FuNGI

D4AMD1

Protein Details

Accession

D4AMD1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
212-238	QSQREWRDPKASKQPERKRKIEDDPKP	Basic
969-989	VYQVTRRRRGVSSRDKRKGTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
223-231	SKQPERKRK

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 9, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007259 GCP IPR040457 GCP_C IPR042241 GCP_C_sf IPR041470 GCP_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0000930 C:gamma-tubulin complex GO:0005874 C:microtubule GO:0000922 C:spindle pole GO:0005816 C:spindle pole body GO:0043015 F:gamma-tubulin binding GO:0007020 P:microtubule nucleation
KEGG	abe:ARB_05384 -
Pfam	View protein in Pfam PF04130 GCP_C_terminal PF17681 GCP_N_terminal

Amino Acid Sequences

MAPHPRSANPRSRRIEDALSQLVDSLLPPSPHILDDDTGSESYRDGHARAEAAERDELRHQLALENAWRIIRNYGSGNKSQPGSGAEVSVEVINNAPDLIKRRLLKVNTTPDKAVRFSNLYSRLLTQPVLSQKWAILYLLYRIGARSGDADQRDGNLLREGARSPLLDERQLDYMSMKDKFGARRTKAPESINPGSSASAIGREASPIELSQSQREWRDPKASKQPERKRKIEDDPKPSGSTVRNIDDFIPAEQPSPEPEPPIQDIVVVKPSEPEILRDLPFFLQGLSTTNLEFSAQSVLKLPRTLPTPIVSLLHTLAEPCLLYRGLSNFVKQAEGGLIEQSLRAAVGSELRSYLGLVASLEGEIRRALTAVSQDSSDQKTVMGAGVTLKRCVVWVKDATLALRLMSLMVEEARNKRGGQLISMIHEFSTSHGDPFVGAYAERLLTHVTRPFYNMLRQWIYDGELSDPYNEFFVVEPETRPDIDPRRAATSVWDEKYKLDSDMVPTIMTHDFAKKVFLIGKSLNFIRYGCGDSAWVVAYSRESSKTLQYGDNATLETYIDEAYKTTMARLIFLMDTKFKLFDHLKALKKYLLLGQGDFIALLMESLASNLDRPANSQYRHTLTAQLEHAIRSSNAQHDSPEVLRRLDARMLELSHGEIGWDCFTLEYKIDAPVDVIITPWASTQYLKVFNFLWRVKRVEFALGSTWRRCMTGARGILGGVDDKLGADWKKARCVIAEMIHFVCQLQYYILFEVIEASWDQLQIAISKPGCTLDDLIEAHTKYLNSITHKGLLGSSSSSFSRSSGSKEDSFLSQLHQILKVMLAYKDAVDGLYSFSVAEFTRRQELNAKIELRTAQGRWGVTDKDAQEPLTRPSRSGSTRRVDSPAFGAVEVPPNQKRWWTADPNTPGTPLPSGDALLGGEDHLLPSLRERLRELSSDFRVRLVTLLGDLAYQPDVDMRFLGVVMNFNDVYQVTRRRRGVSSRDKRKGTSNPSGESTADRDQEKAAGVS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.67
3	0.61
4	0.6
5	0.55
6	0.48
7	0.43
8	0.37
9	0.32
10	0.24
11	0.19
12	0.14
13	0.13
14	0.12
15	0.13
16	0.16
17	0.17
18	0.18
19	0.2
20	0.2
21	0.17
22	0.18
23	0.2
24	0.2
25	0.19
26	0.19
27	0.17
28	0.14
29	0.15
30	0.18
31	0.18
32	0.16
33	0.18
34	0.19
35	0.21
36	0.22
37	0.26
38	0.24
39	0.25
40	0.3
41	0.28
42	0.29
43	0.31
44	0.32
45	0.28
46	0.28
47	0.25
48	0.22
49	0.24
50	0.25
51	0.25
52	0.26
53	0.25
54	0.25
55	0.26
56	0.24
57	0.26
58	0.23
59	0.22
60	0.25
61	0.32
62	0.35
63	0.39
64	0.41
65	0.42
66	0.41
67	0.38
68	0.35
69	0.3
70	0.3
71	0.26
72	0.22
73	0.18
74	0.17
75	0.18
76	0.17
77	0.14
78	0.09
79	0.09
80	0.08
81	0.08
82	0.08
83	0.07
84	0.09
85	0.15
86	0.19
87	0.26
88	0.27
89	0.33
90	0.42
91	0.45
92	0.51
93	0.54
94	0.61
95	0.62
96	0.65
97	0.62
98	0.58
99	0.59
100	0.52
101	0.45
102	0.39
103	0.35
104	0.33
105	0.39
106	0.4
107	0.37
108	0.37
109	0.38
110	0.36
111	0.34
112	0.32
113	0.24
114	0.25
115	0.3
116	0.31
117	0.29
118	0.27
119	0.25
120	0.27
121	0.27
122	0.21
123	0.15
124	0.13
125	0.15
126	0.17
127	0.17
128	0.15
129	0.14
130	0.15
131	0.14
132	0.14
133	0.13
134	0.13
135	0.19
136	0.2
137	0.22
138	0.21
139	0.22
140	0.26
141	0.24
142	0.23
143	0.19
144	0.19
145	0.19
146	0.2
147	0.19
148	0.18
149	0.19
150	0.18
151	0.17
152	0.24
153	0.25
154	0.26
155	0.27
156	0.27
157	0.29
158	0.28
159	0.27
160	0.2
161	0.2
162	0.22
163	0.21
164	0.19
165	0.18
166	0.23
167	0.29
168	0.36
169	0.44
170	0.43
171	0.51
172	0.58
173	0.63
174	0.65
175	0.64
176	0.62
177	0.61
178	0.62
179	0.54
180	0.48
181	0.41
182	0.35
183	0.3
184	0.25
185	0.16
186	0.12
187	0.11
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.1
192	0.1
193	0.1
194	0.09
195	0.12
196	0.15
197	0.17
198	0.19
199	0.22
200	0.26
201	0.28
202	0.35
203	0.35
204	0.35
205	0.44
206	0.45
207	0.5
208	0.57
209	0.64
210	0.67
211	0.75
212	0.81
213	0.82
214	0.86
215	0.84
216	0.81
217	0.79
218	0.81
219	0.81
220	0.79
221	0.77
222	0.76
223	0.73
224	0.67
225	0.59
226	0.52
227	0.44
228	0.41
229	0.37
230	0.33
231	0.3
232	0.3
233	0.3
234	0.29
235	0.27
236	0.22
237	0.2
238	0.16
239	0.16
240	0.16
241	0.15
242	0.16
243	0.2
244	0.19
245	0.19
246	0.2
247	0.23
248	0.25
249	0.26
250	0.22
251	0.19
252	0.19
253	0.18
254	0.23
255	0.18
256	0.16
257	0.15
258	0.16
259	0.18
260	0.17
261	0.17
262	0.17
263	0.2
264	0.21
265	0.21
266	0.22
267	0.18
268	0.19
269	0.16
270	0.12
271	0.09
272	0.08
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.1
277	0.1
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.08
282	0.12
283	0.11
284	0.12
285	0.16
286	0.18
287	0.2
288	0.21
289	0.2
290	0.18
291	0.22
292	0.23
293	0.21
294	0.21
295	0.21
296	0.21
297	0.22
298	0.18
299	0.17
300	0.15
301	0.13
302	0.11
303	0.1
304	0.08
305	0.08
306	0.07
307	0.06
308	0.07
309	0.06
310	0.07
311	0.08
312	0.1
313	0.15
314	0.16
315	0.17
316	0.17
317	0.18
318	0.18
319	0.16
320	0.15
321	0.1
322	0.1
323	0.1
324	0.08
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.06
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.08
335	0.09
336	0.09
337	0.1
338	0.1
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.06
343	0.06
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.08
358	0.09
359	0.1
360	0.1
361	0.11
362	0.13
363	0.16
364	0.15
365	0.13
366	0.11
367	0.11
368	0.1
369	0.1
370	0.07
371	0.05
372	0.08
373	0.13
374	0.13
375	0.14
376	0.13
377	0.13
378	0.13
379	0.15
380	0.14
381	0.14
382	0.15
383	0.17
384	0.2
385	0.2
386	0.2
387	0.2
388	0.19
389	0.13
390	0.11
391	0.09
392	0.06
393	0.06
394	0.05
395	0.04
396	0.04
397	0.05
398	0.08
399	0.1
400	0.12
401	0.14
402	0.14
403	0.15
404	0.19
405	0.19
406	0.17
407	0.2
408	0.19
409	0.2
410	0.21
411	0.19
412	0.14
413	0.14
414	0.13
415	0.09
416	0.14
417	0.12
418	0.11
419	0.11
420	0.11
421	0.11
422	0.12
423	0.11
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.07
432	0.07
433	0.09
434	0.12
435	0.13
436	0.13
437	0.15
438	0.17
439	0.18
440	0.22
441	0.22
442	0.24
443	0.24
444	0.24
445	0.23
446	0.21
447	0.2
448	0.17
449	0.15
450	0.11
451	0.11
452	0.11
453	0.11
454	0.11
455	0.09
456	0.09
457	0.08
458	0.07
459	0.05
460	0.06
461	0.08
462	0.08
463	0.08
464	0.1
465	0.12
466	0.12
467	0.12
468	0.16
469	0.18
470	0.22
471	0.25
472	0.24
473	0.27
474	0.27
475	0.27
476	0.25
477	0.28
478	0.29
479	0.28
480	0.28
481	0.24
482	0.24
483	0.27
484	0.25
485	0.17
486	0.13
487	0.12
488	0.13
489	0.15
490	0.14
491	0.11
492	0.1
493	0.12
494	0.11
495	0.11
496	0.09
497	0.09
498	0.1
499	0.1
500	0.11
501	0.09
502	0.1
503	0.12
504	0.12
505	0.14
506	0.14
507	0.15
508	0.17
509	0.17
510	0.17
511	0.14
512	0.14
513	0.12
514	0.12
515	0.12
516	0.1
517	0.1
518	0.09
519	0.09
520	0.09
521	0.09
522	0.07
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.07
527	0.08
528	0.09
529	0.1
530	0.11
531	0.13
532	0.15
533	0.17
534	0.17
535	0.17
536	0.18
537	0.18
538	0.17
539	0.15
540	0.13
541	0.11
542	0.09
543	0.08
544	0.06
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.07
551	0.06
552	0.06
553	0.09
554	0.09
555	0.1
556	0.09
557	0.1
558	0.09
559	0.1
560	0.11
561	0.1
562	0.11
563	0.1
564	0.11
565	0.09
566	0.15
567	0.15
568	0.17
569	0.24
570	0.31
571	0.36
572	0.38
573	0.4
574	0.36
575	0.35
576	0.33
577	0.28
578	0.26
579	0.21
580	0.19
581	0.18
582	0.16
583	0.16
584	0.14
585	0.11
586	0.05
587	0.04
588	0.03
589	0.03
590	0.02
591	0.02
592	0.03
593	0.03
594	0.03
595	0.04
596	0.05
597	0.07
598	0.07
599	0.08
600	0.15
601	0.21
602	0.22
603	0.24
604	0.28
605	0.3
606	0.33
607	0.32
608	0.32
609	0.27
610	0.3
611	0.28
612	0.26
613	0.23
614	0.21
615	0.2
616	0.15
617	0.14
618	0.12
619	0.13
620	0.15
621	0.17
622	0.17
623	0.17
624	0.17
625	0.2
626	0.2
627	0.23
628	0.2
629	0.18
630	0.18
631	0.19
632	0.2
633	0.2
634	0.18
635	0.16
636	0.16
637	0.17
638	0.16
639	0.15
640	0.14
641	0.11
642	0.1
643	0.08
644	0.06
645	0.07
646	0.07
647	0.06
648	0.06
649	0.06
650	0.07
651	0.08
652	0.08
653	0.08
654	0.09
655	0.11
656	0.11
657	0.11
658	0.1
659	0.1
660	0.1
661	0.09
662	0.08
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.07
670	0.09
671	0.14
672	0.2
673	0.2
674	0.22
675	0.22
676	0.24
677	0.32
678	0.33
679	0.34
680	0.31
681	0.35
682	0.34
683	0.36
684	0.34
685	0.31
686	0.28
687	0.24
688	0.26
689	0.28
690	0.31
691	0.29
692	0.29
693	0.25
694	0.25
695	0.24
696	0.21
697	0.21
698	0.26
699	0.27
700	0.26
701	0.26
702	0.25
703	0.24
704	0.21
705	0.16
706	0.08
707	0.06
708	0.05
709	0.05
710	0.05
711	0.09
712	0.09
713	0.11
714	0.17
715	0.19
716	0.26
717	0.28
718	0.29
719	0.26
720	0.3
721	0.32
722	0.31
723	0.31
724	0.27
725	0.26
726	0.26
727	0.25
728	0.21
729	0.16
730	0.11
731	0.1
732	0.08
733	0.07
734	0.08
735	0.09
736	0.1
737	0.09
738	0.08
739	0.1
740	0.09
741	0.09
742	0.08
743	0.08
744	0.08
745	0.08
746	0.08
747	0.07
748	0.08
749	0.08
750	0.1
751	0.13
752	0.13
753	0.14
754	0.15
755	0.15
756	0.15
757	0.16
758	0.16
759	0.12
760	0.17
761	0.16
762	0.18
763	0.21
764	0.2
765	0.19
766	0.2
767	0.18
768	0.14
769	0.17
770	0.19
771	0.2
772	0.25
773	0.26
774	0.28
775	0.29
776	0.28
777	0.25
778	0.22
779	0.18
780	0.16
781	0.15
782	0.13
783	0.13
784	0.14
785	0.14
786	0.14
787	0.16
788	0.15
789	0.19
790	0.23
791	0.28
792	0.28
793	0.29
794	0.31
795	0.29
796	0.3
797	0.26
798	0.22
799	0.21
800	0.22
801	0.22
802	0.21
803	0.2
804	0.18
805	0.19
806	0.18
807	0.16
808	0.13
809	0.13
810	0.12
811	0.12
812	0.12
813	0.12
814	0.1
815	0.08
816	0.08
817	0.09
818	0.08
819	0.08
820	0.07
821	0.07
822	0.09
823	0.08
824	0.12
825	0.12
826	0.15
827	0.23
828	0.23
829	0.25
830	0.31
831	0.37
832	0.39
833	0.44
834	0.44
835	0.37
836	0.39
837	0.39
838	0.35
839	0.33
840	0.27
841	0.25
842	0.27
843	0.27
844	0.26
845	0.29
846	0.27
847	0.24
848	0.3
849	0.26
850	0.28
851	0.3
852	0.28
853	0.29
854	0.3
855	0.34
856	0.37
857	0.35
858	0.3
859	0.32
860	0.39
861	0.41
862	0.47
863	0.5
864	0.5
865	0.55
866	0.57
867	0.59
868	0.52
869	0.48
870	0.43
871	0.38
872	0.31
873	0.25
874	0.23
875	0.19
876	0.25
877	0.26
878	0.29
879	0.27
880	0.29
881	0.31
882	0.33
883	0.36
884	0.36
885	0.42
886	0.45
887	0.49
888	0.55
889	0.61
890	0.63
891	0.61
892	0.55
893	0.47
894	0.4
895	0.35
896	0.26
897	0.22
898	0.17
899	0.16
900	0.14
901	0.14
902	0.12
903	0.1
904	0.09
905	0.07
906	0.07
907	0.06
908	0.06
909	0.07
910	0.07
911	0.07
912	0.1
913	0.19
914	0.21
915	0.23
916	0.26
917	0.31
918	0.34
919	0.38
920	0.39
921	0.39
922	0.44
923	0.49
924	0.46
925	0.42
926	0.39
927	0.35
928	0.32
929	0.25
930	0.18
931	0.12
932	0.13
933	0.11
934	0.11
935	0.1
936	0.11
937	0.1
938	0.09
939	0.08
940	0.1
941	0.11
942	0.11
943	0.12
944	0.11
945	0.11
946	0.11
947	0.12
948	0.1
949	0.13
950	0.13
951	0.17
952	0.16
953	0.15
954	0.17
955	0.15
956	0.18
957	0.21
958	0.3
959	0.33
960	0.42
961	0.46
962	0.5
963	0.57
964	0.63
965	0.67
966	0.69
967	0.73
968	0.75
969	0.81
970	0.81
971	0.78
972	0.78
973	0.77
974	0.75
975	0.75
976	0.71
977	0.66
978	0.65
979	0.65
980	0.56
981	0.49
982	0.46
983	0.41
984	0.39
985	0.35
986	0.32
987	0.3
988	0.31

D4AMD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer