Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4B3D7

Protein Details
Accession D4B3D7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-88RDSSQPRHATKNRPDRTKPPDIVHydrophilic
426-449GMEEWLRPRKRRLIPKVRPRVGGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
432-452RPRKRRLIPKVRPRVGGAKKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004601  UvdE  
IPR036237  Xyl_isomerase-like_sf  
Gene Ontology GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0009411  P:response to UV  
KEGG abe:ARB_02974  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03851  UvdE  
Amino Acid Sequences MSTGQATIEDFERGSEVGADEEEVEQAASQPPPACLNTYLRNANPPVFCSRTCRIASILENRHPLRDSSQPRHATKNRPDRTKPPDIVRGQKFVQELGLANTRDLVTIIRWNARFGIRFMRISSEMFPFASHAEYGYKLAPFASKALAEVGAVAAELGHRLTVHPGQSSDTNKGQFTQLGSPRKEVISNSIRDLAYHTDMLNLLNLPPQMDRDAVMILHMGGTFGDKERTLSRFREAYLGLPQDIKDRIVLENDDMSWTVHDLLPVCEELNIPFVLDYHHHNIHFDPGQIREGTLDIMTLYDRIRSTWIRKGKTQKMHYSEPTPEAITKVQRRKHNARVSTLPPCDPTMDLMIEAKDKEQAVFELVKIYKLPGFEKINHVIPHYREDWVKTPKKTHMLVGTSQLPKLNPKEANMGGPYGRVYWPPGMEEWLRPRKRRLIPKVRPRVGGAKKREEESSLEEGEGEDYLTLTNTSSDKEEPAKRRKFTAKSEDQEIQSPENPFGRKLRARKNVTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.1
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.1
10 0.08
11 0.08
12 0.07
13 0.08
14 0.11
15 0.1
16 0.13
17 0.14
18 0.16
19 0.2
20 0.21
21 0.23
22 0.23
23 0.29
24 0.33
25 0.38
26 0.42
27 0.4
28 0.46
29 0.46
30 0.48
31 0.44
32 0.41
33 0.41
34 0.4
35 0.39
36 0.4
37 0.41
38 0.42
39 0.42
40 0.41
41 0.36
42 0.38
43 0.43
44 0.46
45 0.5
46 0.48
47 0.55
48 0.54
49 0.55
50 0.5
51 0.45
52 0.39
53 0.41
54 0.44
55 0.44
56 0.53
57 0.58
58 0.6
59 0.69
60 0.72
61 0.72
62 0.73
63 0.77
64 0.76
65 0.77
66 0.81
67 0.8
68 0.81
69 0.81
70 0.77
71 0.74
72 0.75
73 0.71
74 0.75
75 0.7
76 0.67
77 0.57
78 0.55
79 0.48
80 0.39
81 0.33
82 0.25
83 0.21
84 0.19
85 0.25
86 0.2
87 0.2
88 0.21
89 0.2
90 0.18
91 0.17
92 0.14
93 0.1
94 0.15
95 0.18
96 0.22
97 0.23
98 0.24
99 0.27
100 0.29
101 0.29
102 0.26
103 0.32
104 0.3
105 0.31
106 0.31
107 0.33
108 0.31
109 0.31
110 0.32
111 0.26
112 0.22
113 0.21
114 0.2
115 0.16
116 0.15
117 0.14
118 0.11
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.12
123 0.13
124 0.12
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.12
130 0.12
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.09
137 0.07
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.04
148 0.08
149 0.11
150 0.12
151 0.14
152 0.14
153 0.16
154 0.21
155 0.24
156 0.25
157 0.26
158 0.27
159 0.26
160 0.26
161 0.25
162 0.22
163 0.22
164 0.25
165 0.28
166 0.34
167 0.35
168 0.36
169 0.36
170 0.35
171 0.34
172 0.27
173 0.28
174 0.27
175 0.28
176 0.28
177 0.31
178 0.3
179 0.28
180 0.3
181 0.25
182 0.2
183 0.19
184 0.17
185 0.13
186 0.14
187 0.14
188 0.12
189 0.09
190 0.07
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.04
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.08
215 0.1
216 0.13
217 0.16
218 0.18
219 0.21
220 0.21
221 0.22
222 0.24
223 0.21
224 0.21
225 0.22
226 0.21
227 0.18
228 0.17
229 0.17
230 0.16
231 0.17
232 0.15
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.12
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.11
265 0.13
266 0.16
267 0.16
268 0.17
269 0.17
270 0.2
271 0.2
272 0.18
273 0.15
274 0.14
275 0.16
276 0.15
277 0.15
278 0.11
279 0.11
280 0.1
281 0.08
282 0.07
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.07
289 0.07
290 0.08
291 0.11
292 0.15
293 0.19
294 0.26
295 0.34
296 0.35
297 0.41
298 0.51
299 0.56
300 0.63
301 0.66
302 0.67
303 0.66
304 0.69
305 0.66
306 0.61
307 0.55
308 0.48
309 0.41
310 0.33
311 0.28
312 0.23
313 0.22
314 0.25
315 0.3
316 0.36
317 0.4
318 0.46
319 0.55
320 0.61
321 0.69
322 0.71
323 0.68
324 0.65
325 0.66
326 0.65
327 0.64
328 0.58
329 0.49
330 0.42
331 0.37
332 0.33
333 0.27
334 0.23
335 0.17
336 0.14
337 0.13
338 0.13
339 0.12
340 0.13
341 0.12
342 0.11
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.12
349 0.13
350 0.13
351 0.16
352 0.16
353 0.17
354 0.16
355 0.17
356 0.16
357 0.17
358 0.18
359 0.18
360 0.23
361 0.24
362 0.3
363 0.33
364 0.37
365 0.37
366 0.38
367 0.36
368 0.33
369 0.36
370 0.31
371 0.3
372 0.26
373 0.29
374 0.35
375 0.4
376 0.46
377 0.46
378 0.5
379 0.55
380 0.6
381 0.58
382 0.55
383 0.53
384 0.49
385 0.47
386 0.46
387 0.47
388 0.41
389 0.4
390 0.37
391 0.3
392 0.32
393 0.33
394 0.36
395 0.31
396 0.32
397 0.38
398 0.37
399 0.41
400 0.36
401 0.34
402 0.26
403 0.25
404 0.23
405 0.18
406 0.18
407 0.14
408 0.16
409 0.18
410 0.18
411 0.19
412 0.19
413 0.22
414 0.23
415 0.28
416 0.34
417 0.41
418 0.47
419 0.5
420 0.56
421 0.62
422 0.69
423 0.74
424 0.76
425 0.77
426 0.81
427 0.88
428 0.92
429 0.88
430 0.82
431 0.76
432 0.75
433 0.74
434 0.73
435 0.71
436 0.7
437 0.68
438 0.67
439 0.64
440 0.56
441 0.5
442 0.47
443 0.44
444 0.34
445 0.3
446 0.28
447 0.26
448 0.24
449 0.19
450 0.13
451 0.07
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.08
458 0.09
459 0.11
460 0.14
461 0.15
462 0.18
463 0.26
464 0.35
465 0.42
466 0.52
467 0.6
468 0.6
469 0.68
470 0.74
471 0.74
472 0.75
473 0.77
474 0.77
475 0.73
476 0.77
477 0.75
478 0.67
479 0.65
480 0.58
481 0.52
482 0.46
483 0.43
484 0.39
485 0.39
486 0.38
487 0.35
488 0.38
489 0.43
490 0.47
491 0.55
492 0.62
493 0.66