Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4ATB4

Protein Details
Accession D4ATB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-32GAPKGNKKRGEGTPRRRDPMIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-28KGSKQRGGGAPKGNKKRGEGTPRRR
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto_nucl 9.5, mito 9, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR035543  eIF-2B_epsilon_N  
IPR001451  Hexapep  
IPR029044  Nucleotide-diphossugar_trans  
IPR011004  Trimer_LpxA-like_sf  
IPR003307  W2_domain  
IPR044123  W2_eIF2B_epsilon  
Gene Ontology GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
GO:0004475  F:mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GTP) activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0031369  F:translation initiation factor binding  
GO:0048856  P:anatomical structure development  
GO:0043934  P:sporulation  
KEGG abe:ARB_07478  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00132  Hexapep  
PF02020  W2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51363  W2  
CDD cd04197  eIF-2B_epsilon_N  
cd05787  LbH_eIF2B_epsilon  
cd11558  W2_eIF2B_epsilon  
Amino Acid Sequences MAPKGSKQRGGGAPKGNKKRGEGTPRRRDPMIDERQQPFQAVCLLPIANTLLIDYTLEFLSNAGIEEVLLYAGAHADMLETYLNGSKWKSDISPFTKVRLIRTAATTFGEVMRDLHEKHLMNGDFLLVNGDVIGNIPLEQALIEHRARRETNRNAIMTMILREVGESNRVRKSADAPLFVIDPTKDRCLHYEELPYHSHDGYDLPSNLEIDPELLDAHSEIDVRNDLYDCRIDICTPEVLGLWADSFDYQSPRTHFLHGVLKDYELNGMTIHTHILKDHYATRVQNLHAYDLVSRDVISRWTFPLCPDTNLFPGYTYTFKRNFVYQEQGVVLARSATIHSRTVVGKDTTIGEGAVITNSVIGRRCKIGNNVVLDGAYIWDDVVVGEATEIRHAIVANGSVIGVKCRIEPGALLSYNVKISSGISIPESKSITTFQRDPDRKVPNDAKLVGKDGEGFEFVYEEDEDEEEIDFIPGLMYNMAELSLSDASISTLTSDKTEDGDFGFRSRSDSVSTTTSDDEGRDQFHHDAVSSVFDGLKEGLSAEVVQLELVGLRMSANASEHQVRRAVVMAFMKYIQHVTEAGTVGLADSVRELFKKYKDTIMRIVFDHDTDDKPDQVDLLLLFQKDLTERNKGGNILLFTAKELYDLEIVDAEAFSQWWEDERSTATPAMESVRTQTKPFIDWLEAESDDDDDDDDDDEEEDDDDDDDDESES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.79
3 0.78
4 0.74
5 0.71
6 0.72
7 0.71
8 0.73
9 0.74
10 0.75
11 0.79
12 0.83
13 0.84
14 0.76
15 0.68
16 0.65
17 0.65
18 0.64
19 0.62
20 0.61
21 0.59
22 0.64
23 0.63
24 0.56
25 0.45
26 0.37
27 0.35
28 0.27
29 0.24
30 0.21
31 0.2
32 0.18
33 0.19
34 0.19
35 0.12
36 0.12
37 0.11
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.05
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.07
69 0.1
70 0.1
71 0.12
72 0.13
73 0.14
74 0.15
75 0.18
76 0.19
77 0.22
78 0.31
79 0.35
80 0.45
81 0.44
82 0.47
83 0.49
84 0.48
85 0.47
86 0.45
87 0.43
88 0.36
89 0.4
90 0.38
91 0.35
92 0.35
93 0.3
94 0.24
95 0.21
96 0.19
97 0.14
98 0.13
99 0.15
100 0.16
101 0.17
102 0.19
103 0.24
104 0.24
105 0.25
106 0.33
107 0.3
108 0.27
109 0.26
110 0.24
111 0.18
112 0.17
113 0.18
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.11
130 0.13
131 0.17
132 0.19
133 0.25
134 0.27
135 0.34
136 0.42
137 0.46
138 0.54
139 0.57
140 0.57
141 0.51
142 0.49
143 0.44
144 0.36
145 0.29
146 0.19
147 0.13
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.11
152 0.16
153 0.17
154 0.21
155 0.25
156 0.25
157 0.26
158 0.26
159 0.29
160 0.32
161 0.35
162 0.33
163 0.3
164 0.31
165 0.31
166 0.29
167 0.26
168 0.17
169 0.15
170 0.16
171 0.2
172 0.21
173 0.21
174 0.24
175 0.28
176 0.31
177 0.31
178 0.36
179 0.34
180 0.36
181 0.36
182 0.36
183 0.33
184 0.29
185 0.26
186 0.18
187 0.17
188 0.14
189 0.18
190 0.16
191 0.14
192 0.15
193 0.16
194 0.15
195 0.14
196 0.12
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.05
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.11
218 0.12
219 0.11
220 0.12
221 0.13
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.08
236 0.1
237 0.13
238 0.15
239 0.2
240 0.21
241 0.23
242 0.23
243 0.25
244 0.31
245 0.29
246 0.3
247 0.26
248 0.26
249 0.23
250 0.22
251 0.2
252 0.12
253 0.12
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.09
263 0.1
264 0.11
265 0.14
266 0.15
267 0.18
268 0.19
269 0.22
270 0.23
271 0.23
272 0.25
273 0.23
274 0.22
275 0.19
276 0.19
277 0.16
278 0.13
279 0.13
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.14
289 0.14
290 0.14
291 0.21
292 0.19
293 0.2
294 0.2
295 0.22
296 0.22
297 0.22
298 0.21
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.15
303 0.15
304 0.18
305 0.2
306 0.22
307 0.22
308 0.24
309 0.26
310 0.26
311 0.31
312 0.25
313 0.25
314 0.23
315 0.23
316 0.2
317 0.17
318 0.13
319 0.07
320 0.07
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.11
328 0.12
329 0.13
330 0.15
331 0.14
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.04
343 0.03
344 0.03
345 0.04
346 0.05
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.12
351 0.13
352 0.15
353 0.19
354 0.24
355 0.26
356 0.28
357 0.27
358 0.25
359 0.24
360 0.21
361 0.17
362 0.11
363 0.07
364 0.04
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.04
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.05
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.1
397 0.14
398 0.14
399 0.15
400 0.15
401 0.15
402 0.16
403 0.15
404 0.12
405 0.07
406 0.07
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.09
411 0.11
412 0.11
413 0.14
414 0.15
415 0.13
416 0.13
417 0.15
418 0.17
419 0.19
420 0.21
421 0.22
422 0.32
423 0.35
424 0.4
425 0.46
426 0.51
427 0.48
428 0.54
429 0.55
430 0.5
431 0.52
432 0.48
433 0.43
434 0.36
435 0.38
436 0.31
437 0.25
438 0.21
439 0.17
440 0.15
441 0.12
442 0.11
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.07
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.03
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.05
478 0.06
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.1
484 0.11
485 0.1
486 0.1
487 0.13
488 0.13
489 0.13
490 0.14
491 0.12
492 0.15
493 0.16
494 0.16
495 0.16
496 0.17
497 0.19
498 0.2
499 0.21
500 0.2
501 0.2
502 0.19
503 0.17
504 0.16
505 0.16
506 0.15
507 0.16
508 0.15
509 0.18
510 0.18
511 0.18
512 0.18
513 0.15
514 0.15
515 0.13
516 0.14
517 0.11
518 0.1
519 0.1
520 0.09
521 0.1
522 0.09
523 0.09
524 0.07
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.05
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.03
539 0.03
540 0.04
541 0.05
542 0.05
543 0.07
544 0.08
545 0.12
546 0.18
547 0.19
548 0.21
549 0.24
550 0.23
551 0.23
552 0.25
553 0.21
554 0.19
555 0.21
556 0.2
557 0.19
558 0.19
559 0.18
560 0.16
561 0.16
562 0.13
563 0.11
564 0.1
565 0.11
566 0.14
567 0.15
568 0.14
569 0.13
570 0.12
571 0.11
572 0.11
573 0.09
574 0.05
575 0.05
576 0.07
577 0.08
578 0.09
579 0.12
580 0.16
581 0.21
582 0.27
583 0.29
584 0.37
585 0.43
586 0.48
587 0.54
588 0.55
589 0.53
590 0.47
591 0.49
592 0.41
593 0.35
594 0.33
595 0.27
596 0.22
597 0.25
598 0.26
599 0.22
600 0.22
601 0.22
602 0.18
603 0.16
604 0.16
605 0.11
606 0.13
607 0.15
608 0.14
609 0.14
610 0.14
611 0.15
612 0.14
613 0.2
614 0.19
615 0.24
616 0.25
617 0.3
618 0.33
619 0.33
620 0.34
621 0.33
622 0.31
623 0.27
624 0.28
625 0.23
626 0.21
627 0.22
628 0.19
629 0.15
630 0.15
631 0.13
632 0.13
633 0.13
634 0.12
635 0.11
636 0.11
637 0.11
638 0.1
639 0.08
640 0.06
641 0.06
642 0.06
643 0.06
644 0.06
645 0.08
646 0.12
647 0.12
648 0.13
649 0.17
650 0.19
651 0.21
652 0.23
653 0.21
654 0.19
655 0.19
656 0.22
657 0.2
658 0.18
659 0.2
660 0.27
661 0.28
662 0.29
663 0.34
664 0.33
665 0.33
666 0.36
667 0.36
668 0.3
669 0.29
670 0.3
671 0.29
672 0.27
673 0.25
674 0.22
675 0.18
676 0.16
677 0.14
678 0.13
679 0.09
680 0.09
681 0.09
682 0.09
683 0.09
684 0.09
685 0.09
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.08
690 0.08
691 0.08
692 0.08
693 0.08