Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AM49

Protein Details
Accession D4AM49    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-72LTLASSPPLLPRKRKRVEKWAWNKRENHLRRHydrophilic
519-546GDEGPFPSSKRRTKPLTRRKTIQDLQEWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-66PRKRKRVEKWAWNKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039601  Rrn5  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0000500  C:RNA polymerase I upstream activating factor complex  
GO:0042790  P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I  
KEGG abe:ARB_04739  -  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MSSSSYEPQDDAPESPSETDEPRKTTHDSSDAGPSSHQLQRLTLASSPPLLPRKRKRVEKWAWNKRENHLRRANALPIASYRGLLIQATDEIAQEPNHGAPIHGSQFGIVRWSTEEKLALFSALARKGKGAIPEIASFIGSKSRIEVQQYIMGLEQALRVHHITEKKFRAITFSDIHAAAEISDECCLALEKAANALSVQEEQAHNISGKRKYKDMWLVDSNAASFLEEKIQTKDISDVDPSAHHMLATAQLFHIPNWINLSRNVFMNFGGHRIEDNWTRICFHEETPAVTCDSFTDFYKIALSLTRRLVQSSIFFALMRIRATDERARDRERAIRKDDVLNALNTLKVHHNSREFWIYAARRCSLDVREYVSKNSFKTTLLSYDEVEKRLSSSSLELPEPQQGEHENQEEAQEEDNEEEAQHEEEEEAEEGSNILPMNNPEKYTVEDSSSSFEGSETDVSMGDVSSSGTDEELLSDEEEIYAVAIDKETSREEERRLWQILNPTPKPESDIKAEMESGDEGPFPSSKRRTKPLTRRKTIQDLQEWRNAVLPMADWELFGSETLSVNEEIRENHRIKRQKISNEEQTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.24
4 0.21
5 0.23
6 0.3
7 0.33
8 0.35
9 0.36
10 0.4
11 0.43
12 0.45
13 0.47
14 0.44
15 0.42
16 0.4
17 0.46
18 0.44
19 0.39
20 0.35
21 0.3
22 0.3
23 0.31
24 0.32
25 0.24
26 0.24
27 0.27
28 0.29
29 0.3
30 0.27
31 0.26
32 0.23
33 0.25
34 0.25
35 0.27
36 0.34
37 0.38
38 0.46
39 0.54
40 0.64
41 0.71
42 0.81
43 0.83
44 0.86
45 0.89
46 0.9
47 0.91
48 0.91
49 0.91
50 0.89
51 0.85
52 0.83
53 0.83
54 0.78
55 0.77
56 0.76
57 0.7
58 0.67
59 0.67
60 0.63
61 0.56
62 0.5
63 0.41
64 0.33
65 0.34
66 0.29
67 0.24
68 0.19
69 0.16
70 0.16
71 0.14
72 0.13
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.1
77 0.09
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.12
83 0.11
84 0.13
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.17
89 0.18
90 0.18
91 0.18
92 0.16
93 0.17
94 0.17
95 0.18
96 0.13
97 0.11
98 0.13
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.2
103 0.18
104 0.2
105 0.2
106 0.17
107 0.13
108 0.14
109 0.18
110 0.22
111 0.23
112 0.21
113 0.21
114 0.23
115 0.26
116 0.27
117 0.25
118 0.23
119 0.25
120 0.25
121 0.26
122 0.24
123 0.22
124 0.18
125 0.15
126 0.15
127 0.13
128 0.12
129 0.13
130 0.17
131 0.19
132 0.23
133 0.24
134 0.23
135 0.27
136 0.27
137 0.25
138 0.21
139 0.19
140 0.15
141 0.13
142 0.11
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.15
149 0.2
150 0.23
151 0.32
152 0.36
153 0.38
154 0.4
155 0.39
156 0.4
157 0.37
158 0.38
159 0.31
160 0.29
161 0.27
162 0.25
163 0.25
164 0.2
165 0.17
166 0.11
167 0.1
168 0.08
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.11
193 0.13
194 0.19
195 0.24
196 0.31
197 0.31
198 0.33
199 0.34
200 0.41
201 0.47
202 0.45
203 0.44
204 0.4
205 0.42
206 0.4
207 0.39
208 0.31
209 0.23
210 0.19
211 0.12
212 0.09
213 0.07
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.13
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.17
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.14
229 0.13
230 0.12
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.12
235 0.12
236 0.1
237 0.08
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.15
242 0.12
243 0.12
244 0.16
245 0.17
246 0.16
247 0.17
248 0.22
249 0.18
250 0.19
251 0.2
252 0.16
253 0.15
254 0.16
255 0.15
256 0.12
257 0.12
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.13
262 0.13
263 0.16
264 0.17
265 0.16
266 0.17
267 0.18
268 0.2
269 0.19
270 0.16
271 0.2
272 0.18
273 0.2
274 0.21
275 0.21
276 0.18
277 0.16
278 0.15
279 0.1
280 0.11
281 0.11
282 0.09
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.12
287 0.11
288 0.09
289 0.11
290 0.12
291 0.14
292 0.16
293 0.19
294 0.18
295 0.19
296 0.19
297 0.17
298 0.17
299 0.16
300 0.15
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.13
305 0.13
306 0.12
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.15
311 0.19
312 0.21
313 0.26
314 0.31
315 0.34
316 0.34
317 0.36
318 0.4
319 0.44
320 0.46
321 0.44
322 0.43
323 0.42
324 0.44
325 0.44
326 0.41
327 0.34
328 0.28
329 0.24
330 0.21
331 0.19
332 0.16
333 0.15
334 0.13
335 0.14
336 0.17
337 0.2
338 0.23
339 0.24
340 0.28
341 0.3
342 0.27
343 0.25
344 0.29
345 0.27
346 0.28
347 0.29
348 0.27
349 0.24
350 0.25
351 0.27
352 0.23
353 0.24
354 0.21
355 0.23
356 0.28
357 0.29
358 0.31
359 0.33
360 0.33
361 0.3
362 0.31
363 0.27
364 0.22
365 0.23
366 0.22
367 0.2
368 0.21
369 0.22
370 0.2
371 0.26
372 0.27
373 0.26
374 0.25
375 0.21
376 0.18
377 0.18
378 0.18
379 0.12
380 0.12
381 0.15
382 0.17
383 0.18
384 0.18
385 0.18
386 0.22
387 0.22
388 0.19
389 0.16
390 0.15
391 0.17
392 0.2
393 0.2
394 0.16
395 0.16
396 0.17
397 0.16
398 0.15
399 0.14
400 0.11
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.07
424 0.09
425 0.14
426 0.15
427 0.16
428 0.17
429 0.18
430 0.22
431 0.25
432 0.24
433 0.23
434 0.23
435 0.23
436 0.24
437 0.24
438 0.2
439 0.16
440 0.14
441 0.12
442 0.12
443 0.12
444 0.09
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.09
449 0.08
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.07
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.05
473 0.06
474 0.06
475 0.09
476 0.1
477 0.14
478 0.19
479 0.23
480 0.27
481 0.34
482 0.39
483 0.43
484 0.44
485 0.42
486 0.39
487 0.45
488 0.48
489 0.51
490 0.47
491 0.45
492 0.44
493 0.43
494 0.45
495 0.41
496 0.38
497 0.35
498 0.37
499 0.35
500 0.35
501 0.36
502 0.3
503 0.27
504 0.24
505 0.18
506 0.15
507 0.13
508 0.11
509 0.12
510 0.14
511 0.14
512 0.21
513 0.29
514 0.37
515 0.45
516 0.53
517 0.61
518 0.71
519 0.8
520 0.83
521 0.85
522 0.86
523 0.86
524 0.86
525 0.87
526 0.82
527 0.8
528 0.79
529 0.77
530 0.73
531 0.71
532 0.65
533 0.54
534 0.52
535 0.43
536 0.33
537 0.25
538 0.21
539 0.17
540 0.19
541 0.19
542 0.14
543 0.15
544 0.15
545 0.15
546 0.14
547 0.11
548 0.08
549 0.09
550 0.1
551 0.12
552 0.12
553 0.13
554 0.14
555 0.15
556 0.17
557 0.21
558 0.28
559 0.29
560 0.35
561 0.44
562 0.52
563 0.55
564 0.63
565 0.67
566 0.69
567 0.76
568 0.79