FuNGI

D4ATV5

Protein Details

Accession

D4ATV5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
42-65	SPSATRTPSHHHQQQQHQHQQQSH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 10, nucl 8.5, cyto_nucl 8.5, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019680 Mediator_Med1
Gene Ontology	GO:0016592 C:mediator complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0045944 P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II
KEGG	abe:ARB_07768 -
Pfam	View protein in Pfam PF10744 Med1

Amino Acid Sequences

MATPAKNNTASANPGVTPTQITSSPYPAPSAVPMGRPLSHISPSATRTPSHHHQQQQHQHQQQSHPGQQQQQPPASSHSQAPAHQYTPMLDDAAGFSSPSALLALGLSGITPSPGPGGVAMTGGLSMGIGMGLSMSDAMGMGMGMPLDLPMHSLPGATAKDTEAEKRRNMSEVLAMLRSRVAGRGVCREAVERLGTLEGFECMWQDNNLSIAGNSVDLEIEFGRDGTEADVVKDVTLRYATQDMAEGEKREAASAVLKRVLTFGDDGDGDAEERVAAGEWKPVDVFHANLTRLARMDGLCREVNCFEAVEGVHESLQKVWDSTGKGTDPDLKLNTDTDTDTDTKKTTSGPESRFWERLCRSSSVGCPTMHRGENVGLAIHYWADQRRLLDAQRTSLEEVLQAELSPSLKRSKGSSRRQVYSAVIECEAGYPSLRISKGWVGDPTVLPTQDENNNENNNENDINITNNEKSNNNDNEGNNGAEDTNGKVGKTRTNWLEPDPTLVSTDPLLPSSPPNVRFVARLEPAIHVPIVVAAEVYRLVGIAMQQETRAPAAYDALVVPVERRPSRTVKGEGGDEQEEEEHVRTVPIFGQTEGGEDEVTRKKHVYSFHALEHVPGYTVRELPFSHPRQIEEVIPLLRQYALLGKLLSVFQMGTSNNSKGKNEDDEDQESDDEGYTQEGHRMDNVDAAETRLNSLLSSTDQSDETKRISISLRTPVSSPPTLLVVFPLAASSSSSSSSSPSPSSPPSSRTASVTVEVLADGRLQVPCTRGIVEVEPSPSGPANTPTRAAEEKKLCGLLGRVLETCEDLGLLVESACKYAVRRHRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.27
3	0.24
4	0.22
5	0.19
6	0.2
7	0.19
8	0.23
9	0.23
10	0.28
11	0.31
12	0.29
13	0.3
14	0.27
15	0.27
16	0.25
17	0.29
18	0.26
19	0.25
20	0.28
21	0.3
22	0.3
23	0.31
24	0.33
25	0.3
26	0.31
27	0.31
28	0.3
29	0.32
30	0.35
31	0.4
32	0.38
33	0.35
34	0.36
35	0.42
36	0.47
37	0.51
38	0.56
39	0.57
40	0.64
41	0.74
42	0.81
43	0.83
44	0.85
45	0.82
46	0.81
47	0.78
48	0.75
49	0.75
50	0.73
51	0.7
52	0.66
53	0.64
54	0.66
55	0.67
56	0.68
57	0.66
58	0.63
59	0.57
60	0.52
61	0.53
62	0.49
63	0.44
64	0.39
65	0.37
66	0.35
67	0.36
68	0.41
69	0.39
70	0.36
71	0.35
72	0.33
73	0.28
74	0.27
75	0.26
76	0.19
77	0.14
78	0.14
79	0.13
80	0.14
81	0.13
82	0.1
83	0.09
84	0.09
85	0.09
86	0.08
87	0.07
88	0.05
89	0.05
90	0.05
91	0.06
92	0.05
93	0.05
94	0.04
95	0.04
96	0.04
97	0.04
98	0.04
99	0.05
100	0.06
101	0.06
102	0.06
103	0.06
104	0.08
105	0.08
106	0.08
107	0.08
108	0.07
109	0.07
110	0.06
111	0.05
112	0.04
113	0.03
114	0.03
115	0.02
116	0.02
117	0.02
118	0.02
119	0.02
120	0.02
121	0.02
122	0.02
123	0.02
124	0.03
125	0.03
126	0.03
127	0.03
128	0.03
129	0.03
130	0.03
131	0.03
132	0.03
133	0.03
134	0.04
135	0.04
136	0.06
137	0.06
138	0.07
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.13
143	0.14
144	0.13
145	0.14
146	0.13
147	0.16
148	0.18
149	0.25
150	0.28
151	0.33
152	0.35
153	0.39
154	0.4
155	0.4
156	0.4
157	0.34
158	0.3
159	0.28
160	0.27
161	0.25
162	0.23
163	0.21
164	0.2
165	0.19
166	0.15
167	0.13
168	0.13
169	0.13
170	0.17
171	0.24
172	0.26
173	0.27
174	0.27
175	0.27
176	0.26
177	0.26
178	0.24
179	0.16
180	0.15
181	0.15
182	0.14
183	0.12
184	0.11
185	0.09
186	0.08
187	0.08
188	0.07
189	0.07
190	0.08
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.09
195	0.1
196	0.09
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.07
201	0.07
202	0.06
203	0.06
204	0.05
205	0.07
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.06
214	0.09
215	0.08
216	0.09
217	0.11
218	0.1
219	0.1
220	0.11
221	0.11
222	0.09
223	0.1
224	0.09
225	0.1
226	0.12
227	0.12
228	0.11
229	0.13
230	0.13
231	0.16
232	0.18
233	0.17
234	0.15
235	0.17
236	0.17
237	0.15
238	0.15
239	0.11
240	0.15
241	0.16
242	0.18
243	0.19
244	0.19
245	0.19
246	0.2
247	0.19
248	0.14
249	0.13
250	0.1
251	0.09
252	0.09
253	0.09
254	0.08
255	0.08
256	0.07
257	0.06
258	0.06
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.05
264	0.05
265	0.08
266	0.08
267	0.09
268	0.09
269	0.09
270	0.12
271	0.12
272	0.12
273	0.13
274	0.18
275	0.18
276	0.21
277	0.21
278	0.19
279	0.19
280	0.18
281	0.16
282	0.12
283	0.15
284	0.14
285	0.17
286	0.18
287	0.17
288	0.19
289	0.18
290	0.18
291	0.16
292	0.14
293	0.1
294	0.1
295	0.09
296	0.09
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.1
302	0.09
303	0.11
304	0.09
305	0.08
306	0.09
307	0.11
308	0.13
309	0.14
310	0.16
311	0.15
312	0.16
313	0.16
314	0.23
315	0.2
316	0.22
317	0.22
318	0.2
319	0.2
320	0.21
321	0.2
322	0.15
323	0.14
324	0.11
325	0.13
326	0.13
327	0.14
328	0.14
329	0.14
330	0.13
331	0.13
332	0.14
333	0.14
334	0.19
335	0.26
336	0.28
337	0.33
338	0.38
339	0.4
340	0.43
341	0.4
342	0.41
343	0.36
344	0.38
345	0.35
346	0.32
347	0.31
348	0.3
349	0.33
350	0.3
351	0.32
352	0.26
353	0.25
354	0.27
355	0.3
356	0.28
357	0.25
358	0.21
359	0.19
360	0.19
361	0.18
362	0.14
363	0.09
364	0.08
365	0.08
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.07
370	0.09
371	0.1
372	0.1
373	0.12
374	0.14
375	0.14
376	0.19
377	0.18
378	0.19
379	0.19
380	0.2
381	0.19
382	0.18
383	0.17
384	0.12
385	0.12
386	0.1
387	0.08
388	0.07
389	0.06
390	0.06
391	0.07
392	0.06
393	0.07
394	0.09
395	0.1
396	0.11
397	0.14
398	0.24
399	0.34
400	0.43
401	0.52
402	0.56
403	0.57
404	0.58
405	0.57
406	0.48
407	0.43
408	0.35
409	0.27
410	0.21
411	0.18
412	0.17
413	0.15
414	0.13
415	0.08
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.1
423	0.13
424	0.14
425	0.16
426	0.16
427	0.15
428	0.16
429	0.17
430	0.17
431	0.15
432	0.14
433	0.13
434	0.12
435	0.14
436	0.16
437	0.19
438	0.18
439	0.21
440	0.23
441	0.23
442	0.23
443	0.21
444	0.19
445	0.16
446	0.14
447	0.11
448	0.1
449	0.1
450	0.1
451	0.12
452	0.11
453	0.12
454	0.14
455	0.14
456	0.16
457	0.24
458	0.25
459	0.26
460	0.29
461	0.28
462	0.29
463	0.3
464	0.27
465	0.18
466	0.17
467	0.13
468	0.09
469	0.1
470	0.07
471	0.1
472	0.1
473	0.1
474	0.12
475	0.14
476	0.19
477	0.21
478	0.26
479	0.26
480	0.31
481	0.32
482	0.32
483	0.37
484	0.31
485	0.33
486	0.28
487	0.24
488	0.21
489	0.19
490	0.17
491	0.12
492	0.14
493	0.1
494	0.09
495	0.1
496	0.09
497	0.1
498	0.14
499	0.18
500	0.18
501	0.2
502	0.21
503	0.22
504	0.22
505	0.24
506	0.26
507	0.22
508	0.23
509	0.21
510	0.21
511	0.21
512	0.21
513	0.18
514	0.11
515	0.1
516	0.09
517	0.08
518	0.06
519	0.05
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.05
524	0.03
525	0.03
526	0.03
527	0.04
528	0.04
529	0.06
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.09
534	0.1
535	0.1
536	0.1
537	0.08
538	0.07
539	0.08
540	0.08
541	0.08
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.06
546	0.07
547	0.08
548	0.14
549	0.14
550	0.17
551	0.21
552	0.27
553	0.32
554	0.37
555	0.39
556	0.39
557	0.4
558	0.4
559	0.38
560	0.36
561	0.32
562	0.26
563	0.22
564	0.17
565	0.15
566	0.14
567	0.12
568	0.09
569	0.08
570	0.08
571	0.07
572	0.08
573	0.1
574	0.12
575	0.12
576	0.12
577	0.14
578	0.14
579	0.15
580	0.14
581	0.13
582	0.09
583	0.08
584	0.13
585	0.16
586	0.18
587	0.18
588	0.18
589	0.2
590	0.24
591	0.29
592	0.31
593	0.34
594	0.37
595	0.38
596	0.41
597	0.39
598	0.36
599	0.32
600	0.25
601	0.17
602	0.14
603	0.14
604	0.12
605	0.14
606	0.14
607	0.15
608	0.16
609	0.21
610	0.3
611	0.31
612	0.37
613	0.36
614	0.37
615	0.39
616	0.4
617	0.36
618	0.29
619	0.29
620	0.23
621	0.22
622	0.2
623	0.17
624	0.15
625	0.13
626	0.11
627	0.12
628	0.12
629	0.13
630	0.13
631	0.13
632	0.14
633	0.14
634	0.13
635	0.09
636	0.08
637	0.07
638	0.11
639	0.11
640	0.14
641	0.17
642	0.21
643	0.25
644	0.27
645	0.28
646	0.26
647	0.3
648	0.33
649	0.32
650	0.33
651	0.35
652	0.37
653	0.38
654	0.37
655	0.33
656	0.27
657	0.24
658	0.19
659	0.14
660	0.1
661	0.09
662	0.08
663	0.08
664	0.12
665	0.12
666	0.13
667	0.14
668	0.17
669	0.16
670	0.18
671	0.18
672	0.17
673	0.16
674	0.18
675	0.18
676	0.16
677	0.17
678	0.15
679	0.14
680	0.12
681	0.12
682	0.11
683	0.11
684	0.14
685	0.14
686	0.14
687	0.15
688	0.18
689	0.2
690	0.22
691	0.21
692	0.22
693	0.21
694	0.22
695	0.24
696	0.27
697	0.29
698	0.35
699	0.36
700	0.34
701	0.36
702	0.37
703	0.41
704	0.37
705	0.33
706	0.25
707	0.25
708	0.24
709	0.23
710	0.2
711	0.15
712	0.13
713	0.12
714	0.11
715	0.08
716	0.08
717	0.1
718	0.1
719	0.1
720	0.11
721	0.13
722	0.13
723	0.15
724	0.16
725	0.19
726	0.19
727	0.2
728	0.23
729	0.27
730	0.34
731	0.35
732	0.37
733	0.39
734	0.43
735	0.42
736	0.41
737	0.41
738	0.36
739	0.34
740	0.31
741	0.26
742	0.21
743	0.19
744	0.15
745	0.12
746	0.09
747	0.08
748	0.09
749	0.1
750	0.11
751	0.13
752	0.15
753	0.16
754	0.18
755	0.19
756	0.18
757	0.21
758	0.22
759	0.23
760	0.25
761	0.25
762	0.24
763	0.23
764	0.23
765	0.21
766	0.2
767	0.18
768	0.22
769	0.25
770	0.27
771	0.3
772	0.29
773	0.34
774	0.39
775	0.41
776	0.44
777	0.44
778	0.45
779	0.47
780	0.47
781	0.41
782	0.37
783	0.36
784	0.32
785	0.3
786	0.29
787	0.25
788	0.25
789	0.26
790	0.24
791	0.22
792	0.16
793	0.12
794	0.09
795	0.09
796	0.08
797	0.08
798	0.06
799	0.09
800	0.09
801	0.1
802	0.1
803	0.11
804	0.12
805	0.21

D4ATV5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer