Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AJP2

Protein Details
Accession D4AJP2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
624-644EESPEERADRKRQELRRQLEAAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
367-384KNKLKSIGTIGGKKPRPP
633-659RKRQELRRQLEAANKGQNKPAKKKRRF
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG abe:ARB_04492  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MTRNWVRLPLYSDSYPPLLFSYEPSSEGYDVFLTDLGHVWSESLSHKQIIDRAAKDDTSIDPSQDEDQYSVLLQKINDALHGSEGTSLFLSGRGAGSSLRLSTTTKLPKPLEPLEWTLVLSKCSPSALTRHMLVPTLRSWLGIEAQQQSLCELLEEKDKIIGKLFDKIESSGLDLSTVFPGMANIRHGQKRGSLFSQASKLVKGVSPFDKGSWETIHSSGASKKSTSIPVWKYLYDDDLFDARNMELIESEWWNLPTTSRSSNHPGKQAPNNLERCTENDGSESDNEFQTQETPPGLKEIGTRSSPDTTGHHINSEISPTWHSKKYKSSSQKPGSLGNANANIKIQPRTDSEDSTTTSAPESPPRQKNKLKSIGTIGGKKPRPPPRQQELDPAASEADDVVDKPPKPNLEDQATPSPTESDTSGDNDDDIHNKGANRAKGQTLPQQSHRGSQETDSTTQVAQLERQGPPRTRGLGRIGGKTQKESSSQSLGGKDDALATSSWGKTDSPEAEEGGGDHSNSASKQQPPDLSHGHNEQSTATAKPHKRSGRLGIIGGSKASSKFANVKGRNTSYNTTILQDTKDSSHHEASRMVDTREGPAQELPSLPPKSSAIDQTKAENTPGKEESPEERADRKRQELRRQLEAANKGQNKPAKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.33
3 0.28
4 0.24
5 0.2
6 0.18
7 0.2
8 0.23
9 0.21
10 0.23
11 0.24
12 0.25
13 0.24
14 0.24
15 0.22
16 0.16
17 0.14
18 0.14
19 0.13
20 0.1
21 0.1
22 0.11
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.09
28 0.1
29 0.12
30 0.16
31 0.18
32 0.19
33 0.21
34 0.23
35 0.28
36 0.33
37 0.38
38 0.34
39 0.36
40 0.37
41 0.36
42 0.34
43 0.32
44 0.28
45 0.27
46 0.26
47 0.22
48 0.19
49 0.22
50 0.24
51 0.24
52 0.22
53 0.16
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.16
58 0.14
59 0.15
60 0.13
61 0.16
62 0.19
63 0.18
64 0.19
65 0.18
66 0.17
67 0.17
68 0.18
69 0.15
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.12
74 0.12
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.14
89 0.16
90 0.25
91 0.32
92 0.34
93 0.41
94 0.43
95 0.46
96 0.52
97 0.54
98 0.5
99 0.45
100 0.46
101 0.41
102 0.39
103 0.36
104 0.33
105 0.29
106 0.25
107 0.22
108 0.18
109 0.16
110 0.16
111 0.17
112 0.14
113 0.18
114 0.21
115 0.23
116 0.24
117 0.26
118 0.26
119 0.28
120 0.27
121 0.24
122 0.21
123 0.22
124 0.21
125 0.18
126 0.18
127 0.16
128 0.18
129 0.17
130 0.2
131 0.18
132 0.2
133 0.2
134 0.2
135 0.18
136 0.17
137 0.14
138 0.11
139 0.09
140 0.08
141 0.14
142 0.15
143 0.15
144 0.19
145 0.21
146 0.21
147 0.23
148 0.26
149 0.21
150 0.28
151 0.28
152 0.26
153 0.26
154 0.26
155 0.25
156 0.21
157 0.22
158 0.15
159 0.14
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.11
171 0.13
172 0.19
173 0.22
174 0.23
175 0.24
176 0.28
177 0.31
178 0.34
179 0.33
180 0.32
181 0.31
182 0.33
183 0.36
184 0.34
185 0.3
186 0.26
187 0.24
188 0.2
189 0.2
190 0.18
191 0.19
192 0.19
193 0.22
194 0.22
195 0.22
196 0.23
197 0.23
198 0.24
199 0.2
200 0.2
201 0.18
202 0.18
203 0.19
204 0.16
205 0.17
206 0.19
207 0.21
208 0.2
209 0.18
210 0.19
211 0.22
212 0.26
213 0.27
214 0.32
215 0.31
216 0.36
217 0.38
218 0.36
219 0.35
220 0.31
221 0.31
222 0.23
223 0.21
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.13
228 0.13
229 0.1
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.07
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.13
245 0.17
246 0.18
247 0.22
248 0.28
249 0.36
250 0.4
251 0.44
252 0.44
253 0.45
254 0.5
255 0.53
256 0.51
257 0.51
258 0.51
259 0.46
260 0.45
261 0.4
262 0.36
263 0.35
264 0.31
265 0.23
266 0.2
267 0.19
268 0.19
269 0.19
270 0.18
271 0.13
272 0.12
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.11
283 0.11
284 0.09
285 0.11
286 0.13
287 0.16
288 0.16
289 0.17
290 0.18
291 0.19
292 0.19
293 0.18
294 0.17
295 0.18
296 0.23
297 0.22
298 0.2
299 0.19
300 0.19
301 0.18
302 0.18
303 0.14
304 0.1
305 0.11
306 0.14
307 0.17
308 0.22
309 0.24
310 0.25
311 0.33
312 0.38
313 0.45
314 0.52
315 0.58
316 0.63
317 0.67
318 0.7
319 0.63
320 0.61
321 0.55
322 0.47
323 0.39
324 0.31
325 0.31
326 0.25
327 0.23
328 0.2
329 0.18
330 0.18
331 0.19
332 0.17
333 0.14
334 0.16
335 0.22
336 0.24
337 0.24
338 0.24
339 0.24
340 0.25
341 0.24
342 0.22
343 0.16
344 0.14
345 0.14
346 0.12
347 0.15
348 0.19
349 0.26
350 0.34
351 0.4
352 0.48
353 0.53
354 0.6
355 0.64
356 0.69
357 0.62
358 0.57
359 0.55
360 0.55
361 0.52
362 0.5
363 0.43
364 0.42
365 0.42
366 0.44
367 0.48
368 0.52
369 0.56
370 0.58
371 0.65
372 0.65
373 0.71
374 0.69
375 0.7
376 0.64
377 0.59
378 0.5
379 0.41
380 0.33
381 0.24
382 0.22
383 0.12
384 0.07
385 0.04
386 0.05
387 0.06
388 0.11
389 0.11
390 0.12
391 0.16
392 0.17
393 0.2
394 0.24
395 0.28
396 0.29
397 0.31
398 0.34
399 0.39
400 0.38
401 0.36
402 0.32
403 0.27
404 0.22
405 0.21
406 0.17
407 0.1
408 0.1
409 0.12
410 0.13
411 0.12
412 0.11
413 0.11
414 0.11
415 0.12
416 0.13
417 0.12
418 0.12
419 0.13
420 0.18
421 0.23
422 0.25
423 0.26
424 0.26
425 0.28
426 0.3
427 0.34
428 0.36
429 0.38
430 0.39
431 0.41
432 0.47
433 0.46
434 0.48
435 0.46
436 0.41
437 0.35
438 0.33
439 0.35
440 0.3
441 0.31
442 0.27
443 0.25
444 0.22
445 0.23
446 0.22
447 0.16
448 0.13
449 0.16
450 0.19
451 0.2
452 0.27
453 0.31
454 0.32
455 0.35
456 0.38
457 0.39
458 0.36
459 0.38
460 0.38
461 0.4
462 0.41
463 0.43
464 0.43
465 0.44
466 0.44
467 0.43
468 0.41
469 0.35
470 0.35
471 0.34
472 0.34
473 0.32
474 0.34
475 0.33
476 0.32
477 0.3
478 0.28
479 0.24
480 0.19
481 0.16
482 0.13
483 0.12
484 0.09
485 0.1
486 0.13
487 0.13
488 0.13
489 0.13
490 0.13
491 0.13
492 0.18
493 0.19
494 0.18
495 0.19
496 0.19
497 0.19
498 0.19
499 0.18
500 0.15
501 0.14
502 0.1
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.1
507 0.13
508 0.15
509 0.19
510 0.23
511 0.28
512 0.34
513 0.35
514 0.42
515 0.43
516 0.42
517 0.42
518 0.42
519 0.4
520 0.34
521 0.32
522 0.26
523 0.24
524 0.23
525 0.2
526 0.19
527 0.26
528 0.3
529 0.35
530 0.44
531 0.48
532 0.52
533 0.57
534 0.62
535 0.63
536 0.61
537 0.57
538 0.52
539 0.49
540 0.43
541 0.37
542 0.29
543 0.2
544 0.17
545 0.18
546 0.14
547 0.14
548 0.2
549 0.28
550 0.38
551 0.41
552 0.47
553 0.53
554 0.57
555 0.59
556 0.58
557 0.54
558 0.46
559 0.48
560 0.42
561 0.36
562 0.35
563 0.32
564 0.28
565 0.26
566 0.25
567 0.22
568 0.24
569 0.26
570 0.29
571 0.34
572 0.35
573 0.36
574 0.37
575 0.37
576 0.43
577 0.41
578 0.37
579 0.34
580 0.32
581 0.33
582 0.35
583 0.33
584 0.26
585 0.25
586 0.26
587 0.24
588 0.24
589 0.23
590 0.27
591 0.28
592 0.26
593 0.27
594 0.26
595 0.29
596 0.31
597 0.37
598 0.35
599 0.38
600 0.39
601 0.42
602 0.46
603 0.43
604 0.43
605 0.4
606 0.35
607 0.37
608 0.39
609 0.35
610 0.32
611 0.34
612 0.35
613 0.34
614 0.37
615 0.35
616 0.4
617 0.46
618 0.54
619 0.58
620 0.63
621 0.68
622 0.73
623 0.79
624 0.81
625 0.8
626 0.8
627 0.77
628 0.72
629 0.71
630 0.68
631 0.64
632 0.64
633 0.63
634 0.56
635 0.59
636 0.61
637 0.61
638 0.65
639 0.69