Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4ASC2

Protein Details
Accession D4ASC2    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-306TLGGTPVRKKKRKGAKTNPSAYSMHydrophilic
390-415LDKWDDRRVHAKRKGAQGRRGKNGNEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
290-298RKKKRKGAK
398-411VHAKRKGAQGRRGK
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG abe:ARB_07137  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPTKQWIVKSSSSKRETRTLRELDEEFKSATRKNEGEAANYGIFYDDTKYDYMQHLRGLGEGVGDAHFVEARTKGKGKKGMKLEDALKDISLDGDGAESFTYGDANDDILSTASSYIRKATYQDQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREALEALEDDAYVDEECDEDIFDNLVAGGHDAEVDPDEWRDTYIEDDDEGWESDATEKAPVQHDTSTDSQLPTASDDKGSSNKSSQPPNDDQIPDMEEHEGDWLKDFAKYKKDMKASKAAAKVDDSASELRTTASTLFTLGGTPVRKKKRKGAKTNPSAYSMTSSSLARTEGHRLLDDRFERMEALYALDEGEEYEGSSMADDMSIASGVSRFSRFSKLSQAPSLVANDRNTPLRSDFNDVMDGFLDKWDDRRVHAKRKGAQGRRGKNGNEVIGMRMLDEVRQGLGPPKLSTNAFGKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.68
3 0.71
4 0.7
5 0.69
6 0.69
7 0.65
8 0.62
9 0.63
10 0.6
11 0.56
12 0.52
13 0.45
14 0.37
15 0.33
16 0.33
17 0.31
18 0.33
19 0.36
20 0.33
21 0.33
22 0.39
23 0.38
24 0.39
25 0.38
26 0.38
27 0.31
28 0.3
29 0.27
30 0.2
31 0.18
32 0.15
33 0.15
34 0.11
35 0.12
36 0.13
37 0.14
38 0.16
39 0.22
40 0.26
41 0.25
42 0.26
43 0.27
44 0.26
45 0.26
46 0.24
47 0.19
48 0.14
49 0.12
50 0.11
51 0.08
52 0.08
53 0.07
54 0.06
55 0.07
56 0.07
57 0.09
58 0.11
59 0.13
60 0.18
61 0.24
62 0.28
63 0.36
64 0.45
65 0.48
66 0.53
67 0.61
68 0.64
69 0.62
70 0.64
71 0.61
72 0.57
73 0.55
74 0.47
75 0.38
76 0.3
77 0.26
78 0.2
79 0.14
80 0.09
81 0.06
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.04
91 0.06
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.11
105 0.12
106 0.13
107 0.16
108 0.2
109 0.27
110 0.31
111 0.36
112 0.36
113 0.37
114 0.38
115 0.36
116 0.3
117 0.24
118 0.18
119 0.14
120 0.12
121 0.1
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.07
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.15
131 0.15
132 0.14
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.05
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.05
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.11
191 0.12
192 0.13
193 0.14
194 0.14
195 0.17
196 0.19
197 0.19
198 0.18
199 0.17
200 0.15
201 0.14
202 0.14
203 0.12
204 0.12
205 0.1
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.14
210 0.16
211 0.15
212 0.15
213 0.21
214 0.25
215 0.3
216 0.3
217 0.34
218 0.35
219 0.36
220 0.39
221 0.33
222 0.3
223 0.25
224 0.25
225 0.18
226 0.16
227 0.13
228 0.08
229 0.08
230 0.1
231 0.09
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.1
237 0.13
238 0.15
239 0.21
240 0.25
241 0.29
242 0.36
243 0.43
244 0.45
245 0.47
246 0.53
247 0.51
248 0.53
249 0.53
250 0.48
251 0.41
252 0.38
253 0.35
254 0.26
255 0.23
256 0.18
257 0.14
258 0.14
259 0.13
260 0.11
261 0.1
262 0.09
263 0.1
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.1
273 0.12
274 0.16
275 0.24
276 0.34
277 0.41
278 0.45
279 0.55
280 0.62
281 0.71
282 0.78
283 0.81
284 0.81
285 0.85
286 0.89
287 0.82
288 0.75
289 0.65
290 0.54
291 0.47
292 0.36
293 0.28
294 0.21
295 0.18
296 0.14
297 0.14
298 0.15
299 0.12
300 0.13
301 0.18
302 0.2
303 0.21
304 0.22
305 0.22
306 0.23
307 0.3
308 0.29
309 0.26
310 0.23
311 0.22
312 0.21
313 0.2
314 0.2
315 0.13
316 0.13
317 0.11
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.06
323 0.07
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.06
341 0.08
342 0.09
343 0.1
344 0.13
345 0.2
346 0.22
347 0.24
348 0.34
349 0.38
350 0.42
351 0.45
352 0.44
353 0.38
354 0.39
355 0.41
356 0.34
357 0.32
358 0.28
359 0.28
360 0.29
361 0.33
362 0.31
363 0.3
364 0.3
365 0.32
366 0.33
367 0.37
368 0.37
369 0.34
370 0.37
371 0.34
372 0.32
373 0.26
374 0.24
375 0.17
376 0.15
377 0.15
378 0.11
379 0.14
380 0.2
381 0.2
382 0.23
383 0.33
384 0.41
385 0.5
386 0.57
387 0.63
388 0.64
389 0.73
390 0.81
391 0.8
392 0.81
393 0.81
394 0.82
395 0.83
396 0.83
397 0.74
398 0.72
399 0.69
400 0.63
401 0.57
402 0.49
403 0.41
404 0.37
405 0.35
406 0.27
407 0.22
408 0.19
409 0.15
410 0.16
411 0.14
412 0.12
413 0.13
414 0.14
415 0.17
416 0.21
417 0.24
418 0.24
419 0.27
420 0.3
421 0.3
422 0.33