Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AKE5

Protein Details
Accession D4AKE5    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-32TPAVSFKKRSAKAKSSLRKKAATHydrophilic
45-67SDDEQGHRIKRRRKNAGVSASSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-30KKRSAKAKSSLRKKA
53-58IKRRRK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 9, mito 6, cyto 5.5, plas 1, E.R. 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG abe:ARB_03970  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MEQSVAEEQTPAVSFKKRSAKAKSSLRKKAATPPPASDSEDFTSSDDEQGHRIKRRRKNAGVSASSKSAAASAGRELDSEKPETTERPALPTTNDATKQSNWYDEELDEKNLLGNTRPRPGDVGQVAADGKYRGTSNYQSFIQKNPNAPTKQVGPMKAATNIRTITVTDYAPDVCKDYKRTGFCGFGDSCKYLHAREDYKAGWELDRDWDVQTEGKKLEGQTVASRRGGENEAGDDEEDEEEEGIPPECAICHKPYTSPIVTKSMFICPHSPSQERSVNLIIDIIGGNLFIYKGLFLSLFIVLYSLPLFSPFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.3
3 0.4
4 0.45
5 0.53
6 0.61
7 0.66
8 0.71
9 0.8
10 0.82
11 0.82
12 0.86
13 0.84
14 0.79
15 0.74
16 0.75
17 0.74
18 0.73
19 0.66
20 0.62
21 0.6
22 0.58
23 0.59
24 0.49
25 0.45
26 0.39
27 0.36
28 0.31
29 0.26
30 0.26
31 0.22
32 0.23
33 0.19
34 0.17
35 0.19
36 0.25
37 0.31
38 0.37
39 0.44
40 0.52
41 0.6
42 0.7
43 0.76
44 0.79
45 0.82
46 0.83
47 0.85
48 0.82
49 0.77
50 0.7
51 0.61
52 0.52
53 0.42
54 0.32
55 0.23
56 0.16
57 0.13
58 0.11
59 0.1
60 0.12
61 0.12
62 0.13
63 0.14
64 0.17
65 0.19
66 0.2
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.21
71 0.24
72 0.27
73 0.25
74 0.27
75 0.28
76 0.27
77 0.27
78 0.29
79 0.27
80 0.25
81 0.27
82 0.24
83 0.26
84 0.27
85 0.3
86 0.28
87 0.29
88 0.25
89 0.25
90 0.24
91 0.21
92 0.24
93 0.21
94 0.21
95 0.17
96 0.15
97 0.14
98 0.14
99 0.14
100 0.12
101 0.17
102 0.19
103 0.25
104 0.25
105 0.24
106 0.27
107 0.27
108 0.32
109 0.26
110 0.25
111 0.19
112 0.2
113 0.19
114 0.16
115 0.16
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.1
122 0.15
123 0.17
124 0.2
125 0.22
126 0.25
127 0.26
128 0.28
129 0.32
130 0.31
131 0.33
132 0.34
133 0.4
134 0.37
135 0.36
136 0.35
137 0.31
138 0.35
139 0.33
140 0.3
141 0.25
142 0.26
143 0.26
144 0.29
145 0.27
146 0.22
147 0.22
148 0.21
149 0.19
150 0.17
151 0.16
152 0.13
153 0.13
154 0.12
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.12
163 0.15
164 0.2
165 0.25
166 0.27
167 0.31
168 0.32
169 0.34
170 0.31
171 0.33
172 0.29
173 0.25
174 0.26
175 0.23
176 0.2
177 0.19
178 0.19
179 0.14
180 0.18
181 0.21
182 0.2
183 0.21
184 0.25
185 0.23
186 0.24
187 0.27
188 0.23
189 0.19
190 0.17
191 0.17
192 0.16
193 0.17
194 0.16
195 0.14
196 0.14
197 0.14
198 0.16
199 0.16
200 0.16
201 0.15
202 0.15
203 0.17
204 0.16
205 0.21
206 0.19
207 0.2
208 0.24
209 0.29
210 0.31
211 0.3
212 0.31
213 0.26
214 0.28
215 0.28
216 0.22
217 0.18
218 0.17
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.12
223 0.11
224 0.1
225 0.09
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.09
237 0.11
238 0.14
239 0.17
240 0.19
241 0.21
242 0.25
243 0.32
244 0.34
245 0.35
246 0.35
247 0.39
248 0.38
249 0.38
250 0.37
251 0.37
252 0.35
253 0.33
254 0.33
255 0.29
256 0.36
257 0.4
258 0.41
259 0.37
260 0.42
261 0.46
262 0.44
263 0.45
264 0.41
265 0.35
266 0.32
267 0.3
268 0.22
269 0.16
270 0.15
271 0.1
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.07
293 0.06