Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RHT0

Protein Details
Accession G0RHT0    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-32NQQFCSFKLKTEKQQNFCRNEHydrophilic
276-312ESEAEKAGSKRKRGKVTKMKSKRPKQQEKEKLTLTNDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
143-157LAPKVRHREATRERK
281-302KAGSKRKRGKVTKMKSKRPKQQ
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029004  L28e/Mak16  
IPR006958  Mak16  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG tre:TRIREDRAFT_59991  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04874  Mak16  
PF01778  Ribosomal_L28e  
Amino Acid Sequences MASDEIVWQIINQQFCSFKLKTEKQQNFCRNEYNVTGLCNRQSCPLANSRYATIRQHPTKDTLYLYMKTVERAHLPSKMWERIKLSNNYTKALEQIDERLIYWPKFLIHKCKQRLTRLTQVQIRMRRIAAEDERLGEKLVPKLAPKVRHREATRERKAEAAAKLERTIERELLERLRQGAYGDQPLNVSEDIWKKVLNAMEKGGEGERDKDMDQGIESDEEEEEREGEAGSEEDDAEAAIEYVSDLDESEDELEDLEDWLESEEEEEEEEEEDSDESEAEKAGSKRKRGKVTKMKSKRPKQQEKEKLTLTNDLAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.32
4 0.26
5 0.29
6 0.38
7 0.44
8 0.52
9 0.61
10 0.69
11 0.7
12 0.81
13 0.83
14 0.8
15 0.76
16 0.72
17 0.64
18 0.6
19 0.54
20 0.49
21 0.41
22 0.38
23 0.37
24 0.33
25 0.35
26 0.32
27 0.3
28 0.29
29 0.31
30 0.3
31 0.31
32 0.36
33 0.37
34 0.39
35 0.4
36 0.38
37 0.4
38 0.41
39 0.41
40 0.41
41 0.46
42 0.48
43 0.51
44 0.51
45 0.51
46 0.5
47 0.49
48 0.43
49 0.39
50 0.38
51 0.34
52 0.32
53 0.32
54 0.3
55 0.29
56 0.29
57 0.25
58 0.24
59 0.27
60 0.28
61 0.28
62 0.29
63 0.33
64 0.38
65 0.44
66 0.43
67 0.43
68 0.45
69 0.48
70 0.54
71 0.54
72 0.54
73 0.53
74 0.53
75 0.51
76 0.47
77 0.4
78 0.34
79 0.29
80 0.23
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.16
85 0.16
86 0.18
87 0.2
88 0.19
89 0.18
90 0.16
91 0.15
92 0.21
93 0.24
94 0.3
95 0.36
96 0.46
97 0.52
98 0.59
99 0.64
100 0.67
101 0.72
102 0.69
103 0.7
104 0.67
105 0.67
106 0.63
107 0.63
108 0.61
109 0.6
110 0.55
111 0.47
112 0.41
113 0.35
114 0.32
115 0.32
116 0.27
117 0.24
118 0.22
119 0.21
120 0.22
121 0.21
122 0.2
123 0.15
124 0.14
125 0.12
126 0.14
127 0.13
128 0.13
129 0.2
130 0.24
131 0.32
132 0.35
133 0.42
134 0.44
135 0.5
136 0.51
137 0.54
138 0.6
139 0.63
140 0.66
141 0.6
142 0.56
143 0.5
144 0.5
145 0.45
146 0.37
147 0.31
148 0.25
149 0.23
150 0.24
151 0.24
152 0.23
153 0.21
154 0.2
155 0.16
156 0.14
157 0.15
158 0.16
159 0.17
160 0.18
161 0.15
162 0.16
163 0.15
164 0.14
165 0.13
166 0.14
167 0.13
168 0.17
169 0.17
170 0.15
171 0.15
172 0.15
173 0.16
174 0.14
175 0.12
176 0.11
177 0.14
178 0.15
179 0.15
180 0.15
181 0.14
182 0.17
183 0.2
184 0.19
185 0.18
186 0.17
187 0.18
188 0.18
189 0.19
190 0.16
191 0.15
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.14
197 0.14
198 0.14
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.12
268 0.14
269 0.23
270 0.3
271 0.38
272 0.48
273 0.57
274 0.67
275 0.71
276 0.8
277 0.82
278 0.87
279 0.89
280 0.9
281 0.92
282 0.92
283 0.94
284 0.94
285 0.94
286 0.94
287 0.93
288 0.94
289 0.93
290 0.91
291 0.89
292 0.85
293 0.8
294 0.73
295 0.7