Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4B0M1

Protein Details
Accession D4B0M1    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-113PKNLRRRTASHNVKRVPRRLRARAKREMIEDBasic
170-204EVATRIPKIKKNKLSHPHKPASKFRKRQICKTWLPHydrophilic
611-636IRERKREKEVWERKPKSKRVEYNSVNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-108NLRRRTASHNVKRVPRRLRARAKR
122-124RRK
143-151NARSKAKRQ
175-196IPKIKKNKLSHPHKPASKFRKR
341-347KSKTPRR
613-629ERKREKEVWERKPKSKR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 8.5, cyto_nucl 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
KEGG abe:ARB_01997  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MASNGPNKRKGVWESSSSLHRKRVKIQDARTLAVQSSDTALSKTGELDVAAFVAARQFEIRALEAGIRKSKNAATTRAFQQVPKNLRRRTASHNVKRVPRRLRARAKREMIEDNTPTVTARRRKPTQLMRLRLESARRLQGLNARSKAKRQVAAKAKLAQSPYYAGHDSEVATRIPKIKKNKLSHPHKPASKFRKRQICKTWLPTHMFHAKRAHLTEPKNPLWRFAIPLTPTEKCYRTTHRASGARGAIAWDMSYMSTIGLEGTYTSLESLLRALGVNGQNAWGGNEYKWRNGTRSLRVWVYERDGQKRPIAPVQLIWCPPKQDEDIEMTDADSAPKKLQKSKTPRRRMFLRAHPSAFLQLWEELLKVAKIQKPQVMVEDLRFEIGSIEVAGPGSTEALLGALKPALPHGVDVWPEGSPESTWLSLAGLTNSASLPRNALLSFNISDPRLRFPPKTIKIPNSAESHTKLMETLASWKPDSTQKLSPDLFSQPARRKACWQLPSQKAINRRKSEVSPGENVPPKSTDPNIPIILLASNNSSKNSNSQGSWTVLLPWKCVTPVWYYLLYYPLSSGGNPRFGGIQEQQQLAFESKKPWFPGDFPGTRAGWEWEIRERKREKEVWERKPKSKRVEYNSVNLGNGKSGEIGQGWACDWERLLSGPASMAVNHGVGPGERHNQPGRSETAEADLIMPPDLIQLDPLIASAIISKLKKSNQLPASMESLCQKPALATVSITLLGRGTPMRRSRIYRLPTSDLELRSKWFSLLNQLEGPLKKTGNDSEERAHLPIPREEDLLGYVTSGNFNLAAGKGTGIGAILVNRICPHRTLDDSSVPSTDKDRHQEGKLMNVCIIRAAGESVGRLGRWEVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.52
3 0.59
4 0.58
5 0.57
6 0.57
7 0.59
8 0.59
9 0.65
10 0.71
11 0.72
12 0.74
13 0.77
14 0.78
15 0.75
16 0.72
17 0.65
18 0.56
19 0.46
20 0.38
21 0.31
22 0.22
23 0.2
24 0.19
25 0.17
26 0.15
27 0.16
28 0.15
29 0.15
30 0.15
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.12
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.08
39 0.06
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.11
46 0.13
47 0.15
48 0.13
49 0.14
50 0.18
51 0.21
52 0.26
53 0.32
54 0.31
55 0.3
56 0.33
57 0.35
58 0.39
59 0.4
60 0.43
61 0.41
62 0.46
63 0.5
64 0.55
65 0.52
66 0.47
67 0.51
68 0.53
69 0.57
70 0.6
71 0.65
72 0.62
73 0.68
74 0.71
75 0.67
76 0.67
77 0.69
78 0.7
79 0.71
80 0.76
81 0.76
82 0.8
83 0.84
84 0.84
85 0.82
86 0.81
87 0.81
88 0.82
89 0.85
90 0.87
91 0.87
92 0.88
93 0.87
94 0.82
95 0.77
96 0.75
97 0.69
98 0.66
99 0.59
100 0.51
101 0.43
102 0.38
103 0.33
104 0.28
105 0.31
106 0.32
107 0.38
108 0.45
109 0.51
110 0.59
111 0.68
112 0.75
113 0.78
114 0.8
115 0.8
116 0.76
117 0.75
118 0.71
119 0.65
120 0.6
121 0.55
122 0.51
123 0.5
124 0.45
125 0.41
126 0.4
127 0.42
128 0.44
129 0.46
130 0.45
131 0.45
132 0.46
133 0.51
134 0.57
135 0.58
136 0.57
137 0.52
138 0.57
139 0.6
140 0.65
141 0.66
142 0.64
143 0.6
144 0.57
145 0.56
146 0.47
147 0.39
148 0.35
149 0.3
150 0.28
151 0.26
152 0.22
153 0.2
154 0.2
155 0.19
156 0.18
157 0.18
158 0.14
159 0.14
160 0.15
161 0.22
162 0.27
163 0.33
164 0.4
165 0.49
166 0.58
167 0.65
168 0.74
169 0.78
170 0.82
171 0.85
172 0.86
173 0.85
174 0.82
175 0.82
176 0.82
177 0.82
178 0.83
179 0.82
180 0.8
181 0.82
182 0.81
183 0.83
184 0.83
185 0.82
186 0.79
187 0.8
188 0.79
189 0.75
190 0.74
191 0.66
192 0.62
193 0.62
194 0.54
195 0.5
196 0.49
197 0.45
198 0.45
199 0.46
200 0.46
201 0.44
202 0.47
203 0.49
204 0.51
205 0.53
206 0.57
207 0.54
208 0.51
209 0.48
210 0.45
211 0.41
212 0.35
213 0.35
214 0.27
215 0.31
216 0.33
217 0.3
218 0.32
219 0.32
220 0.32
221 0.29
222 0.34
223 0.38
224 0.42
225 0.47
226 0.49
227 0.54
228 0.57
229 0.56
230 0.57
231 0.51
232 0.43
233 0.36
234 0.32
235 0.23
236 0.18
237 0.15
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.07
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.1
263 0.12
264 0.12
265 0.12
266 0.12
267 0.12
268 0.13
269 0.13
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.17
274 0.18
275 0.21
276 0.26
277 0.26
278 0.27
279 0.34
280 0.4
281 0.4
282 0.45
283 0.45
284 0.42
285 0.42
286 0.43
287 0.38
288 0.36
289 0.34
290 0.33
291 0.35
292 0.38
293 0.39
294 0.4
295 0.4
296 0.38
297 0.37
298 0.35
299 0.29
300 0.28
301 0.29
302 0.29
303 0.29
304 0.28
305 0.25
306 0.25
307 0.24
308 0.25
309 0.22
310 0.19
311 0.19
312 0.21
313 0.21
314 0.21
315 0.2
316 0.17
317 0.16
318 0.14
319 0.13
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.13
324 0.16
325 0.23
326 0.3
327 0.38
328 0.48
329 0.59
330 0.67
331 0.76
332 0.79
333 0.79
334 0.79
335 0.77
336 0.75
337 0.74
338 0.72
339 0.66
340 0.61
341 0.55
342 0.49
343 0.43
344 0.35
345 0.25
346 0.17
347 0.11
348 0.11
349 0.1
350 0.1
351 0.07
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.11
356 0.14
357 0.17
358 0.2
359 0.22
360 0.24
361 0.25
362 0.26
363 0.24
364 0.22
365 0.2
366 0.2
367 0.17
368 0.15
369 0.14
370 0.12
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.04
391 0.04
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.08
398 0.08
399 0.09
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.06
406 0.07
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.06
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.12
432 0.11
433 0.13
434 0.13
435 0.16
436 0.18
437 0.2
438 0.2
439 0.24
440 0.34
441 0.37
442 0.45
443 0.47
444 0.47
445 0.51
446 0.54
447 0.53
448 0.46
449 0.43
450 0.37
451 0.34
452 0.32
453 0.25
454 0.21
455 0.16
456 0.13
457 0.12
458 0.09
459 0.13
460 0.14
461 0.15
462 0.15
463 0.15
464 0.17
465 0.22
466 0.25
467 0.24
468 0.26
469 0.27
470 0.33
471 0.34
472 0.32
473 0.3
474 0.28
475 0.27
476 0.24
477 0.29
478 0.29
479 0.38
480 0.41
481 0.39
482 0.42
483 0.48
484 0.53
485 0.52
486 0.52
487 0.53
488 0.54
489 0.58
490 0.57
491 0.52
492 0.54
493 0.58
494 0.6
495 0.54
496 0.53
497 0.52
498 0.5
499 0.56
500 0.53
501 0.47
502 0.41
503 0.39
504 0.42
505 0.43
506 0.41
507 0.34
508 0.29
509 0.26
510 0.25
511 0.25
512 0.23
513 0.21
514 0.26
515 0.25
516 0.23
517 0.21
518 0.19
519 0.17
520 0.13
521 0.11
522 0.08
523 0.1
524 0.11
525 0.12
526 0.13
527 0.13
528 0.16
529 0.2
530 0.2
531 0.18
532 0.2
533 0.22
534 0.23
535 0.23
536 0.2
537 0.19
538 0.21
539 0.21
540 0.2
541 0.17
542 0.16
543 0.16
544 0.16
545 0.15
546 0.14
547 0.17
548 0.19
549 0.19
550 0.19
551 0.19
552 0.22
553 0.2
554 0.16
555 0.13
556 0.11
557 0.11
558 0.1
559 0.15
560 0.15
561 0.18
562 0.18
563 0.18
564 0.18
565 0.18
566 0.22
567 0.19
568 0.23
569 0.22
570 0.23
571 0.23
572 0.22
573 0.24
574 0.21
575 0.21
576 0.16
577 0.17
578 0.19
579 0.23
580 0.24
581 0.25
582 0.26
583 0.26
584 0.32
585 0.36
586 0.35
587 0.33
588 0.35
589 0.33
590 0.31
591 0.3
592 0.24
593 0.19
594 0.19
595 0.19
596 0.23
597 0.32
598 0.33
599 0.41
600 0.43
601 0.44
602 0.51
603 0.55
604 0.53
605 0.56
606 0.65
607 0.67
608 0.75
609 0.77
610 0.78
611 0.83
612 0.84
613 0.82
614 0.82
615 0.8
616 0.77
617 0.81
618 0.76
619 0.72
620 0.71
621 0.63
622 0.53
623 0.45
624 0.37
625 0.27
626 0.24
627 0.17
628 0.11
629 0.1
630 0.1
631 0.09
632 0.1
633 0.09
634 0.09
635 0.09
636 0.11
637 0.11
638 0.1
639 0.1
640 0.1
641 0.1
642 0.1
643 0.12
644 0.1
645 0.09
646 0.09
647 0.1
648 0.1
649 0.09
650 0.09
651 0.09
652 0.09
653 0.08
654 0.09
655 0.08
656 0.07
657 0.1
658 0.13
659 0.17
660 0.18
661 0.23
662 0.27
663 0.3
664 0.32
665 0.34
666 0.33
667 0.32
668 0.33
669 0.28
670 0.27
671 0.24
672 0.22
673 0.2
674 0.18
675 0.14
676 0.13
677 0.12
678 0.08
679 0.09
680 0.09
681 0.07
682 0.06
683 0.06
684 0.06
685 0.06
686 0.06
687 0.06
688 0.05
689 0.05
690 0.06
691 0.07
692 0.12
693 0.12
694 0.14
695 0.19
696 0.23
697 0.32
698 0.34
699 0.42
700 0.42
701 0.49
702 0.5
703 0.48
704 0.49
705 0.41
706 0.39
707 0.33
708 0.3
709 0.23
710 0.2
711 0.17
712 0.13
713 0.15
714 0.17
715 0.14
716 0.13
717 0.13
718 0.14
719 0.16
720 0.15
721 0.12
722 0.1
723 0.09
724 0.1
725 0.12
726 0.13
727 0.19
728 0.26
729 0.32
730 0.38
731 0.44
732 0.51
733 0.57
734 0.62
735 0.62
736 0.63
737 0.63
738 0.59
739 0.58
740 0.57
741 0.51
742 0.49
743 0.42
744 0.39
745 0.36
746 0.35
747 0.3
748 0.26
749 0.24
750 0.29
751 0.32
752 0.32
753 0.3
754 0.31
755 0.36
756 0.34
757 0.36
758 0.3
759 0.27
760 0.24
761 0.27
762 0.31
763 0.31
764 0.34
765 0.35
766 0.35
767 0.4
768 0.4
769 0.38
770 0.35
771 0.33
772 0.33
773 0.33
774 0.35
775 0.32
776 0.31
777 0.29
778 0.28
779 0.25
780 0.23
781 0.18
782 0.13
783 0.12
784 0.11
785 0.12
786 0.11
787 0.1
788 0.08
789 0.08
790 0.09
791 0.09
792 0.1
793 0.09
794 0.1
795 0.1
796 0.1
797 0.09
798 0.08
799 0.08
800 0.07
801 0.08
802 0.1
803 0.1
804 0.11
805 0.13
806 0.16
807 0.17
808 0.17
809 0.22
810 0.25
811 0.3
812 0.36
813 0.4
814 0.45
815 0.48
816 0.48
817 0.45
818 0.4
819 0.36
820 0.34
821 0.35
822 0.34
823 0.37
824 0.43
825 0.47
826 0.49
827 0.55
828 0.53
829 0.57
830 0.56
831 0.51
832 0.46
833 0.41
834 0.37
835 0.31
836 0.29
837 0.2
838 0.15
839 0.14
840 0.12
841 0.12
842 0.13
843 0.14
844 0.16
845 0.15
846 0.15