Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RAF9

Protein Details
Accession G0RAF9    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-32VAVFKKRGAKGKANLRKRPATPHydrophilic
302-327NSATRLKKLLEKKRERAARRRQEAIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-30KKRGAKGKANLRKRPA
57-60KRRK
308-322KKLLEKKRERAARRR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG tre:TRIREDRAFT_119991  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16539  RING-HC_RNF113A_B  
Amino Acid Sequences MADTEAGSAPVAVFKKRGAKGKANLRKRPATPPPAASDSDSDSDFSSSEDEAGHRVKRRKRTAVVTAAARGAAPSNRDDGGGATAAFTANRSVPIADSNDATKHSNWYDEDAKDALSAKNLLGSSRASKDAQPDGTYKGLANQTSFIQKNPDAPRKTVGPVKAPTNIRTVTITDYAPDTCKESLYCGFGDNCKYLHAREDLKAGWQLDQEWEKVTKGKKNLGGTVVASANRNKAKVDEGDDDDDEEAMLENIPFACIICRESYKEPIVTRCGHYFCLPCALQRYKKDPTCAACGSGTNGVFNSATRLKKLLEKKRERAARRRQEAIERGEEVSDEEEEEEED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.29
3 0.34
4 0.44
5 0.46
6 0.54
7 0.62
8 0.71
9 0.77
10 0.79
11 0.82
12 0.81
13 0.82
14 0.77
15 0.78
16 0.77
17 0.76
18 0.72
19 0.68
20 0.66
21 0.62
22 0.59
23 0.51
24 0.44
25 0.39
26 0.34
27 0.29
28 0.24
29 0.2
30 0.19
31 0.17
32 0.14
33 0.12
34 0.1
35 0.1
36 0.1
37 0.1
38 0.13
39 0.17
40 0.21
41 0.27
42 0.35
43 0.42
44 0.52
45 0.62
46 0.68
47 0.72
48 0.75
49 0.77
50 0.78
51 0.76
52 0.68
53 0.61
54 0.51
55 0.43
56 0.35
57 0.25
58 0.19
59 0.15
60 0.14
61 0.13
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.14
67 0.14
68 0.13
69 0.11
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.09
81 0.12
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.15
86 0.15
87 0.17
88 0.19
89 0.16
90 0.18
91 0.18
92 0.2
93 0.2
94 0.24
95 0.27
96 0.24
97 0.26
98 0.23
99 0.22
100 0.19
101 0.2
102 0.15
103 0.11
104 0.12
105 0.09
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.13
111 0.14
112 0.16
113 0.19
114 0.16
115 0.18
116 0.22
117 0.25
118 0.25
119 0.24
120 0.23
121 0.24
122 0.24
123 0.23
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.17
128 0.16
129 0.15
130 0.15
131 0.2
132 0.21
133 0.17
134 0.18
135 0.18
136 0.26
137 0.32
138 0.4
139 0.36
140 0.37
141 0.39
142 0.38
143 0.4
144 0.36
145 0.31
146 0.28
147 0.28
148 0.3
149 0.34
150 0.33
151 0.32
152 0.32
153 0.3
154 0.25
155 0.23
156 0.22
157 0.18
158 0.18
159 0.16
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.11
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.13
175 0.14
176 0.16
177 0.15
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.13
182 0.16
183 0.18
184 0.19
185 0.19
186 0.22
187 0.2
188 0.21
189 0.24
190 0.21
191 0.18
192 0.16
193 0.15
194 0.16
195 0.17
196 0.16
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.19
201 0.22
202 0.24
203 0.27
204 0.32
205 0.36
206 0.38
207 0.41
208 0.38
209 0.36
210 0.31
211 0.29
212 0.25
213 0.2
214 0.19
215 0.17
216 0.21
217 0.21
218 0.21
219 0.19
220 0.18
221 0.21
222 0.22
223 0.27
224 0.25
225 0.27
226 0.3
227 0.29
228 0.29
229 0.25
230 0.22
231 0.16
232 0.12
233 0.08
234 0.05
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.08
245 0.1
246 0.13
247 0.17
248 0.21
249 0.27
250 0.29
251 0.33
252 0.34
253 0.36
254 0.39
255 0.38
256 0.38
257 0.38
258 0.36
259 0.34
260 0.35
261 0.33
262 0.29
263 0.33
264 0.3
265 0.27
266 0.33
267 0.38
268 0.42
269 0.47
270 0.53
271 0.55
272 0.59
273 0.63
274 0.62
275 0.58
276 0.59
277 0.53
278 0.49
279 0.41
280 0.37
281 0.34
282 0.33
283 0.28
284 0.21
285 0.2
286 0.19
287 0.18
288 0.17
289 0.2
290 0.21
291 0.22
292 0.23
293 0.26
294 0.26
295 0.34
296 0.45
297 0.49
298 0.54
299 0.63
300 0.69
301 0.77
302 0.85
303 0.85
304 0.86
305 0.86
306 0.86
307 0.84
308 0.84
309 0.79
310 0.79
311 0.78
312 0.75
313 0.69
314 0.61
315 0.54
316 0.46
317 0.41
318 0.32
319 0.26
320 0.2
321 0.14
322 0.12