Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

D4AKF6

Protein Details
Accession D4AKF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
303-324LSAKSAKGRNRDKKLQKKAVLCHydrophilic
464-483GPSRSDSKTGKKARKGSARSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
306-319KSAKGRNRDKKLQK
473-479GKKARKG
Subcellular Location(s) cyto 10.5, extr 9, cyto_nucl 8.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023797  RNA3'_phos_cyclase_dom  
IPR037136  RNA3'_phos_cyclase_dom_sf  
IPR000228  RNA3'_term_phos_cyc  
IPR013792  RNA3'P_cycl/enolpyr_Trfase_a/b  
Gene Ontology GO:0003963  F:RNA-3'-phosphate cyclase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG abe:ARB_03978  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01137  RTC  
Amino Acid Sequences MLHLDGSTLEGGGQLVRIAAALSALTGKPLSISRIRANRSGSKGLKASHCAAIKFLLDVCGGTAVGNQVGHHELSIYPRGQKTGRSSLQTKREDNNANSDLRKSAASLQQLSLTSLYSSPRVTVKSEYDIRLSTPGSVFLIFQALYPYLLFAGACTPTIEADAGTSDTVREHPKGIRVNITGGTHVSFSPSYDYISQVLIPNFAKFGLPPLSMELKKRGWATGQWAEVGAVSLVISPLSANGTPSRSDTISSPSHDSGRAQAETPPVVFPSIELDAFDKGFITQIDVTILAPDTLAQKLLKELSAKSAKGRNRDKKLQKKAVLCHDPSGVRNPYREQETSEDGDEYLSNAGEQAACMGDACNMKQGPPQTAREFIQLETIRTLSRELNRQVNREQSVLPTTPEIDDAEVDEMQSHRINIGDVVVNLHTSEATSHYSQTYILLVAHTSTGFRLGRDALYSSFHHGPSRSDSKTGKKARKGSARSSADSGNILLRMKGMIDQCVTDLMDEFESHPGDQGQGRRIIIPKKAVDVYMRDQLVVFEALGRLTHPGPHLSAGGEQRDEEGVSLHTRTAKWVCEQILGCP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.05
4 0.06
5 0.05
6 0.05
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.08
11 0.07
12 0.09
13 0.09
14 0.09
15 0.1
16 0.12
17 0.17
18 0.2
19 0.26
20 0.33
21 0.42
22 0.47
23 0.5
24 0.56
25 0.59
26 0.6
27 0.64
28 0.59
29 0.57
30 0.57
31 0.57
32 0.56
33 0.53
34 0.5
35 0.47
36 0.48
37 0.41
38 0.38
39 0.36
40 0.3
41 0.26
42 0.23
43 0.18
44 0.14
45 0.14
46 0.13
47 0.11
48 0.11
49 0.09
50 0.1
51 0.08
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.11
56 0.13
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.15
62 0.21
63 0.2
64 0.24
65 0.25
66 0.29
67 0.29
68 0.35
69 0.38
70 0.43
71 0.47
72 0.48
73 0.53
74 0.57
75 0.66
76 0.67
77 0.65
78 0.58
79 0.62
80 0.63
81 0.6
82 0.61
83 0.54
84 0.5
85 0.47
86 0.44
87 0.37
88 0.3
89 0.28
90 0.2
91 0.23
92 0.24
93 0.28
94 0.29
95 0.29
96 0.31
97 0.32
98 0.31
99 0.25
100 0.2
101 0.16
102 0.15
103 0.15
104 0.13
105 0.13
106 0.13
107 0.16
108 0.18
109 0.19
110 0.22
111 0.24
112 0.3
113 0.35
114 0.35
115 0.35
116 0.34
117 0.32
118 0.31
119 0.28
120 0.23
121 0.18
122 0.17
123 0.15
124 0.15
125 0.13
126 0.11
127 0.12
128 0.1
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.05
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.07
155 0.09
156 0.12
157 0.13
158 0.15
159 0.17
160 0.24
161 0.3
162 0.31
163 0.35
164 0.33
165 0.34
166 0.35
167 0.33
168 0.27
169 0.22
170 0.2
171 0.15
172 0.14
173 0.13
174 0.1
175 0.1
176 0.12
177 0.12
178 0.13
179 0.13
180 0.14
181 0.13
182 0.14
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.15
188 0.14
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.08
193 0.12
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.16
198 0.22
199 0.23
200 0.25
201 0.26
202 0.24
203 0.27
204 0.28
205 0.25
206 0.22
207 0.22
208 0.28
209 0.28
210 0.27
211 0.24
212 0.23
213 0.22
214 0.2
215 0.18
216 0.1
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.14
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.17
237 0.18
238 0.2
239 0.22
240 0.21
241 0.22
242 0.21
243 0.21
244 0.19
245 0.2
246 0.19
247 0.16
248 0.17
249 0.18
250 0.18
251 0.18
252 0.15
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.07
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.06
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.16
291 0.2
292 0.2
293 0.22
294 0.28
295 0.3
296 0.38
297 0.48
298 0.51
299 0.55
300 0.64
301 0.72
302 0.76
303 0.84
304 0.84
305 0.8
306 0.77
307 0.75
308 0.75
309 0.72
310 0.62
311 0.54
312 0.47
313 0.42
314 0.36
315 0.37
316 0.31
317 0.26
318 0.26
319 0.27
320 0.27
321 0.3
322 0.29
323 0.26
324 0.25
325 0.27
326 0.27
327 0.26
328 0.23
329 0.18
330 0.18
331 0.15
332 0.12
333 0.08
334 0.06
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.13
349 0.13
350 0.13
351 0.16
352 0.18
353 0.2
354 0.24
355 0.29
356 0.27
357 0.31
358 0.32
359 0.33
360 0.32
361 0.27
362 0.31
363 0.27
364 0.25
365 0.23
366 0.22
367 0.18
368 0.18
369 0.19
370 0.15
371 0.18
372 0.24
373 0.26
374 0.35
375 0.39
376 0.42
377 0.44
378 0.47
379 0.45
380 0.39
381 0.37
382 0.3
383 0.31
384 0.28
385 0.25
386 0.19
387 0.17
388 0.16
389 0.16
390 0.14
391 0.1
392 0.09
393 0.09
394 0.1
395 0.09
396 0.09
397 0.09
398 0.08
399 0.1
400 0.11
401 0.1
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.08
406 0.1
407 0.09
408 0.09
409 0.11
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.08
415 0.06
416 0.07
417 0.07
418 0.11
419 0.11
420 0.13
421 0.13
422 0.14
423 0.14
424 0.14
425 0.12
426 0.09
427 0.09
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.06
435 0.12
436 0.12
437 0.12
438 0.13
439 0.14
440 0.15
441 0.16
442 0.18
443 0.14
444 0.17
445 0.18
446 0.22
447 0.24
448 0.24
449 0.25
450 0.25
451 0.26
452 0.31
453 0.37
454 0.33
455 0.36
456 0.4
457 0.46
458 0.55
459 0.62
460 0.64
461 0.65
462 0.72
463 0.76
464 0.81
465 0.79
466 0.77
467 0.78
468 0.75
469 0.69
470 0.64
471 0.56
472 0.47
473 0.41
474 0.33
475 0.25
476 0.21
477 0.18
478 0.15
479 0.13
480 0.12
481 0.12
482 0.15
483 0.14
484 0.15
485 0.16
486 0.16
487 0.16
488 0.18
489 0.18
490 0.14
491 0.13
492 0.11
493 0.11
494 0.11
495 0.12
496 0.13
497 0.15
498 0.14
499 0.15
500 0.14
501 0.15
502 0.18
503 0.22
504 0.24
505 0.27
506 0.28
507 0.31
508 0.36
509 0.4
510 0.42
511 0.45
512 0.42
513 0.43
514 0.44
515 0.43
516 0.41
517 0.41
518 0.4
519 0.4
520 0.38
521 0.32
522 0.3
523 0.29
524 0.27
525 0.22
526 0.16
527 0.1
528 0.11
529 0.11
530 0.11
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.15
535 0.15
536 0.18
537 0.19
538 0.21
539 0.21
540 0.2
541 0.25
542 0.26
543 0.28
544 0.27
545 0.25
546 0.25
547 0.25
548 0.24
549 0.18
550 0.15
551 0.13
552 0.15
553 0.15
554 0.16
555 0.19
556 0.19
557 0.25
558 0.28
559 0.3
560 0.31
561 0.37
562 0.37
563 0.4