FuNGI

G0RIB5

Protein Details

Accession

G0RIB5

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
487-511	AVATPKPAKKEKKSKKDDAKLSESK	Hydrophilic
525-549	AADVKTPKADRKGKRKHTNSEDDAV	Hydrophilic
558-579	DISSAKGKSKKQKTARASSPEL	Hydrophilic
624-650	TATPSTAKKSTKKTKPETPVPAPRQTA	Hydrophilic
676-697	ATPVQSKSKKSKASKDEANATG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
491-540	PKPAKKEKKSKKDDAKLSESKDKKKDADVAATPKAADVKTPKADRKGKRK
565-569	KSKKQ
714-714	K

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
KEGG	tre:TRIREDRAFT_107078 -
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MAPKEPYKVHSLNKHVEDTKKGLSGSAQYNRRPIAKAAAAAVKNEPGALNAAVFGNNNDSDESSDSSESDSDSDGETGADLLKKLGANGATPSTGPKRRGKVDEIADSDIERTASAKRAAAKKEQLAKKESSTSETSSDSSSESESEQDEPKAKANGAVAAPQAAAGEESSSSSSEDESEDGDEESDGEEEEEPKAEPKPAAKQAATPAKPAATNGTAKAAAAAADSSSSSEESSEDEDEPAKPQPTKAQPTKAQSTKAQATKAQTAKVTSAKAQPAKEVTEESSSDSEDSDAQADESMGLSDRETETQVAVPNFIAPDFTLRKGDDGANGQDVARICNEANLQGKQFWYFTVPSNVPVSVIENIEIPMDRSQLGSRVFSHDGQDYGVSFDTISTRSSIQILIPSSSDSNYQPARQQVAQTMHIKRIANLGGAAASTAGPEPRRAARPQPKGLKARYQPFGVNTPMGNIGADASGDEDVEMDEAPAAVATPKPAKKEKKSKKDDAKLSESKDKKKDADVAATPKAADVKTPKADRKGKRKHTNSEDDAVAAEAQLKEDISSAKGKSKKQKTARASSPELGAELPPMPKKQTPIAPPTIPSSSAYSFSNLSSSATAVATPSKAATATPSTAKKSTKKTKPETPVPAPRQTAVPLPSIPLTARPKESPVPLPPSAAFATPVQSKSKKSKASKDEANATGSSQQSPPPSAQGGDKKKAAIKVKGSG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.66
3	0.65
4	0.63
5	0.59
6	0.55
7	0.5
8	0.45
9	0.38
10	0.35
11	0.37
12	0.39
13	0.43
14	0.45
15	0.45
16	0.51
17	0.54
18	0.55
19	0.51
20	0.45
21	0.45
22	0.42
23	0.4
24	0.39
25	0.43
26	0.4
27	0.39
28	0.38
29	0.31
30	0.27
31	0.26
32	0.21
33	0.14
34	0.16
35	0.14
36	0.12
37	0.11
38	0.12
39	0.12
40	0.12
41	0.12
42	0.13
43	0.13
44	0.14
45	0.14
46	0.14
47	0.16
48	0.18
49	0.19
50	0.18
51	0.18
52	0.17
53	0.18
54	0.18
55	0.16
56	0.14
57	0.13
58	0.11
59	0.12
60	0.12
61	0.1
62	0.1
63	0.09
64	0.09
65	0.09
66	0.09
67	0.08
68	0.09
69	0.11
70	0.11
71	0.12
72	0.15
73	0.14
74	0.14
75	0.17
76	0.18
77	0.16
78	0.16
79	0.22
80	0.26
81	0.32
82	0.37
83	0.42
84	0.48
85	0.55
86	0.61
87	0.61
88	0.62
89	0.63
90	0.65
91	0.61
92	0.56
93	0.49
94	0.43
95	0.38
96	0.3
97	0.23
98	0.14
99	0.11
100	0.11
101	0.15
102	0.17
103	0.19
104	0.25
105	0.32
106	0.37
107	0.44
108	0.49
109	0.52
110	0.6
111	0.63
112	0.62
113	0.6
114	0.59
115	0.55
116	0.55
117	0.49
118	0.44
119	0.41
120	0.38
121	0.36
122	0.34
123	0.31
124	0.25
125	0.24
126	0.2
127	0.17
128	0.15
129	0.13
130	0.12
131	0.12
132	0.12
133	0.15
134	0.16
135	0.18
136	0.2
137	0.21
138	0.24
139	0.25
140	0.24
141	0.24
142	0.22
143	0.24
144	0.21
145	0.23
146	0.19
147	0.17
148	0.17
149	0.14
150	0.13
151	0.08
152	0.08
153	0.05
154	0.06
155	0.05
156	0.06
157	0.07
158	0.07
159	0.08
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.09
164	0.09
165	0.09
166	0.09
167	0.09
168	0.09
169	0.09
170	0.08
171	0.07
172	0.07
173	0.07
174	0.06
175	0.06
176	0.06
177	0.07
178	0.07
179	0.08
180	0.08
181	0.09
182	0.1
183	0.12
184	0.13
185	0.16
186	0.24
187	0.3
188	0.35
189	0.34
190	0.36
191	0.43
192	0.51
193	0.49
194	0.42
195	0.37
196	0.33
197	0.33
198	0.3
199	0.26
200	0.19
201	0.2
202	0.19
203	0.2
204	0.19
205	0.18
206	0.18
207	0.14
208	0.1
209	0.09
210	0.08
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.06
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.08
221	0.1
222	0.11
223	0.11
224	0.11
225	0.12
226	0.12
227	0.14
228	0.16
229	0.16
230	0.15
231	0.15
232	0.23
233	0.3
234	0.39
235	0.43
236	0.49
237	0.52
238	0.58
239	0.66
240	0.62
241	0.58
242	0.52
243	0.53
244	0.51
245	0.49
246	0.45
247	0.39
248	0.4
249	0.44
250	0.43
251	0.38
252	0.32
253	0.3
254	0.31
255	0.31
256	0.28
257	0.23
258	0.26
259	0.29
260	0.32
261	0.32
262	0.31
263	0.3
264	0.3
265	0.28
266	0.24
267	0.2
268	0.19
269	0.18
270	0.18
271	0.17
272	0.15
273	0.14
274	0.13
275	0.11
276	0.09
277	0.09
278	0.07
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.09
296	0.12
297	0.11
298	0.11
299	0.1
300	0.1
301	0.1
302	0.09
303	0.08
304	0.05
305	0.1
306	0.11
307	0.12
308	0.14
309	0.14
310	0.15
311	0.16
312	0.17
313	0.14
314	0.15
315	0.15
316	0.14
317	0.14
318	0.13
319	0.14
320	0.13
321	0.12
322	0.09
323	0.09
324	0.08
325	0.1
326	0.1
327	0.11
328	0.14
329	0.14
330	0.15
331	0.15
332	0.15
333	0.14
334	0.14
335	0.11
336	0.11
337	0.11
338	0.12
339	0.16
340	0.16
341	0.17
342	0.18
343	0.17
344	0.15
345	0.14
346	0.14
347	0.1
348	0.1
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.08
354	0.07
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.11
361	0.12
362	0.12
363	0.13
364	0.17
365	0.18
366	0.18
367	0.2
368	0.17
369	0.16
370	0.15
371	0.14
372	0.1
373	0.09
374	0.08
375	0.07
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.08
384	0.09
385	0.09
386	0.08
387	0.11
388	0.11
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.11
393	0.11
394	0.12
395	0.1
396	0.13
397	0.14
398	0.15
399	0.17
400	0.19
401	0.22
402	0.21
403	0.21
404	0.23
405	0.25
406	0.29
407	0.33
408	0.32
409	0.31
410	0.35
411	0.34
412	0.29
413	0.29
414	0.25
415	0.19
416	0.17
417	0.15
418	0.1
419	0.1
420	0.09
421	0.05
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.06
426	0.06
427	0.07
428	0.1
429	0.13
430	0.17
431	0.2
432	0.3
433	0.39
434	0.47
435	0.55
436	0.62
437	0.66
438	0.69
439	0.7
440	0.69
441	0.66
442	0.64
443	0.59
444	0.52
445	0.46
446	0.42
447	0.42
448	0.35
449	0.29
450	0.22
451	0.2
452	0.18
453	0.16
454	0.13
455	0.09
456	0.08
457	0.06
458	0.06
459	0.05
460	0.05
461	0.04
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.03
469	0.03
470	0.03
471	0.03
472	0.03
473	0.03
474	0.03
475	0.04
476	0.06
477	0.13
478	0.15
479	0.2
480	0.29
481	0.38
482	0.48
483	0.59
484	0.68
485	0.73
486	0.8
487	0.86
488	0.88
489	0.89
490	0.88
491	0.84
492	0.83
493	0.78
494	0.74
495	0.73
496	0.68
497	0.66
498	0.64
499	0.62
500	0.55
501	0.54
502	0.56
503	0.5
504	0.51
505	0.48
506	0.48
507	0.45
508	0.43
509	0.38
510	0.3
511	0.29
512	0.22
513	0.2
514	0.19
515	0.23
516	0.3
517	0.37
518	0.41
519	0.48
520	0.58
521	0.63
522	0.7
523	0.74
524	0.77
525	0.82
526	0.86
527	0.87
528	0.87
529	0.88
530	0.82
531	0.75
532	0.65
533	0.54
534	0.46
535	0.36
536	0.26
537	0.15
538	0.13
539	0.09
540	0.09
541	0.09
542	0.08
543	0.08
544	0.09
545	0.1
546	0.09
547	0.14
548	0.15
549	0.22
550	0.28
551	0.35
552	0.44
553	0.54
554	0.62
555	0.67
556	0.76
557	0.78
558	0.82
559	0.84
560	0.82
561	0.78
562	0.7
563	0.63
564	0.53
565	0.44
566	0.35
567	0.26
568	0.19
569	0.15
570	0.17
571	0.17
572	0.19
573	0.22
574	0.23
575	0.27
576	0.32
577	0.37
578	0.41
579	0.45
580	0.51
581	0.49
582	0.49
583	0.5
584	0.45
585	0.39
586	0.34
587	0.31
588	0.26
589	0.25
590	0.25
591	0.22
592	0.21
593	0.2
594	0.19
595	0.15
596	0.14
597	0.13
598	0.12
599	0.12
600	0.11
601	0.1
602	0.1
603	0.11
604	0.1
605	0.1
606	0.1
607	0.09
608	0.09
609	0.09
610	0.13
611	0.15
612	0.18
613	0.24
614	0.28
615	0.32
616	0.38
617	0.44
618	0.47
619	0.54
620	0.62
621	0.65
622	0.71
623	0.75
624	0.8
625	0.84
626	0.86
627	0.85
628	0.85
629	0.86
630	0.82
631	0.81
632	0.73
633	0.64
634	0.57
635	0.49
636	0.46
637	0.38
638	0.35
639	0.27
640	0.27
641	0.27
642	0.26
643	0.24
644	0.26
645	0.3
646	0.31
647	0.36
648	0.35
649	0.4
650	0.44
651	0.49
652	0.48
653	0.48
654	0.51
655	0.47
656	0.49
657	0.44
658	0.43
659	0.39
660	0.32
661	0.27
662	0.2
663	0.24
664	0.25
665	0.27
666	0.3
667	0.33
668	0.38
669	0.46
670	0.55
671	0.6
672	0.64
673	0.72
674	0.74
675	0.8
676	0.83
677	0.82
678	0.81
679	0.74
680	0.69
681	0.59
682	0.51
683	0.46
684	0.38
685	0.33
686	0.25
687	0.26
688	0.26
689	0.29
690	0.29
691	0.28
692	0.29
693	0.28
694	0.34
695	0.41
696	0.46
697	0.5
698	0.51
699	0.51
700	0.54
701	0.6
702	0.6
703	0.59

G0RIB5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer