Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AXC3

Protein Details
Accession D4AXC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
150-173KTQFSRAKYMLRKRKKYLHRFTVEHydrophilic
361-390LASWKPSKRSMHFKKKRRWTRVRNTVDETRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
366-379PSKRSMHFKKKRRW
Subcellular Location(s) cyto 10, cysk 8, cyto_mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG abe:ARB_00851  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSSIPPNVYVALKLPSDVTKIIQTVPNSNISLGKYGSFPCNQIIGRPFYATFEIADNPDDDGHVLHIVPAAELHTEALLADGEGEGEGEAGTSTPSVPFPQEDNRHIIDNKSTQQLTMEQIEELKQSSTDAGREIISKLLESHSALDQKTQFSRAKYMLRKRKKYLHRFTVEPMDVGVLTEWMLEQKDPGRVLELRDETIGLIGAWANVHYGGGGESDGAAKVNGAVNQAKGRWLIVDDTGGLVVAAMAERAGILYPPEVLSGEGLGSITKQGARPAQSVEDETPAVEAMPAPHTTLTVIHHNLQPNLSMLKYFSHDINEPSETHPLSSHLKTLSWLQLLHPSEDAIYEMEPPEISEEELASWKPSKRSMHFKKKRRWTRVRNTVDETRAGGFDGLIVATLMDPASILKYTVPLLAGSAQVVVYSPYIEPLVQLADLYSTARRTAYITYKREVAEGAAEDKEEDFPVDPTLLLAPTLHTSRVRTWQVLPGRTHPLMTGRGGAEGYVFHAVRVLPAIGKVEARGVQAKKRRTEIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.19
4 0.21
5 0.22
6 0.21
7 0.22
8 0.23
9 0.26
10 0.28
11 0.28
12 0.31
13 0.32
14 0.36
15 0.32
16 0.32
17 0.32
18 0.29
19 0.29
20 0.25
21 0.23
22 0.2
23 0.21
24 0.26
25 0.24
26 0.25
27 0.24
28 0.29
29 0.28
30 0.31
31 0.34
32 0.35
33 0.34
34 0.35
35 0.33
36 0.3
37 0.32
38 0.27
39 0.22
40 0.19
41 0.19
42 0.18
43 0.19
44 0.16
45 0.15
46 0.14
47 0.14
48 0.11
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.09
53 0.08
54 0.1
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.05
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.03
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.05
82 0.05
83 0.07
84 0.08
85 0.09
86 0.11
87 0.15
88 0.24
89 0.3
90 0.33
91 0.37
92 0.38
93 0.41
94 0.4
95 0.38
96 0.35
97 0.35
98 0.35
99 0.36
100 0.34
101 0.29
102 0.3
103 0.31
104 0.28
105 0.26
106 0.23
107 0.17
108 0.18
109 0.18
110 0.17
111 0.16
112 0.13
113 0.09
114 0.09
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.13
129 0.12
130 0.14
131 0.15
132 0.19
133 0.19
134 0.22
135 0.23
136 0.25
137 0.26
138 0.29
139 0.29
140 0.27
141 0.32
142 0.33
143 0.4
144 0.46
145 0.55
146 0.6
147 0.67
148 0.74
149 0.76
150 0.81
151 0.83
152 0.85
153 0.85
154 0.85
155 0.79
156 0.74
157 0.7
158 0.7
159 0.59
160 0.48
161 0.37
162 0.27
163 0.22
164 0.19
165 0.15
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.09
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.16
179 0.17
180 0.19
181 0.24
182 0.23
183 0.2
184 0.2
185 0.2
186 0.16
187 0.15
188 0.14
189 0.06
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.04
211 0.06
212 0.07
213 0.09
214 0.1
215 0.11
216 0.13
217 0.13
218 0.14
219 0.12
220 0.11
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.05
231 0.04
232 0.03
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.08
261 0.1
262 0.13
263 0.14
264 0.15
265 0.17
266 0.17
267 0.18
268 0.17
269 0.15
270 0.13
271 0.12
272 0.1
273 0.08
274 0.08
275 0.06
276 0.05
277 0.04
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.09
285 0.1
286 0.13
287 0.14
288 0.16
289 0.19
290 0.21
291 0.21
292 0.2
293 0.19
294 0.15
295 0.15
296 0.12
297 0.1
298 0.09
299 0.09
300 0.1
301 0.11
302 0.1
303 0.12
304 0.14
305 0.15
306 0.17
307 0.18
308 0.17
309 0.18
310 0.2
311 0.18
312 0.17
313 0.16
314 0.16
315 0.19
316 0.19
317 0.2
318 0.17
319 0.17
320 0.18
321 0.21
322 0.22
323 0.18
324 0.18
325 0.16
326 0.23
327 0.24
328 0.24
329 0.2
330 0.17
331 0.15
332 0.15
333 0.15
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.09
348 0.09
349 0.09
350 0.12
351 0.15
352 0.17
353 0.23
354 0.29
355 0.34
356 0.45
357 0.54
358 0.62
359 0.7
360 0.78
361 0.82
362 0.86
363 0.91
364 0.91
365 0.91
366 0.9
367 0.92
368 0.93
369 0.91
370 0.87
371 0.83
372 0.79
373 0.7
374 0.61
375 0.51
376 0.41
377 0.33
378 0.26
379 0.19
380 0.12
381 0.1
382 0.08
383 0.06
384 0.05
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.03
391 0.03
392 0.04
393 0.05
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.08
399 0.09
400 0.1
401 0.08
402 0.09
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.07
413 0.06
414 0.07
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.08
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.09
426 0.09
427 0.09
428 0.1
429 0.11
430 0.11
431 0.12
432 0.18
433 0.27
434 0.35
435 0.38
436 0.4
437 0.44
438 0.44
439 0.43
440 0.37
441 0.28
442 0.23
443 0.21
444 0.21
445 0.17
446 0.16
447 0.16
448 0.16
449 0.16
450 0.12
451 0.12
452 0.1
453 0.1
454 0.12
455 0.12
456 0.11
457 0.1
458 0.11
459 0.1
460 0.1
461 0.09
462 0.09
463 0.12
464 0.14
465 0.16
466 0.17
467 0.2
468 0.25
469 0.34
470 0.37
471 0.37
472 0.38
473 0.44
474 0.5
475 0.54
476 0.53
477 0.49
478 0.53
479 0.5
480 0.48
481 0.41
482 0.38
483 0.35
484 0.32
485 0.32
486 0.24
487 0.25
488 0.24
489 0.22
490 0.17
491 0.14
492 0.15
493 0.16
494 0.15
495 0.13
496 0.15
497 0.15
498 0.16
499 0.18
500 0.16
501 0.11
502 0.13
503 0.16
504 0.16
505 0.17
506 0.16
507 0.18
508 0.2
509 0.22
510 0.29
511 0.3
512 0.38
513 0.46
514 0.54
515 0.56