Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RDG5

Protein Details
Accession G0RDG5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-71EYQGRKRKEFEDYVRRNRVKBasic
618-644DVEAVQKQMPRRVKRRRRVQDESGGTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
628-634RRVKRRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.833, cyto 8, cyto_mito 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG tre:TRIREDRAFT_75739  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF13428  TPR_14  
Amino Acid Sequences MESSRGPPRVKNKAAAPIQISAEQLLREAVDRQEVQIQAPTQRFADLEELHEYQGRKRKEFEDYVRRNRVKLSNWLQYAQWELEQKEFARARSVFERCLDVHPNEVQVWTRYIEAEMKSRNINHARNLLDRAVTRLPRVDKMWYKYVYMEEMLGNIPGVRQVFDRWMQWQPGEAAWSAYIKMEKRYGEYDRAREIFRTFTMVHPEPRNWIKWAKFEEEYGTSDQVREVFGTAVETLGDEFVDEKLFIAYARFESKLKEYERARAIYKYALDRLPRSKSRLLHAAYTTFEKQFGDQDGVEDVVLSKRRVFYEEQVRENPKNYDAWFDYAGLEEASRDADRVRDVYERAIAQVPPTQEKRHWRRYIYLWIFYAVWEELEGQDIERARQIYTTCLNLIPHKKFTFAKIWLLAAQFEIRQGDLAAARKLLGRAIGMCPKDKLFNGYIDLERKLFEFVRCRKLYEKHVQYNPTNCQTWIKFAELERGLDDLDRARAIFELAVSQPQLDMPELLWKAYIDFEEEEGEYERTRALYERLLEKTDHVKVWISYAHFEINIPEEGGEDEEQEQEDEEQPVSEEAKARARRVFERAHKSMRDKDLKEERVSLLNAWLSFERTHGSEADVEAVQKQMPRRVKRRRRVQDESGGTAGEDVYEEYYDYVFPADDQQAKNLSNIMAMAQKWKQTGGDLSGAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.67
3 0.61
4 0.55
5 0.52
6 0.47
7 0.41
8 0.32
9 0.29
10 0.22
11 0.19
12 0.16
13 0.13
14 0.12
15 0.14
16 0.14
17 0.19
18 0.19
19 0.21
20 0.26
21 0.27
22 0.27
23 0.29
24 0.3
25 0.3
26 0.32
27 0.32
28 0.27
29 0.27
30 0.26
31 0.23
32 0.27
33 0.22
34 0.23
35 0.26
36 0.27
37 0.26
38 0.3
39 0.28
40 0.29
41 0.36
42 0.39
43 0.37
44 0.41
45 0.45
46 0.5
47 0.59
48 0.62
49 0.65
50 0.69
51 0.76
52 0.82
53 0.79
54 0.71
55 0.69
56 0.67
57 0.61
58 0.61
59 0.6
60 0.58
61 0.6
62 0.6
63 0.53
64 0.47
65 0.45
66 0.36
67 0.31
68 0.27
69 0.25
70 0.26
71 0.29
72 0.28
73 0.33
74 0.34
75 0.31
76 0.34
77 0.33
78 0.35
79 0.41
80 0.43
81 0.38
82 0.37
83 0.41
84 0.34
85 0.4
86 0.4
87 0.32
88 0.34
89 0.32
90 0.33
91 0.29
92 0.28
93 0.25
94 0.21
95 0.22
96 0.18
97 0.18
98 0.15
99 0.16
100 0.2
101 0.2
102 0.24
103 0.26
104 0.27
105 0.3
106 0.31
107 0.38
108 0.41
109 0.43
110 0.43
111 0.46
112 0.47
113 0.47
114 0.5
115 0.43
116 0.38
117 0.34
118 0.34
119 0.34
120 0.32
121 0.3
122 0.32
123 0.34
124 0.35
125 0.37
126 0.4
127 0.41
128 0.45
129 0.51
130 0.46
131 0.45
132 0.43
133 0.43
134 0.36
135 0.29
136 0.25
137 0.17
138 0.16
139 0.15
140 0.13
141 0.11
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.1
149 0.15
150 0.17
151 0.19
152 0.21
153 0.25
154 0.26
155 0.25
156 0.26
157 0.23
158 0.22
159 0.22
160 0.18
161 0.14
162 0.13
163 0.13
164 0.11
165 0.11
166 0.14
167 0.13
168 0.16
169 0.2
170 0.2
171 0.23
172 0.28
173 0.31
174 0.37
175 0.41
176 0.42
177 0.44
178 0.46
179 0.43
180 0.4
181 0.37
182 0.3
183 0.25
184 0.26
185 0.2
186 0.2
187 0.27
188 0.28
189 0.33
190 0.33
191 0.33
192 0.35
193 0.38
194 0.38
195 0.33
196 0.37
197 0.35
198 0.39
199 0.42
200 0.41
201 0.38
202 0.37
203 0.37
204 0.33
205 0.32
206 0.28
207 0.25
208 0.2
209 0.19
210 0.18
211 0.15
212 0.13
213 0.11
214 0.09
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.03
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.13
241 0.17
242 0.23
243 0.24
244 0.29
245 0.29
246 0.35
247 0.39
248 0.4
249 0.39
250 0.33
251 0.33
252 0.29
253 0.3
254 0.25
255 0.24
256 0.25
257 0.25
258 0.27
259 0.32
260 0.36
261 0.37
262 0.4
263 0.42
264 0.41
265 0.43
266 0.47
267 0.43
268 0.4
269 0.38
270 0.34
271 0.3
272 0.31
273 0.28
274 0.21
275 0.19
276 0.15
277 0.14
278 0.15
279 0.15
280 0.13
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.11
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.13
294 0.16
295 0.18
296 0.22
297 0.31
298 0.36
299 0.38
300 0.41
301 0.46
302 0.44
303 0.44
304 0.39
305 0.29
306 0.26
307 0.23
308 0.22
309 0.19
310 0.2
311 0.19
312 0.18
313 0.17
314 0.14
315 0.14
316 0.1
317 0.08
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.09
328 0.1
329 0.11
330 0.12
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.14
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.14
339 0.16
340 0.18
341 0.19
342 0.21
343 0.32
344 0.39
345 0.47
346 0.51
347 0.49
348 0.52
349 0.55
350 0.62
351 0.56
352 0.51
353 0.41
354 0.36
355 0.34
356 0.29
357 0.25
358 0.14
359 0.1
360 0.07
361 0.07
362 0.05
363 0.07
364 0.07
365 0.05
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.09
370 0.1
371 0.09
372 0.11
373 0.11
374 0.13
375 0.14
376 0.15
377 0.14
378 0.15
379 0.16
380 0.19
381 0.26
382 0.26
383 0.3
384 0.29
385 0.32
386 0.31
387 0.34
388 0.36
389 0.32
390 0.33
391 0.28
392 0.29
393 0.27
394 0.27
395 0.23
396 0.16
397 0.14
398 0.1
399 0.1
400 0.09
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.08
406 0.11
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.11
411 0.12
412 0.11
413 0.09
414 0.08
415 0.09
416 0.12
417 0.18
418 0.18
419 0.19
420 0.19
421 0.2
422 0.22
423 0.2
424 0.21
425 0.17
426 0.18
427 0.2
428 0.22
429 0.23
430 0.24
431 0.24
432 0.2
433 0.19
434 0.17
435 0.17
436 0.16
437 0.17
438 0.23
439 0.29
440 0.38
441 0.39
442 0.41
443 0.45
444 0.48
445 0.54
446 0.55
447 0.59
448 0.57
449 0.63
450 0.66
451 0.65
452 0.66
453 0.63
454 0.57
455 0.49
456 0.41
457 0.4
458 0.35
459 0.36
460 0.32
461 0.28
462 0.26
463 0.25
464 0.33
465 0.28
466 0.28
467 0.23
468 0.21
469 0.19
470 0.17
471 0.17
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.08
477 0.08
478 0.09
479 0.08
480 0.07
481 0.08
482 0.08
483 0.1
484 0.1
485 0.09
486 0.09
487 0.09
488 0.1
489 0.08
490 0.08
491 0.07
492 0.14
493 0.14
494 0.14
495 0.14
496 0.13
497 0.13
498 0.14
499 0.14
500 0.1
501 0.1
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.13
506 0.14
507 0.14
508 0.12
509 0.11
510 0.11
511 0.1
512 0.1
513 0.11
514 0.11
515 0.15
516 0.18
517 0.24
518 0.26
519 0.28
520 0.27
521 0.29
522 0.33
523 0.32
524 0.3
525 0.25
526 0.25
527 0.23
528 0.26
529 0.26
530 0.21
531 0.19
532 0.2
533 0.2
534 0.18
535 0.18
536 0.16
537 0.16
538 0.15
539 0.13
540 0.11
541 0.1
542 0.11
543 0.13
544 0.12
545 0.1
546 0.1
547 0.1
548 0.11
549 0.1
550 0.11
551 0.1
552 0.11
553 0.12
554 0.11
555 0.1
556 0.11
557 0.12
558 0.12
559 0.12
560 0.14
561 0.15
562 0.24
563 0.28
564 0.31
565 0.34
566 0.38
567 0.41
568 0.44
569 0.51
570 0.52
571 0.58
572 0.61
573 0.66
574 0.68
575 0.7
576 0.72
577 0.72
578 0.72
579 0.65
580 0.68
581 0.7
582 0.69
583 0.66
584 0.62
585 0.54
586 0.49
587 0.48
588 0.39
589 0.33
590 0.29
591 0.26
592 0.24
593 0.23
594 0.2
595 0.19
596 0.19
597 0.17
598 0.16
599 0.18
600 0.16
601 0.17
602 0.16
603 0.16
604 0.19
605 0.17
606 0.16
607 0.15
608 0.15
609 0.15
610 0.16
611 0.19
612 0.25
613 0.34
614 0.43
615 0.53
616 0.64
617 0.74
618 0.81
619 0.89
620 0.91
621 0.92
622 0.91
623 0.9
624 0.89
625 0.85
626 0.79
627 0.69
628 0.58
629 0.47
630 0.39
631 0.29
632 0.18
633 0.12
634 0.07
635 0.07
636 0.07
637 0.08
638 0.08
639 0.09
640 0.08
641 0.08
642 0.08
643 0.07
644 0.07
645 0.12
646 0.17
647 0.23
648 0.24
649 0.28
650 0.32
651 0.33
652 0.33
653 0.31
654 0.26
655 0.21
656 0.2
657 0.18
658 0.17
659 0.17
660 0.23
661 0.23
662 0.27
663 0.27
664 0.29
665 0.28
666 0.27
667 0.32
668 0.29