FuNGI

G0RDG4

Protein Details

Accession

G0RDG4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
398-419	VPDDKPARKRGGRRARKAKEAL	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
401-417	DKPARKRGGRRARKAKE

Subcellular Location(s)

cyto 14, nucl 9, cyto_pero 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR042239 Nop_C IPR002687 Nop_dom IPR036070 Nop_dom_sf IPR012976 NOSIC IPR027105 Prp31 IPR019175 Prp31_C
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome GO:0000244 P:spliceosomal tri-snRNP complex assembly
KEGG	tre:TRIREDRAFT_75736 -
Pfam	View protein in Pfam PF01798 Nop PF09785 Prp31_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51358 NOP

Amino Acid Sequences

MSTVADDLLNDFGSSGDEAEELENDGLVLPEKAEKKANGDRDAMDVDDDDDNDEASDDEGAGAGAGALNDMEDAEATKAKVEKMQLGAVKDVRSVASLMQTLEPVLEKINHYRSQPTAQQTSVGNIEDHPEYHLLTQSNSLSTMIDGEVALVHKFIRDHYSTRFPELERLVTTPLEYAKVVAIIGNGPMDAENIKALQTSTENPLGVGLKAVLDGPSLMIVTVEATTSKGHEMAPEELQRVRQACEMMIALHRAKQTLTEYVQSRMNIFAPNLTVLIGSLTAAQLLNAAGGLTGLSKTPACNIPSWGSKKRQAGLATNIGIRQQGYLYNSDIIRGIPNDLKKQAMRIVAAKLVLAARVDRIHSSPDGSTGEQLKSACLERLEKLTEPPPNKGQRALPVPDDKPARKRGGRRARKAKEALAMTELRKAQNRMAFGKEEKEVGYGTGEGTVGMGMIGQANDGRIRGMQVDQRTRAKLGVKSKGWGGASTLGGGGTASSIGGFGMAPGMDLRGKGLRTSGVGTTVGSATGIQSSLAFTPVQGLELVDPKMQAELSRKRKAEEDKWFKGGSFTQVGNNSGGAGAGGFKVPGPPALKKVDTGATKMGPPPVPNRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.09
3	0.08
4	0.07
5	0.08
6	0.09
7	0.09
8	0.1
9	0.1
10	0.09
11	0.08
12	0.08
13	0.08
14	0.08
15	0.08
16	0.07
17	0.13
18	0.16
19	0.18
20	0.24
21	0.25
22	0.32
23	0.41
24	0.48
25	0.47
26	0.48
27	0.47
28	0.45
29	0.45
30	0.38
31	0.3
32	0.22
33	0.19
34	0.17
35	0.16
36	0.13
37	0.11
38	0.11
39	0.1
40	0.1
41	0.08
42	0.07
43	0.07
44	0.06
45	0.05
46	0.05
47	0.05
48	0.05
49	0.04
50	0.04
51	0.04
52	0.04
53	0.04
54	0.03
55	0.04
56	0.04
57	0.04
58	0.04
59	0.03
60	0.05
61	0.06
62	0.08
63	0.09
64	0.12
65	0.13
66	0.14
67	0.18
68	0.2
69	0.24
70	0.25
71	0.31
72	0.31
73	0.32
74	0.36
75	0.35
76	0.33
77	0.29
78	0.27
79	0.21
80	0.19
81	0.17
82	0.13
83	0.14
84	0.15
85	0.15
86	0.15
87	0.15
88	0.14
89	0.13
90	0.13
91	0.1
92	0.1
93	0.11
94	0.13
95	0.19
96	0.27
97	0.29
98	0.31
99	0.34
100	0.36
101	0.41
102	0.45
103	0.45
104	0.42
105	0.39
106	0.4
107	0.37
108	0.36
109	0.32
110	0.26
111	0.2
112	0.16
113	0.18
114	0.16
115	0.15
116	0.14
117	0.13
118	0.12
119	0.13
120	0.16
121	0.14
122	0.14
123	0.18
124	0.17
125	0.17
126	0.17
127	0.16
128	0.12
129	0.12
130	0.12
131	0.08
132	0.08
133	0.07
134	0.06
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.06
139	0.06
140	0.07
141	0.08
142	0.09
143	0.14
144	0.16
145	0.19
146	0.25
147	0.35
148	0.35
149	0.39
150	0.41
151	0.36
152	0.39
153	0.39
154	0.36
155	0.28
156	0.28
157	0.25
158	0.22
159	0.22
160	0.17
161	0.15
162	0.14
163	0.12
164	0.11
165	0.09
166	0.09
167	0.09
168	0.08
169	0.07
170	0.06
171	0.07
172	0.06
173	0.06
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.07
185	0.08
186	0.1
187	0.14
188	0.16
189	0.16
190	0.15
191	0.17
192	0.16
193	0.14
194	0.13
195	0.09
196	0.06
197	0.06
198	0.07
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.04
203	0.05
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.03
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.05
213	0.05
214	0.06
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.09
219	0.11
220	0.13
221	0.17
222	0.18
223	0.19
224	0.19
225	0.2
226	0.21
227	0.19
228	0.18
229	0.16
230	0.15
231	0.14
232	0.14
233	0.14
234	0.12
235	0.12
236	0.13
237	0.11
238	0.14
239	0.14
240	0.13
241	0.13
242	0.14
243	0.15
244	0.17
245	0.18
246	0.2
247	0.21
248	0.23
249	0.26
250	0.23
251	0.22
252	0.19
253	0.18
254	0.15
255	0.13
256	0.12
257	0.1
258	0.1
259	0.09
260	0.08
261	0.07
262	0.05
263	0.06
264	0.05
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.02
280	0.03
281	0.03
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.07
286	0.1
287	0.11
288	0.12
289	0.15
290	0.17
291	0.23
292	0.29
293	0.33
294	0.34
295	0.39
296	0.42
297	0.41
298	0.43
299	0.39
300	0.37
301	0.36
302	0.36
303	0.31
304	0.28
305	0.27
306	0.22
307	0.2
308	0.16
309	0.11
310	0.07
311	0.08
312	0.09
313	0.1
314	0.11
315	0.13
316	0.13
317	0.13
318	0.13
319	0.11
320	0.11
321	0.09
322	0.11
323	0.11
324	0.14
325	0.17
326	0.17
327	0.2
328	0.19
329	0.21
330	0.23
331	0.22
332	0.21
333	0.2
334	0.21
335	0.2
336	0.19
337	0.17
338	0.14
339	0.12
340	0.11
341	0.09
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.09
346	0.09
347	0.1
348	0.11
349	0.12
350	0.13
351	0.12
352	0.14
353	0.15
354	0.14
355	0.16
356	0.16
357	0.16
358	0.16
359	0.16
360	0.14
361	0.13
362	0.14
363	0.13
364	0.12
365	0.14
366	0.13
367	0.17
368	0.19
369	0.18
370	0.2
371	0.23
372	0.28
373	0.28
374	0.31
375	0.36
376	0.4
377	0.41
378	0.41
379	0.39
380	0.4
381	0.43
382	0.42
383	0.39
384	0.39
385	0.38
386	0.4
387	0.44
388	0.4
389	0.41
390	0.45
391	0.48
392	0.48
393	0.55
394	0.6
395	0.66
396	0.73
397	0.77
398	0.81
399	0.8
400	0.83
401	0.79
402	0.73
403	0.68
404	0.6
405	0.5
406	0.43
407	0.41
408	0.32
409	0.33
410	0.3
411	0.25
412	0.27
413	0.28
414	0.28
415	0.28
416	0.32
417	0.3
418	0.31
419	0.33
420	0.31
421	0.32
422	0.29
423	0.27
424	0.23
425	0.21
426	0.18
427	0.14
428	0.14
429	0.1
430	0.09
431	0.09
432	0.08
433	0.07
434	0.07
435	0.06
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.03
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.05
445	0.06
446	0.06
447	0.07
448	0.06
449	0.08
450	0.09
451	0.12
452	0.16
453	0.24
454	0.31
455	0.36
456	0.4
457	0.42
458	0.41
459	0.42
460	0.42
461	0.41
462	0.43
463	0.47
464	0.44
465	0.44
466	0.45
467	0.46
468	0.41
469	0.35
470	0.29
471	0.24
472	0.22
473	0.2
474	0.19
475	0.13
476	0.12
477	0.11
478	0.09
479	0.04
480	0.04
481	0.03
482	0.03
483	0.03
484	0.03
485	0.04
486	0.03
487	0.03
488	0.04
489	0.04
490	0.05
491	0.05
492	0.07
493	0.07
494	0.07
495	0.1
496	0.12
497	0.13
498	0.13
499	0.15
500	0.15
501	0.17
502	0.2
503	0.18
504	0.17
505	0.17
506	0.16
507	0.16
508	0.15
509	0.13
510	0.1
511	0.09
512	0.07
513	0.08
514	0.08
515	0.06
516	0.06
517	0.08
518	0.08
519	0.09
520	0.09
521	0.08
522	0.12
523	0.12
524	0.12
525	0.11
526	0.11
527	0.12
528	0.16
529	0.18
530	0.15
531	0.15
532	0.14
533	0.15
534	0.15
535	0.16
536	0.21
537	0.3
538	0.39
539	0.48
540	0.49
541	0.5
542	0.58
543	0.64
544	0.65
545	0.66
546	0.67
547	0.64
548	0.68
549	0.67
550	0.59
551	0.54
552	0.47
553	0.41
554	0.36
555	0.31
556	0.31
557	0.34
558	0.36
559	0.33
560	0.3
561	0.24
562	0.19
563	0.17
564	0.11
565	0.08
566	0.07
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.09
572	0.09
573	0.15
574	0.19
575	0.22
576	0.28
577	0.35
578	0.36
579	0.35
580	0.39
581	0.41
582	0.39
583	0.39
584	0.39
585	0.35
586	0.36
587	0.38
588	0.41
589	0.37
590	0.38

G0RDG4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer