Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5AED9

Protein Details
Accession Q5AED9    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-33MSNRGRQPSGPPPSRKRETKWSGKPKRYANFGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-27SGPPPSRKRETKWSGKPKR
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045071  BBP-like  
IPR004087  KH_dom  
IPR004088  KH_dom_type_1  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0048024  P:regulation of mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG cal:CAALFM_C303300CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00013  KH_1  
PF16275  SF1-HH  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50084  KH_TYPE_1  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd02395  KH-I_BBP  
Amino Acid Sequences MSNRGRQPSGPPPSRKRETKWSGKPKRYANFGAQSFDTVITGHLTQEQLDAYQRYFRIEEISNFLSVAKQQHKSIVDVLPSAKVDETDHYKRDPSPPPKYDKNGNRTNTRERRVTEALEKERHELVELAASSIKNYMIPSNYRRPSRTVERLYVPVKDYPDINFVGFLIGPRGNTLKKLQEDSGARLQIRGKGSVKEGKSSDGFGSSQTGTDIQDDLHVLITADSPLKISKAVKLVNEIIDKLIFSPQGMNFMKRDQLKELAVLNGTLRETKPFDPEAHEKKQQQQMDITKIVCKICGNIGHIARDCKQNNGKRPLDDNAENEPTTINKKARTDVPPPPPPPPPPAPPSSSTEISKQVPPPPPPPPPPAPSAAASGFATTENYKQGLVPPPPPPPPPPPPPVRSALVNFENNSKVLLTKEKEESGSSELKNTGESSSSSSGVPPSPPPPSSNVPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.83
3 0.8
4 0.8
5 0.81
6 0.82
7 0.84
8 0.85
9 0.87
10 0.89
11 0.9
12 0.88
13 0.86
14 0.83
15 0.78
16 0.76
17 0.75
18 0.67
19 0.63
20 0.54
21 0.48
22 0.41
23 0.35
24 0.26
25 0.17
26 0.15
27 0.13
28 0.13
29 0.11
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.14
34 0.14
35 0.12
36 0.16
37 0.17
38 0.16
39 0.21
40 0.21
41 0.23
42 0.23
43 0.23
44 0.24
45 0.26
46 0.27
47 0.28
48 0.3
49 0.26
50 0.26
51 0.25
52 0.21
53 0.2
54 0.25
55 0.25
56 0.27
57 0.28
58 0.35
59 0.36
60 0.38
61 0.4
62 0.37
63 0.31
64 0.3
65 0.3
66 0.26
67 0.25
68 0.23
69 0.18
70 0.15
71 0.15
72 0.17
73 0.24
74 0.27
75 0.29
76 0.3
77 0.33
78 0.35
79 0.42
80 0.47
81 0.49
82 0.53
83 0.58
84 0.64
85 0.7
86 0.72
87 0.74
88 0.74
89 0.73
90 0.72
91 0.71
92 0.72
93 0.7
94 0.75
95 0.75
96 0.71
97 0.68
98 0.61
99 0.63
100 0.58
101 0.56
102 0.52
103 0.52
104 0.53
105 0.53
106 0.52
107 0.47
108 0.45
109 0.41
110 0.34
111 0.25
112 0.19
113 0.18
114 0.17
115 0.15
116 0.15
117 0.15
118 0.14
119 0.14
120 0.13
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.13
125 0.18
126 0.24
127 0.33
128 0.39
129 0.43
130 0.44
131 0.45
132 0.5
133 0.54
134 0.58
135 0.53
136 0.52
137 0.51
138 0.55
139 0.53
140 0.49
141 0.41
142 0.35
143 0.31
144 0.27
145 0.24
146 0.2
147 0.21
148 0.19
149 0.17
150 0.14
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.12
160 0.11
161 0.14
162 0.17
163 0.2
164 0.22
165 0.26
166 0.25
167 0.29
168 0.31
169 0.33
170 0.36
171 0.33
172 0.3
173 0.29
174 0.29
175 0.28
176 0.28
177 0.27
178 0.23
179 0.22
180 0.26
181 0.31
182 0.3
183 0.3
184 0.29
185 0.27
186 0.26
187 0.26
188 0.22
189 0.17
190 0.17
191 0.12
192 0.14
193 0.12
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.1
218 0.15
219 0.17
220 0.17
221 0.2
222 0.22
223 0.24
224 0.24
225 0.21
226 0.16
227 0.14
228 0.14
229 0.11
230 0.11
231 0.07
232 0.07
233 0.09
234 0.09
235 0.17
236 0.18
237 0.19
238 0.18
239 0.19
240 0.24
241 0.23
242 0.25
243 0.2
244 0.22
245 0.21
246 0.23
247 0.23
248 0.19
249 0.17
250 0.15
251 0.13
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.1
257 0.13
258 0.14
259 0.18
260 0.19
261 0.2
262 0.24
263 0.32
264 0.37
265 0.4
266 0.45
267 0.44
268 0.5
269 0.56
270 0.53
271 0.46
272 0.46
273 0.45
274 0.45
275 0.45
276 0.38
277 0.34
278 0.34
279 0.32
280 0.26
281 0.21
282 0.17
283 0.17
284 0.21
285 0.2
286 0.23
287 0.25
288 0.27
289 0.29
290 0.31
291 0.29
292 0.34
293 0.32
294 0.35
295 0.42
296 0.45
297 0.53
298 0.6
299 0.61
300 0.56
301 0.59
302 0.56
303 0.54
304 0.5
305 0.44
306 0.4
307 0.4
308 0.37
309 0.33
310 0.29
311 0.24
312 0.24
313 0.26
314 0.23
315 0.24
316 0.26
317 0.3
318 0.37
319 0.42
320 0.45
321 0.49
322 0.56
323 0.6
324 0.6
325 0.61
326 0.59
327 0.56
328 0.56
329 0.53
330 0.49
331 0.46
332 0.47
333 0.47
334 0.45
335 0.47
336 0.45
337 0.43
338 0.39
339 0.37
340 0.37
341 0.36
342 0.38
343 0.37
344 0.38
345 0.42
346 0.45
347 0.48
348 0.5
349 0.56
350 0.56
351 0.59
352 0.58
353 0.54
354 0.53
355 0.51
356 0.47
357 0.41
358 0.39
359 0.33
360 0.28
361 0.25
362 0.22
363 0.18
364 0.15
365 0.15
366 0.13
367 0.14
368 0.14
369 0.15
370 0.14
371 0.15
372 0.2
373 0.26
374 0.29
375 0.33
376 0.35
377 0.41
378 0.46
379 0.49
380 0.49
381 0.49
382 0.53
383 0.55
384 0.58
385 0.6
386 0.59
387 0.6
388 0.6
389 0.55
390 0.52
391 0.48
392 0.48
393 0.46
394 0.46
395 0.42
396 0.42
397 0.4
398 0.35
399 0.32
400 0.25
401 0.2
402 0.19
403 0.26
404 0.24
405 0.28
406 0.33
407 0.35
408 0.36
409 0.37
410 0.37
411 0.34
412 0.38
413 0.33
414 0.32
415 0.31
416 0.29
417 0.3
418 0.27
419 0.23
420 0.18
421 0.19
422 0.21
423 0.22
424 0.23
425 0.22
426 0.22
427 0.23
428 0.23
429 0.25
430 0.23
431 0.25
432 0.3
433 0.32
434 0.33
435 0.37