FuNGI

G0R8X0

Protein Details

Accession

G0R8X0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
80-103	EADERRARGRSRFRSKRSRGDAMG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
83-100	ERRARGRSRFRSKRSRGD
298-302	KAKAK

Subcellular Location(s)

mito 16, nucl 9.5, cyto_nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
KEGG	tre:TRIREDRAFT_119530 -
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MVRGRTTARGVRRGGAAASSRPQTDADDSNHSQDQPGATSARAARAAASTGRFRPKNVRRDESERDALAQQEQQKASEREADERRARGRSRFRSKRSRGDAMGSRGGAFGRPVAGASGPFSSGMGGPAGGGWFGAGGGGGGGGGSFARSGKFEAKSGSGYGFSGEGGFRESRINADKLHAMAHDGDLDSEDEAMLNALHSRTGSVMPMGILRREHKEAPVMVATAAELEAAEKANANATGEEESLWVDGEGSLPPVDQPEEGDWKRAARVKKEPTDDSMDLDVDTKPATDEKKPPLTKAKAKKPVAQDPEEKMIRTDLSLLASELGAITINGDGEEKADETANKDGRLYLFQFPPLLPPLKQVAAPQPRIKVKEEEEQQHASASLHATPLSGAATPVDLTQQGDGEESSSSDDEEDEEQERRHGFRTQALSNGGLIGRLNVRRSGKVELDWGGRILEMSPAAGMNFLTTAVIVEESDEKPQNGVTTGESIGMGKIMGRFVLAPIWSEEEEWEVAPEELDIGGASQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.39
3	0.35
4	0.32
5	0.34
6	0.34
7	0.31
8	0.31
9	0.31
10	0.29
11	0.3
12	0.31
13	0.3
14	0.35
15	0.37
16	0.4
17	0.42
18	0.38
19	0.34
20	0.31
21	0.28
22	0.22
23	0.23
24	0.19
25	0.17
26	0.22
27	0.22
28	0.24
29	0.24
30	0.22
31	0.2
32	0.2
33	0.23
34	0.21
35	0.24
36	0.25
37	0.3
38	0.39
39	0.39
40	0.41
41	0.5
42	0.55
43	0.61
44	0.66
45	0.67
46	0.66
47	0.73
48	0.78
49	0.75
50	0.72
51	0.63
52	0.56
53	0.5
54	0.44
55	0.38
56	0.35
57	0.32
58	0.33
59	0.32
60	0.31
61	0.38
62	0.38
63	0.37
64	0.4
65	0.36
66	0.37
67	0.43
68	0.49
69	0.47
70	0.5
71	0.53
72	0.53
73	0.55
74	0.56
75	0.61
76	0.63
77	0.69
78	0.74
79	0.79
80	0.83
81	0.87
82	0.89
83	0.86
84	0.84
85	0.75
86	0.73
87	0.71
88	0.66
89	0.63
90	0.52
91	0.44
92	0.36
93	0.34
94	0.26
95	0.19
96	0.13
97	0.09
98	0.09
99	0.08
100	0.09
101	0.09
102	0.09
103	0.1
104	0.1
105	0.09
106	0.09
107	0.09
108	0.09
109	0.08
110	0.09
111	0.07
112	0.06
113	0.06
114	0.06
115	0.06
116	0.05
117	0.04
118	0.03
119	0.03
120	0.03
121	0.03
122	0.02
123	0.02
124	0.02
125	0.02
126	0.02
127	0.02
128	0.02
129	0.02
130	0.02
131	0.02
132	0.03
133	0.03
134	0.04
135	0.05
136	0.08
137	0.14
138	0.16
139	0.17
140	0.19
141	0.21
142	0.22
143	0.22
144	0.21
145	0.16
146	0.14
147	0.13
148	0.11
149	0.09
150	0.08
151	0.07
152	0.06
153	0.09
154	0.09
155	0.09
156	0.1
157	0.1
158	0.13
159	0.17
160	0.19
161	0.17
162	0.19
163	0.2
164	0.19
165	0.2
166	0.17
167	0.14
168	0.13
169	0.12
170	0.11
171	0.09
172	0.09
173	0.08
174	0.09
175	0.07
176	0.06
177	0.06
178	0.04
179	0.04
180	0.05
181	0.04
182	0.03
183	0.04
184	0.04
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.07
190	0.07
191	0.06
192	0.07
193	0.07
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.12
198	0.14
199	0.17
200	0.21
201	0.21
202	0.2
203	0.23
204	0.22
205	0.23
206	0.22
207	0.18
208	0.15
209	0.13
210	0.12
211	0.08
212	0.07
213	0.04
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.04
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.05
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.07
227	0.07
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.05
239	0.05
240	0.04
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.05
245	0.06
246	0.07
247	0.14
248	0.15
249	0.17
250	0.17
251	0.17
252	0.2
253	0.23
254	0.25
255	0.23
256	0.32
257	0.38
258	0.45
259	0.49
260	0.48
261	0.47
262	0.51
263	0.46
264	0.39
265	0.31
266	0.25
267	0.2
268	0.19
269	0.16
270	0.09
271	0.08
272	0.06
273	0.05
274	0.08
275	0.1
276	0.13
277	0.19
278	0.25
279	0.34
280	0.35
281	0.38
282	0.46
283	0.5
284	0.55
285	0.59
286	0.64
287	0.64
288	0.67
289	0.7
290	0.68
291	0.7
292	0.67
293	0.63
294	0.57
295	0.51
296	0.55
297	0.5
298	0.42
299	0.33
300	0.28
301	0.24
302	0.18
303	0.16
304	0.1
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.09
309	0.08
310	0.08
311	0.06
312	0.05
313	0.04
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.07
326	0.07
327	0.09
328	0.16
329	0.17
330	0.17
331	0.17
332	0.18
333	0.18
334	0.21
335	0.22
336	0.21
337	0.2
338	0.2
339	0.21
340	0.2
341	0.22
342	0.22
343	0.21
344	0.16
345	0.18
346	0.21
347	0.21
348	0.22
349	0.21
350	0.27
351	0.33
352	0.38
353	0.39
354	0.43
355	0.47
356	0.49
357	0.5
358	0.47
359	0.43
360	0.46
361	0.49
362	0.47
363	0.47
364	0.47
365	0.44
366	0.38
367	0.34
368	0.26
369	0.21
370	0.17
371	0.13
372	0.11
373	0.1
374	0.1
375	0.09
376	0.09
377	0.09
378	0.07
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.08
387	0.08
388	0.08
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.07
395	0.09
396	0.08
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.09
401	0.1
402	0.12
403	0.12
404	0.14
405	0.14
406	0.17
407	0.19
408	0.19
409	0.2
410	0.23
411	0.23
412	0.28
413	0.34
414	0.34
415	0.37
416	0.37
417	0.35
418	0.31
419	0.3
420	0.23
421	0.17
422	0.15
423	0.12
424	0.15
425	0.17
426	0.19
427	0.24
428	0.27
429	0.3
430	0.33
431	0.37
432	0.35
433	0.34
434	0.36
435	0.34
436	0.34
437	0.32
438	0.29
439	0.23
440	0.2
441	0.18
442	0.14
443	0.12
444	0.09
445	0.08
446	0.08
447	0.08
448	0.08
449	0.08
450	0.08
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.07
461	0.11
462	0.12
463	0.17
464	0.19
465	0.19
466	0.19
467	0.2
468	0.2
469	0.18
470	0.19
471	0.15
472	0.16
473	0.16
474	0.17
475	0.16
476	0.15
477	0.13
478	0.12
479	0.1
480	0.08
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.1
486	0.1
487	0.14
488	0.13
489	0.13
490	0.15
491	0.19
492	0.19
493	0.19
494	0.19
495	0.18
496	0.19
497	0.17
498	0.16
499	0.13
500	0.13
501	0.12
502	0.12
503	0.09
504	0.08
505	0.08

G0R8X0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer