FuNGI

D4B178

Protein Details

Accession

D4B178

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
240-260	QQRGGGKGKRKKQSGRDRGQG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
243-258	GGGKGKRKKQSGRDRG

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12, nucl 11.5, cyto 11.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR001656 PsdUridine_synth_TruD IPR011760 PsdUridine_synth_TruD_insert IPR042214 TruD_catalytic
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis
KEGG	abe:ARB_02207 -
Pfam	View protein in Pfam PF01142 TruD
PROSITE	View protein in PROSITE PS50984 TRUD
CDD	cd02576 PseudoU_synth_ScPUS7

Amino Acid Sequences

MADEDESRRKRIKVSNGDSGSESLAAPIQGLVGATADAGSPAPDAQAVKEAEVGITQFVSPDLPGFSGVVKKRYTDFLVNEILPSGEVLHLKDTELSTALKTAIAETATPVESASATPQDTPVTGEEIEGKTGEVEDDKTEKPAAETAGIVLADLATEDRELLDQLFGPETTPKLLNLYSRAVAKASSRPGELGKVKSLVITDKDQRTSLHQAIRRIFKSNLDSTTDSDGTIVVSAASVQQRGGGKGKRKKQSGRDRGQGASQLPRGKLGWSELGGDYLHFTLYKENKDTMEVISFLSRQLKVAPKAFQFAGTKDRRGATVQRVSVFRIYPDRMPKLNASLRMAAIGDYEYQKQGLELGELNGNEFVITLRDCQFPEGVVDRGNISSPETIAKVTELVGKSLCDLRERGYFNYYGLQRFGTFATRTDTTGLKMLRGEFKEACESILHYSPIALAAAQDVSSEDPSQRPQISTDDILRAKAIHIFQTTGNGRDALEVLPRKFTAESNIIRLLCQRKNDYFGALQSIPRNLRLMYVHAYQSLVWNFAAGERWRLYGDKVVEGDLVLVSEFKDETKAAAQQAEVDADGEEIVLPDADDSAAVDDMFERARALTAEEAASGKYSIFDIVLPLPGFDILYPANKMTDFYKEFMGSDKGGNLDPFDMRRSWRDISLSGSYRKMLSRPGADYSFEVKPYRAEDEQFVKTDLERLRENTSKSADGNNDNNQSSLTSETLEQPEKLAVILKFQLGASQYATMALRELMKTGGAKEYKPDFAR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.71
3	0.69
4	0.69
5	0.62
6	0.54
7	0.45
8	0.34
9	0.27
10	0.17
11	0.15
12	0.12
13	0.11
14	0.09
15	0.08
16	0.07
17	0.07
18	0.07
19	0.05
20	0.05
21	0.05
22	0.05
23	0.05
24	0.05
25	0.05
26	0.05
27	0.06
28	0.06
29	0.06
30	0.08
31	0.09
32	0.1
33	0.16
34	0.17
35	0.17
36	0.19
37	0.19
38	0.17
39	0.17
40	0.16
41	0.1
42	0.1
43	0.09
44	0.08
45	0.08
46	0.08
47	0.07
48	0.08
49	0.09
50	0.09
51	0.1
52	0.1
53	0.11
54	0.18
55	0.22
56	0.26
57	0.26
58	0.28
59	0.3
60	0.35
61	0.38
62	0.38
63	0.38
64	0.37
65	0.41
66	0.4
67	0.37
68	0.32
69	0.27
70	0.19
71	0.16
72	0.12
73	0.09
74	0.1
75	0.11
76	0.13
77	0.14
78	0.14
79	0.17
80	0.16
81	0.15
82	0.16
83	0.16
84	0.13
85	0.15
86	0.14
87	0.13
88	0.12
89	0.12
90	0.12
91	0.12
92	0.11
93	0.11
94	0.13
95	0.13
96	0.13
97	0.12
98	0.1
99	0.1
100	0.1
101	0.12
102	0.12
103	0.12
104	0.13
105	0.14
106	0.15
107	0.14
108	0.16
109	0.14
110	0.14
111	0.14
112	0.14
113	0.17
114	0.17
115	0.18
116	0.16
117	0.15
118	0.12
119	0.12
120	0.12
121	0.08
122	0.09
123	0.11
124	0.15
125	0.16
126	0.17
127	0.18
128	0.18
129	0.18
130	0.19
131	0.18
132	0.15
133	0.14
134	0.13
135	0.14
136	0.14
137	0.12
138	0.09
139	0.07
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.04
144	0.04
145	0.04
146	0.04
147	0.05
148	0.06
149	0.06
150	0.07
151	0.07
152	0.08
153	0.1
154	0.09
155	0.1
156	0.11
157	0.11
158	0.13
159	0.13
160	0.12
161	0.14
162	0.16
163	0.18
164	0.2
165	0.22
166	0.22
167	0.23
168	0.23
169	0.21
170	0.21
171	0.21
172	0.23
173	0.26
174	0.26
175	0.25
176	0.26
177	0.26
178	0.32
179	0.34
180	0.31
181	0.28
182	0.28
183	0.27
184	0.26
185	0.26
186	0.22
187	0.21
188	0.23
189	0.27
190	0.31
191	0.33
192	0.33
193	0.33
194	0.35
195	0.39
196	0.39
197	0.4
198	0.38
199	0.43
200	0.48
201	0.55
202	0.51
203	0.48
204	0.44
205	0.42
206	0.45
207	0.43
208	0.39
209	0.36
210	0.36
211	0.34
212	0.38
213	0.33
214	0.27
215	0.22
216	0.19
217	0.14
218	0.13
219	0.1
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.11
228	0.12
229	0.15
230	0.21
231	0.24
232	0.33
233	0.41
234	0.5
235	0.55
236	0.62
237	0.69
238	0.73
239	0.79
240	0.8
241	0.81
242	0.8
243	0.75
244	0.68
245	0.62
246	0.56
247	0.47
248	0.41
249	0.37
250	0.33
251	0.29
252	0.3
253	0.28
254	0.24
255	0.23
256	0.2
257	0.18
258	0.15
259	0.17
260	0.15
261	0.16
262	0.15
263	0.14
264	0.12
265	0.09
266	0.09
267	0.06
268	0.07
269	0.12
270	0.16
271	0.19
272	0.21
273	0.22
274	0.22
275	0.24
276	0.25
277	0.19
278	0.17
279	0.14
280	0.13
281	0.12
282	0.12
283	0.11
284	0.14
285	0.13
286	0.12
287	0.15
288	0.21
289	0.24
290	0.28
291	0.31
292	0.29
293	0.32
294	0.31
295	0.32
296	0.27
297	0.25
298	0.3
299	0.28
300	0.29
301	0.28
302	0.29
303	0.26
304	0.27
305	0.3
306	0.29
307	0.32
308	0.33
309	0.34
310	0.34
311	0.34
312	0.34
313	0.29
314	0.23
315	0.21
316	0.21
317	0.22
318	0.28
319	0.3
320	0.29
321	0.31
322	0.3
323	0.32
324	0.34
325	0.33
326	0.29
327	0.27
328	0.26
329	0.24
330	0.23
331	0.15
332	0.12
333	0.09
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.07
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.06
345	0.07
346	0.09
347	0.09
348	0.1
349	0.08
350	0.08
351	0.07
352	0.06
353	0.05
354	0.04
355	0.05
356	0.06
357	0.08
358	0.1
359	0.1
360	0.11
361	0.11
362	0.1
363	0.12
364	0.12
365	0.11
366	0.1
367	0.1
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.08
372	0.08
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.06
381	0.06
382	0.1
383	0.09
384	0.1
385	0.1
386	0.1
387	0.11
388	0.13
389	0.13
390	0.1
391	0.11
392	0.13
393	0.18
394	0.21
395	0.21
396	0.21
397	0.21
398	0.2
399	0.24
400	0.23
401	0.18
402	0.17
403	0.16
404	0.14
405	0.15
406	0.15
407	0.13
408	0.12
409	0.12
410	0.15
411	0.15
412	0.15
413	0.16
414	0.16
415	0.13
416	0.18
417	0.17
418	0.14
419	0.14
420	0.15
421	0.19
422	0.2
423	0.23
424	0.19
425	0.2
426	0.22
427	0.21
428	0.21
429	0.15
430	0.15
431	0.14
432	0.16
433	0.14
434	0.11
435	0.11
436	0.1
437	0.1
438	0.09
439	0.06
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.05
447	0.06
448	0.07
449	0.07
450	0.08
451	0.1
452	0.14
453	0.14
454	0.14
455	0.15
456	0.18
457	0.2
458	0.21
459	0.21
460	0.24
461	0.23
462	0.23
463	0.21
464	0.18
465	0.16
466	0.17
467	0.16
468	0.13
469	0.14
470	0.15
471	0.14
472	0.22
473	0.22
474	0.2
475	0.2
476	0.18
477	0.17
478	0.16
479	0.17
480	0.1
481	0.15
482	0.17
483	0.17
484	0.18
485	0.18
486	0.19
487	0.19
488	0.19
489	0.19
490	0.22
491	0.23
492	0.25
493	0.3
494	0.28
495	0.28
496	0.32
497	0.34
498	0.29
499	0.33
500	0.34
501	0.32
502	0.37
503	0.37
504	0.36
505	0.3
506	0.28
507	0.29
508	0.24
509	0.24
510	0.21
511	0.25
512	0.23
513	0.23
514	0.23
515	0.18
516	0.19
517	0.18
518	0.2
519	0.19
520	0.21
521	0.21
522	0.2
523	0.21
524	0.18
525	0.21
526	0.19
527	0.16
528	0.13
529	0.12
530	0.11
531	0.12
532	0.17
533	0.13
534	0.16
535	0.16
536	0.17
537	0.18
538	0.19
539	0.19
540	0.2
541	0.21
542	0.2
543	0.2
544	0.2
545	0.19
546	0.18
547	0.17
548	0.11
549	0.09
550	0.05
551	0.05
552	0.04
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.07
557	0.07
558	0.08
559	0.11
560	0.14
561	0.15
562	0.16
563	0.15
564	0.16
565	0.16
566	0.15
567	0.13
568	0.1
569	0.09
570	0.08
571	0.08
572	0.06
573	0.05
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.04
578	0.03
579	0.04
580	0.04
581	0.04
582	0.04
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.07
590	0.07
591	0.06
592	0.06
593	0.07
594	0.07
595	0.09
596	0.09
597	0.1
598	0.1
599	0.11
600	0.11
601	0.1
602	0.11
603	0.09
604	0.08
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.08
611	0.09
612	0.13
613	0.12
614	0.12
615	0.11
616	0.11
617	0.11
618	0.09
619	0.1
620	0.08
621	0.11
622	0.12
623	0.12
624	0.13
625	0.13
626	0.15
627	0.14
628	0.21
629	0.21
630	0.22
631	0.25
632	0.25
633	0.25
634	0.27
635	0.29
636	0.21
637	0.2
638	0.2
639	0.18
640	0.19
641	0.19
642	0.16
643	0.15
644	0.16
645	0.17
646	0.18
647	0.19
648	0.2
649	0.24
650	0.29
651	0.29
652	0.31
653	0.32
654	0.31
655	0.35
656	0.4
657	0.41
658	0.39
659	0.38
660	0.35
661	0.34
662	0.35
663	0.31
664	0.3
665	0.32
666	0.34
667	0.35
668	0.4
669	0.4
670	0.39
671	0.4
672	0.38
673	0.34
674	0.32
675	0.3
676	0.25
677	0.25
678	0.27
679	0.3
680	0.28
681	0.27
682	0.3
683	0.35
684	0.39
685	0.38
686	0.36
687	0.31
688	0.29
689	0.34
690	0.31
691	0.29
692	0.28
693	0.3
694	0.36
695	0.41
696	0.44
697	0.43
698	0.44
699	0.42
700	0.4
701	0.44
702	0.42
703	0.43
704	0.46
705	0.48
706	0.49
707	0.47
708	0.45
709	0.39
710	0.34
711	0.29
712	0.25
713	0.18
714	0.14
715	0.15
716	0.2
717	0.25
718	0.27
719	0.25
720	0.24
721	0.24
722	0.23
723	0.22
724	0.22
725	0.17
726	0.19
727	0.21
728	0.2
729	0.2
730	0.2
731	0.22
732	0.18
733	0.2
734	0.17
735	0.16
736	0.16
737	0.17
738	0.18
739	0.15
740	0.14
741	0.14
742	0.15
743	0.14
744	0.15
745	0.13
746	0.16
747	0.17
748	0.18
749	0.25
750	0.24
751	0.25
752	0.31
753	0.36

D4B178

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer