Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q2GNZ6

Protein Details
Accession Q2GNZ6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-125GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
414-429RKETEDRREAGFKRRK
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 10, cyto 6.5, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPAAFRWLSTKYPKIISPVVEEKALVMEDGTVVPVDATQPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPAPSDEEEMMVEVFKYTERVVNMVRPRKLLMIAVADGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQDAKEKEEDKQQLLKMLQKEKGSTAKEEPIETVVKKAFDSNSITPGTPFMDILAASLRYWCAYKLNTDPAWAKMKVIISDATVPGEGEHKIMEFVRSQRNSPEHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQQGKARMCKLCGQKGHDERNCRGEAKEKAGEFDEKDKAEPLKPFIWLHVSILREYLAIELNIPNLPFRWDLERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPALEIRENGIETLMAIWKDNLPVMGGYVTKDGHVDLDRAQYILSGLAKQEDSIFRRRKETEDRREAGFKRRKLNNQQGNNRGGAHDSPLSGRGGRKGAPEANGPPVGMNLFPVASIPKPVITHDMVVNRANVANKSAASVLKSQIQSLVAQTQEKPEGDEPKEENPEAKTPPSALGKRKAELIEEGTATASDAASDTETPATTSSEEGPIDTVRLWEEGYADRYYEQKFKVDAKDIAFRHKVARAYVEGLAWVLMYYFQGCPSWEWFYPYHYAPFAADFVDLGKMKISFEKGRISRPFEQLMSVLPAASRHAIPEVFHDLMTQEDSPILDFYPEDFEIDLNGKKMSWQGIALLPFIEMPRLLDAMKTKSHLLSAEDKARNAPGHDVLLISDSHPGLYEDISSHFYSKKQAVPEFKLDPKRSDGLSGKVRKIEGYVPHGSLVYPLERNTMPDVDYDRSMSVNYDMPTSSHIHKSMLLRGLKMPTPALDRSDVDFVRSKGRGAGRSFGGVPLRNNYNGGGRGDRINYAGGPPRGGGGGGRGRGGYQQDRGYGNGYGGGGGSGGGGGGGGYGNGYGGYQQPAAPGQQSWQPPPPPGYPGFGVGVPPPPPPAHASGGGYNQGYGNQGYGGQNYRNDRYPPGPPPHGGYQGGGYPGGGYQGGGHQGGYQGQYHPPHGQSQDRRHDNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.46
3 0.49
4 0.51
5 0.47
6 0.47
7 0.47
8 0.45
9 0.41
10 0.38
11 0.32
12 0.29
13 0.26
14 0.18
15 0.11
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.09
20 0.07
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.09
25 0.11
26 0.13
27 0.18
28 0.2
29 0.23
30 0.24
31 0.24
32 0.25
33 0.24
34 0.26
35 0.24
36 0.24
37 0.22
38 0.21
39 0.22
40 0.18
41 0.17
42 0.13
43 0.1
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.13
50 0.18
51 0.21
52 0.23
53 0.29
54 0.36
55 0.39
56 0.43
57 0.44
58 0.42
59 0.41
60 0.41
61 0.34
62 0.29
63 0.25
64 0.22
65 0.18
66 0.14
67 0.11
68 0.09
69 0.09
70 0.07
71 0.09
72 0.09
73 0.13
74 0.13
75 0.17
76 0.2
77 0.28
78 0.37
79 0.44
80 0.46
81 0.45
82 0.46
83 0.45
84 0.44
85 0.38
86 0.32
87 0.28
88 0.25
89 0.24
90 0.22
91 0.19
92 0.17
93 0.16
94 0.13
95 0.08
96 0.08
97 0.11
98 0.18
99 0.26
100 0.36
101 0.45
102 0.55
103 0.66
104 0.74
105 0.79
106 0.81
107 0.78
108 0.74
109 0.75
110 0.75
111 0.73
112 0.76
113 0.71
114 0.67
115 0.69
116 0.64
117 0.55
118 0.54
119 0.5
120 0.45
121 0.46
122 0.44
123 0.44
124 0.45
125 0.49
126 0.47
127 0.49
128 0.49
129 0.45
130 0.46
131 0.44
132 0.5
133 0.47
134 0.44
135 0.42
136 0.44
137 0.43
138 0.42
139 0.38
140 0.33
141 0.34
142 0.3
143 0.29
144 0.25
145 0.24
146 0.23
147 0.25
148 0.23
149 0.23
150 0.3
151 0.27
152 0.3
153 0.31
154 0.31
155 0.27
156 0.27
157 0.25
158 0.18
159 0.16
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.12
165 0.11
166 0.1
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.19
175 0.24
176 0.31
177 0.31
178 0.35
179 0.36
180 0.36
181 0.41
182 0.37
183 0.31
184 0.27
185 0.3
186 0.26
187 0.26
188 0.23
189 0.18
190 0.21
191 0.21
192 0.18
193 0.15
194 0.14
195 0.12
196 0.13
197 0.12
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.13
205 0.18
206 0.27
207 0.29
208 0.3
209 0.36
210 0.4
211 0.45
212 0.47
213 0.53
214 0.48
215 0.55
216 0.57
217 0.54
218 0.58
219 0.52
220 0.46
221 0.35
222 0.31
223 0.24
224 0.23
225 0.19
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.08
231 0.06
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.04
237 0.05
238 0.07
239 0.08
240 0.11
241 0.13
242 0.14
243 0.18
244 0.2
245 0.24
246 0.25
247 0.27
248 0.26
249 0.3
250 0.29
251 0.25
252 0.28
253 0.27
254 0.29
255 0.3
256 0.33
257 0.29
258 0.31
259 0.38
260 0.41
261 0.44
262 0.46
263 0.48
264 0.53
265 0.6
266 0.68
267 0.66
268 0.64
269 0.6
270 0.61
271 0.58
272 0.5
273 0.42
274 0.4
275 0.4
276 0.4
277 0.43
278 0.36
279 0.35
280 0.36
281 0.37
282 0.31
283 0.32
284 0.3
285 0.25
286 0.25
287 0.27
288 0.27
289 0.28
290 0.28
291 0.27
292 0.24
293 0.27
294 0.26
295 0.25
296 0.27
297 0.24
298 0.24
299 0.23
300 0.22
301 0.19
302 0.2
303 0.18
304 0.13
305 0.13
306 0.11
307 0.09
308 0.08
309 0.09
310 0.08
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.08
316 0.11
317 0.1
318 0.11
319 0.15
320 0.16
321 0.18
322 0.21
323 0.22
324 0.2
325 0.23
326 0.21
327 0.16
328 0.15
329 0.14
330 0.1
331 0.09
332 0.08
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.07
346 0.11
347 0.13
348 0.13
349 0.13
350 0.14
351 0.14
352 0.13
353 0.12
354 0.08
355 0.05
356 0.06
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.08
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.06
366 0.06
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.1
380 0.13
381 0.13
382 0.13
383 0.13
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.1
394 0.13
395 0.16
396 0.25
397 0.32
398 0.32
399 0.37
400 0.39
401 0.43
402 0.5
403 0.57
404 0.58
405 0.61
406 0.62
407 0.6
408 0.65
409 0.61
410 0.61
411 0.58
412 0.53
413 0.52
414 0.57
415 0.63
416 0.66
417 0.75
418 0.74
419 0.75
420 0.79
421 0.76
422 0.71
423 0.64
424 0.54
425 0.43
426 0.35
427 0.26
428 0.2
429 0.14
430 0.12
431 0.11
432 0.12
433 0.12
434 0.12
435 0.13
436 0.13
437 0.14
438 0.15
439 0.16
440 0.18
441 0.2
442 0.21
443 0.23
444 0.22
445 0.23
446 0.22
447 0.2
448 0.17
449 0.14
450 0.13
451 0.1
452 0.09
453 0.05
454 0.05
455 0.04
456 0.05
457 0.06
458 0.05
459 0.06
460 0.06
461 0.07
462 0.08
463 0.09
464 0.12
465 0.12
466 0.13
467 0.15
468 0.17
469 0.18
470 0.18
471 0.17
472 0.14
473 0.15
474 0.14
475 0.12
476 0.11
477 0.1
478 0.09
479 0.1
480 0.11
481 0.1
482 0.11
483 0.12
484 0.12
485 0.16
486 0.16
487 0.16
488 0.16
489 0.16
490 0.14
491 0.14
492 0.15
493 0.1
494 0.11
495 0.11
496 0.12
497 0.14
498 0.13
499 0.14
500 0.14
501 0.19
502 0.2
503 0.23
504 0.24
505 0.26
506 0.28
507 0.26
508 0.25
509 0.21
510 0.23
511 0.2
512 0.19
513 0.15
514 0.14
515 0.17
516 0.22
517 0.24
518 0.25
519 0.32
520 0.34
521 0.34
522 0.37
523 0.34
524 0.29
525 0.26
526 0.24
527 0.18
528 0.15
529 0.15
530 0.12
531 0.11
532 0.1
533 0.08
534 0.05
535 0.03
536 0.03
537 0.03
538 0.04
539 0.04
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.07
548 0.08
549 0.09
550 0.09
551 0.09
552 0.09
553 0.09
554 0.09
555 0.08
556 0.08
557 0.06
558 0.07
559 0.06
560 0.06
561 0.07
562 0.08
563 0.11
564 0.11
565 0.1
566 0.1
567 0.13
568 0.15
569 0.18
570 0.17
571 0.17
572 0.19
573 0.23
574 0.26
575 0.28
576 0.3
577 0.28
578 0.35
579 0.33
580 0.37
581 0.35
582 0.32
583 0.3
584 0.3
585 0.29
586 0.23
587 0.25
588 0.2
589 0.21
590 0.21
591 0.18
592 0.14
593 0.12
594 0.11
595 0.08
596 0.07
597 0.04
598 0.03
599 0.03
600 0.04
601 0.05
602 0.05
603 0.06
604 0.07
605 0.08
606 0.11
607 0.15
608 0.14
609 0.17
610 0.17
611 0.19
612 0.22
613 0.22
614 0.21
615 0.17
616 0.17
617 0.14
618 0.15
619 0.12
620 0.1
621 0.09
622 0.07
623 0.07
624 0.1
625 0.1
626 0.09
627 0.09
628 0.09
629 0.1
630 0.12
631 0.15
632 0.14
633 0.17
634 0.25
635 0.26
636 0.34
637 0.38
638 0.43
639 0.45
640 0.46
641 0.47
642 0.39
643 0.38
644 0.3
645 0.27
646 0.23
647 0.17
648 0.13
649 0.1
650 0.1
651 0.1
652 0.11
653 0.1
654 0.07
655 0.09
656 0.09
657 0.1
658 0.13
659 0.17
660 0.16
661 0.16
662 0.16
663 0.14
664 0.15
665 0.16
666 0.12
667 0.07
668 0.07
669 0.07
670 0.08
671 0.08
672 0.07
673 0.06
674 0.05
675 0.06
676 0.1
677 0.1
678 0.1
679 0.1
680 0.1
681 0.11
682 0.13
683 0.13
684 0.1
685 0.1
686 0.09
687 0.1
688 0.12
689 0.13
690 0.11
691 0.11
692 0.12
693 0.15
694 0.16
695 0.16
696 0.14
697 0.12
698 0.12
699 0.11
700 0.1
701 0.06
702 0.06
703 0.07
704 0.08
705 0.08
706 0.09
707 0.12
708 0.15
709 0.17
710 0.18
711 0.18
712 0.18
713 0.19
714 0.19
715 0.19
716 0.23
717 0.26
718 0.33
719 0.34
720 0.34
721 0.33
722 0.35
723 0.32
724 0.27
725 0.25
726 0.17
727 0.17
728 0.17
729 0.16
730 0.13
731 0.13
732 0.12
733 0.1
734 0.1
735 0.09
736 0.08
737 0.09
738 0.09
739 0.08
740 0.09
741 0.09
742 0.07
743 0.1
744 0.13
745 0.13
746 0.14
747 0.15
748 0.16
749 0.2
750 0.23
751 0.25
752 0.28
753 0.33
754 0.39
755 0.43
756 0.49
757 0.5
758 0.53
759 0.58
760 0.55
761 0.52
762 0.49
763 0.47
764 0.41
765 0.42
766 0.38
767 0.36
768 0.43
769 0.46
770 0.45
771 0.45
772 0.45
773 0.38
774 0.37
775 0.36
776 0.32
777 0.32
778 0.32
779 0.3
780 0.3
781 0.3
782 0.27
783 0.23
784 0.19
785 0.16
786 0.14
787 0.13
788 0.16
789 0.16
790 0.19
791 0.2
792 0.2
793 0.17
794 0.18
795 0.22
796 0.21
797 0.21
798 0.21
799 0.18
800 0.17
801 0.17
802 0.15
803 0.13
804 0.15
805 0.15
806 0.15
807 0.15
808 0.14
809 0.17
810 0.19
811 0.21
812 0.21
813 0.22
814 0.22
815 0.26
816 0.29
817 0.33
818 0.36
819 0.35
820 0.32
821 0.34
822 0.37
823 0.35
824 0.33
825 0.28
826 0.23
827 0.26
828 0.26
829 0.26
830 0.25
831 0.24
832 0.26
833 0.31
834 0.28
835 0.27
836 0.29
837 0.28
838 0.32
839 0.31
840 0.28
841 0.28
842 0.34
843 0.37
844 0.36
845 0.4
846 0.34
847 0.37
848 0.37
849 0.34
850 0.33
851 0.3
852 0.29
853 0.29
854 0.31
855 0.29
856 0.29
857 0.27
858 0.27
859 0.28
860 0.29
861 0.26
862 0.24
863 0.27
864 0.27
865 0.27
866 0.23
867 0.21
868 0.18
869 0.19
870 0.25
871 0.23
872 0.22
873 0.21
874 0.2
875 0.19
876 0.19
877 0.15
878 0.14
879 0.19
880 0.19
881 0.2
882 0.19
883 0.2
884 0.23
885 0.29
886 0.27
887 0.26
888 0.29
889 0.32
890 0.33
891 0.34
892 0.33
893 0.28
894 0.24
895 0.21
896 0.17
897 0.13
898 0.12
899 0.1
900 0.08
901 0.07
902 0.06
903 0.04
904 0.03
905 0.03
906 0.03
907 0.02
908 0.03
909 0.03
910 0.02
911 0.03
912 0.03
913 0.03
914 0.03
915 0.04
916 0.04
917 0.06
918 0.09
919 0.1
920 0.11
921 0.12
922 0.14
923 0.16
924 0.16
925 0.15
926 0.15
927 0.2
928 0.24
929 0.28
930 0.35
931 0.36
932 0.39
933 0.43
934 0.44
935 0.43
936 0.41
937 0.4
938 0.34
939 0.34
940 0.31
941 0.27
942 0.25
943 0.21
944 0.24
945 0.21
946 0.21
947 0.21
948 0.2
949 0.22
950 0.24
951 0.27
952 0.26
953 0.28
954 0.3
955 0.31
956 0.34
957 0.36
958 0.32
959 0.28
960 0.24
961 0.21
962 0.2
963 0.16
964 0.13
965 0.1
966 0.13
967 0.14
968 0.17
969 0.2
970 0.22
971 0.28
972 0.33
973 0.37
974 0.4
975 0.41
976 0.43
977 0.44
978 0.49
979 0.52
980 0.55
981 0.56
982 0.52
983 0.56
984 0.57
985 0.58
986 0.51
987 0.43
988 0.37
989 0.34
990 0.34
991 0.27
992 0.2
993 0.15
994 0.13
995 0.14
996 0.11
997 0.08
998 0.07
999 0.1
1000 0.13
1001 0.13
1002 0.13
1003 0.13
1004 0.14
1005 0.17
1006 0.18
1007 0.17
1008 0.17
1009 0.23
1010 0.26
1011 0.29
1012 0.33
1013 0.32
1014 0.37
1015 0.41
1016 0.49
1017 0.52
1018 0.6
1019 0.67