Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4B0H4

Protein Details
Accession D4B0H4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-27MDEEKEGQQEKRKKQRRTLFVKVPVSLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-66KKIER
Subcellular Location(s) nucl 8.5, cyto_nucl 7.5, mito 6, cyto 5.5, pero 3, plas 2, cysk 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004839  Aminotransferase_I/II  
IPR015424  PyrdxlP-dep_Trfase  
IPR015421  PyrdxlP-dep_Trfase_major  
IPR015422  PyrdxlP-dep_Trfase_small  
Gene Ontology GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0030170  F:pyridoxal phosphate binding  
GO:0009058  P:biosynthetic process  
KEGG abe:ARB_01949  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00155  Aminotran_1_2  
Amino Acid Sequences MDEEKEGQQEKRKKQRRTLFVKVPVSLEGLQFWFRDAPRSGLAVVGERDREREREREEANAKKIERSREHKTMLRPPGSNLQRSLREALERRESKGTLRSLKVVPTGAVDFSSNDFLSLSTNPTFRSRFLSNLARASSSLPLASTGSRLLDGNSLYAEQLEQQIASFHNAPCGLIFNSGFDANSGVFSCIPQPGDVVIYDELIHASVHDGMRLSRARKLAPFIHNSIEDFERVLEALLIDDPLLLAGQRNVFVALESIYSMDGDFAPIREVLDMLERKLPHGNGHVIVDEAHATGVFGTHGAGVVQQLGVEDRVLIRLHTFGKALASNGAIILCSPLVREYLINYARPLIFTSALGMPSLAAVRTAYELMEEGQTRKLQLHLQDLIQLFHEKLMQLSPSDTSIFEAKHSPTSPIFSLQTKYPRELSKACQDAGLMVRAIMPPTVQVGTERVRVCLHSGNDVEQVLLLSRVIEKWLKEKSHHATENRLEAAKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.88
3 0.89
4 0.89
5 0.89
6 0.88
7 0.88
8 0.85
9 0.76
10 0.68
11 0.58
12 0.53
13 0.44
14 0.34
15 0.26
16 0.22
17 0.22
18 0.2
19 0.2
20 0.21
21 0.2
22 0.25
23 0.25
24 0.27
25 0.27
26 0.29
27 0.27
28 0.25
29 0.25
30 0.23
31 0.23
32 0.22
33 0.23
34 0.22
35 0.27
36 0.28
37 0.33
38 0.34
39 0.39
40 0.41
41 0.45
42 0.46
43 0.51
44 0.56
45 0.58
46 0.6
47 0.6
48 0.56
49 0.55
50 0.58
51 0.58
52 0.6
53 0.59
54 0.61
55 0.63
56 0.68
57 0.67
58 0.7
59 0.7
60 0.71
61 0.7
62 0.62
63 0.57
64 0.61
65 0.61
66 0.57
67 0.52
68 0.49
69 0.48
70 0.5
71 0.49
72 0.42
73 0.43
74 0.44
75 0.46
76 0.49
77 0.46
78 0.46
79 0.48
80 0.46
81 0.42
82 0.45
83 0.46
84 0.44
85 0.44
86 0.45
87 0.42
88 0.44
89 0.43
90 0.37
91 0.29
92 0.25
93 0.23
94 0.19
95 0.18
96 0.15
97 0.13
98 0.13
99 0.16
100 0.13
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.12
105 0.12
106 0.14
107 0.14
108 0.15
109 0.16
110 0.21
111 0.22
112 0.21
113 0.26
114 0.25
115 0.26
116 0.31
117 0.38
118 0.37
119 0.4
120 0.4
121 0.34
122 0.33
123 0.31
124 0.27
125 0.19
126 0.16
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.06
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.08
151 0.08
152 0.11
153 0.13
154 0.11
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.15
160 0.13
161 0.12
162 0.12
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.07
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.04
192 0.05
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.07
198 0.12
199 0.16
200 0.16
201 0.18
202 0.2
203 0.21
204 0.23
205 0.27
206 0.3
207 0.32
208 0.35
209 0.33
210 0.33
211 0.32
212 0.31
213 0.29
214 0.22
215 0.17
216 0.13
217 0.11
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.02
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.11
260 0.11
261 0.12
262 0.15
263 0.15
264 0.16
265 0.19
266 0.2
267 0.16
268 0.19
269 0.2
270 0.17
271 0.18
272 0.17
273 0.14
274 0.14
275 0.12
276 0.09
277 0.07
278 0.06
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.05
297 0.04
298 0.05
299 0.04
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.09
305 0.11
306 0.12
307 0.12
308 0.1
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.11
313 0.11
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.04
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.08
328 0.16
329 0.18
330 0.19
331 0.19
332 0.21
333 0.21
334 0.21
335 0.21
336 0.15
337 0.14
338 0.13
339 0.15
340 0.14
341 0.14
342 0.13
343 0.11
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.06
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.07
356 0.08
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.15
361 0.15
362 0.16
363 0.16
364 0.18
365 0.19
366 0.22
367 0.28
368 0.27
369 0.26
370 0.31
371 0.31
372 0.29
373 0.27
374 0.24
375 0.17
376 0.16
377 0.17
378 0.11
379 0.11
380 0.13
381 0.12
382 0.12
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.14
387 0.13
388 0.14
389 0.15
390 0.15
391 0.15
392 0.18
393 0.19
394 0.24
395 0.25
396 0.26
397 0.25
398 0.29
399 0.29
400 0.29
401 0.3
402 0.27
403 0.29
404 0.31
405 0.38
406 0.37
407 0.39
408 0.41
409 0.42
410 0.45
411 0.48
412 0.48
413 0.5
414 0.51
415 0.48
416 0.43
417 0.38
418 0.36
419 0.34
420 0.3
421 0.2
422 0.15
423 0.16
424 0.16
425 0.17
426 0.13
427 0.11
428 0.09
429 0.12
430 0.12
431 0.1
432 0.11
433 0.15
434 0.19
435 0.26
436 0.26
437 0.25
438 0.26
439 0.27
440 0.29
441 0.32
442 0.3
443 0.3
444 0.31
445 0.32
446 0.34
447 0.32
448 0.29
449 0.22
450 0.2
451 0.14
452 0.13
453 0.1
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.13
458 0.16
459 0.17
460 0.24
461 0.33
462 0.36
463 0.39
464 0.48
465 0.52
466 0.6
467 0.66
468 0.63
469 0.64
470 0.66
471 0.7
472 0.64