FuNGI

G0RJC0

Protein Details

Accession

G0RJC0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
427-447	QGTWDRRGNRRQRQEEEQREL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto_nucl 10.5, cyto 8, pero 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045245 Pfs2-like IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000785 C:chromatin GO:0005847 C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex GO:0098789 P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation
KEGG	tre:TRIREDRAFT_22287 -
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MAYEPRGDHGDRGGGQGQDGSYMKVRGRRPVTDYSASVLHWMRDRAPNYRGGYTGERERPSASYIVDMIPPAGRPVSPADSIPAKHLHSSLNKIKHPINVVRWTPEGRRLLTASTSGEFTLWNGTGFNFETIMQAHDSAIRALEYSHSDDWLISGDHDGVIKYWQPNFNNVKSINAHTDPIRDLAFSPNDSKFVTASDDSTLKIFDFALGQEELKLEGHGWDAKSVDWHPTKGLIISGSKDHLVKLWDPRTARALTTLHGHKSTITKVLFEKKLGRCFATSARDQTARVFDLRMMRDIVLLKGHEKDISTLTFHPIHPNLLSTGGMDGSLFHYMLDTPNPPAGQPLTVAPYDSLDPESTPAQSVWPTHKVPFAHDYAIWSLDWHPLGHILASGSNDRITRFWARARPGETEIFQDRYHIGEAAAEAQGTWDRRGNRRQRQEEEQRELEDEMDALVDQDAQKPAVPGLTGGIPGLPLGGGAVPGLGSAIPPPPMVPGVGVGGGSAAPPPPPPPPPFGIPGFNGAPPPPLPGLDPHNPPDPAKLLELMQQAGVPIPPPGSLPPGLIPPPGGIPPPPGNFQLPIPPPLMNPSDLEASRRRAPLPSQEESLRQEQRHGKYTRAR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.27
3	0.27
4	0.24
5	0.22
6	0.22
7	0.2
8	0.2
9	0.23
10	0.26
11	0.31
12	0.34
13	0.39
14	0.45
15	0.48
16	0.51
17	0.57
18	0.61
19	0.59
20	0.57
21	0.5
22	0.46
23	0.4
24	0.39
25	0.31
26	0.27
27	0.25
28	0.26
29	0.28
30	0.34
31	0.37
32	0.39
33	0.4
34	0.45
35	0.45
36	0.46
37	0.42
38	0.39
39	0.41
40	0.41
41	0.47
42	0.46
43	0.44
44	0.43
45	0.44
46	0.4
47	0.38
48	0.35
49	0.26
50	0.21
51	0.21
52	0.21
53	0.2
54	0.18
55	0.16
56	0.14
57	0.14
58	0.13
59	0.13
60	0.11
61	0.12
62	0.17
63	0.2
64	0.2
65	0.2
66	0.23
67	0.27
68	0.27
69	0.29
70	0.29
71	0.26
72	0.27
73	0.28
74	0.31
75	0.32
76	0.4
77	0.45
78	0.49
79	0.5
80	0.53
81	0.54
82	0.53
83	0.54
84	0.53
85	0.53
86	0.53
87	0.53
88	0.52
89	0.52
90	0.51
91	0.47
92	0.48
93	0.45
94	0.38
95	0.38
96	0.36
97	0.34
98	0.32
99	0.31
100	0.25
101	0.21
102	0.2
103	0.17
104	0.15
105	0.13
106	0.12
107	0.14
108	0.11
109	0.11
110	0.1
111	0.1
112	0.12
113	0.13
114	0.13
115	0.1
116	0.1
117	0.11
118	0.11
119	0.13
120	0.11
121	0.11
122	0.1
123	0.12
124	0.12
125	0.11
126	0.11
127	0.09
128	0.09
129	0.08
130	0.1
131	0.11
132	0.15
133	0.15
134	0.15
135	0.15
136	0.15
137	0.15
138	0.15
139	0.12
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.08
144	0.09
145	0.09
146	0.07
147	0.09
148	0.12
149	0.14
150	0.18
151	0.23
152	0.24
153	0.33
154	0.39
155	0.4
156	0.44
157	0.41
158	0.41
159	0.38
160	0.4
161	0.37
162	0.32
163	0.31
164	0.25
165	0.28
166	0.24
167	0.23
168	0.2
169	0.15
170	0.14
171	0.17
172	0.19
173	0.18
174	0.21
175	0.2
176	0.21
177	0.21
178	0.21
179	0.16
180	0.15
181	0.17
182	0.13
183	0.14
184	0.14
185	0.15
186	0.14
187	0.15
188	0.14
189	0.1
190	0.1
191	0.09
192	0.07
193	0.07
194	0.06
195	0.09
196	0.09
197	0.09
198	0.09
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.06
204	0.06
205	0.08
206	0.1
207	0.1
208	0.1
209	0.11
210	0.11
211	0.13
212	0.13
213	0.19
214	0.18
215	0.19
216	0.18
217	0.2
218	0.2
219	0.18
220	0.18
221	0.12
222	0.11
223	0.12
224	0.13
225	0.12
226	0.13
227	0.13
228	0.12
229	0.12
230	0.13
231	0.15
232	0.22
233	0.24
234	0.27
235	0.27
236	0.29
237	0.31
238	0.3
239	0.27
240	0.24
241	0.21
242	0.18
243	0.23
244	0.24
245	0.22
246	0.22
247	0.22
248	0.19
249	0.21
250	0.21
251	0.22
252	0.19
253	0.19
254	0.21
255	0.29
256	0.29
257	0.29
258	0.36
259	0.34
260	0.41
261	0.4
262	0.38
263	0.31
264	0.32
265	0.35
266	0.31
267	0.28
268	0.25
269	0.26
270	0.26
271	0.26
272	0.26
273	0.23
274	0.2
275	0.18
276	0.15
277	0.14
278	0.19
279	0.19
280	0.19
281	0.17
282	0.16
283	0.17
284	0.17
285	0.16
286	0.11
287	0.11
288	0.11
289	0.11
290	0.11
291	0.1
292	0.1
293	0.1
294	0.11
295	0.11
296	0.12
297	0.11
298	0.14
299	0.15
300	0.15
301	0.18
302	0.17
303	0.17
304	0.15
305	0.15
306	0.13
307	0.11
308	0.11
309	0.08
310	0.07
311	0.06
312	0.06
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.06
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.09
326	0.1
327	0.09
328	0.1
329	0.1
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.1
334	0.1
335	0.1
336	0.09
337	0.09
338	0.09
339	0.09
340	0.1
341	0.07
342	0.07
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.09
348	0.08
349	0.09
350	0.11
351	0.14
352	0.19
353	0.2
354	0.21
355	0.24
356	0.24
357	0.26
358	0.28
359	0.26
360	0.22
361	0.21
362	0.21
363	0.19
364	0.19
365	0.16
366	0.13
367	0.11
368	0.12
369	0.13
370	0.11
371	0.1
372	0.1
373	0.1
374	0.09
375	0.09
376	0.06
377	0.07
378	0.08
379	0.09
380	0.09
381	0.1
382	0.11
383	0.11
384	0.11
385	0.14
386	0.16
387	0.18
388	0.23
389	0.27
390	0.31
391	0.35
392	0.38
393	0.38
394	0.38
395	0.38
396	0.34
397	0.33
398	0.32
399	0.29
400	0.26
401	0.23
402	0.2
403	0.19
404	0.19
405	0.14
406	0.11
407	0.09
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.08
412	0.07
413	0.07
414	0.1
415	0.1
416	0.11
417	0.14
418	0.18
419	0.25
420	0.35
421	0.45
422	0.53
423	0.62
424	0.7
425	0.72
426	0.78
427	0.83
428	0.82
429	0.79
430	0.72
431	0.63
432	0.56
433	0.49
434	0.39
435	0.28
436	0.19
437	0.11
438	0.08
439	0.07
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.06
444	0.09
445	0.1
446	0.1
447	0.11
448	0.11
449	0.11
450	0.11
451	0.11
452	0.08
453	0.08
454	0.09
455	0.08
456	0.08
457	0.08
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.04
462	0.03
463	0.03
464	0.03
465	0.03
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.03
470	0.03
471	0.03
472	0.03
473	0.04
474	0.06
475	0.07
476	0.07
477	0.08
478	0.09
479	0.1
480	0.1
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.07
487	0.07
488	0.06
489	0.06
490	0.06
491	0.05
492	0.05
493	0.06
494	0.09
495	0.13
496	0.19
497	0.22
498	0.26
499	0.3
500	0.33
501	0.37
502	0.38
503	0.38
504	0.34
505	0.36
506	0.33
507	0.29
508	0.27
509	0.23
510	0.23
511	0.19
512	0.21
513	0.17
514	0.16
515	0.16
516	0.19
517	0.25
518	0.29
519	0.33
520	0.33
521	0.39
522	0.4
523	0.4
524	0.4
525	0.37
526	0.32
527	0.3
528	0.28
529	0.22
530	0.26
531	0.28
532	0.24
533	0.21
534	0.19
535	0.17
536	0.16
537	0.15
538	0.1
539	0.09
540	0.08
541	0.08
542	0.1
543	0.11
544	0.15
545	0.15
546	0.17
547	0.17
548	0.22
549	0.23
550	0.22
551	0.21
552	0.18
553	0.2
554	0.19
555	0.19
556	0.15
557	0.2
558	0.27
559	0.3
560	0.32
561	0.32
562	0.33
563	0.33
564	0.34
565	0.37
566	0.33
567	0.33
568	0.32
569	0.3
570	0.28
571	0.32
572	0.32
573	0.25
574	0.23
575	0.23
576	0.27
577	0.27
578	0.31
579	0.31
580	0.35
581	0.4
582	0.42
583	0.4
584	0.39
585	0.44
586	0.5
587	0.52
588	0.5
589	0.49
590	0.49
591	0.53
592	0.53
593	0.57
594	0.54
595	0.47
596	0.51
597	0.55
598	0.58
599	0.62
600	0.59

G0RJC0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer