Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4B042

Protein Details
Accession D4B042    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-26GSDGDIDPRRKRRRISPPETGPYVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-15RRKRRR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG abe:ARB_01813  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10367  Vps39_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MGSDGDIDPRRKRRRISPPETGPYVLRPLLEDVPVQAEDGEGQAYITCVEYWNENLYVGTSAGEILHFVSLPSESELEAGKPSFILASRQPITSSARTGTSCGIQQILVLATASKACVLCNGSVFFYSLPELSPAYGTTKVSNCNWIGGLDLDELDAEDGEEASDPIIMVGMQDKIMLVKIGGGPRRVRNIEFPGCLIANRRGTIACVADSRSYALLEVEHRQKIPLFPISSNDEYDEFKVEDIPSRSESPARDKLPVASNGNSGVKTHGRSTSLNAIAASSELRQQSTQPDVSGTSTPDSLAEGKLPKPTSSHDRRLSIPSRSPSAAPGDGLGQKPLPPTPSPTPKKPTSMLKPHIVSPTPSEFLLVTGTDASSPAVGMFVNLEGETAERGTIEFQTYPDAIVLDNGDEDPNSHPSGDDADGYVLAVVNAAIDTEADGEVTEEKCLEVQRWDVNPGEGGRQRSLINISLEPPVSGPVGVARTVSPNKINFADVGELLQVVRLKVPDLRTPGSMTPQKNNDPRTEASIEQLQKEKELFENDSDSSKQVKLRRGWEAERNEEELAFAKTLGYVKSNVMLWEGNQIWRVLRNPLALQLENALTLTQEIQDAKTCRIADKGAIIDMMARLDSILPRTAPESLGLNYVKQKASLLLFGDLIATNPEYQTPSAIKSVEDVLIAGELDPRIIILFTPLLREEILQGPQGIWICAGLTKVIDTLLEVSKDQDGTIKFNFTEPILRMLVRYLTSWHRKRGYGSVTDDTYVFDSVDSALLRLLLHLDATHNEAVNGKIVASDLRQELNKLVDNWKGNFTRAVELLELYQRLFVLSRLYQSRKMSGHVLRTWRRTIEGEKDVGGEMTIPAVELQVRKYLVKIRDPNLVEEYGLWLAARNPKLGIQVFSDDSSRVQFDPPQVIRILKDRAPGAVQVYLEHLVFTKNITRYADDLISYYLDTVISVLETSPEARASLTESYSTYRALRPPKPSYLSFITENAPPEPWWQSRLRLLQLLGGAARSQFTSAASLPSDLPYSISAVLERIEPFKNELVSECIILGGRQGRHDDALHLLTHGLGDYDSAIRYCLFEGSGASASHSMFSRKFAPSEGQKQLFAGLLREFLHIADPSERTERTGDLLARFAPLFDVREVLDLVPDEWSVDALSEYFARALRDLTSESRNAKVQRALSAGLNLKVCADFIKESEKIGGWIEDAGDVKPLKASRDSTTESEPQAEGAAKNNQSPNEAGTQIRPDDTLKIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.83
3 0.83
4 0.84
5 0.84
6 0.85
7 0.82
8 0.74
9 0.64
10 0.57
11 0.53
12 0.43
13 0.33
14 0.27
15 0.27
16 0.28
17 0.27
18 0.24
19 0.2
20 0.22
21 0.22
22 0.2
23 0.15
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.11
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.09
37 0.11
38 0.14
39 0.17
40 0.18
41 0.17
42 0.17
43 0.16
44 0.17
45 0.15
46 0.13
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.09
59 0.11
60 0.11
61 0.1
62 0.12
63 0.13
64 0.13
65 0.15
66 0.14
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.16
73 0.17
74 0.25
75 0.27
76 0.28
77 0.29
78 0.3
79 0.36
80 0.35
81 0.35
82 0.28
83 0.3
84 0.3
85 0.31
86 0.3
87 0.27
88 0.25
89 0.23
90 0.22
91 0.18
92 0.17
93 0.17
94 0.15
95 0.12
96 0.1
97 0.09
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.13
105 0.15
106 0.16
107 0.19
108 0.2
109 0.19
110 0.2
111 0.21
112 0.17
113 0.16
114 0.16
115 0.13
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.12
121 0.12
122 0.14
123 0.16
124 0.17
125 0.2
126 0.23
127 0.27
128 0.28
129 0.33
130 0.3
131 0.3
132 0.29
133 0.25
134 0.23
135 0.19
136 0.19
137 0.13
138 0.13
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.06
158 0.07
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.08
165 0.06
166 0.08
167 0.12
168 0.18
169 0.22
170 0.26
171 0.31
172 0.36
173 0.45
174 0.45
175 0.44
176 0.45
177 0.51
178 0.52
179 0.49
180 0.45
181 0.4
182 0.37
183 0.35
184 0.32
185 0.3
186 0.28
187 0.27
188 0.27
189 0.24
190 0.25
191 0.28
192 0.25
193 0.2
194 0.17
195 0.19
196 0.19
197 0.19
198 0.2
199 0.17
200 0.15
201 0.14
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.19
206 0.24
207 0.25
208 0.25
209 0.27
210 0.28
211 0.29
212 0.31
213 0.32
214 0.29
215 0.27
216 0.31
217 0.37
218 0.37
219 0.35
220 0.32
221 0.26
222 0.25
223 0.26
224 0.24
225 0.18
226 0.16
227 0.17
228 0.16
229 0.21
230 0.21
231 0.23
232 0.24
233 0.26
234 0.28
235 0.28
236 0.31
237 0.33
238 0.39
239 0.38
240 0.38
241 0.36
242 0.4
243 0.43
244 0.46
245 0.42
246 0.35
247 0.34
248 0.35
249 0.36
250 0.31
251 0.25
252 0.23
253 0.22
254 0.23
255 0.25
256 0.24
257 0.26
258 0.26
259 0.31
260 0.35
261 0.34
262 0.33
263 0.29
264 0.26
265 0.23
266 0.22
267 0.18
268 0.1
269 0.12
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.15
274 0.19
275 0.23
276 0.24
277 0.2
278 0.21
279 0.2
280 0.23
281 0.23
282 0.2
283 0.16
284 0.15
285 0.14
286 0.13
287 0.14
288 0.12
289 0.11
290 0.13
291 0.14
292 0.16
293 0.22
294 0.23
295 0.22
296 0.23
297 0.27
298 0.34
299 0.4
300 0.48
301 0.49
302 0.51
303 0.53
304 0.6
305 0.6
306 0.57
307 0.55
308 0.49
309 0.47
310 0.45
311 0.42
312 0.36
313 0.36
314 0.3
315 0.23
316 0.2
317 0.19
318 0.21
319 0.21
320 0.2
321 0.15
322 0.15
323 0.17
324 0.18
325 0.18
326 0.16
327 0.22
328 0.29
329 0.4
330 0.45
331 0.51
332 0.56
333 0.57
334 0.61
335 0.6
336 0.61
337 0.6
338 0.64
339 0.62
340 0.63
341 0.6
342 0.59
343 0.59
344 0.51
345 0.42
346 0.37
347 0.36
348 0.29
349 0.27
350 0.24
351 0.19
352 0.18
353 0.18
354 0.13
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.04
378 0.05
379 0.06
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.12
385 0.12
386 0.12
387 0.11
388 0.1
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.05
397 0.07
398 0.08
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.1
403 0.11
404 0.14
405 0.14
406 0.12
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.09
411 0.09
412 0.05
413 0.04
414 0.04
415 0.03
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.02
420 0.02
421 0.03
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.06
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.07
433 0.08
434 0.09
435 0.09
436 0.11
437 0.16
438 0.18
439 0.2
440 0.19
441 0.19
442 0.2
443 0.19
444 0.22
445 0.2
446 0.21
447 0.2
448 0.21
449 0.21
450 0.21
451 0.22
452 0.2
453 0.19
454 0.17
455 0.18
456 0.18
457 0.18
458 0.16
459 0.14
460 0.12
461 0.1
462 0.09
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.12
470 0.14
471 0.16
472 0.18
473 0.18
474 0.2
475 0.2
476 0.21
477 0.16
478 0.16
479 0.15
480 0.12
481 0.11
482 0.09
483 0.08
484 0.07
485 0.08
486 0.07
487 0.06
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.1
492 0.13
493 0.16
494 0.2
495 0.22
496 0.22
497 0.25
498 0.25
499 0.28
500 0.32
501 0.3
502 0.3
503 0.34
504 0.4
505 0.43
506 0.45
507 0.41
508 0.4
509 0.39
510 0.39
511 0.37
512 0.3
513 0.27
514 0.3
515 0.28
516 0.25
517 0.28
518 0.22
519 0.2
520 0.2
521 0.19
522 0.15
523 0.17
524 0.17
525 0.14
526 0.17
527 0.16
528 0.18
529 0.18
530 0.17
531 0.16
532 0.16
533 0.2
534 0.22
535 0.28
536 0.32
537 0.36
538 0.42
539 0.45
540 0.47
541 0.51
542 0.5
543 0.49
544 0.46
545 0.43
546 0.36
547 0.31
548 0.27
549 0.2
550 0.17
551 0.11
552 0.09
553 0.06
554 0.07
555 0.08
556 0.08
557 0.08
558 0.08
559 0.08
560 0.1
561 0.11
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.09
566 0.12
567 0.13
568 0.12
569 0.12
570 0.12
571 0.11
572 0.13
573 0.14
574 0.12
575 0.13
576 0.14
577 0.13
578 0.18
579 0.2
580 0.18
581 0.17
582 0.16
583 0.14
584 0.13
585 0.12
586 0.08
587 0.05
588 0.05
589 0.05
590 0.04
591 0.05
592 0.05
593 0.06
594 0.1
595 0.11
596 0.12
597 0.16
598 0.15
599 0.15
600 0.16
601 0.16
602 0.13
603 0.14
604 0.14
605 0.1
606 0.1
607 0.09
608 0.08
609 0.08
610 0.07
611 0.04
612 0.04
613 0.03
614 0.04
615 0.04
616 0.05
617 0.06
618 0.06
619 0.06
620 0.08
621 0.08
622 0.08
623 0.08
624 0.09
625 0.09
626 0.13
627 0.12
628 0.13
629 0.15
630 0.17
631 0.17
632 0.15
633 0.15
634 0.13
635 0.13
636 0.14
637 0.12
638 0.1
639 0.1
640 0.1
641 0.1
642 0.08
643 0.08
644 0.06
645 0.06
646 0.05
647 0.05
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.08
652 0.08
653 0.1
654 0.11
655 0.11
656 0.11
657 0.11
658 0.12
659 0.11
660 0.1
661 0.08
662 0.06
663 0.06
664 0.06
665 0.05
666 0.05
667 0.04
668 0.04
669 0.04
670 0.04
671 0.03
672 0.03
673 0.03
674 0.04
675 0.05
676 0.05
677 0.07
678 0.07
679 0.08
680 0.08
681 0.08
682 0.09
683 0.1
684 0.12
685 0.11
686 0.11
687 0.1
688 0.12
689 0.12
690 0.1
691 0.07
692 0.06
693 0.05
694 0.06
695 0.06
696 0.05
697 0.04
698 0.04
699 0.05
700 0.05
701 0.04
702 0.04
703 0.06
704 0.07
705 0.08
706 0.08
707 0.09
708 0.1
709 0.1
710 0.1
711 0.11
712 0.11
713 0.14
714 0.14
715 0.15
716 0.14
717 0.15
718 0.16
719 0.12
720 0.15
721 0.13
722 0.16
723 0.15
724 0.15
725 0.14
726 0.15
727 0.16
728 0.13
729 0.12
730 0.11
731 0.18
732 0.28
733 0.31
734 0.38
735 0.39
736 0.4
737 0.43
738 0.47
739 0.44
740 0.41
741 0.42
742 0.39
743 0.36
744 0.35
745 0.32
746 0.25
747 0.22
748 0.16
749 0.11
750 0.07
751 0.06
752 0.06
753 0.08
754 0.07
755 0.06
756 0.06
757 0.06
758 0.06
759 0.06
760 0.06
761 0.05
762 0.05
763 0.05
764 0.06
765 0.06
766 0.09
767 0.1
768 0.09
769 0.09
770 0.1
771 0.1
772 0.11
773 0.1
774 0.07
775 0.06
776 0.07
777 0.07
778 0.07
779 0.09
780 0.09
781 0.11
782 0.11
783 0.12
784 0.13
785 0.15
786 0.17
787 0.16
788 0.18
789 0.21
790 0.24
791 0.25
792 0.3
793 0.28
794 0.26
795 0.27
796 0.26
797 0.24
798 0.22
799 0.21
800 0.16
801 0.15
802 0.15
803 0.14
804 0.13
805 0.1
806 0.1
807 0.08
808 0.08
809 0.08
810 0.08
811 0.1
812 0.1
813 0.14
814 0.2
815 0.23
816 0.29
817 0.3
818 0.35
819 0.32
820 0.34
821 0.37
822 0.36
823 0.39
824 0.39
825 0.46
826 0.46
827 0.5
828 0.51
829 0.44
830 0.43
831 0.39
832 0.39
833 0.38
834 0.36
835 0.32
836 0.3
837 0.3
838 0.27
839 0.24
840 0.19
841 0.11
842 0.07
843 0.06
844 0.05
845 0.04
846 0.04
847 0.04
848 0.06
849 0.06
850 0.08
851 0.11
852 0.13
853 0.13
854 0.15
855 0.22
856 0.25
857 0.33
858 0.39
859 0.38
860 0.45
861 0.46
862 0.48
863 0.44
864 0.39
865 0.3
866 0.23
867 0.23
868 0.15
869 0.14
870 0.1
871 0.07
872 0.1
873 0.16
874 0.17
875 0.16
876 0.16
877 0.18
878 0.23
879 0.24
880 0.23
881 0.19
882 0.21
883 0.21
884 0.22
885 0.21
886 0.17
887 0.16
888 0.16
889 0.15
890 0.12
891 0.12
892 0.14
893 0.16
894 0.25
895 0.25
896 0.26
897 0.26
898 0.26
899 0.26
900 0.29
901 0.31
902 0.24
903 0.27
904 0.25
905 0.25
906 0.25
907 0.25
908 0.22
909 0.2
910 0.18
911 0.15
912 0.16
913 0.16
914 0.14
915 0.13
916 0.11
917 0.09
918 0.09
919 0.1
920 0.14
921 0.15
922 0.18
923 0.2
924 0.21
925 0.22
926 0.26
927 0.25
928 0.19
929 0.19
930 0.16
931 0.15
932 0.14
933 0.12
934 0.09
935 0.07
936 0.07
937 0.06
938 0.05
939 0.04
940 0.04
941 0.04
942 0.05
943 0.05
944 0.06
945 0.07
946 0.07
947 0.07
948 0.07
949 0.08
950 0.1
951 0.12
952 0.13
953 0.13
954 0.14
955 0.16
956 0.17
957 0.19
958 0.17
959 0.18
960 0.24
961 0.31
962 0.36
963 0.42
964 0.47
965 0.54
966 0.57
967 0.55
968 0.55
969 0.52
970 0.5
971 0.43
972 0.39
973 0.34
974 0.31
975 0.32
976 0.26
977 0.22
978 0.19
979 0.2
980 0.23
981 0.23
982 0.25
983 0.25
984 0.29
985 0.35
986 0.4
987 0.4
988 0.38
989 0.37
990 0.35
991 0.33
992 0.3
993 0.23
994 0.18
995 0.14
996 0.11
997 0.11
998 0.08
999 0.08
1000 0.07
1001 0.08
1002 0.1
1003 0.11
1004 0.13
1005 0.13
1006 0.14
1007 0.14
1008 0.15
1009 0.15
1010 0.12
1011 0.13
1012 0.11
1013 0.12
1014 0.12
1015 0.12
1016 0.11
1017 0.1
1018 0.11
1019 0.12
1020 0.12
1021 0.14
1022 0.15
1023 0.16
1024 0.19
1025 0.21
1026 0.22
1027 0.2
1028 0.2
1029 0.22
1030 0.21
1031 0.2
1032 0.17
1033 0.14
1034 0.13
1035 0.13
1036 0.14
1037 0.15
1038 0.16
1039 0.18
1040 0.21
1041 0.22
1042 0.24
1043 0.25
1044 0.24
1045 0.22
1046 0.23
1047 0.21
1048 0.18
1049 0.17
1050 0.14
1051 0.13
1052 0.11
1053 0.07
1054 0.05
1055 0.05
1056 0.06
1057 0.07
1058 0.08
1059 0.08
1060 0.09
1061 0.09
1062 0.1
1063 0.1
1064 0.1
1065 0.09
1066 0.09
1067 0.09
1068 0.12
1069 0.15
1070 0.14
1071 0.14
1072 0.15
1073 0.15
1074 0.16
1075 0.17
1076 0.17
1077 0.15
1078 0.18
1079 0.23
1080 0.24
1081 0.25
1082 0.26
1083 0.32
1084 0.38
1085 0.46
1086 0.52
1087 0.49
1088 0.47
1089 0.46
1090 0.45
1091 0.4
1092 0.31
1093 0.25
1094 0.17
1095 0.17
1096 0.18
1097 0.19
1098 0.18
1099 0.15
1100 0.17
1101 0.15
1102 0.17
1103 0.18
1104 0.17
1105 0.2
1106 0.25
1107 0.25
1108 0.24
1109 0.25
1110 0.23
1111 0.23
1112 0.28
1113 0.27
1114 0.24
1115 0.27
1116 0.25
1117 0.25
1118 0.24
1119 0.2
1120 0.17
1121 0.16
1122 0.17
1123 0.15
1124 0.16
1125 0.14
1126 0.16
1127 0.17
1128 0.15
1129 0.14
1130 0.12
1131 0.12
1132 0.12
1133 0.11
1134 0.1
1135 0.09
1136 0.09
1137 0.08
1138 0.07
1139 0.07
1140 0.06
1141 0.08
1142 0.07
1143 0.08
1144 0.09
1145 0.11
1146 0.12
1147 0.12
1148 0.13
1149 0.13
1150 0.16
1151 0.19
1152 0.22
1153 0.25
1154 0.29
1155 0.31
1156 0.33
1157 0.38
1158 0.38
1159 0.41
1160 0.43
1161 0.41
1162 0.41
1163 0.42
1164 0.4
1165 0.36
1166 0.4
1167 0.38
1168 0.36
1169 0.33
1170 0.28
1171 0.26
1172 0.24
1173 0.22
1174 0.17
1175 0.17
1176 0.14
1177 0.15
1178 0.22
1179 0.21
1180 0.23
1181 0.26
1182 0.25
1183 0.22
1184 0.23
1185 0.22
1186 0.15
1187 0.16
1188 0.15
1189 0.14
1190 0.14
1191 0.13
1192 0.16
1193 0.15
1194 0.15
1195 0.19
1196 0.2
1197 0.21
1198 0.26
1199 0.3
1200 0.3
1201 0.37
1202 0.42
1203 0.41
1204 0.46
1205 0.47
1206 0.44
1207 0.43
1208 0.38
1209 0.31
1210 0.29
1211 0.27
1212 0.21
1213 0.22
1214 0.28
1215 0.26
1216 0.32
1217 0.37
1218 0.36
1219 0.36
1220 0.37
1221 0.35
1222 0.31
1223 0.32
1224 0.28
1225 0.27
1226 0.32
1227 0.31
1228 0.31
1229 0.29
1230 0.26