FuNGI

Q2H0B2

Protein Details

Accession

Q2H0B2

Localization Confidence

High

Confidence Score

24.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-54	KPASANPLVARKKKRPTPVFSKPPNKRPGLG	Hydrophilic
202-224	VARANEPKPKPNNKKEKPTAFYG	Hydrophilic
577-597	DAGAKLKKKLKVKPGMRPGGT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-52	PTGRPPFVPRKPASANPLVARKKKRPTPVFSKPPNKRPG
209-216	KPKPNNKK
514-519	KGKLKR
535-550	RKKIRTGKGSVAPSRG
580-614	AKLKKKLKVKPGMRPGGTPSGSRAGSPAPGANRPG

Subcellular Location(s)

nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPAGSGPSRPTGRPPFVPRKPASANPLVARKKKRPTPVFSKPPNKRPGLGKGDIDDDEIPILNDMNDPSMRKLAQIREENGGWTEKTPANYKDFPLVVTKRSLLEGLRHHIMRLSKAKGDSSKAKGDAIVDIMNQDQFPRPVTLLRRDPRLPPAHRMVVKEDSAPADPAEAAEFERARQLKADKEAQRALDQAQIAPVARANEPKPKPNNKKEKPTAFYGRNSDAQKKESKIHYEETWPWHLEDAEGKAGVWVGSYIASLSDLNVALVIDGARFRMIPLERYYKFDEKPKFDTLSLDDAEKMMYEVKEIKRWVMKQKDQEFMEREKSETRRFLGGPTRVKTESATSRMARRTERQDDFELDMSGDEFQDDDEAPNFEADDEDTKDSKERIRREQVAANTFGAGEEEKVEQQEREEQLEKIRSKMMGKQTVKTLKKLEHGQDYDDLESGSDQNNPFTDESASEDEESDKESEKEDEEGKKAGQKDQGASGSNTKGNTTPSGKQRTVDALKKGKLKRAGSPNMSESSDNEAVRKKIRTGKGSVAPSRGGTPIPGRPKPLSAAMSDGEATAGEGSDAGAKLKKKLKVKPGMRPGGTPSGSRAGSPAPGANRPGAPKTGGATPSGSPPPSQAVDIIQPREIAEALAPYAKEGISLSNLMKKFQTRVNKPGNITTSQWIQMVKVHGVYGPDKLLRPKAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.49
3	0.53
4	0.57
5	0.62
6	0.65
7	0.7
8	0.79
9	0.73
10	0.72
11	0.72
12	0.7
13	0.68
14	0.65
15	0.63
16	0.59
17	0.66
18	0.66
19	0.68
20	0.7
21	0.72
22	0.74
23	0.76
24	0.81
25	0.81
26	0.82
27	0.83
28	0.85
29	0.87
30	0.87
31	0.9
32	0.88
33	0.89
34	0.89
35	0.83
36	0.77
37	0.74
38	0.74
39	0.71
40	0.67
41	0.61
42	0.54
43	0.54
44	0.48
45	0.44
46	0.34
47	0.25
48	0.21
49	0.18
50	0.15
51	0.11
52	0.11
53	0.08
54	0.09
55	0.09
56	0.12
57	0.14
58	0.15
59	0.18
60	0.22
61	0.22
62	0.24
63	0.3
64	0.33
65	0.41
66	0.46
67	0.46
68	0.47
69	0.48
70	0.46
71	0.41
72	0.37
73	0.29
74	0.22
75	0.24
76	0.21
77	0.24
78	0.29
79	0.31
80	0.35
81	0.37
82	0.38
83	0.4
84	0.37
85	0.36
86	0.38
87	0.37
88	0.33
89	0.33
90	0.33
91	0.27
92	0.28
93	0.29
94	0.21
95	0.25
96	0.28
97	0.3
98	0.35
99	0.34
100	0.33
101	0.35
102	0.36
103	0.37
104	0.38
105	0.37
106	0.36
107	0.38
108	0.43
109	0.43
110	0.47
111	0.48
112	0.46
113	0.49
114	0.45
115	0.44
116	0.4
117	0.36
118	0.31
119	0.26
120	0.21
121	0.14
122	0.14
123	0.14
124	0.13
125	0.12
126	0.12
127	0.12
128	0.12
129	0.14
130	0.15
131	0.16
132	0.2
133	0.26
134	0.33
135	0.4
136	0.44
137	0.49
138	0.49
139	0.52
140	0.56
141	0.6
142	0.56
143	0.53
144	0.56
145	0.57
146	0.58
147	0.57
148	0.53
149	0.49
150	0.46
151	0.4
152	0.35
153	0.29
154	0.26
155	0.25
156	0.19
157	0.14
158	0.13
159	0.12
160	0.11
161	0.09
162	0.08
163	0.1
164	0.11
165	0.1
166	0.17
167	0.17
168	0.17
169	0.2
170	0.22
171	0.24
172	0.3
173	0.4
174	0.38
175	0.44
176	0.47
177	0.45
178	0.44
179	0.4
180	0.36
181	0.3
182	0.25
183	0.19
184	0.16
185	0.15
186	0.14
187	0.13
188	0.13
189	0.11
190	0.12
191	0.16
192	0.17
193	0.26
194	0.29
195	0.37
196	0.45
197	0.54
198	0.64
199	0.7
200	0.79
201	0.78
202	0.86
203	0.87
204	0.87
205	0.8
206	0.78
207	0.76
208	0.7
209	0.67
210	0.61
211	0.55
212	0.51
213	0.51
214	0.5
215	0.44
216	0.43
217	0.44
218	0.41
219	0.44
220	0.43
221	0.46
222	0.42
223	0.43
224	0.41
225	0.41
226	0.43
227	0.42
228	0.41
229	0.35
230	0.32
231	0.29
232	0.26
233	0.21
234	0.19
235	0.16
236	0.13
237	0.12
238	0.12
239	0.11
240	0.11
241	0.1
242	0.08
243	0.05
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.03
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.09
267	0.1
268	0.13
269	0.18
270	0.25
271	0.26
272	0.31
273	0.36
274	0.36
275	0.37
276	0.42
277	0.45
278	0.42
279	0.46
280	0.46
281	0.43
282	0.39
283	0.39
284	0.34
285	0.31
286	0.27
287	0.22
288	0.18
289	0.15
290	0.15
291	0.12
292	0.1
293	0.07
294	0.06
295	0.07
296	0.13
297	0.14
298	0.18
299	0.19
300	0.21
301	0.24
302	0.28
303	0.36
304	0.4
305	0.44
306	0.49
307	0.55
308	0.59
309	0.55
310	0.57
311	0.52
312	0.46
313	0.47
314	0.38
315	0.33
316	0.32
317	0.34
318	0.34
319	0.33
320	0.31
321	0.28
322	0.28
323	0.3
324	0.32
325	0.35
326	0.37
327	0.36
328	0.38
329	0.35
330	0.35
331	0.32
332	0.29
333	0.27
334	0.24
335	0.27
336	0.24
337	0.28
338	0.32
339	0.34
340	0.32
341	0.32
342	0.37
343	0.41
344	0.43
345	0.42
346	0.41
347	0.41
348	0.4
349	0.35
350	0.27
351	0.19
352	0.16
353	0.12
354	0.1
355	0.07
356	0.05
357	0.04
358	0.03
359	0.04
360	0.04
361	0.05
362	0.05
363	0.06
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.07
371	0.08
372	0.1
373	0.11
374	0.11
375	0.13
376	0.14
377	0.18
378	0.22
379	0.26
380	0.33
381	0.41
382	0.45
383	0.48
384	0.52
385	0.53
386	0.5
387	0.46
388	0.37
389	0.29
390	0.24
391	0.2
392	0.15
393	0.1
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.08
399	0.09
400	0.08
401	0.09
402	0.15
403	0.16
404	0.19
405	0.21
406	0.2
407	0.24
408	0.32
409	0.31
410	0.26
411	0.27
412	0.25
413	0.25
414	0.31
415	0.34
416	0.37
417	0.39
418	0.39
419	0.45
420	0.53
421	0.54
422	0.51
423	0.47
424	0.41
425	0.45
426	0.49
427	0.46
428	0.45
429	0.44
430	0.42
431	0.42
432	0.39
433	0.34
434	0.28
435	0.23
436	0.14
437	0.13
438	0.12
439	0.09
440	0.1
441	0.1
442	0.11
443	0.11
444	0.13
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.1
449	0.14
450	0.16
451	0.16
452	0.14
453	0.15
454	0.14
455	0.14
456	0.15
457	0.12
458	0.11
459	0.1
460	0.11
461	0.12
462	0.12
463	0.15
464	0.17
465	0.2
466	0.2
467	0.22
468	0.21
469	0.25
470	0.25
471	0.27
472	0.28
473	0.27
474	0.27
475	0.3
476	0.33
477	0.31
478	0.31
479	0.3
480	0.28
481	0.28
482	0.26
483	0.22
484	0.2
485	0.2
486	0.24
487	0.24
488	0.28
489	0.34
490	0.42
491	0.42
492	0.41
493	0.42
494	0.46
495	0.48
496	0.48
497	0.48
498	0.47
499	0.51
500	0.59
501	0.6
502	0.58
503	0.6
504	0.57
505	0.57
506	0.6
507	0.64
508	0.6
509	0.61
510	0.58
511	0.52
512	0.51
513	0.43
514	0.34
515	0.33
516	0.33
517	0.28
518	0.27
519	0.27
520	0.29
521	0.33
522	0.34
523	0.32
524	0.36
525	0.43
526	0.47
527	0.48
528	0.54
529	0.57
530	0.63
531	0.61
532	0.55
533	0.49
534	0.44
535	0.41
536	0.34
537	0.26
538	0.21
539	0.21
540	0.25
541	0.33
542	0.34
543	0.37
544	0.38
545	0.4
546	0.41
547	0.43
548	0.37
549	0.29
550	0.3
551	0.26
552	0.25
553	0.23
554	0.2
555	0.13
556	0.11
557	0.1
558	0.06
559	0.06
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.07
564	0.07
565	0.08
566	0.12
567	0.13
568	0.21
569	0.28
570	0.34
571	0.4
572	0.49
573	0.58
574	0.65
575	0.73
576	0.76
577	0.8
578	0.83
579	0.76
580	0.71
581	0.66
582	0.64
583	0.57
584	0.47
585	0.4
586	0.37
587	0.36
588	0.33
589	0.29
590	0.21
591	0.22
592	0.22
593	0.23
594	0.2
595	0.23
596	0.26
597	0.27
598	0.29
599	0.31
600	0.32
601	0.3
602	0.28
603	0.27
604	0.27
605	0.31
606	0.28
607	0.26
608	0.25
609	0.24
610	0.28
611	0.31
612	0.29
613	0.23
614	0.24
615	0.27
616	0.26
617	0.26
618	0.21
619	0.2
620	0.27
621	0.32
622	0.32
623	0.28
624	0.27
625	0.27
626	0.27
627	0.24
628	0.17
629	0.12
630	0.11
631	0.11
632	0.13
633	0.13
634	0.12
635	0.13
636	0.12
637	0.12
638	0.11
639	0.12
640	0.12
641	0.15
642	0.17
643	0.23
644	0.24
645	0.25
646	0.28
647	0.29
648	0.31
649	0.36
650	0.45
651	0.45
652	0.55
653	0.64
654	0.67
655	0.67
656	0.71
657	0.68
658	0.61
659	0.57
660	0.51
661	0.46
662	0.41
663	0.4
664	0.32
665	0.28
666	0.29
667	0.3
668	0.28
669	0.24
670	0.22
671	0.22
672	0.25
673	0.25
674	0.24
675	0.24
676	0.25
677	0.28
678	0.33

Q2H0B2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer