FuNGI

G0RE53

Protein Details

Accession

G0RE53

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
211-233	TEAVTSVRKRKKRWDVSTTPAGE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 14, nucl 5, cyto 4, pero 1, E.R. 1, golg 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like IPR034085 TOG
Gene Ontology	GO:0005856 C:cytoskeleton GO:0071014 C:post-mRNA release spliceosomal complex GO:0005686 C:U2 snRNP GO:0071004 C:U2-type prespliceosome GO:0003729 F:mRNA binding GO:0045292 P:mRNA cis splicing, via spliceosome GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
KEGG	tre:TRIREDRAFT_76191 -
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDADFETIKRLQQERNAAAASSKGSRALAASNQRTDSTKQRLTDSADSALYDTQGGDKFAGYHTSLPMGDDDDEMADGDNTRRLVGQYTASREMIDEFARGDGVEEDDILAGKGEKSGRITDRETDYQKRRFNRVLTPTRADPFAENRQAGAAENGTSYREIMEMRELEREEQRVKQAIQAKATNNNNNDDELKPTLAEGDKENAEAGSTEAVTSVRKRKKRWDVSTTPAGEEESKEETGAEVKSKRSRWDQTPAPGAMEAPKKRSRWDQAPSATPMGNQGLATPMHPSQAAPMPPAFGTDVSGRNMPLSDEELDLLLPGEKEGYKILEPPPGYEPVRAPAHKLMATPAPQTGFMMQDPDQVRLGGKPMPAEIPGVGDLQFFKPEDMAYFGKLTDGADENALSVDELKERKIMRLLLKIKNGTPPMRKTALRQITDNARQFGAGALFDQILPLLMEKSLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLSKAAGLATMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAVLPHLKGLVDCIAPNLSDEQTKVRTVTSLAIAALAEASNPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTSQIMEILLREFSSPDEEMKKVVLKVVSQCAGTEGVTAGYLKEHVLDEFFKSFWVRRMALDKRNYKQVVETTVDIGQKVGVSEILERIVNNLKDESEAYRKMTVETVEKVVASLGAADIGERLEERLIDGILHAFQEQSVEDIVMLNGFGSVVNALGTRCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLISRIAMVMKQCGEDALMGKLGIVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGISQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVNTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALTDRDQVHRQTAASVVKHIALGVVGLGCEDAMIHLLNLLYPNLFETSPHVIDRIIEAIEAIRVAAGPGLVLNYVWAGLFHPARKVRTPYWRLYNDAYVAAADAMVPYYPNLDDELMDRPELAIIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.49
3	0.53
4	0.51
5	0.45
6	0.41
7	0.37
8	0.33
9	0.26
10	0.23
11	0.2
12	0.19
13	0.19
14	0.2
15	0.21
16	0.26
17	0.33
18	0.38
19	0.41
20	0.43
21	0.44
22	0.46
23	0.46
24	0.48
25	0.47
26	0.47
27	0.45
28	0.48
29	0.51
30	0.55
31	0.57
32	0.51
33	0.45
34	0.39
35	0.37
36	0.34
37	0.3
38	0.23
39	0.16
40	0.13
41	0.13
42	0.14
43	0.15
44	0.14
45	0.14
46	0.14
47	0.15
48	0.19
49	0.16
50	0.17
51	0.17
52	0.2
53	0.2
54	0.19
55	0.19
56	0.18
57	0.17
58	0.15
59	0.14
60	0.12
61	0.12
62	0.11
63	0.11
64	0.09
65	0.09
66	0.1
67	0.13
68	0.13
69	0.13
70	0.14
71	0.14
72	0.17
73	0.19
74	0.25
75	0.28
76	0.34
77	0.38
78	0.37
79	0.36
80	0.33
81	0.33
82	0.28
83	0.23
84	0.17
85	0.13
86	0.14
87	0.14
88	0.13
89	0.12
90	0.1
91	0.11
92	0.1
93	0.09
94	0.09
95	0.09
96	0.1
97	0.09
98	0.08
99	0.07
100	0.07
101	0.1
102	0.11
103	0.14
104	0.17
105	0.23
106	0.27
107	0.32
108	0.35
109	0.38
110	0.44
111	0.49
112	0.52
113	0.55
114	0.6
115	0.63
116	0.68
117	0.68
118	0.69
119	0.69
120	0.68
121	0.68
122	0.7
123	0.71
124	0.71
125	0.71
126	0.68
127	0.63
128	0.59
129	0.5
130	0.43
131	0.4
132	0.42
133	0.43
134	0.38
135	0.36
136	0.35
137	0.34
138	0.31
139	0.26
140	0.18
141	0.12
142	0.12
143	0.13
144	0.13
145	0.13
146	0.12
147	0.1
148	0.1
149	0.1
150	0.11
151	0.16
152	0.17
153	0.18
154	0.23
155	0.24
156	0.26
157	0.29
158	0.33
159	0.3
160	0.32
161	0.36
162	0.36
163	0.36
164	0.39
165	0.43
166	0.43
167	0.46
168	0.48
169	0.46
170	0.49
171	0.56
172	0.57
173	0.52
174	0.53
175	0.48
176	0.45
177	0.44
178	0.36
179	0.32
180	0.28
181	0.25
182	0.2
183	0.19
184	0.2
185	0.18
186	0.19
187	0.17
188	0.19
189	0.18
190	0.19
191	0.19
192	0.15
193	0.14
194	0.13
195	0.11
196	0.08
197	0.08
198	0.07
199	0.07
200	0.08
201	0.1
202	0.15
203	0.24
204	0.32
205	0.39
206	0.45
207	0.55
208	0.66
209	0.75
210	0.8
211	0.8
212	0.79
213	0.8
214	0.84
215	0.75
216	0.65
217	0.54
218	0.46
219	0.36
220	0.3
221	0.25
222	0.19
223	0.17
224	0.16
225	0.16
226	0.14
227	0.16
228	0.16
229	0.18
230	0.17
231	0.22
232	0.3
233	0.33
234	0.39
235	0.45
236	0.51
237	0.53
238	0.59
239	0.61
240	0.61
241	0.66
242	0.6
243	0.53
244	0.45
245	0.39
246	0.36
247	0.37
248	0.32
249	0.32
250	0.38
251	0.37
252	0.42
253	0.5
254	0.53
255	0.54
256	0.58
257	0.6
258	0.59
259	0.64
260	0.63
261	0.57
262	0.49
263	0.39
264	0.35
265	0.28
266	0.23
267	0.17
268	0.13
269	0.13
270	0.13
271	0.13
272	0.13
273	0.12
274	0.12
275	0.12
276	0.12
277	0.13
278	0.18
279	0.19
280	0.18
281	0.18
282	0.18
283	0.18
284	0.2
285	0.17
286	0.11
287	0.13
288	0.14
289	0.16
290	0.17
291	0.18
292	0.16
293	0.16
294	0.16
295	0.14
296	0.13
297	0.13
298	0.12
299	0.12
300	0.12
301	0.12
302	0.11
303	0.11
304	0.09
305	0.07
306	0.06
307	0.05
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.08
312	0.1
313	0.1
314	0.14
315	0.16
316	0.2
317	0.2
318	0.22
319	0.24
320	0.27
321	0.28
322	0.26
323	0.25
324	0.26
325	0.32
326	0.3
327	0.31
328	0.29
329	0.32
330	0.32
331	0.31
332	0.27
333	0.26
334	0.28
335	0.25
336	0.23
337	0.2
338	0.19
339	0.19
340	0.17
341	0.14
342	0.12
343	0.14
344	0.13
345	0.18
346	0.19
347	0.21
348	0.2
349	0.19
350	0.19
351	0.16
352	0.18
353	0.14
354	0.14
355	0.13
356	0.13
357	0.14
358	0.14
359	0.14
360	0.12
361	0.11
362	0.11
363	0.11
364	0.1
365	0.09
366	0.1
367	0.1
368	0.12
369	0.1
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.1
374	0.13
375	0.13
376	0.13
377	0.13
378	0.13
379	0.12
380	0.13
381	0.12
382	0.09
383	0.1
384	0.09
385	0.09
386	0.09
387	0.09
388	0.09
389	0.09
390	0.06
391	0.05
392	0.05
393	0.08
394	0.09
395	0.1
396	0.14
397	0.15
398	0.17
399	0.2
400	0.24
401	0.26
402	0.35
403	0.41
404	0.43
405	0.49
406	0.49
407	0.47
408	0.48
409	0.48
410	0.45
411	0.45
412	0.42
413	0.42
414	0.45
415	0.44
416	0.42
417	0.48
418	0.5
419	0.45
420	0.43
421	0.41
422	0.45
423	0.52
424	0.51
425	0.42
426	0.33
427	0.31
428	0.29
429	0.26
430	0.18
431	0.1
432	0.08
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.07
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.05
445	0.07
446	0.1
447	0.12
448	0.12
449	0.13
450	0.16
451	0.17
452	0.18
453	0.16
454	0.15
455	0.14
456	0.18
457	0.2
458	0.17
459	0.18
460	0.18
461	0.18
462	0.18
463	0.18
464	0.13
465	0.13
466	0.14
467	0.14
468	0.15
469	0.17
470	0.16
471	0.17
472	0.18
473	0.18
474	0.16
475	0.14
476	0.13
477	0.13
478	0.14
479	0.13
480	0.12
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.06
486	0.04
487	0.03
488	0.04
489	0.05
490	0.05
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.07
495	0.09
496	0.1
497	0.12
498	0.12
499	0.14
500	0.14
501	0.14
502	0.14
503	0.12
504	0.1
505	0.07
506	0.07
507	0.05
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.06
519	0.07
520	0.09
521	0.1
522	0.11
523	0.13
524	0.14
525	0.15
526	0.15
527	0.14
528	0.11
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.1
533	0.1
534	0.09
535	0.08
536	0.09
537	0.08
538	0.07
539	0.06
540	0.05
541	0.04
542	0.04
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.03
547	0.02
548	0.03
549	0.03
550	0.04
551	0.06
552	0.08
553	0.11
554	0.16
555	0.2
556	0.23
557	0.28
558	0.37
559	0.45
560	0.52
561	0.55
562	0.58
563	0.6
564	0.65
565	0.62
566	0.57
567	0.49
568	0.45
569	0.44
570	0.37
571	0.33
572	0.26
573	0.24
574	0.19
575	0.17
576	0.13
577	0.08
578	0.06
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.05
583	0.05
584	0.04
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.08
594	0.07
595	0.08
596	0.08
597	0.07
598	0.07
599	0.08
600	0.1
601	0.11
602	0.12
603	0.12
604	0.11
605	0.11
606	0.11
607	0.12
608	0.1
609	0.09
610	0.08
611	0.08
612	0.08
613	0.07
614	0.06
615	0.05
616	0.03
617	0.03
618	0.03
619	0.03
620	0.03
621	0.03
622	0.03
623	0.04
624	0.05
625	0.05
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.07
630	0.07
631	0.07
632	0.06
633	0.05
634	0.05
635	0.06
636	0.08
637	0.13
638	0.22
639	0.24
640	0.25
641	0.31
642	0.34
643	0.36
644	0.36
645	0.37
646	0.32
647	0.3
648	0.3
649	0.24
650	0.2
651	0.18
652	0.15
653	0.08
654	0.05
655	0.04
656	0.03
657	0.04
658	0.03
659	0.04
660	0.05
661	0.05
662	0.04
663	0.07
664	0.08
665	0.08
666	0.08
667	0.08
668	0.08
669	0.08
670	0.08
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.06
681	0.09
682	0.09
683	0.1
684	0.13
685	0.13
686	0.13
687	0.14
688	0.16
689	0.13
690	0.15
691	0.14
692	0.13
693	0.16
694	0.19
695	0.19
696	0.17
697	0.17
698	0.16
699	0.15
700	0.14
701	0.11
702	0.07
703	0.06
704	0.06
705	0.06
706	0.05
707	0.04
708	0.05
709	0.05
710	0.05
711	0.06
712	0.05
713	0.07
714	0.08
715	0.1
716	0.1
717	0.1
718	0.1
719	0.11
720	0.12
721	0.16
722	0.2
723	0.18
724	0.2
725	0.28
726	0.34
727	0.4
728	0.48
729	0.51
730	0.49
731	0.57
732	0.56
733	0.48
734	0.45
735	0.4
736	0.36
737	0.31
738	0.29
739	0.22
740	0.25
741	0.24
742	0.21
743	0.18
744	0.13
745	0.11
746	0.1
747	0.08
748	0.05
749	0.05
750	0.06
751	0.07
752	0.07
753	0.08
754	0.07
755	0.09
756	0.15
757	0.14
758	0.15
759	0.15
760	0.14
761	0.15
762	0.16
763	0.18
764	0.18
765	0.19
766	0.2
767	0.22
768	0.22
769	0.22
770	0.23
771	0.21
772	0.19
773	0.19
774	0.19
775	0.17
776	0.17
777	0.16
778	0.14
779	0.12
780	0.08
781	0.06
782	0.04
783	0.04
784	0.03
785	0.03
786	0.04
787	0.04
788	0.04
789	0.04
790	0.04
791	0.04
792	0.04
793	0.05
794	0.06
795	0.06
796	0.06
797	0.06
798	0.06
799	0.06
800	0.07
801	0.06
802	0.05
803	0.05
804	0.06
805	0.06
806	0.06
807	0.06
808	0.05
809	0.05
810	0.06
811	0.06
812	0.05
813	0.05
814	0.04
815	0.03
816	0.03
817	0.03
818	0.03
819	0.03
820	0.03
821	0.04
822	0.04
823	0.04
824	0.08
825	0.09
826	0.12
827	0.12
828	0.13
829	0.14
830	0.2
831	0.3
832	0.29
833	0.31
834	0.3
835	0.33
836	0.33
837	0.32
838	0.29
839	0.22
840	0.22
841	0.21
842	0.22
843	0.25
844	0.26
845	0.27
846	0.3
847	0.32
848	0.37
849	0.41
850	0.39
851	0.33
852	0.33
853	0.32
854	0.29
855	0.26
856	0.19
857	0.15
858	0.12
859	0.12
860	0.1
861	0.1
862	0.09
863	0.08
864	0.1
865	0.1
866	0.1
867	0.11
868	0.11
869	0.11
870	0.1
871	0.11
872	0.09
873	0.09
874	0.08
875	0.08
876	0.09
877	0.08
878	0.07
879	0.06
880	0.05
881	0.04
882	0.05
883	0.06
884	0.06
885	0.06
886	0.06
887	0.06
888	0.06
889	0.06
890	0.05
891	0.05
892	0.04
893	0.04
894	0.04
895	0.04
896	0.05
897	0.04
898	0.04
899	0.04
900	0.04
901	0.04
902	0.04
903	0.04
904	0.03
905	0.03
906	0.04
907	0.05
908	0.05
909	0.06
910	0.09
911	0.12
912	0.13
913	0.13
914	0.15
915	0.16
916	0.18
917	0.2
918	0.2
919	0.23
920	0.25
921	0.26
922	0.28
923	0.29
924	0.33
925	0.37
926	0.46
927	0.45
928	0.51
929	0.53
930	0.59
931	0.62
932	0.64
933	0.61
934	0.61
935	0.57
936	0.53
937	0.5
938	0.42
939	0.35
940	0.28
941	0.23
942	0.14
943	0.11
944	0.08
945	0.08
946	0.08
947	0.09
948	0.1
949	0.11
950	0.14
951	0.17
952	0.2
953	0.22
954	0.23
955	0.23
956	0.26
957	0.25
958	0.24
959	0.24
960	0.22
961	0.21
962	0.19
963	0.18
964	0.19
965	0.19
966	0.19
967	0.15
968	0.18
969	0.22
970	0.22
971	0.24
972	0.22
973	0.27
974	0.33
975	0.43
976	0.49
977	0.5
978	0.59
979	0.65
980	0.72
981	0.67
982	0.6
983	0.51
984	0.41
985	0.36
986	0.28
987	0.2
988	0.11
989	0.13
990	0.13
991	0.12
992	0.11
993	0.11
994	0.11
995	0.1
996	0.1
997	0.07
998	0.07
999	0.08
1000	0.1
1001	0.12
1002	0.12
1003	0.13
1004	0.14
1005	0.16
1006	0.19
1007	0.26
1008	0.29
1009	0.35
1010	0.37
1011	0.42
1012	0.42
1013	0.43
1014	0.4
1015	0.32
1016	0.28
1017	0.2
1018	0.17
1019	0.11
1020	0.09
1021	0.06
1022	0.06
1023	0.05
1024	0.04
1025	0.04
1026	0.04
1027	0.05
1028	0.05
1029	0.06
1030	0.09
1031	0.1
1032	0.1
1033	0.11
1034	0.16
1035	0.16
1036	0.18
1037	0.18
1038	0.17
1039	0.18
1040	0.18
1041	0.19
1042	0.2
1043	0.23
1044	0.25
1045	0.26
1046	0.25
1047	0.28
1048	0.27
1049	0.26
1050	0.2
1051	0.17
1052	0.14
1053	0.14
1054	0.15
1055	0.11
1056	0.11
1057	0.11
1058	0.11
1059	0.13
1060	0.12
1061	0.13
1062	0.11
1063	0.11
1064	0.11
1065	0.1
1066	0.1
1067	0.09
1068	0.08
1069	0.07
1070	0.08
1071	0.08
1072	0.08
1073	0.08
1074	0.08
1075	0.09
1076	0.07
1077	0.07
1078	0.08
1079	0.12
1080	0.11
1081	0.12
1082	0.13
1083	0.17
1084	0.21
1085	0.24
1086	0.26
1087	0.24
1088	0.24
1089	0.25
1090	0.3
1091	0.32
1092	0.29
1093	0.3
1094	0.27
1095	0.26
1096	0.25
1097	0.23
1098	0.18
1099	0.11
1100	0.1
1101	0.08
1102	0.06
1103	0.05
1104	0.05
1105	0.05
1106	0.04
1107	0.04
1108	0.04
1109	0.03
1110	0.04
1111	0.05
1112	0.05
1113	0.06
1114	0.06
1115	0.07
1116	0.09
1117	0.09
1118	0.08
1119	0.08
1120	0.1
1121	0.11
1122	0.11
1123	0.1
1124	0.14
1125	0.21
1126	0.23
1127	0.24
1128	0.23
1129	0.21
1130	0.22
1131	0.24
1132	0.21
1133	0.14
1134	0.11
1135	0.11
1136	0.11
1137	0.11
1138	0.1
1139	0.08
1140	0.06
1141	0.05
1142	0.06
1143	0.06
1144	0.05
1145	0.05
1146	0.05
1147	0.06
1148	0.06
1149	0.06
1150	0.06
1151	0.06
1152	0.06
1153	0.06
1154	0.06
1155	0.06
1156	0.12
1157	0.16
1158	0.17
1159	0.25
1160	0.31
1161	0.36
1162	0.43
1163	0.49
1164	0.52
1165	0.59
1166	0.65
1167	0.66
1168	0.7
1169	0.7
1170	0.68
1171	0.66
1172	0.64
1173	0.55
1174	0.49
1175	0.4
1176	0.3
1177	0.26
1178	0.2
1179	0.15
1180	0.09
1181	0.07
1182	0.06
1183	0.06
1184	0.06
1185	0.06
1186	0.08
1187	0.08
1188	0.09
1189	0.11
1190	0.11
1191	0.12
1192	0.13
1193	0.19
1194	0.19
1195	0.19
1196	0.18
1197	0.16

G0RE53

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer