Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RTA4

Protein Details
Accession G0RTA4    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-128QEADGRRSKRSDKKRNPQERRKILREVPQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-121RRSKRSDKKRNPQERRK
Subcellular Location(s) extr 8, cyto 4, plas 4, E.R. 3, golg 3, vacu 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009291  Vps62  
KEGG tre:TRIREDRAFT_67902  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06101  Vps62  
Amino Acid Sequences MILTVPLAIIVFAATYLPVILDPTDRNPESRARDRLWVSSSPYFWDRQACRWFSLCGLHHLRRDPAVLPPLEDEPEDELRLELRKRMDRTWEEDAELNAQEADGRRSKRSDKKRNPQERRKILREVPQYVLKHAPLVHLYSGEQFWPSDIREHIEHMIVTVDHKRVNLTEKVSLHNLQALNKYEKRMVTLHSVEDVESRPKWLHSHDNLPVPFDDPNASTPPSLGSGKKVHSEPDTWFDVDKKHPVHRISDPRNKNVPAYAPTPAPGKEQQRIVPRGHKPDPDGYSKAPATLVLVDKGSGIIDAFWFFFYSYNLGQTVLGLRFGNHVGDWEHCMVRFQNGVPRGIFFSEHEGGQAYAWEAVEKRGDRPVIYSAVGSHAMYALPGSHPYVLPFKLLKDVTDKGPLWDPALNNYAYFYDYTREDPKDTIEHEDGIAEKGLLHDTHSFTPAASNPDAPTTWLHFQGRWGDEVYTLADPRQWRLFGQYHYVTGPAGPKFKNLERQTLCPARNCRLLYEVDPKGTWY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.04
5 0.05
6 0.06
7 0.07
8 0.1
9 0.13
10 0.18
11 0.26
12 0.27
13 0.28
14 0.31
15 0.38
16 0.43
17 0.5
18 0.53
19 0.47
20 0.55
21 0.57
22 0.6
23 0.56
24 0.52
25 0.5
26 0.48
27 0.46
28 0.42
29 0.42
30 0.38
31 0.35
32 0.4
33 0.36
34 0.4
35 0.48
36 0.46
37 0.47
38 0.47
39 0.46
40 0.4
41 0.45
42 0.38
43 0.38
44 0.43
45 0.45
46 0.48
47 0.51
48 0.51
49 0.45
50 0.46
51 0.38
52 0.36
53 0.38
54 0.33
55 0.31
56 0.3
57 0.3
58 0.28
59 0.27
60 0.22
61 0.19
62 0.21
63 0.2
64 0.18
65 0.16
66 0.17
67 0.22
68 0.21
69 0.21
70 0.26
71 0.33
72 0.37
73 0.41
74 0.49
75 0.49
76 0.55
77 0.58
78 0.53
79 0.47
80 0.45
81 0.42
82 0.35
83 0.3
84 0.23
85 0.15
86 0.13
87 0.13
88 0.12
89 0.16
90 0.19
91 0.21
92 0.24
93 0.3
94 0.39
95 0.48
96 0.58
97 0.64
98 0.7
99 0.78
100 0.86
101 0.93
102 0.95
103 0.95
104 0.95
105 0.95
106 0.93
107 0.88
108 0.86
109 0.81
110 0.79
111 0.77
112 0.7
113 0.64
114 0.62
115 0.57
116 0.51
117 0.49
118 0.39
119 0.33
120 0.29
121 0.27
122 0.21
123 0.22
124 0.19
125 0.17
126 0.17
127 0.16
128 0.16
129 0.14
130 0.13
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.13
136 0.13
137 0.16
138 0.16
139 0.19
140 0.2
141 0.19
142 0.18
143 0.14
144 0.15
145 0.11
146 0.12
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.21
154 0.23
155 0.23
156 0.27
157 0.27
158 0.3
159 0.33
160 0.32
161 0.27
162 0.28
163 0.26
164 0.23
165 0.26
166 0.28
167 0.31
168 0.32
169 0.33
170 0.32
171 0.31
172 0.31
173 0.28
174 0.26
175 0.27
176 0.26
177 0.25
178 0.24
179 0.24
180 0.21
181 0.2
182 0.19
183 0.16
184 0.14
185 0.15
186 0.14
187 0.14
188 0.16
189 0.18
190 0.26
191 0.26
192 0.33
193 0.36
194 0.42
195 0.41
196 0.41
197 0.37
198 0.29
199 0.26
200 0.19
201 0.16
202 0.1
203 0.13
204 0.13
205 0.14
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.14
210 0.15
211 0.13
212 0.15
213 0.18
214 0.19
215 0.23
216 0.23
217 0.22
218 0.23
219 0.25
220 0.22
221 0.23
222 0.24
223 0.21
224 0.21
225 0.19
226 0.2
227 0.2
228 0.24
229 0.22
230 0.24
231 0.29
232 0.3
233 0.34
234 0.39
235 0.47
236 0.51
237 0.58
238 0.58
239 0.58
240 0.62
241 0.59
242 0.51
243 0.43
244 0.36
245 0.3
246 0.28
247 0.23
248 0.18
249 0.18
250 0.19
251 0.18
252 0.18
253 0.2
254 0.22
255 0.23
256 0.26
257 0.3
258 0.36
259 0.39
260 0.39
261 0.42
262 0.44
263 0.48
264 0.5
265 0.47
266 0.42
267 0.45
268 0.46
269 0.42
270 0.4
271 0.33
272 0.34
273 0.31
274 0.29
275 0.22
276 0.18
277 0.14
278 0.14
279 0.13
280 0.09
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.05
287 0.04
288 0.03
289 0.04
290 0.04
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.09
304 0.12
305 0.09
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.08
313 0.09
314 0.09
315 0.1
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.12
320 0.14
321 0.13
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.17
326 0.19
327 0.21
328 0.2
329 0.2
330 0.2
331 0.19
332 0.19
333 0.14
334 0.18
335 0.17
336 0.17
337 0.16
338 0.15
339 0.14
340 0.13
341 0.13
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.13
349 0.14
350 0.15
351 0.19
352 0.2
353 0.19
354 0.22
355 0.23
356 0.21
357 0.21
358 0.2
359 0.15
360 0.17
361 0.18
362 0.15
363 0.12
364 0.09
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.08
372 0.09
373 0.09
374 0.11
375 0.16
376 0.15
377 0.18
378 0.18
379 0.17
380 0.23
381 0.23
382 0.23
383 0.24
384 0.26
385 0.26
386 0.33
387 0.32
388 0.28
389 0.32
390 0.32
391 0.29
392 0.29
393 0.27
394 0.23
395 0.26
396 0.24
397 0.19
398 0.2
399 0.18
400 0.15
401 0.16
402 0.12
403 0.12
404 0.13
405 0.17
406 0.22
407 0.24
408 0.25
409 0.25
410 0.28
411 0.3
412 0.3
413 0.33
414 0.28
415 0.27
416 0.25
417 0.25
418 0.23
419 0.19
420 0.18
421 0.11
422 0.09
423 0.09
424 0.11
425 0.1
426 0.12
427 0.14
428 0.17
429 0.19
430 0.21
431 0.2
432 0.18
433 0.21
434 0.22
435 0.23
436 0.21
437 0.21
438 0.2
439 0.23
440 0.24
441 0.22
442 0.22
443 0.23
444 0.24
445 0.28
446 0.29
447 0.27
448 0.31
449 0.38
450 0.37
451 0.33
452 0.32
453 0.26
454 0.25
455 0.25
456 0.24
457 0.18
458 0.17
459 0.15
460 0.17
461 0.18
462 0.22
463 0.26
464 0.25
465 0.23
466 0.3
467 0.36
468 0.35
469 0.42
470 0.41
471 0.37
472 0.37
473 0.36
474 0.29
475 0.25
476 0.28
477 0.23
478 0.27
479 0.26
480 0.3
481 0.36
482 0.42
483 0.51
484 0.49
485 0.56
486 0.54
487 0.59
488 0.64
489 0.66
490 0.63
491 0.61
492 0.64
493 0.6
494 0.63
495 0.59
496 0.52
497 0.47
498 0.48
499 0.46
500 0.49
501 0.47
502 0.42