FuNGI

G0RAC2

Protein Details

Accession

G0RAC2

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
10-60	GPPHPPSHGPPRHPKPNPLRPLRKKPNPLVASSRKPPPKPSRPPANGAPSS	Hydrophilic
192-215	VAKEVVTKRPKKQKEEKTMFNRAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-53	HPPSHGPPRHPKPNPLRPLRKKPNPLVASSRKPPPKPSRPP
199-208	KRPKKQKEEK
497-514	KQKLSEMAKKGKSLKRPG
670-676	KRLRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	tre:TRIREDRAFT_104004 -

Amino Acid Sequences

MSDPAGNPGGPPHPPSHGPPRHPKPNPLRPLRKKPNPLVASSRKPPPKPSRPPANGAPSSSAQGAANGAKPSAEEIRNQYGGWSEPPPNYPYNDIPIMTTKKALLDGIRYHLMKFSQTKLGEKPIDPTDQEEFARPVTLHRRDARQPPPGRAVKVEEPERPPVDEQEAERLAQAKAEREAQRAIDQAKIAPVAKEVVTKRPKKQKEEKTMFNRAPKTSAAKKESDLRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAALSESSVAFMIDGSVFRMIPLEKCYKFNSKPPFQPFTIDQAEAFMNRKVDVGRWVMKDEEKKAGLSDLEATRRLLYGRGQMIKTESDTFRAASREEKMEHDELDVSGDEFQDDDETPHFEPQEDEDTKESKTRIRREQLGANLFGEADEQEVDKELQEQLREELERQKYGKTTKKALIKRDREEIYESDDSSSNPWSSSSEDDSSDEEEEAAKEEEKKEGESKDAQGDKDKAKLQGAKGSTTPQGKQKLSEMAKKGKSLKRPGSPTLSESSGNESTRKKQKKVTAAALGSRPGTPGLSQTTVRRPKITAGSGSDGEATAGEMSDGAMQKKKIKLVGSSRGTPSASRAGSPNPAAAGASSPSSGGLIEPWEILEKIPADGITIGDLINLFQGRVGDGPGRMPRQEWIGLVKQLCDYGPDKRLRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.37
3	0.44
4	0.49
5	0.55
6	0.63
7	0.7
8	0.76
9	0.79
10	0.83
11	0.83
12	0.84
13	0.87
14	0.87
15	0.88
16	0.88
17	0.93
18	0.94
19	0.93
20	0.93
21	0.91
22	0.91
23	0.84
24	0.79
25	0.78
26	0.77
27	0.75
28	0.71
29	0.72
30	0.7
31	0.69
32	0.74
33	0.75
34	0.76
35	0.78
36	0.82
37	0.84
38	0.81
39	0.84
40	0.82
41	0.81
42	0.74
43	0.66
44	0.61
45	0.51
46	0.47
47	0.41
48	0.33
49	0.23
50	0.2
51	0.2
52	0.17
53	0.19
54	0.17
55	0.17
56	0.15
57	0.15
58	0.18
59	0.22
60	0.22
61	0.22
62	0.27
63	0.34
64	0.36
65	0.35
66	0.32
67	0.28
68	0.28
69	0.27
70	0.25
71	0.23
72	0.24
73	0.28
74	0.31
75	0.31
76	0.32
77	0.34
78	0.32
79	0.34
80	0.34
81	0.31
82	0.29
83	0.34
84	0.36
85	0.32
86	0.31
87	0.26
88	0.24
89	0.25
90	0.25
91	0.2
92	0.21
93	0.23
94	0.27
95	0.32
96	0.31
97	0.3
98	0.31
99	0.3
100	0.29
101	0.3
102	0.29
103	0.31
104	0.33
105	0.37
106	0.37
107	0.45
108	0.44
109	0.41
110	0.42
111	0.38
112	0.4
113	0.36
114	0.37
115	0.31
116	0.3
117	0.3
118	0.28
119	0.25
120	0.21
121	0.23
122	0.19
123	0.21
124	0.28
125	0.33
126	0.38
127	0.41
128	0.47
129	0.52
130	0.62
131	0.64
132	0.64
133	0.64
134	0.62
135	0.67
136	0.66
137	0.61
138	0.54
139	0.53
140	0.5
141	0.52
142	0.51
143	0.48
144	0.46
145	0.51
146	0.49
147	0.45
148	0.39
149	0.34
150	0.34
151	0.3
152	0.27
153	0.28
154	0.28
155	0.26
156	0.25
157	0.24
158	0.2
159	0.2
160	0.2
161	0.15
162	0.16
163	0.24
164	0.26
165	0.27
166	0.29
167	0.28
168	0.3
169	0.3
170	0.29
171	0.24
172	0.22
173	0.2
174	0.2
175	0.2
176	0.18
177	0.14
178	0.14
179	0.13
180	0.13
181	0.19
182	0.19
183	0.26
184	0.35
185	0.41
186	0.49
187	0.58
188	0.65
189	0.69
190	0.78
191	0.79
192	0.81
193	0.83
194	0.85
195	0.83
196	0.85
197	0.8
198	0.77
199	0.71
200	0.61
201	0.55
202	0.48
203	0.47
204	0.45
205	0.49
206	0.45
207	0.42
208	0.43
209	0.49
210	0.5
211	0.47
212	0.42
213	0.36
214	0.34
215	0.33
216	0.32
217	0.25
218	0.23
219	0.2
220	0.17
221	0.15
222	0.12
223	0.11
224	0.11
225	0.12
226	0.13
227	0.13
228	0.12
229	0.12
230	0.12
231	0.12
232	0.11
233	0.09
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.05
241	0.06
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.04
247	0.04
248	0.05
249	0.04
250	0.04
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.07
256	0.07
257	0.08
258	0.13
259	0.19
260	0.19
261	0.22
262	0.26
263	0.33
264	0.35
265	0.42
266	0.47
267	0.47
268	0.53
269	0.58
270	0.59
271	0.51
272	0.52
273	0.46
274	0.43
275	0.39
276	0.31
277	0.24
278	0.21
279	0.21
280	0.18
281	0.18
282	0.13
283	0.1
284	0.1
285	0.11
286	0.1
287	0.11
288	0.13
289	0.16
290	0.2
291	0.2
292	0.21
293	0.22
294	0.25
295	0.28
296	0.26
297	0.27
298	0.23
299	0.22
300	0.21
301	0.2
302	0.17
303	0.14
304	0.15
305	0.13
306	0.14
307	0.14
308	0.15
309	0.14
310	0.14
311	0.14
312	0.11
313	0.11
314	0.14
315	0.17
316	0.21
317	0.2
318	0.21
319	0.22
320	0.21
321	0.21
322	0.2
323	0.16
324	0.15
325	0.15
326	0.15
327	0.15
328	0.16
329	0.15
330	0.14
331	0.15
332	0.16
333	0.16
334	0.18
335	0.2
336	0.2
337	0.2
338	0.18
339	0.16
340	0.13
341	0.13
342	0.11
343	0.07
344	0.07
345	0.06
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.06
352	0.06
353	0.08
354	0.09
355	0.1
356	0.1
357	0.09
358	0.1
359	0.11
360	0.18
361	0.17
362	0.18
363	0.19
364	0.2
365	0.2
366	0.22
367	0.21
368	0.18
369	0.25
370	0.32
371	0.39
372	0.44
373	0.5
374	0.51
375	0.56
376	0.58
377	0.54
378	0.47
379	0.38
380	0.32
381	0.26
382	0.21
383	0.16
384	0.09
385	0.05
386	0.05
387	0.04
388	0.04
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.08
394	0.09
395	0.1
396	0.11
397	0.11
398	0.13
399	0.14
400	0.14
401	0.21
402	0.22
403	0.25
404	0.25
405	0.26
406	0.28
407	0.35
408	0.42
409	0.39
410	0.43
411	0.46
412	0.54
413	0.58
414	0.64
415	0.67
416	0.67
417	0.66
418	0.68
419	0.63
420	0.56
421	0.54
422	0.45
423	0.42
424	0.35
425	0.31
426	0.24
427	0.23
428	0.21
429	0.19
430	0.2
431	0.13
432	0.11
433	0.11
434	0.11
435	0.12
436	0.15
437	0.18
438	0.17
439	0.18
440	0.19
441	0.2
442	0.21
443	0.19
444	0.16
445	0.12
446	0.11
447	0.1
448	0.11
449	0.1
450	0.09
451	0.11
452	0.12
453	0.15
454	0.15
455	0.18
456	0.2
457	0.2
458	0.23
459	0.24
460	0.26
461	0.3
462	0.33
463	0.31
464	0.33
465	0.37
466	0.35
467	0.37
468	0.38
469	0.32
470	0.35
471	0.38
472	0.34
473	0.37
474	0.37
475	0.33
476	0.31
477	0.32
478	0.32
479	0.31
480	0.32
481	0.32
482	0.39
483	0.37
484	0.38
485	0.39
486	0.43
487	0.44
488	0.49
489	0.49
490	0.5
491	0.52
492	0.56
493	0.61
494	0.57
495	0.61
496	0.64
497	0.66
498	0.66
499	0.69
500	0.69
501	0.68
502	0.64
503	0.58
504	0.52
505	0.46
506	0.38
507	0.32
508	0.33
509	0.3
510	0.28
511	0.29
512	0.29
513	0.34
514	0.44
515	0.52
516	0.5
517	0.53
518	0.61
519	0.67
520	0.73
521	0.73
522	0.71
523	0.66
524	0.67
525	0.61
526	0.54
527	0.45
528	0.36
529	0.28
530	0.2
531	0.17
532	0.13
533	0.14
534	0.16
535	0.19
536	0.2
537	0.25
538	0.35
539	0.43
540	0.45
541	0.44
542	0.41
543	0.44
544	0.5
545	0.49
546	0.44
547	0.4
548	0.43
549	0.41
550	0.4
551	0.34
552	0.26
553	0.22
554	0.16
555	0.12
556	0.07
557	0.06
558	0.05
559	0.04
560	0.05
561	0.09
562	0.1
563	0.12
564	0.16
565	0.18
566	0.25
567	0.29
568	0.33
569	0.34
570	0.36
571	0.42
572	0.48
573	0.56
574	0.56
575	0.57
576	0.56
577	0.55
578	0.53
579	0.44
580	0.39
581	0.37
582	0.32
583	0.28
584	0.28
585	0.28
586	0.32
587	0.33
588	0.31
589	0.23
590	0.22
591	0.21
592	0.19
593	0.17
594	0.12
595	0.12
596	0.11
597	0.1
598	0.1
599	0.1
600	0.09
601	0.08
602	0.07
603	0.08
604	0.09
605	0.09
606	0.09
607	0.11
608	0.12
609	0.12
610	0.14
611	0.13
612	0.13
613	0.14
614	0.13
615	0.13
616	0.13
617	0.13
618	0.11
619	0.1
620	0.09
621	0.09
622	0.09
623	0.07
624	0.1
625	0.1
626	0.08
627	0.09
628	0.1
629	0.1
630	0.11
631	0.14
632	0.13
633	0.14
634	0.2
635	0.26
636	0.3
637	0.3
638	0.3
639	0.3
640	0.33
641	0.35
642	0.31
643	0.31
644	0.33
645	0.38
646	0.38
647	0.37
648	0.32
649	0.31
650	0.29
651	0.27
652	0.23
653	0.25
654	0.33
655	0.4
656	0.47

G0RAC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer