Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AWS3

Protein Details
Accession D4AWS3    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-49QTGSKSKSASSRHRTPRPREQKTVRKLLRQSKIPSHydrophilic
80-100VTELVRRRHVRPQTRHYRAMIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-39ASSRHRTPRPREQKTVR
520-526IRPHRVR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
KEGG abe:ARB_00639  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
Amino Acid Sequences MPGSYTAEGSQGKEQTGSKSKSASSRHRTPRPREQKTVRKLLRQSKIPSDLSQRTEGNLENILQNVVEKLPNHTAALDVVTELVRRRHVRPQTRHYRAMILANTQCIRGSAKQVEALLNDMKENGVVVDSGTLHAALKALAVHPDYLLRSEIIRKLRERWISLSPTGWHNIVTGYIREGQFEMALETLEHMKLQHVPVQGWLHSLLLYNLAEYGEFEEVLHLLRSRVEAGLTLSPNLWHRLLDISSAAMHPELTQFIWEQQVELGHLNPPYGICDNVLAISARTGNARLAASVFKVLGNRNGVLTLNDYESLVDTYVESGDVESAIRILCSMDSSSIGVKTGSTRSLLSHLIMAGSKPTDVWDTFKRMKKEEDLVFPLPLLNVALELCAHLGDAKTAWDLYRELHTLCSSSVETSTFNILFKACRGSNDADLAGYFVQEMIQMKILPDRKTYENLVLLCVEISRFETAYKYLVEMSGSGFELSRQAKEDIRAKCDGQEDPHASKIIHDSAVRKPASRGIIRPHRVRRSFTIPARGKGVEPEEVKRIDATGQYEHGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.33
3 0.41
4 0.42
5 0.39
6 0.41
7 0.44
8 0.49
9 0.56
10 0.58
11 0.58
12 0.64
13 0.72
14 0.79
15 0.85
16 0.86
17 0.88
18 0.89
19 0.89
20 0.89
21 0.89
22 0.89
23 0.89
24 0.91
25 0.87
26 0.85
27 0.85
28 0.85
29 0.83
30 0.82
31 0.78
32 0.77
33 0.77
34 0.71
35 0.67
36 0.66
37 0.63
38 0.59
39 0.58
40 0.49
41 0.42
42 0.42
43 0.38
44 0.31
45 0.27
46 0.23
47 0.19
48 0.19
49 0.18
50 0.15
51 0.14
52 0.12
53 0.11
54 0.13
55 0.12
56 0.17
57 0.22
58 0.24
59 0.24
60 0.23
61 0.22
62 0.19
63 0.2
64 0.15
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.1
69 0.12
70 0.14
71 0.2
72 0.24
73 0.28
74 0.36
75 0.46
76 0.56
77 0.63
78 0.72
79 0.76
80 0.8
81 0.82
82 0.75
83 0.7
84 0.62
85 0.59
86 0.51
87 0.46
88 0.4
89 0.39
90 0.37
91 0.32
92 0.29
93 0.23
94 0.24
95 0.2
96 0.25
97 0.24
98 0.26
99 0.28
100 0.29
101 0.3
102 0.27
103 0.28
104 0.23
105 0.2
106 0.18
107 0.15
108 0.13
109 0.11
110 0.11
111 0.07
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.13
135 0.11
136 0.11
137 0.15
138 0.2
139 0.25
140 0.29
141 0.3
142 0.35
143 0.42
144 0.46
145 0.45
146 0.44
147 0.45
148 0.45
149 0.44
150 0.41
151 0.35
152 0.32
153 0.31
154 0.27
155 0.2
156 0.16
157 0.15
158 0.14
159 0.13
160 0.11
161 0.11
162 0.15
163 0.15
164 0.16
165 0.16
166 0.14
167 0.13
168 0.13
169 0.11
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.1
180 0.11
181 0.15
182 0.15
183 0.16
184 0.2
185 0.22
186 0.21
187 0.2
188 0.19
189 0.14
190 0.13
191 0.13
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.08
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.09
217 0.13
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.12
222 0.14
223 0.15
224 0.14
225 0.1
226 0.1
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.09
283 0.1
284 0.12
285 0.14
286 0.14
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.13
292 0.11
293 0.09
294 0.09
295 0.09
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.03
311 0.04
312 0.04
313 0.03
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.07
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.07
326 0.07
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.12
333 0.15
334 0.15
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.07
346 0.09
347 0.1
348 0.14
349 0.17
350 0.24
351 0.32
352 0.37
353 0.4
354 0.4
355 0.44
356 0.44
357 0.49
358 0.46
359 0.45
360 0.45
361 0.44
362 0.41
363 0.37
364 0.32
365 0.24
366 0.19
367 0.13
368 0.06
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.05
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.08
386 0.09
387 0.1
388 0.14
389 0.14
390 0.14
391 0.16
392 0.16
393 0.16
394 0.15
395 0.17
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.12
400 0.12
401 0.13
402 0.16
403 0.14
404 0.14
405 0.14
406 0.13
407 0.13
408 0.14
409 0.19
410 0.16
411 0.17
412 0.22
413 0.24
414 0.26
415 0.28
416 0.27
417 0.21
418 0.2
419 0.2
420 0.15
421 0.11
422 0.08
423 0.05
424 0.05
425 0.07
426 0.08
427 0.08
428 0.1
429 0.11
430 0.11
431 0.18
432 0.23
433 0.24
434 0.26
435 0.29
436 0.31
437 0.34
438 0.37
439 0.36
440 0.36
441 0.35
442 0.33
443 0.29
444 0.25
445 0.21
446 0.18
447 0.13
448 0.08
449 0.1
450 0.09
451 0.09
452 0.1
453 0.12
454 0.13
455 0.15
456 0.15
457 0.14
458 0.13
459 0.13
460 0.13
461 0.12
462 0.12
463 0.12
464 0.12
465 0.11
466 0.11
467 0.1
468 0.16
469 0.17
470 0.17
471 0.18
472 0.2
473 0.23
474 0.3
475 0.37
476 0.37
477 0.4
478 0.43
479 0.4
480 0.42
481 0.43
482 0.4
483 0.37
484 0.41
485 0.42
486 0.42
487 0.44
488 0.41
489 0.37
490 0.36
491 0.36
492 0.31
493 0.28
494 0.27
495 0.27
496 0.33
497 0.42
498 0.41
499 0.37
500 0.36
501 0.39
502 0.44
503 0.46
504 0.45
505 0.47
506 0.56
507 0.63
508 0.71
509 0.75
510 0.77
511 0.77
512 0.78
513 0.75
514 0.73
515 0.75
516 0.72
517 0.73
518 0.69
519 0.67
520 0.66
521 0.6
522 0.52
523 0.48
524 0.45
525 0.42
526 0.39
527 0.39
528 0.4
529 0.4
530 0.4
531 0.33
532 0.31
533 0.26
534 0.26
535 0.26
536 0.24