 0.17
210 0.19
211 0.21
212 0.19
213 0.2
214 0.23
215 0.24
216 0.22
217 0.23
218 0.21
219 0.17
220 0.18
221 0.2
222 0.18
223 0.18
224 0.18
225 0.19
226 0.18
227 0.18
228 0.16
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.15
233 0.13
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.21
238 0.21
239 0.22
240 0.2
241 0.21
242 0.22
243 0.24
244 0.25
245 0.21
246 0.21
247 0.18
248 0.17
249 0.15
250 0.12
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.14
255 0.13
256 0.16
257 0.16
258 0.17
259 0.18
260 0.2
261 0.2
262 0.18
263 0.19
264 0.19
265 0.23
266 0.23
267 0.26
268 0.23
269 0.22
270 0.23
271 0.22
272 0.21
273 0.21
274 0.25
275 0.19
276 0.2
277 0.19
278 0.19
279 0.18
280 0.19
281 0.17
282 0.13
283 0.17
284 0.17
285 0.2
286 0.22
287 0.32
288 0.34
289 0.36
290 0.39
291 0.37
292 0.37
293 0.4
294 0.45
295 0.37
296 0.4
297 0.37
298 0.35
299 0.38
300 0.41
301 0.38
302 0.31
303 0.34
304 0.28
305 0.29
306 0.27
307 0.23
308 0.19
309 0.15
310 0.14
311 0.09
312 0.08
313 0.06
314 0.08
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.08
323 0.1
324 0.15
325 0.2
326 0.23
327 0.24
328 0.26
329 0.27
330 0.26
331 0.27
332 0.26
333 0.21
334 0.19
335 0.23
336 0.25
337 0.25
338 0.24
339 0.22
340 0.2
341 0.24
342 0.27
343 0.22
344 0.19
345 0.22
346 0.22
347 0.24
348 0.26
349 0.24
350 0.24
351 0.23
352 0.28
353 0.24
354 0.23
355 0.2
356 0.18
357 0.15
358 0.14
359 0.12
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.11
368 0.13
369 0.13
370 0.14
371 0.13
372 0.15
373 0.15
374 0.14
375 0.14
376 0.11
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.08
381 0.09
382 0.1
383 0.12
384 0.13
385 0.13
386 0.12
387 0.16
388 0.16
389 0.17
390 0.19
391 0.17
392 0.22
393 0.21
394 0.22
395 0.2
396 0.19
397 0.16
398 0.15
399 0.21
400 0.2
401 0.29
402 0.3
403 0.32