Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G0RT96

Protein Details
Accession G0RT96    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-127WEWVDERMDRRKRQREAREKAEREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-120RKRQREAR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 11.333, mito 9, cyto_mito 7.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG tre:TRIREDRAFT_23118  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PF14559  TPR_19  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MTSRRDFLSQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPARDGPSEDQIKEALAKRAAQLGLVPDGKKGKEKEEEEDDERYQDPDNEVGLFAGGVYDKEDEEADKIWEWVDERMDRRKRQREAREKAEREEYERNNPKIQQQFSDLKRALATVSDEDWANLPEVGDLTGKNRRSKQALRQRFYAVPDSVLAAARDSGEMGTTVVDDGAATSTTDASDGTMTNFAQIGAARDRVLKSRLEQASQTAGDASVIGSSTSIDAQGYITSLNKMQVNESQAQVGDINRVRELLQSVVKTNPNNALGWIAAARLEELAGKIVAARKTIDQGCTRCPKSEDAWLENIRLNHDSPNSKIIARRAIEANPRSVRLWVEAMRLENIPSHKKRVIRQALDHIPESEALWKEAVNLEDDPEDAKLMLAKATELIPLSVDLWLALARLETPENAQKVLNKARKAVPTSHEIWIAAARLQEQLGQGHKSAVMKRAVQVLAKESAMPKREEWIAEAEKCEEEGAIITCQNIIQETLGWGLDEDDDRKDTWAEDARASINRGKYETARAIYAYALRVFVNSRTMWMAAADLERNHGTRESLWQVLEKAVEACPKSEDLWMMLAKEKWQSGDVDNARLVLKRAFNQNPNNEDIWLAAVKLESENGNEEQARKLLEVAREQAPTDRVWMKSVVFERVLGNVETALDLVLQALQLFPAAAKLWMLKGQIYEDLGKTGQAREAYAAGVKAVPRSVPLWLLYSRLEENAGLIVKARSVLDRARLAVPKNGELWCESVRLERRAGNMAQAKSLMAKALQEVPKSGLLWVEQIWHLEPRTQRKPRSLEAIKKVDNDPILFVAVARIFWADRKLEKAQSWFEKALVLDADRGDSWAWYYKFLVQHGTEEKRADMVTKCVLNEPRHGEVWQAVAKNPKNAKKSVEEILKLVAAELEQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.33
3 0.28
4 0.23
5 0.18
6 0.15
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.12
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.28
37 0.3
38 0.3
39 0.36
40 0.35
41 0.29
42 0.27
43 0.23
44 0.27
45 0.29
46 0.28
47 0.26
48 0.3
49 0.32
50 0.37
51 0.36
52 0.37
53 0.43
54 0.46
55 0.49
56 0.54
57 0.59
58 0.56
59 0.58
60 0.52
61 0.45
62 0.42
63 0.36
64 0.29
65 0.25
66 0.23
67 0.2
68 0.2
69 0.18
70 0.17
71 0.16
72 0.14
73 0.11
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.05
78 0.07
79 0.08
80 0.07
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.13
86 0.13
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.14
91 0.14
92 0.15
93 0.19
94 0.23
95 0.27
96 0.37
97 0.46
98 0.53
99 0.63
100 0.7
101 0.74
102 0.79
103 0.86
104 0.86
105 0.87
106 0.89
107 0.9
108 0.84
109 0.8
110 0.79
111 0.7
112 0.65
113 0.65
114 0.59
115 0.59
116 0.64
117 0.63
118 0.59
119 0.59
120 0.61
121 0.6
122 0.58
123 0.51
124 0.48
125 0.53
126 0.5
127 0.58
128 0.5
129 0.43
130 0.4
131 0.37
132 0.3
133 0.23
134 0.23
135 0.16
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.17
141 0.15
142 0.13
143 0.11
144 0.09
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.12
151 0.19
152 0.24
153 0.3
154 0.35
155 0.4
156 0.48
157 0.55
158 0.62
159 0.66
160 0.73
161 0.71
162 0.7
163 0.7
164 0.65
165 0.61
166 0.57
167 0.46
168 0.36
169 0.32
170 0.29
171 0.24
172 0.22
173 0.18
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.07
180 0.06
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.12
210 0.12
211 0.14
212 0.13
213 0.16
214 0.17
215 0.2
216 0.22
217 0.21
218 0.21
219 0.29
220 0.31
221 0.31
222 0.3
223 0.29
224 0.33
225 0.3
226 0.28
227 0.19
228 0.16
229 0.14
230 0.13
231 0.1
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.08
249 0.11
250 0.13
251 0.13
252 0.15
253 0.18
254 0.22
255 0.23
256 0.22
257 0.2
258 0.18
259 0.18
260 0.17
261 0.14
262 0.16
263 0.16
264 0.17
265 0.16
266 0.17
267 0.16
268 0.17
269 0.18
270 0.15
271 0.17
272 0.17
273 0.18
274 0.22
275 0.26
276 0.24
277 0.25
278 0.27
279 0.25
280 0.24
281 0.22
282 0.19
283 0.15
284 0.15
285 0.13
286 0.08
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.13
302 0.13
303 0.19
304 0.21
305 0.24
306 0.25
307 0.27
308 0.33
309 0.4
310 0.41
311 0.38
312 0.38
313 0.38
314 0.35
315 0.41
316 0.39
317 0.34
318 0.39
319 0.37
320 0.37
321 0.36
322 0.34
323 0.28
324 0.24
325 0.21
326 0.18
327 0.21
328 0.21
329 0.21
330 0.24
331 0.23
332 0.22
333 0.24
334 0.24
335 0.28
336 0.26
337 0.27
338 0.26
339 0.29
340 0.35
341 0.34
342 0.38
343 0.33
344 0.34
345 0.31
346 0.3
347 0.27
348 0.21
349 0.23
350 0.18
351 0.19
352 0.19
353 0.19
354 0.19
355 0.19
356 0.17
357 0.16
358 0.17
359 0.23
360 0.23
361 0.28
362 0.3
363 0.35
364 0.39
365 0.47
366 0.54
367 0.5
368 0.52
369 0.56
370 0.58
371 0.56
372 0.52
373 0.42
374 0.33
375 0.28
376 0.24
377 0.2
378 0.14
379 0.12
380 0.11
381 0.1
382 0.1
383 0.12
384 0.12
385 0.1
386 0.09
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.09
391 0.08
392 0.07
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.05
399 0.05
400 0.06
401 0.06
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.05
419 0.05
420 0.07
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.13
425 0.14
426 0.19
427 0.28
428 0.31
429 0.28
430 0.31
431 0.35
432 0.39
433 0.4
434 0.39
435 0.33
436 0.32
437 0.35
438 0.33
439 0.28
440 0.24
441 0.21
442 0.18
443 0.16
444 0.12
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.09
450 0.08
451 0.1
452 0.1
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.12
457 0.13
458 0.14
459 0.18
460 0.18
461 0.18
462 0.19
463 0.23
464 0.23
465 0.22
466 0.2
467 0.18
468 0.17
469 0.16
470 0.16
471 0.13
472 0.16
473 0.17
474 0.18
475 0.16
476 0.17
477 0.18
478 0.18
479 0.17
480 0.19
481 0.2
482 0.2
483 0.2
484 0.19
485 0.17
486 0.17
487 0.15
488 0.09
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.05
500 0.04
501 0.04
502 0.05
503 0.06
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.06
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.08
514 0.09
515 0.09
516 0.09
517 0.11
518 0.16
519 0.16
520 0.16
521 0.17
522 0.18
523 0.2
524 0.21
525 0.22
526 0.19
527 0.18
528 0.19
529 0.19
530 0.19
531 0.23
532 0.24
533 0.22
534 0.2
535 0.19
536 0.18
537 0.17
538 0.17
539 0.14
540 0.1
541 0.1
542 0.09
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.12
547 0.11
548 0.12
549 0.12
550 0.12
551 0.12
552 0.11
553 0.1
554 0.07
555 0.09
556 0.09
557 0.07
558 0.1
559 0.1
560 0.11
561 0.11
562 0.11
563 0.11
564 0.1
565 0.15
566 0.16
567 0.17
568 0.17
569 0.18
570 0.18
571 0.18
572 0.17
573 0.13
574 0.11
575 0.1
576 0.13
577 0.13
578 0.13
579 0.13
580 0.14
581 0.14
582 0.14
583 0.13
584 0.11
585 0.14
586 0.13
587 0.13
588 0.15
589 0.14
590 0.15
591 0.16
592 0.16
593 0.14
594 0.15
595 0.16
596 0.14
597 0.23
598 0.23
599 0.23
600 0.23
601 0.23
602 0.22
603 0.21
604 0.21
605 0.16
606 0.17
607 0.18
608 0.26
609 0.31
610 0.38
611 0.45
612 0.51
613 0.5
614 0.51
615 0.49
616 0.4
617 0.35
618 0.28
619 0.22
620 0.15
621 0.11
622 0.08
623 0.07
624 0.07
625 0.07
626 0.08
627 0.06
628 0.07
629 0.1
630 0.11
631 0.13
632 0.13
633 0.14
634 0.14
635 0.15
636 0.15
637 0.12
638 0.14
639 0.16
640 0.18
641 0.2
642 0.23
643 0.25
644 0.25
645 0.25
646 0.26
647 0.24
648 0.2
649 0.22
650 0.22
651 0.2
652 0.21
653 0.22
654 0.2
655 0.24
656 0.26
657 0.25
658 0.21
659 0.22
660 0.21
661 0.21
662 0.22
663 0.17
664 0.15
665 0.11
666 0.11
667 0.09
668 0.09
669 0.06
670 0.04
671 0.04
672 0.04
673 0.04
674 0.04
675 0.04
676 0.04
677 0.03
678 0.04
679 0.04
680 0.03
681 0.04
682 0.05
683 0.05
684 0.06
685 0.07
686 0.08
687 0.11
688 0.12
689 0.12
690 0.13
691 0.14
692 0.16
693 0.17
694 0.18
695 0.15
696 0.16
697 0.15
698 0.15
699 0.15
700 0.14
701 0.16
702 0.14
703 0.14
704 0.14
705 0.14
706 0.14
707 0.14
708 0.13
709 0.1
710 0.11
711 0.11
712 0.11
713 0.11
714 0.1
715 0.11
716 0.12
717 0.13
718 0.13
719 0.14
720 0.16
721 0.16
722 0.18
723 0.18
724 0.2
725 0.19
726 0.18
727 0.18
728 0.14
729 0.14
730 0.15
731 0.14
732 0.11
733 0.11
734 0.11
735 0.1
736 0.11
737 0.11
738 0.09
739 0.12
740 0.15
741 0.2
742 0.22
743 0.25
744 0.29
745 0.32
746 0.33
747 0.36
748 0.36
749 0.32
750 0.33
751 0.32
752 0.27
753 0.25
754 0.27
755 0.23
756 0.21
757 0.19
758 0.23
759 0.28
760 0.3
761 0.32
762 0.31
763 0.32
764 0.37
765 0.37
766 0.37
767 0.38
768 0.36
769 0.35
770 0.32
771 0.29
772 0.25
773 0.25
774 0.18
775 0.12
776 0.11
777 0.12
778 0.2
779 0.24
780 0.23
781 0.24
782 0.26
783 0.28
784 0.28
785 0.26
786 0.19
787 0.16
788 0.17
789 0.16
790 0.16
791 0.14
792 0.16
793 0.17
794 0.19
795 0.19
796 0.22
797 0.28
798 0.34
799 0.44
800 0.51
801 0.56
802 0.62
803 0.68
804 0.69
805 0.73
806 0.73
807 0.73
808 0.73
809 0.76
810 0.71
811 0.69
812 0.65
813 0.59
814 0.53
815 0.44
816 0.36
817 0.28
818 0.25
819 0.2
820 0.19
821 0.17
822 0.14
823 0.13
824 0.11
825 0.11
826 0.1
827 0.13
828 0.17
829 0.17
830 0.19
831 0.26
832 0.31
833 0.36
834 0.4
835 0.44
836 0.49
837 0.52
838 0.56
839 0.51
840 0.46
841 0.43
842 0.38
843 0.35
844 0.29
845 0.22
846 0.18
847 0.18
848 0.19
849 0.16
850 0.18
851 0.14
852 0.12
853 0.14
854 0.2
855 0.2
856 0.2
857 0.22
858 0.27
859 0.3
860 0.32
861 0.36
862 0.29
863 0.35
864 0.42
865 0.45
866 0.44
867 0.41
868 0.4
869 0.36
870 0.35
871 0.32
872 0.26
873 0.26
874 0.28
875 0.3
876 0.3
877 0.35
878 0.42
879 0.41
880 0.46
881 0.48
882 0.46
883 0.46
884 0.45
885 0.4
886 0.35
887 0.38
888 0.35
889 0.3
890 0.28
891 0.36
892 0.39
893 0.46
894 0.52
895 0.55
896 0.55
897 0.58
898 0.61
899 0.59
900 0.61
901 0.61
902 0.61
903 0.55
904 0.51
905 0.49
906 0.45
907 0.37
908 0.32