Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AMS9

Protein Details
Accession D4AMS9    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
250-275DEYIKGQSKETRRERQRKEKNVLEVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-50PRRGKRDGPSEPR
55-58PPRG
283-327RRGGDSSRGRGRGGDRGGDRGRGGRGGRGDFRGGRGNGRGAPRGG
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.5, nucl 13.5, cyto 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG abe:ARB_05532  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MYELLDINIYAQHTGNDPELDPNREPEPPVQVVDKSAPRRGKRDGPSEPRDTVPPPRGNRGPRLPGNEQARPHPNLPALSTLSISIYRTLLSNKVILGISAFRDRNAGSQNNRNRPTDAPSDRAPPAAHRNRDTRGYNIRDDRQSRTDRTITEKQVEQGWGSRSGESALKDERAGEDIARSEEKEAAEANAEEPVEEPEDKSKSYADYLAEQAQAKLELAAKESRKANEGAKMDKKWAAAKELKRDDEEDEYIKGQSKETRRERQRKEKNVLEVDMRFVEVPRRGGDSSRGRGRGGDRGGDRGRGGRGGRGDFRGGRGNGRGAPRGGPSHATGPTVDEKNFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.17
3 0.17
4 0.17
5 0.24
6 0.28
7 0.33
8 0.32
9 0.33
10 0.33
11 0.33
12 0.35
13 0.3
14 0.33
15 0.3
16 0.31
17 0.31
18 0.29
19 0.3
20 0.34
21 0.39
22 0.36
23 0.42
24 0.48
25 0.5
26 0.55
27 0.6
28 0.63
29 0.63
30 0.68
31 0.71
32 0.72
33 0.75
34 0.75
35 0.7
36 0.62
37 0.58
38 0.51
39 0.49
40 0.49
41 0.5
42 0.48
43 0.54
44 0.59
45 0.61
46 0.66
47 0.66
48 0.66
49 0.64
50 0.68
51 0.63
52 0.64
53 0.66
54 0.63
55 0.56
56 0.54
57 0.54
58 0.5
59 0.48
60 0.44
61 0.4
62 0.35
63 0.35
64 0.32
65 0.27
66 0.24
67 0.23
68 0.19
69 0.17
70 0.16
71 0.16
72 0.13
73 0.11
74 0.1
75 0.11
76 0.12
77 0.13
78 0.14
79 0.14
80 0.13
81 0.15
82 0.15
83 0.13
84 0.13
85 0.12
86 0.12
87 0.17
88 0.18
89 0.15
90 0.17
91 0.17
92 0.2
93 0.24
94 0.28
95 0.27
96 0.36
97 0.45
98 0.53
99 0.57
100 0.55
101 0.52
102 0.48
103 0.49
104 0.49
105 0.43
106 0.38
107 0.36
108 0.39
109 0.37
110 0.37
111 0.32
112 0.27
113 0.33
114 0.37
115 0.4
116 0.4
117 0.44
118 0.45
119 0.52
120 0.49
121 0.45
122 0.46
123 0.45
124 0.47
125 0.48
126 0.5
127 0.5
128 0.5
129 0.49
130 0.48
131 0.48
132 0.45
133 0.44
134 0.42
135 0.37
136 0.42
137 0.45
138 0.4
139 0.39
140 0.37
141 0.33
142 0.33
143 0.32
144 0.24
145 0.2
146 0.19
147 0.19
148 0.19
149 0.18
150 0.15
151 0.15
152 0.17
153 0.14
154 0.15
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.13
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.15
193 0.13
194 0.13
195 0.15
196 0.17
197 0.18
198 0.17
199 0.16
200 0.14
201 0.13
202 0.11
203 0.1
204 0.11
205 0.09
206 0.11
207 0.16
208 0.17
209 0.21
210 0.24
211 0.24
212 0.24
213 0.26
214 0.26
215 0.28
216 0.3
217 0.33
218 0.37
219 0.37
220 0.38
221 0.38
222 0.38
223 0.35
224 0.34
225 0.34
226 0.35
227 0.39
228 0.47
229 0.51
230 0.52
231 0.48
232 0.48
233 0.44
234 0.41
235 0.38
236 0.3
237 0.25
238 0.23
239 0.22
240 0.25
241 0.22
242 0.19
243 0.23
244 0.29
245 0.37
246 0.46
247 0.56
248 0.62
249 0.72
250 0.81
251 0.85
252 0.89
253 0.89
254 0.89
255 0.86
256 0.84
257 0.79
258 0.72
259 0.66
260 0.55
261 0.48
262 0.4
263 0.33
264 0.24
265 0.19
266 0.22
267 0.2
268 0.21
269 0.2
270 0.24
271 0.24
272 0.25
273 0.34
274 0.37
275 0.42
276 0.48
277 0.49
278 0.45
279 0.48
280 0.49
281 0.49
282 0.43
283 0.42
284 0.35
285 0.42
286 0.43
287 0.42
288 0.4
289 0.35
290 0.34
291 0.32
292 0.31
293 0.28
294 0.32
295 0.35
296 0.38
297 0.38
298 0.41
299 0.37
300 0.4
301 0.44
302 0.39
303 0.38
304 0.37
305 0.38
306 0.38
307 0.41
308 0.42
309 0.35
310 0.37
311 0.37
312 0.37
313 0.35
314 0.33
315 0.31
316 0.32
317 0.33
318 0.31
319 0.27
320 0.28
321 0.32
322 0.33
323 0.31
324 0.28
325 0.29
326 0.33
327 0.33