FuNGI

G0RDT0

Protein Details

Accession

G0RDT0

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
124-150	ATEEQAKSKRDRKRKRKHDNDDLEEKY	Basic
523-552	RDGLPKDLKIGKKHKKKAGRPQNRSAKRAA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
130-140	KSKRDRKRKRK
418-427	VTRAKDPRKT
449-483	KYKPKATPEQQAAAGRARKLLGRSAAAKQRHGGKR
518-557	RRASSRDGLPKDLKIGKKHKKKAGRPQNRSAKRAAAWKKK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 6.5, cyto_mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	tre:TRIREDRAFT_3001 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12394 RRM1_RBM34

Amino Acid Sequences

MAKTKNVLAVAPKAIDPTLDALFASSAGPVTAPSKPRLGAPPTKKSASSGKSSKEDEDDDDDEGDDEVLSEISEELDYGDDDDDDDAEQEEGSDDNAAEEQEGAESKDGSGDEDAMSVTLEATATEEQAKSKRDRKRKRKHDNDDLEEKYLAKLADDDEPEPSGKRLKGQEEDADKDSDDEQPVHESLTQESKQSEMEKAARTVFLGNVATEAISSKSAKKELMKHLASVLDKDASPPEKIESLRFRSVAFSTGSMPKRAAYITKSLMDATTKSTNAYAVFSTPAAVRKVVAELNGTEVLGRHIRVDSVAHPSPMNHRACVFVGNLGFVDDETVISQKAGGETVEKKRNKVPSDIEEGLWRTFGTQGKVENVRVVRDSKTRVGKGFAYVQFYDANDVEAALLLNGKKFPPMLPRPLRVTRAKDPRKTAQAVERARSKADVADGASRSTKYKPKATPEQQAAAGRARKLLGRSAAAKQRHGGKRSFPAATAKDSEGEGQGEAAANGIIKSPERIIFEGRRASSRDGLPKDLKIGKKHKKKAGRPQNRSAKRAAAWKKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.25
2	0.23
3	0.19
4	0.18
5	0.15
6	0.14
7	0.13
8	0.12
9	0.12
10	0.12
11	0.11
12	0.07
13	0.06
14	0.06
15	0.06
16	0.07
17	0.1
18	0.15
19	0.18
20	0.21
21	0.25
22	0.26
23	0.3
24	0.37
25	0.42
26	0.47
27	0.52
28	0.6
29	0.62
30	0.65
31	0.61
32	0.57
33	0.59
34	0.54
35	0.54
36	0.51
37	0.52
38	0.55
39	0.58
40	0.57
41	0.52
42	0.5
43	0.44
44	0.44
45	0.38
46	0.33
47	0.3
48	0.27
49	0.23
50	0.2
51	0.16
52	0.09
53	0.08
54	0.06
55	0.06
56	0.05
57	0.05
58	0.05
59	0.05
60	0.05
61	0.05
62	0.05
63	0.06
64	0.06
65	0.07
66	0.07
67	0.06
68	0.07
69	0.07
70	0.07
71	0.07
72	0.07
73	0.07
74	0.07
75	0.06
76	0.06
77	0.06
78	0.06
79	0.06
80	0.06
81	0.06
82	0.06
83	0.07
84	0.07
85	0.06
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.07
90	0.07
91	0.08
92	0.08
93	0.08
94	0.1
95	0.1
96	0.11
97	0.11
98	0.11
99	0.1
100	0.1
101	0.1
102	0.08
103	0.08
104	0.06
105	0.05
106	0.05
107	0.04
108	0.04
109	0.06
110	0.06
111	0.07
112	0.09
113	0.1
114	0.12
115	0.16
116	0.21
117	0.26
118	0.34
119	0.43
120	0.52
121	0.63
122	0.72
123	0.79
124	0.86
125	0.91
126	0.94
127	0.95
128	0.95
129	0.94
130	0.91
131	0.88
132	0.8
133	0.71
134	0.6
135	0.5
136	0.39
137	0.31
138	0.23
139	0.14
140	0.12
141	0.11
142	0.15
143	0.17
144	0.17
145	0.16
146	0.17
147	0.18
148	0.17
149	0.17
150	0.17
151	0.16
152	0.21
153	0.25
154	0.29
155	0.33
156	0.36
157	0.42
158	0.42
159	0.46
160	0.42
161	0.38
162	0.32
163	0.29
164	0.26
165	0.22
166	0.18
167	0.14
168	0.12
169	0.14
170	0.14
171	0.14
172	0.15
173	0.13
174	0.13
175	0.2
176	0.2
177	0.18
178	0.19
179	0.19
180	0.19
181	0.2
182	0.2
183	0.17
184	0.21
185	0.21
186	0.23
187	0.23
188	0.21
189	0.2
190	0.19
191	0.15
192	0.13
193	0.12
194	0.1
195	0.09
196	0.09
197	0.08
198	0.07
199	0.08
200	0.05
201	0.07
202	0.08
203	0.1
204	0.13
205	0.14
206	0.17
207	0.21
208	0.29
209	0.35
210	0.44
211	0.42
212	0.4
213	0.4
214	0.41
215	0.37
216	0.3
217	0.23
218	0.15
219	0.14
220	0.14
221	0.15
222	0.13
223	0.14
224	0.13
225	0.13
226	0.15
227	0.16
228	0.21
229	0.24
230	0.28
231	0.3
232	0.3
233	0.29
234	0.28
235	0.28
236	0.25
237	0.19
238	0.14
239	0.14
240	0.21
241	0.22
242	0.2
243	0.2
244	0.18
245	0.18
246	0.18
247	0.17
248	0.12
249	0.16
250	0.17
251	0.18
252	0.19
253	0.18
254	0.18
255	0.16
256	0.15
257	0.14
258	0.14
259	0.13
260	0.13
261	0.13
262	0.14
263	0.13
264	0.14
265	0.1
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.1
275	0.09
276	0.11
277	0.11
278	0.11
279	0.09
280	0.08
281	0.11
282	0.11
283	0.1
284	0.08
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.15
296	0.16
297	0.16
298	0.16
299	0.16
300	0.21
301	0.28
302	0.27
303	0.21
304	0.21
305	0.22
306	0.22
307	0.24
308	0.19
309	0.13
310	0.12
311	0.12
312	0.11
313	0.09
314	0.09
315	0.06
316	0.07
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.06
327	0.05
328	0.08
329	0.13
330	0.21
331	0.3
332	0.3
333	0.32
334	0.37
335	0.45
336	0.44
337	0.46
338	0.44
339	0.41
340	0.48
341	0.47
342	0.42
343	0.38
344	0.37
345	0.31
346	0.25
347	0.19
348	0.12
349	0.14
350	0.16
351	0.16
352	0.16
353	0.17
354	0.22
355	0.25
356	0.25
357	0.26
358	0.24
359	0.24
360	0.24
361	0.24
362	0.23
363	0.25
364	0.29
365	0.31
366	0.38
367	0.39
368	0.39
369	0.4
370	0.38
371	0.36
372	0.4
373	0.35
374	0.33
375	0.3
376	0.3
377	0.28
378	0.26
379	0.26
380	0.18
381	0.16
382	0.11
383	0.11
384	0.09
385	0.08
386	0.08
387	0.05
388	0.07
389	0.06
390	0.07
391	0.08
392	0.08
393	0.09
394	0.1
395	0.12
396	0.21
397	0.27
398	0.36
399	0.42
400	0.47
401	0.53
402	0.59
403	0.63
404	0.6
405	0.62
406	0.61
407	0.65
408	0.7
409	0.7
410	0.71
411	0.73
412	0.73
413	0.69
414	0.64
415	0.62
416	0.62
417	0.6
418	0.58
419	0.57
420	0.51
421	0.48
422	0.45
423	0.37
424	0.29
425	0.26
426	0.23
427	0.18
428	0.23
429	0.23
430	0.23
431	0.25
432	0.23
433	0.23
434	0.26
435	0.31
436	0.31
437	0.39
438	0.44
439	0.52
440	0.62
441	0.68
442	0.72
443	0.71
444	0.69
445	0.65
446	0.62
447	0.55
448	0.51
449	0.47
450	0.38
451	0.34
452	0.31
453	0.29
454	0.28
455	0.31
456	0.28
457	0.29
458	0.32
459	0.38
460	0.45
461	0.46
462	0.46
463	0.44
464	0.5
465	0.54
466	0.54
467	0.51
468	0.5
469	0.56
470	0.6
471	0.57
472	0.49
473	0.49
474	0.48
475	0.48
476	0.45
477	0.37
478	0.32
479	0.31
480	0.3
481	0.24
482	0.22
483	0.16
484	0.13
485	0.12
486	0.11
487	0.1
488	0.09
489	0.07
490	0.06
491	0.06
492	0.07
493	0.08
494	0.08
495	0.11
496	0.13
497	0.17
498	0.21
499	0.23
500	0.29
501	0.33
502	0.39
503	0.45
504	0.44
505	0.45
506	0.45
507	0.48
508	0.47
509	0.48
510	0.51
511	0.48
512	0.54
513	0.54
514	0.52
515	0.55
516	0.56
517	0.55
518	0.56
519	0.62
520	0.65
521	0.72
522	0.8
523	0.82
524	0.85
525	0.9
526	0.91
527	0.92
528	0.92
529	0.91
530	0.92
531	0.93
532	0.91
533	0.85
534	0.79
535	0.75
536	0.69
537	0.7

G0RDT0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer