FuNGI

G0RCH3

Protein Details

Accession

G0RCH3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
537-563	IQKHVQNSGRRPRTRARPKSLEQFCRM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 16, nucl 6, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024500 DUF3074 IPR002078 Sigma_54_int IPR023393 START-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
KEGG	tre:TRIREDRAFT_75470 -
Pfam	View protein in Pfam PF11274 DUF3074
PROSITE	View protein in PROSITE PS50045 SIGMA54_INTERACT_4

Amino Acid Sequences

MAQYGPYVRLWGIRPSQLPAETASAQDLVPFLQSILSEAVPFISSVPLQSSSSSSSSSSSSSGKSNKSSQGGAGLDGPWKPKGCRAFPHSAAPVHMFERVVSAEDLKLAAKSDNLPQASSSSGAAPKFRPETWSLRRSVHEGARKAGTADWDEWKRCFKDEHADAEMKFTPSVMDHALKKQWDCTGAEVTLGGDTYEDLTLKLEESTHKMPAPLNNRVFPVLQLTAAVRGRREFIVVQIAAVPESSKAEEQRPDGAVRGAYTSIERFREVDEQGNVEWLMGTVSDARGVLPAWIQKMAVPGQIAKDVDMFLEWIAKEREGNPPRPFADADAVARITVELNVRTVSAQTERLEEELAALAEYIEADKEFREKHDKRLQNLCNEILAVKQRVVEIQGPEWNEGGGGGGEKAEAGQKEVDEAVERLRREMGEMRGLVSDMSSALDKLPTAAEAEALVRRSQAPASASNGDATQAPAIDKASGTKEARSIKQRIEDTIASTRRWNSDHKTTKLTDAVFIANYLKQQSKRDPQMAVYMQRTIQKHVQNSGRRPRTRARPKSLEQFCRMLVWKDVLDTAEIVLVRDWRRTARALEERG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.39
3	0.44
4	0.41
5	0.39
6	0.34
7	0.34
8	0.29
9	0.27
10	0.25
11	0.2
12	0.18
13	0.18
14	0.16
15	0.1
16	0.1
17	0.1
18	0.08
19	0.08
20	0.08
21	0.1
22	0.12
23	0.12
24	0.11
25	0.11
26	0.12
27	0.11
28	0.11
29	0.09
30	0.09
31	0.09
32	0.1
33	0.13
34	0.14
35	0.15
36	0.16
37	0.18
38	0.2
39	0.21
40	0.22
41	0.2
42	0.19
43	0.19
44	0.2
45	0.2
46	0.19
47	0.19
48	0.24
49	0.3
50	0.33
51	0.37
52	0.42
53	0.46
54	0.48
55	0.47
56	0.41
57	0.42
58	0.38
59	0.33
60	0.29
61	0.23
62	0.22
63	0.22
64	0.24
65	0.2
66	0.23
67	0.23
68	0.27
69	0.34
70	0.38
71	0.45
72	0.5
73	0.56
74	0.57
75	0.64
76	0.62
77	0.55
78	0.52
79	0.46
80	0.41
81	0.32
82	0.31
83	0.23
84	0.18
85	0.19
86	0.17
87	0.16
88	0.14
89	0.14
90	0.12
91	0.12
92	0.13
93	0.11
94	0.11
95	0.1
96	0.1
97	0.1
98	0.12
99	0.17
100	0.23
101	0.24
102	0.24
103	0.23
104	0.24
105	0.23
106	0.22
107	0.17
108	0.13
109	0.16
110	0.17
111	0.19
112	0.19
113	0.24
114	0.27
115	0.27
116	0.27
117	0.29
118	0.38
119	0.44
120	0.49
121	0.47
122	0.47
123	0.48
124	0.49
125	0.5
126	0.48
127	0.47
128	0.43
129	0.43
130	0.42
131	0.4
132	0.37
133	0.31
134	0.27
135	0.22
136	0.22
137	0.26
138	0.28
139	0.3
140	0.31
141	0.36
142	0.34
143	0.33
144	0.33
145	0.29
146	0.34
147	0.38
148	0.42
149	0.41
150	0.42
151	0.4
152	0.42
153	0.41
154	0.31
155	0.26
156	0.2
157	0.15
158	0.12
159	0.14
160	0.13
161	0.15
162	0.16
163	0.2
164	0.24
165	0.25
166	0.26
167	0.26
168	0.26
169	0.25
170	0.24
171	0.24
172	0.23
173	0.21
174	0.2
175	0.17
176	0.15
177	0.12
178	0.11
179	0.08
180	0.04
181	0.04
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.06
187	0.06
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.08
192	0.14
193	0.16
194	0.17
195	0.18
196	0.19
197	0.21
198	0.26
199	0.32
200	0.35
201	0.36
202	0.36
203	0.36
204	0.37
205	0.35
206	0.28
207	0.25
208	0.17
209	0.14
210	0.12
211	0.12
212	0.15
213	0.17
214	0.17
215	0.14
216	0.14
217	0.16
218	0.16
219	0.17
220	0.13
221	0.12
222	0.18
223	0.17
224	0.16
225	0.15
226	0.15
227	0.13
228	0.13
229	0.11
230	0.05
231	0.06
232	0.07
233	0.07
234	0.09
235	0.12
236	0.15
237	0.17
238	0.2
239	0.21
240	0.2
241	0.2
242	0.19
243	0.16
244	0.14
245	0.13
246	0.1
247	0.08
248	0.09
249	0.1
250	0.11
251	0.12
252	0.12
253	0.12
254	0.13
255	0.17
256	0.17
257	0.19
258	0.18
259	0.18
260	0.17
261	0.18
262	0.15
263	0.11
264	0.1
265	0.06
266	0.05
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.05
275	0.05
276	0.05
277	0.06
278	0.07
279	0.07
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.1
284	0.11
285	0.11
286	0.1
287	0.1
288	0.1
289	0.13
290	0.12
291	0.1
292	0.1
293	0.09
294	0.08
295	0.07
296	0.07
297	0.04
298	0.06
299	0.06
300	0.08
301	0.08
302	0.09
303	0.09
304	0.11
305	0.21
306	0.23
307	0.3
308	0.3
309	0.34
310	0.35
311	0.36
312	0.35
313	0.26
314	0.25
315	0.2
316	0.18
317	0.15
318	0.15
319	0.12
320	0.12
321	0.1
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.07
326	0.07
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.08
331	0.08
332	0.09
333	0.12
334	0.12
335	0.13
336	0.14
337	0.14
338	0.14
339	0.12
340	0.11
341	0.09
342	0.08
343	0.06
344	0.05
345	0.05
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.04
353	0.07
354	0.07
355	0.11
356	0.22
357	0.23
358	0.33
359	0.43
360	0.48
361	0.52
362	0.61
363	0.63
364	0.59
365	0.61
366	0.52
367	0.43
368	0.37
369	0.32
370	0.24
371	0.23
372	0.17
373	0.14
374	0.14
375	0.14
376	0.14
377	0.16
378	0.18
379	0.16
380	0.17
381	0.19
382	0.2
383	0.2
384	0.2
385	0.17
386	0.13
387	0.11
388	0.09
389	0.06
390	0.05
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.07
397	0.07
398	0.08
399	0.09
400	0.09
401	0.1
402	0.11
403	0.11
404	0.09
405	0.1
406	0.14
407	0.17
408	0.17
409	0.17
410	0.19
411	0.18
412	0.2
413	0.25
414	0.23
415	0.25
416	0.25
417	0.25
418	0.24
419	0.24
420	0.21
421	0.15
422	0.12
423	0.06
424	0.07
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.07
429	0.06
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.08
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.09
438	0.11
439	0.12
440	0.12
441	0.11
442	0.12
443	0.13
444	0.13
445	0.15
446	0.15
447	0.17
448	0.22
449	0.23
450	0.23
451	0.22
452	0.22
453	0.19
454	0.17
455	0.15
456	0.1
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.1
461	0.1
462	0.09
463	0.11
464	0.13
465	0.2
466	0.21
467	0.22
468	0.27
469	0.33
470	0.39
471	0.44
472	0.46
473	0.45
474	0.52
475	0.52
476	0.49
477	0.5
478	0.44
479	0.42
480	0.46
481	0.44
482	0.37
483	0.38
484	0.38
485	0.36
486	0.37
487	0.39
488	0.37
489	0.45
490	0.54
491	0.54
492	0.58
493	0.56
494	0.59
495	0.58
496	0.51
497	0.42
498	0.35
499	0.32
500	0.25
501	0.24
502	0.21
503	0.17
504	0.18
505	0.19
506	0.23
507	0.25
508	0.31
509	0.4
510	0.48
511	0.56
512	0.6
513	0.59
514	0.55
515	0.61
516	0.6
517	0.57
518	0.49
519	0.43
520	0.41
521	0.44
522	0.44
523	0.4
524	0.42
525	0.42
526	0.44
527	0.49
528	0.56
529	0.59
530	0.68
531	0.73
532	0.75
533	0.73
534	0.75
535	0.76
536	0.78
537	0.8
538	0.81
539	0.8
540	0.8
541	0.83
542	0.87
543	0.88
544	0.86
545	0.8
546	0.73
547	0.64
548	0.6
549	0.55
550	0.48
551	0.41
552	0.36
553	0.32
554	0.29
555	0.29
556	0.24
557	0.22
558	0.19
559	0.16
560	0.14
561	0.14
562	0.13
563	0.13
564	0.18
565	0.19
566	0.22
567	0.24
568	0.25
569	0.29
570	0.33
571	0.35
572	0.4

G0RCH3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer